Heatmap: Cluster_166 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00115760 (EXP7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.09	0.61	0.0	0.28	0.3	0.2	0.0	0.3	0.06	0.14	0.0	1.0	0.22	0.04	0.02	0.0	0.5
AMTR_s00001p00119760 (PHS1)	1.0	0.43	0.44	0.05	0.28	0.09	0.44	0.12	0.65	0.64	0.48	0.5	0.49	0.44	0.18	0.76	0.36	0.66	0.65	0.41	0.62	0.35
AMTR_s00002p00130350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.90)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.67	0.0	0.55	0.58	0.07	0.0	0.18	0.03	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97
AMTR_s00002p00256740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.409)	0.04	0.02	0.01	0.0	0.01	0.09	1.0	0.07	0.44	0.61	0.01	0.0	0.1	0.18	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.66
AMTR_s00002p00263250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.476)	0.4	0.14	0.34	0.03	0.36	0.53	0.81	0.26	0.78	0.69	0.82	0.78	0.36	0.22	0.22	0.22	1.0	0.5	0.47	0.21	0.19	0.74
AMTR_s00002p00269920 (YUC4)	0.0	0.05	0.0	0.0	0.04	0.03	0.6	0.02	0.31	0.46	0.22	0.11	0.02	0.08	0.02	0.0	1.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00003p00246520 (AGAL2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.39	0.19	0.26	0.25	0.24	0.17	0.04	0.08	0.03	0.0	1.0	0.25	0.13	0.01	0.01	0.25
AMTR_s00004p00142010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.138)	0.0	0.0	0.0	0.28	0.66	0.0	0.42	0.34	0.48	0.53	0.59	0.8	0.28	0.25	0.23	0.08	1.0	0.06	0.01	0.04	0.02	0.56
AMTR_s00005p00098760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.24)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.49	0.0	0.44	0.28	0.0	0.0	0.0	0.1	0.06	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
AMTR_s00006p00028150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.6)	1.0	0.04	0.1	0.03	0.51	0.39	0.87	0.36	0.6	0.52	0.79	0.87	0.46	0.69	0.49	0.2	0.63	0.52	0.64	0.49	0.13	0.43
AMTR_s00006p00073100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.26)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.35	0.27	0.16	0.34	0.25	0.23	0.15	0.32	0.39	0.16	0.21	0.03	0.75	0.2	0.1	0.2	0.4	0.33
AMTR_s00006p00180530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.75)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.11	0.15	0.37	0.08	0.25	0.17	0.07	0.0	0.14	0.06	0.14	0.0	1.0	0.15	0.01	0.14	0.02	0.23
AMTR_s00006p00256960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.195)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	0.13	0.16	0.1	0.1	0.83	0.72	0.75	0.21	0.06	1.0	0.45	0.22	0.27	0.07	0.06	0.73
AMTR_s00007p00223380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.217)	1.0	0.0	0.0	0.01	0.37	0.03	0.56	0.42	0.86	1.0	0.69	0.65	0.83	0.35	0.32	0.59	0.75	0.93	0.74	0.51	0.74	0.48
AMTR_s00009p00244800 (APO3)	0.41	0.27	0.0	0.26	0.38	0.09	0.95	0.06	0.86	0.76	0.82	0.35	0.98	0.93	0.5	0.17	1.0	0.3	0.24	0.6	0.28	0.49
AMTR_s00009p00251790 (TUB8)	0.23	0.22	0.09	0.19	0.04	0.18	0.46	0.14	0.53	0.48	0.23	0.23	0.39	0.11	0.08	0.1	1.0	0.13	0.25	0.11	0.03	0.52
AMTR_s00010p00241610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.309)	0.0	0.06	0.09	0.01	0.04	0.64	1.0	0.22	0.23	0.2	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.0	0.02	0.01	0.06	0.01	0.0	0.97
AMTR_s00011p00235020 (KN)	0.38	0.0	0.03	0.04	0.15	0.65	0.64	0.76	0.99	0.76	0.3	0.32	0.04	0.11	0.08	0.0	1.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.12
AMTR_s00011p00267070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.235)	0.0	0.14	0.0	0.06	0.68	0.02	0.18	0.32	0.45	0.4	0.43	0.46	0.34	0.13	0.16	0.26	1.0	0.32	0.35	0.15	0.29	0.17
AMTR_s00013p00200170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.135)	0.11	0.59	0.26	0.28	0.3	0.0	0.24	0.34	0.31	0.27	1.0	0.98	0.8	0.54	0.25	0.37	0.81	0.38	0.33	0.37	0.41	0.67
AMTR_s00013p00217890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.153)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.19	0.04	0.32	0.05	0.38	0.35	0.61	0.28	0.64	0.11	0.06	0.04	1.0	0.06	0.05	0.08	0.08	0.41
AMTR_s00015p00021860 (UGT84A1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.43	0.25	0.65	0.78	0.04	0.06	0.07	0.29	0.01	0.01	1.0	0.04	0.02	0.07	0.24	0.01
AMTR_s00017p00071350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.26)	0.48	0.12	0.0	0.23	0.23	0.0	1.0	0.26	0.52	0.5	0.52	0.52	0.41	0.35	0.18	0.26	0.63	0.26	0.28	0.26	0.27	0.26
AMTR_s00017p00237730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.202)	0.06	0.17	0.0	0.1	0.05	0.5	0.17	0.28	0.89	0.44	1.0	0.83	0.08	0.07	0.07	0.06	0.74	0.27	0.16	0.05	0.14	0.11
AMTR_s00019p00179020 (GLR2.7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.93	0.04	0.71	0.64	0.01	0.02	0.04	0.2	0.17	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	1.0
AMTR_s00019p00192810 (CLA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.01	0.68	0.01	0.0	0.2	0.91	0.09	0.02	0.07	0.0	0.74	0.0	0.22	0.8	0.05	1.0
AMTR_s00019p00250630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.410)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.61	1.0	0.01	0.0	0.03	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
AMTR_s00022p00116300 (BUBR1)	0.0	0.36	0.0	0.01	0.19	0.52	0.06	0.51	0.49	0.26	0.67	0.72	0.12	0.02	0.05	0.04	1.0	0.12	0.03	0.01	0.02	0.17
AMTR_s00023p00245540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.219)	0.68	0.44	0.01	0.34	0.5	0.42	1.0	0.04	0.82	0.58	0.85	0.71	0.56	0.67	0.51	0.48	0.77	0.63	0.57	0.45	0.38	0.38
AMTR_s00024p00226830 (CKX7)	0.0	0.0	0.0	0.06	0.07	0.12	0.59	0.1	0.54	0.53	0.13	0.23	0.05	0.09	0.18	0.06	0.5	0.72	1.0	0.26	0.82	0.28
AMTR_s00027p00246880 (GH9B18)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.4	0.0	0.9	1.0	0.3	0.15	0.02	0.08	0.04	0.0	0.8	0.27	0.07	0.01	0.0	0.0
AMTR_s00027p00247030 (GH9B18)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.05	1.0	0.96	0.07	0.12	0.02	0.02	0.01	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
AMTR_s00029p00139330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.161)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.45	0.0	0.6	0.45	0.54	0.57	0.21	0.2	0.16	0.4	0.35	0.59	0.3	0.2	0.32	0.42
AMTR_s00032p00131610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.91)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.25	0.55	0.31	0.93	0.74	0.79	0.89	0.17	0.18	0.17	0.19	1.0	0.12	0.09	0.08	0.07	0.26
AMTR_s00032p00143730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.104)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.28	0.31	0.0	0.14	0.16	0.64	0.47	0.45	0.06	0.06	1.0	0.65	0.41	0.09	0.04	0.0	0.78
AMTR_s00032p00143850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.105)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.25	0.0	0.17	0.17	0.68	0.48	0.4	0.09	0.13	1.0	0.6	0.52	0.47	0.03	0.06	0.85
AMTR_s00032p00220610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.227)	0.99	0.0	0.0	0.03	0.42	0.3	0.98	0.42	0.88	0.92	0.62	0.72	0.52	0.35	0.4	0.35	1.0	0.41	0.52	0.53	0.25	0.38
AMTR_s00033p00236820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.242)	0.0	0.0	0.18	0.01	0.06	0.51	0.09	0.27	0.39	0.2	0.56	0.56	0.05	0.05	0.05	0.08	1.0	0.29	0.11	0.04	0.12	0.14
AMTR_s00034p00237620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.121)	0.16	0.09	0.11	0.09	0.18	0.36	0.35	0.28	0.41	0.49	0.61	0.45	0.78	0.41	0.22	0.13	1.0	0.26	0.28	0.28	0.08	0.48
AMTR_s00036p00146430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.69)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.62	0.0	0.55	1.0	0.16	0.27	0.03	0.15	0.07	0.0	0.45	0.95	0.68	0.4	0.43	0.1
AMTR_s00037p00072620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.20)	0.0	0.0	0.0	0.49	0.24	0.0	0.15	0.61	0.24	0.18	0.35	0.64	0.85	0.11	0.19	0.1	1.0	0.37	0.93	0.38	0.11	0.68
AMTR_s00039p00161440 (SPT16)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.56	0.0	0.62	0.6	0.51	0.49	0.21	0.18	0.09	0.13	0.42	0.39	0.6	0.43	0.19	0.23
AMTR_s00039p00161570 (SPT16)	0.78	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.32	0.0	0.58	0.46	0.3	1.0	0.08	0.12	0.06	0.08	0.37	0.49	0.21	0.39	0.15	0.15
AMTR_s00044p00046900 (SUS6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.01	0.48	0.41	0.34	0.24	0.11	0.19	0.06	0.03	0.7	0.27	0.14	0.03	0.04	0.55
AMTR_s00044p00093650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.65)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.14	0.0	0.26	0.24	0.32	0.09	0.6	0.11	0.1	0.0	1.0	0.18	0.08	0.28	0.16	0.26
AMTR_s00045p00139940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.143)	0.06	0.0	0.06	0.0	0.16	0.51	0.32	0.42	0.64	0.53	0.63	0.41	0.07	0.08	0.07	0.01	1.0	0.17	0.08	0.02	0.08	0.14
AMTR_s00048p00184670 (CYCA2;4)	0.0	0.11	0.06	0.19	0.12	1.0	0.39	0.38	0.49	0.44	0.51	0.61	0.07	0.11	0.03	0.02	0.93	0.08	0.03	0.01	0.03	0.25
AMTR_s00049p00217900 (SOG1)	0.5	0.28	0.0	0.0	0.28	0.0	0.12	0.41	0.14	0.12	1.0	0.74	0.61	0.17	0.17	0.16	0.54	0.18	0.26	0.28	0.13	0.73
AMTR_s00050p00186430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.49)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	0.0	1.0	0.0	0.35	0.38	0.06	0.4	0.17	0.15	0.08	0.14	0.34	0.18	0.09	0.03	0.16	0.71
AMTR_s00057p00079210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.50)	0.29	0.0	0.53	0.0	0.14	0.0	0.24	0.68	0.42	0.23	0.55	0.64	0.42	0.07	0.09	0.14	1.0	0.15	0.17	0.21	0.16	0.42
AMTR_s00057p00131460 (BON)	0.3	0.72	0.43	0.04	0.36	0.01	0.37	0.13	0.43	0.4	0.57	0.55	0.68	0.49	0.3	0.36	1.0	0.33	0.35	0.23	0.28	0.7
AMTR_s00058p00166220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.150)	0.06	0.27	0.62	0.21	0.14	0.06	0.74	0.64	1.0	0.92	0.71	0.51	0.39	0.4	0.22	0.39	0.78	0.52	0.41	0.43	0.25	0.36
AMTR_s00061p00095500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.71)	0.36	0.38	0.68	0.01	0.2	0.02	0.66	0.43	1.0	0.91	0.52	0.47	0.22	0.13	0.11	0.21	0.67	0.56	0.47	0.21	0.33	0.12
AMTR_s00061p00184640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.208)	0.0	0.46	0.4	0.01	0.09	0.0	0.03	0.49	0.93	1.0	0.69	0.46	0.46	0.32	0.14	0.32	0.49	0.69	0.42	0.49	0.58	0.47
AMTR_s00065p00166970 (MEE13)	0.83	0.1	0.02	0.13	0.41	0.1	0.99	0.14	0.69	0.71	1.0	0.73	0.51	0.53	0.63	0.33	0.83	0.39	0.48	0.57	0.32	0.38
AMTR_s00065p00210290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.207)	0.04	0.0	0.0	0.07	0.13	0.01	1.0	0.46	0.8	0.81	0.41	0.38	0.17	0.23	0.08	0.11	0.45	0.83	0.64	0.26	0.66	0.07
AMTR_s00068p00201090 (TAF11)	0.75	1.0	0.08	0.07	0.61	0.37	0.81	0.53	0.43	0.49	0.91	0.81	0.73	0.63	0.48	0.36	0.53	0.69	0.78	0.77	0.39	0.68
AMTR_s00069p00030230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.14)	0.25	0.1	0.0	0.09	0.34	0.34	1.0	0.1	0.7	0.63	0.46	0.47	0.49	0.59	0.39	0.48	0.31	0.32	0.57	0.49	0.22	0.4
AMTR_s00074p00041920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.8)	0.23	0.11	0.04	0.24	0.12	0.52	0.59	0.01	0.44	0.51	0.94	1.0	0.67	0.39	0.51	0.16	0.88	0.58	0.31	0.11	0.02	0.92
AMTR_s00078p00151820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.128)	0.04	0.08	0.09	0.01	0.18	0.44	0.06	0.1	0.03	0.05	0.39	0.29	0.03	0.01	0.02	0.0	1.0	0.05	0.05	0.01	0.01	0.08
AMTR_s00080p00054810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.16)	0.09	0.0	0.0	0.01	0.09	1.0	0.36	0.09	0.46	0.36	0.31	0.31	0.1	0.13	0.05	0.04	0.77	0.09	0.05	0.02	0.04	0.13
AMTR_s00081p00088180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.30)	1.0	0.71	0.18	0.06	0.32	0.29	0.85	0.21	0.85	0.78	0.63	0.68	0.53	0.49	0.47	0.37	0.47	0.44	0.39	0.49	0.23	0.37
AMTR_s00083p00036180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.9)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.14	0.0	0.52	0.0	0.52	0.45	0.59	0.74	0.16	0.08	0.05	0.09	1.0	0.08	0.04	0.02	0.07	0.42
AMTR_s00085p00146350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00085.92)	0.36	0.0	0.11	0.02	0.14	0.55	0.02	0.25	0.57	0.23	0.55	0.82	0.12	0.02	0.05	0.06	1.0	0.1	0.07	0.05	0.09	0.17
AMTR_s00088p00108420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.74)	0.0	0.28	0.19	0.0	0.46	0.31	1.0	0.45	0.67	0.67	0.26	0.34	0.56	0.31	0.24	0.18	0.71	0.15	0.2	0.43	0.08	0.68
AMTR_s00092p00122190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.86)	0.32	0.42	0.0	0.01	0.14	0.0	0.65	0.39	0.67	0.63	0.28	0.26	0.79	0.45	0.35	0.21	0.97	0.34	0.34	0.81	0.45	1.0
AMTR_s00114p00109200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.44)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.54	0.0	0.08	0.15	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00121p00120770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00121.29)	0.36	0.0	0.0	0.3	0.13	0.0	1.0	0.0	0.5	0.36	0.6	0.45	0.37	0.27	0.13	0.15	0.32	0.59	0.69	0.56	0.35	0.26
AMTR_s00126p00116180 (CHR25)	0.0	0.0	0.39	0.06	0.3	0.03	0.42	0.0	0.42	0.43	0.54	0.51	0.48	0.32	0.25	0.18	1.0	0.09	0.05	0.24	0.04	0.37
AMTR_s00127p00033470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.8)	0.13	0.36	0.43	0.21	0.5	0.32	0.52	0.12	0.56	0.51	0.6	0.62	0.73	0.4	0.4	0.27	1.0	0.4	0.45	0.61	0.12	0.52
AMTR_s00128p00024350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00128.6)	0.62	0.07	0.03	0.11	0.22	0.3	1.0	0.0	0.76	0.63	0.57	0.51	0.54	0.62	0.26	0.35	0.52	0.39	0.43	0.36	0.32	0.38
AMTR_s00140p00036490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.9)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.96	0.28	0.0	0.68	0.83	0.27	1.0	0.2	0.29	0.08	0.0	0.38	0.16	0.07	0.01	0.0	0.45
AMTR_s00147p00086270 (MTHFR2)	0.39	0.68	0.51	0.15	0.22	0.27	0.41	0.1	0.54	0.55	0.8	0.69	0.75	0.42	0.36	0.46	1.0	0.44	0.38	0.22	0.2	0.92
AMTR_s00199p00036120 (PSF3)	0.05	0.25	0.0	0.12	0.36	0.0	0.37	0.49	0.32	0.3	0.63	0.66	0.39	0.19	0.13	0.22	1.0	0.38	0.36	0.14	0.08	0.43
AMTR_s00280p00015410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00280.1)	0.0	0.0	0.0	0.1	0.25	0.0	0.1	0.4	0.5	0.64	0.56	1.0	0.26	0.26	0.28	0.07	0.82	0.24	0.4	0.18	0.08	0.28
AMTR_s03551p00001840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03551.1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.25	0.0	0.47	0.6	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	1.0	0.56	0.43	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)