Heatmap: Cluster_436 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.01 0.65 0.6 0.46 1.0 0.24 0.77 0.32 0.59 0.59 0.51 0.51 0.61 0.63 0.47 0.79 0.17 0.19 0.2 0.31 0.33 0.12 0.12 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.5 0.49 0.52 0.5 0.6 0.99 0.69 0.67 0.99 0.99 1.0 0.54 0.51 0.39 0.35 0.34 0.34 0.32 0.31 0.38 0.32 0.34 0.34
0.34 0.28 0.32 0.32 0.43 0.5 0.73 0.2 0.24 0.27 0.81 0.84 0.62 0.53 0.62 0.85 0.67 0.76 0.91 0.77 0.73 0.69 0.57 0.69 0.81 0.47 0.5 0.63 0.72 1.0 0.66 0.77 0.97
0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.56 0.0 0.01 0.0 0.77 0.73 0.8 0.79 0.38 0.4 0.53 0.65 0.55 0.63 0.67 0.93 1.0 0.78 0.7 0.21 0.23 0.24 0.32 0.3 0.24 0.24 0.55
0.08 0.06 0.03 0.02 0.04 0.03 0.29 0.03 0.03 0.03 0.73 0.43 0.82 0.44 0.55 1.0 0.48 0.93 0.88 0.88 0.75 0.5 0.76 0.47 0.45 0.13 0.16 0.33 0.43 0.52 0.31 0.29 0.49
0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.3 0.0 0.0 0.0 0.53 0.34 0.42 0.58 0.19 0.46 0.59 0.63 0.42 0.65 0.64 1.0 0.41 0.7 0.2 0.03 0.04 0.06 0.13 0.13 0.05 0.07 0.22
0.31 0.23 0.19 0.21 0.25 0.45 0.46 0.22 0.14 0.28 0.45 0.44 0.27 0.52 0.45 0.67 0.2 0.43 0.55 0.43 0.61 0.62 1.0 0.08 0.88 0.25 0.26 0.31 0.34 0.45 0.27 0.36 0.56
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.55 0.26 0.23 0.31 0.43 0.69 0.29 0.74 1.0 0.9 0.88 0.23 0.33 0.47 0.27 0.08 0.09 0.05 0.05 0.11 0.05 0.07 0.18
0.41 0.39 0.32 0.25 0.22 0.22 0.6 0.19 0.18 0.24 0.75 0.67 1.0 0.46 0.47 0.67 0.86 0.73 0.93 0.8 0.76 0.69 0.69 0.58 0.68 0.33 0.3 0.51 0.71 0.83 0.61 0.57 0.74
0.06 0.04 0.05 0.03 0.03 0.02 0.09 0.02 0.01 0.02 0.69 0.27 0.35 0.46 0.49 0.88 0.31 1.0 0.9 0.79 0.83 0.26 0.27 0.86 0.27 0.1 0.11 0.05 0.06 0.12 0.05 0.07 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.55 0.28 0.18 0.26 0.37 0.41 0.11 0.74 1.0 0.77 0.87 0.27 0.08 0.41 0.11 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.03 0.04 0.14
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.54 0.0 0.0 0.01 0.59 0.73 0.62 0.56 0.16 0.72 0.45 0.43 0.65 0.83 0.84 0.83 0.93 0.39 0.85 0.18 0.2 0.24 0.35 0.43 0.15 0.16 1.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.49 0.01 0.0 0.01 0.57 0.67 0.49 0.81 0.22 0.63 0.32 0.44 0.57 0.66 0.6 0.66 0.77 0.44 0.78 0.19 0.22 0.25 0.36 0.4 0.15 0.14 1.0
0.1 0.15 0.12 0.16 0.15 0.12 0.38 0.19 0.18 0.21 0.63 0.68 0.87 0.72 0.4 0.88 0.62 0.67 0.68 0.55 0.73 0.64 0.53 0.34 1.0 0.26 0.28 0.53 0.75 0.72 0.42 0.55 0.81
0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.31 0.02 0.01 0.03 0.81 0.52 0.44 0.33 0.8 0.73 0.51 0.62 1.0 0.77 0.77 0.39 0.35 0.3 0.4 0.34 0.36 0.27 0.36 0.34 0.35 0.36 0.28
0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.47 0.0 0.0 0.0 0.45 0.35 1.0 0.53 0.78 0.75 0.57 0.45 0.66 0.76 0.45 0.24 0.78 0.73 0.6 0.12 0.09 0.32 0.36 0.36 0.36 0.34 0.33
0.06 0.05 0.03 0.04 0.07 0.07 0.06 0.06 0.07 0.05 0.85 0.36 0.28 0.5 0.3 0.75 0.36 1.0 0.85 0.94 0.91 0.27 0.1 0.24 0.42 0.07 0.09 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03
0.1 0.1 0.04 0.1 0.03 0.06 0.37 0.02 0.04 0.02 0.45 0.43 0.57 0.45 0.55 1.0 0.41 0.52 0.53 0.87 0.72 0.5 0.54 0.57 0.6 0.14 0.14 0.33 0.45 0.44 0.59 0.36 0.48
0.36 0.34 0.32 0.29 0.35 0.5 0.63 0.22 0.24 0.34 1.0 0.88 0.74 0.58 1.0 0.69 0.69 0.89 0.84 0.77 0.8 0.7 0.59 0.62 0.81 0.48 0.52 0.65 0.88 0.97 0.66 0.72 0.84
0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.13 0.02 0.02 0.06 0.71 0.82 0.52 0.94 0.32 1.0 0.53 0.66 0.93 0.95 0.84 0.52 0.3 0.18 0.84 0.1 0.14 0.2 0.43 0.45 0.25 0.22 0.41
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.25 0.02 0.01 0.01 0.52 0.25 0.45 0.29 0.29 0.89 0.42 0.43 0.74 1.0 0.7 0.34 0.21 0.5 0.33 0.15 0.2 0.18 0.24 0.19 0.17 0.19 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.02 0.0 0.27 0.38 0.63 0.14 0.4 1.0 0.35 0.28 0.37 0.59 0.38 0.72 0.53 0.43 0.6 0.01 0.01 0.33 0.4 0.5 0.42 0.34 0.63
0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.05 0.51 0.01 0.01 0.01 0.6 0.49 0.43 1.0 0.35 0.58 0.25 0.76 0.46 0.31 0.39 0.58 0.62 0.34 0.33 0.07 0.1 0.21 0.17 0.2 0.19 0.23 0.23
0.01 0.01 0.04 0.02 0.05 0.01 0.56 0.09 0.11 0.03 0.37 0.55 0.23 0.81 0.26 0.36 0.5 0.22 0.37 0.33 0.29 0.89 0.41 1.0 0.32 0.0 0.0 0.15 0.13 0.17 0.11 0.08 0.13
0.02 0.03 0.03 0.03 0.01 0.02 0.42 0.02 0.0 0.02 0.6 0.62 0.58 0.46 0.66 0.91 0.78 0.74 0.98 1.0 1.0 0.6 0.53 0.48 0.46 0.48 0.5 0.41 0.41 0.48 0.42 0.43 0.47
0.07 0.04 0.0 0.05 0.08 0.0 0.68 0.02 0.09 0.1 0.51 0.66 0.6 0.46 0.66 0.69 0.57 0.93 0.48 0.55 0.8 1.0 0.4 0.72 0.65 0.0 0.0 0.19 0.19 0.21 0.21 0.15 0.08
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.3 0.49 0.51 0.03 0.39 1.0 0.17 0.45 0.36 0.36 0.54 0.37 0.13 0.4 0.33 0.03 0.03 0.1 0.08 0.2 0.06 0.07 0.1
0.02 0.05 0.01 0.02 0.0 0.02 0.59 0.0 0.0 0.02 0.49 0.82 0.48 0.48 0.32 0.96 0.39 0.72 0.85 0.88 0.78 0.23 0.51 0.07 0.45 0.41 0.39 0.2 0.68 0.68 0.28 0.18 1.0
0.14 0.12 0.07 0.08 0.06 0.06 0.19 0.02 0.06 0.04 0.58 0.24 0.55 0.32 0.31 0.56 0.61 0.73 0.8 0.66 0.79 0.37 0.36 1.0 0.47 0.12 0.18 0.24 0.21 0.28 0.18 0.18 0.38
0.05 0.04 0.03 0.05 0.05 0.04 0.33 0.02 0.02 0.02 0.71 0.44 0.62 0.33 0.3 0.69 0.63 0.63 0.81 0.88 1.0 0.41 0.55 0.39 0.46 0.4 0.45 0.34 0.45 0.45 0.35 0.27 0.47
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.02 0.0 0.24 0.71 0.43 0.27 1.0 0.58 0.33 0.28 0.38 0.36 0.64 0.54 0.1 0.32 0.39 0.05 0.01 0.31 0.16 0.31 0.41 0.18 0.22
0.08 0.05 0.1 0.08 0.09 0.12 0.13 0.07 0.09 0.09 0.67 0.28 0.42 0.19 1.0 0.87 0.36 0.75 0.89 0.81 0.94 0.29 0.43 0.26 0.44 0.08 0.11 0.2 0.22 0.24 0.24 0.27 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.42 0.3 0.5 0.41 0.56 1.0 0.43 0.63 0.81 0.66 0.68 0.38 0.4 0.36 0.28 0.26 0.27 0.24 0.31 0.24 0.26 0.3 0.3
0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.55 0.03 0.02 0.02 0.69 0.7 0.75 0.58 0.76 1.0 0.33 0.39 0.52 0.54 0.47 0.86 0.76 0.3 0.76 0.16 0.2 0.08 0.14 0.16 0.1 0.09 0.18
0.17 0.16 0.17 0.16 0.11 0.16 0.13 0.23 0.13 0.23 0.88 0.39 0.33 0.68 0.16 0.86 0.36 0.84 1.0 0.84 0.88 0.32 0.07 0.06 0.39 0.19 0.19 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03
0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.5 0.0 0.01 0.0 0.54 0.66 0.83 0.72 0.72 1.0 0.48 0.4 0.52 0.47 0.47 0.7 0.75 0.86 0.57 0.02 0.03 0.13 0.11 0.11 0.13 0.17 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.01 0.0 0.49 0.49 0.67 0.48 0.29 1.0 0.33 0.52 0.55 0.44 0.57 0.43 0.35 0.54 0.38 0.11 0.11 0.17 0.18 0.19 0.16 0.17 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.59 0.35 0.24 0.38 0.25 0.73 0.4 0.51 0.82 1.0 0.9 0.28 0.14 0.18 0.36 0.07 0.08 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03
0.13 0.06 0.11 0.12 0.21 0.3 0.86 0.09 0.22 0.07 0.42 0.53 0.45 0.42 0.16 0.63 0.47 0.44 0.72 0.83 0.61 0.56 0.55 0.21 0.44 0.4 0.55 0.36 0.62 0.68 0.37 0.29 1.0
0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.68 0.01 0.01 0.03 0.56 0.76 0.51 0.95 0.58 1.0 0.32 0.56 0.53 0.64 0.61 0.73 0.41 0.31 0.5 0.21 0.32 0.13 0.19 0.32 0.2 0.19 0.23
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.44 0.19 0.45 0.44 0.36 0.74 0.59 0.65 0.81 0.87 0.88 0.47 0.56 1.0 0.44 0.09 0.1 0.19 0.18 0.26 0.16 0.19 0.32
0.42 0.3 0.31 0.25 0.36 0.41 0.4 0.45 0.41 0.41 0.93 0.57 0.94 0.62 0.61 0.92 0.56 0.69 1.0 0.9 0.96 0.55 0.61 0.59 0.49 0.39 0.42 0.44 0.67 0.71 0.48 0.44 0.76
0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.05 0.03 0.07 0.7 0.31 0.55 0.67 0.35 0.6 0.37 0.76 0.83 0.51 0.78 0.44 0.36 1.0 0.66 0.12 0.14 0.12 0.23 0.32 0.2 0.14 0.36
0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02 0.52 0.03 0.02 0.0 0.55 0.74 0.61 0.48 0.61 0.97 0.57 0.86 0.86 0.78 1.0 0.58 0.98 0.57 0.53 0.09 0.1 0.42 0.43 0.4 0.36 0.32 0.59
0.03 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.31 0.67 1.0 0.47 0.45 0.65 0.41 0.62 0.23 0.52 0.36 0.64 0.51 0.66 0.48 0.14 0.12 0.36 0.38 0.42 0.32 0.33 0.36
0.38 0.28 0.23 0.22 0.21 0.26 0.59 0.17 0.15 0.18 0.73 0.68 0.4 0.92 0.25 0.63 0.36 0.86 0.65 0.51 0.6 0.64 0.63 0.38 0.95 0.18 0.2 0.25 0.38 0.45 0.14 0.15 1.0
0.09 0.1 0.09 0.08 0.08 0.09 0.36 0.18 0.17 0.2 0.59 1.0 0.53 0.66 0.24 0.43 0.5 0.63 0.52 0.37 0.58 0.84 0.68 0.26 0.86 0.29 0.31 0.24 0.21 0.39 0.4 0.28 0.39
0.38 0.42 0.25 0.25 0.38 0.51 0.71 0.32 0.34 0.37 0.75 0.67 0.37 1.0 0.6 0.78 0.31 0.68 0.81 0.57 0.64 0.55 0.95 0.44 0.6 0.48 0.44 0.76 0.71 0.53 0.63 0.55 0.59
0.07 0.07 0.06 0.06 0.11 0.03 0.46 0.23 0.33 0.12 0.61 0.96 0.84 0.69 0.23 0.55 0.56 0.62 0.51 0.36 0.5 1.0 0.74 0.45 0.93 0.17 0.18 0.2 0.18 0.32 0.34 0.24 0.3
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.85 0.15 0.51 0.0 0.29 0.8 0.3 0.46 0.74 0.7 0.55 0.22 0.36 1.0 0.53 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.68 0.35 0.47 0.4 0.36 0.97 0.74 0.87 0.91 0.95 1.0 0.36 0.26 0.47 0.38 0.3 0.42 0.29 0.39 0.38 0.34 0.29 0.44
0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.06 0.01 0.01 0.01 0.64 0.34 0.18 0.37 0.17 0.82 0.25 0.83 0.95 1.0 0.84 0.36 0.07 0.3 0.35 0.16 0.18 0.09 0.06 0.05 0.02 0.06 0.08
0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.25 0.0 0.01 0.0 0.65 0.47 0.59 0.5 0.46 1.0 0.6 0.71 0.91 0.95 0.9 0.37 0.54 0.46 0.37 0.38 0.37 0.31 0.25 0.33 0.27 0.34 0.35
0.09 0.08 0.14 0.11 0.17 0.15 0.41 0.05 0.08 0.12 0.61 0.81 1.0 0.53 0.54 0.42 0.56 0.55 0.26 0.21 0.26 0.76 0.32 0.65 0.83 0.19 0.26 0.33 0.26 0.29 0.34 0.24 0.39
0.2 0.23 0.16 0.14 0.19 0.23 0.7 0.21 0.24 0.2 0.49 0.66 0.9 0.7 0.48 0.61 0.52 0.45 0.47 0.4 0.46 0.73 0.78 1.0 0.46 0.4 0.41 0.34 0.42 0.38 0.31 0.29 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)