Heatmap: Cluster_139 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
1.37 -1.04 1.85 1.2 0.63 1.57 -0.33 -4.22 -4.11 -3.81 -3.89 -5.85 - 0.66 -1.61 -0.16 -0.02 0.07 0.2 -0.18 0.07 0.73 -0.54 0.3 0.68 -0.07 0.24 0.73 0.91 -1.73 0.01 -3.19 -0.45 -1.37 0.97 -1.5 -3.69 -3.51 0.78 0.37 -0.82 -0.2 -0.92 -0.55
0.46 0.7 0.2 -0.21 -7.43 -0.27 -1.61 -0.96 -1.04 -1.25 -1.25 -3.57 -1.75 0.31 -0.58 0.12 -0.02 0.39 0.13 -0.16 -0.07 0.78 0.25 0.64 -0.19 -0.75 0.31 0.36 0.42 -4.93 0.12 -0.92 -0.26 -0.51 -0.72 2.61 -1.81 -0.96 0.52 0.62 -1.44 0.24 0.51 -0.1
-0.26 -0.23 0.58 0.68 -5.51 -0.09 -1.6 0.01 -1.19 -1.14 -1.03 0.63 0.0 0.1 -0.06 -0.29 -0.27 0.39 0.05 -0.03 0.66 -0.71 -0.46 0.01 -1.08 -0.51 0.88 0.62 0.41 -1.32 0.3 -0.87 -0.01 -0.4 1.14 1.79 -1.25 -0.63 0.4 -0.26 -0.51 -1.65 -0.13 0.53
-0.16 0.76 -1.55 -1.62 0.62 -1.59 -1.01 0.85 1.28 1.2 1.47 -2.99 -2.04 0.46 2.77 -1.04 -1.49 -1.08 -0.88 -0.43 0.15 -0.47 0.27 -0.9 -1.85 -1.71 -0.89 -1.22 -1.76 - 0.44 -0.98 0.74 1.71 -2.39 -0.62 -2.74 -1.92 -1.04 -2.04 -0.36 -0.51 0.17 0.16
0.43 0.91 0.45 -0.24 0.12 0.16 -0.49 -0.23 0.27 0.63 0.75 -1.54 0.64 0.45 0.66 -0.54 -0.84 -0.57 -0.12 -0.29 0.3 -0.02 -0.1 0.17 0.22 -0.32 -0.34 -0.41 0.25 -5.29 0.17 -0.82 0.05 1.15 -1.28 0.32 -0.93 -1.41 -0.27 0.37 -1.47 -0.34 -0.09 0.18
0.68 1.27 1.39 0.61 1.37 1.03 -0.35 -1.02 -1.1 -0.91 -0.55 -2.35 -1.53 0.37 -0.67 0.25 0.04 -0.18 -0.05 -0.29 0.1 0.96 -0.0 0.05 0.7 -0.95 -0.32 -0.06 0.43 -2.66 -0.17 -1.66 -0.45 0.56 -0.39 -1.2 -2.09 -2.37 -0.21 -0.04 -0.52 0.28 -0.58 -0.01
AT1G17060 (SOB7)
2.49 2.05 2.79 -0.79 - 1.97 -3.41 -0.79 -0.92 0.06 -1.78 -1.87 -1.31 -2.02 -4.12 -2.45 -2.46 -3.52 -6.73 -4.46 0.85 -1.83 -2.11 -1.51 0.41 -1.9 -0.97 -0.21 -4.87 - -0.43 -0.97 -0.97 -1.77 -2.19 1.5 -1.73 -1.65 -1.8 0.06 -0.63 -1.66 -0.36 2.12
0.63 -0.55 -0.32 1.15 0.67 0.98 -0.97 -1.87 -0.5 -0.16 -0.03 -1.79 0.95 -1.04 0.1 0.99 0.87 0.89 0.12 -0.38 0.19 0.63 -0.48 -0.35 -0.36 -0.19 0.37 0.58 0.14 -4.11 -0.95 -1.81 -1.1 0.42 0.21 0.29 -2.04 -3.2 0.38 0.38 -0.8 0.13 -0.97 -0.73
-0.95 1.83 -0.22 0.86 -3.45 -1.62 -1.1 1.03 2.41 2.58 2.48 -3.11 -4.39 -2.35 -0.14 -4.02 -3.88 -3.18 -1.43 -1.17 -2.11 0.33 -0.82 -2.49 -1.42 0.74 -0.61 -2.93 -1.63 2.11 -1.23 -2.3 -0.63 -2.59 -4.47 -1.84 -0.86 -1.74 -3.89 -1.26 -0.75 -1.84 -0.53 -0.32
1.84 1.01 2.17 0.77 -6.92 2.27 -0.14 -3.06 -5.51 -5.77 -5.93 -5.55 - -1.44 -4.35 -0.95 -0.88 -0.71 -0.4 -0.4 -0.69 1.36 -0.53 -1.13 -0.21 0.29 -0.54 -0.78 0.53 0.62 0.05 -5.24 -0.41 -2.82 1.54 0.71 - -5.93 -0.59 0.48 -0.9 0.48 0.03 -1.14
-0.3 -0.47 -0.03 -0.3 2.24 -0.65 -1.32 -0.69 -0.13 -0.18 -0.12 -2.33 -0.02 -0.39 0.54 -0.38 -0.41 0.11 -0.23 -0.33 0.24 0.83 -0.04 0.8 0.51 0.89 0.18 -0.05 0.44 -5.86 -0.74 -2.79 -1.19 0.22 0.36 1.52 -4.71 -4.51 -0.28 -0.5 -1.23 -0.32 0.49 -0.44
0.55 0.07 1.1 0.54 2.74 0.7 -1.41 -1.65 -1.21 -1.25 -1.05 -4.16 -1.12 0.56 -0.1 -1.01 -0.61 -0.19 0.22 -0.3 0.33 -0.62 -0.16 0.72 0.3 -0.85 0.55 0.67 0.75 -4.01 0.32 -2.1 -0.01 -0.43 -1.6 0.42 -2.24 -2.36 0.67 -0.15 -1.92 -1.87 -0.64 -0.6
-0.48 0.78 -1.68 -3.59 -0.66 -3.89 -0.39 -0.99 -0.18 -0.0 0.44 1.49 -0.12 0.63 0.21 0.45 0.45 0.53 0.38 0.41 0.89 -1.65 0.76 -0.12 0.17 -0.7 0.37 0.53 -0.42 -7.45 -0.02 -1.31 0.25 1.39 -0.37 0.82 -2.04 -2.17 0.46 -0.72 -0.45 -2.65 -1.34 0.3
AT1G49820 (MTK)
0.92 0.54 0.26 0.69 -0.67 0.68 -0.5 -0.06 0.23 0.19 0.34 -5.32 -1.07 0.09 1.55 -0.04 -0.0 0.12 0.13 -0.23 0.96 0.24 -0.02 -0.6 -0.16 -1.44 0.13 0.16 -0.02 - -0.01 -2.12 -0.17 -0.12 0.41 -0.03 -2.52 -2.44 0.18 0.0 -1.32 0.09 0.4 0.02
-0.23 -1.18 -0.4 1.02 -1.32 0.05 -0.36 -1.26 -0.47 -1.01 -0.93 -4.58 - -0.12 0.61 -0.11 0.13 0.62 0.88 0.35 0.61 0.35 -0.14 -0.3 -0.8 -2.02 0.83 0.94 -0.12 - 0.47 -1.6 0.56 -0.66 0.8 2.2 -2.0 -2.12 0.81 -0.37 -1.03 0.31 0.0 -0.92
0.87 -0.01 1.36 0.45 1.72 0.78 -0.67 -1.85 -2.35 -2.05 -1.71 -2.73 -6.14 -0.58 -1.81 -1.16 -1.14 -1.12 -0.73 -1.21 -0.46 1.63 -1.21 1.54 1.32 0.7 -0.71 -0.54 1.37 1.46 -0.53 -2.58 -0.95 -1.28 -1.47 1.29 -2.97 -2.66 -0.51 -0.32 -1.4 -0.02 -0.76 -0.33
0.06 1.43 1.24 0.61 2.69 -0.16 -2.66 -0.64 -0.19 -0.17 -0.34 -2.9 -3.22 -0.08 -0.54 -0.33 -0.67 -0.36 0.85 -0.18 -0.19 0.51 -0.74 -0.02 -0.31 0.02 0.41 -0.02 -1.17 0.48 -0.94 -3.76 -1.06 -1.28 0.32 0.64 -2.94 -5.29 -0.43 -0.76 -0.73 -1.14 -0.12 0.34
-0.05 -0.39 0.0 0.9 - 0.28 -1.56 0.16 -0.06 0.1 -0.39 - -2.48 -0.09 0.72 0.14 -0.07 0.34 -0.36 -0.39 -0.15 0.54 -0.86 -0.84 -0.48 -0.74 0.63 0.31 0.72 -4.01 -0.29 -0.97 -0.57 -0.81 0.47 2.68 0.17 -1.12 -0.05 -0.16 -0.93 0.45 -0.89 -0.33
-0.66 -2.07 -0.16 0.5 - -0.5 -0.02 -2.29 -2.64 -3.62 -4.02 -4.09 -6.87 0.9 -0.07 -0.35 0.02 0.73 1.11 0.72 0.25 0.3 0.13 0.17 0.03 -1.47 1.07 1.02 0.37 -5.15 0.73 -4.81 1.11 -2.4 0.58 2.21 - -5.06 1.02 -0.02 -0.21 0.07 0.37 -0.79
1.49 1.16 2.57 -1.22 -3.23 1.07 -3.2 -1.35 -6.55 - -7.82 - -6.73 0.48 -3.55 0.64 0.21 -0.18 0.36 -0.26 0.65 0.74 -1.61 2.24 2.08 -0.28 0.06 0.05 -1.2 - 0.22 - -0.9 -7.03 -5.37 -1.09 -4.68 - 0.47 -1.45 -0.54 -2.37 0.11 -0.25
AT2G02350 (SKIP3)
-0.2 1.76 0.4 1.09 - 0.43 -2.13 -1.19 0.93 0.83 1.29 -2.25 -0.09 -0.41 -0.21 -0.3 -0.46 -0.25 -0.29 -0.85 -0.42 0.06 -1.66 -1.54 -2.1 -0.25 -0.29 0.14 -1.93 0.09 -0.57 -1.61 -1.23 -1.24 0.77 2.71 -0.22 -1.37 -0.01 -1.02 -1.51 -0.85 -1.04 -0.65
-0.27 -0.94 -1.05 0.05 - -0.48 -1.15 -0.61 0.64 0.59 0.67 -5.16 -3.93 -0.44 0.93 -0.4 -0.05 0.12 0.09 -0.36 0.21 1.14 -0.57 -0.58 -0.76 1.1 0.75 0.84 0.25 -8.42 -0.09 -0.34 -0.29 0.69 -0.95 2.01 -0.52 -0.64 0.87 -0.42 -1.49 0.04 -0.81 -0.8
-0.21 0.02 0.29 -0.26 3.45 -0.35 -2.13 -1.03 0.01 0.35 -0.08 -0.31 -1.24 -0.38 -0.33 0.14 0.36 0.6 -0.04 -0.78 -0.36 -0.67 -1.3 -0.8 -0.48 -0.08 0.51 0.24 -1.32 -2.64 -1.2 -1.03 -1.06 0.33 -0.09 0.58 -1.75 -1.66 0.06 -0.53 -2.49 -1.43 -1.03 -1.16
-0.59 0.37 -0.07 -0.21 - -0.52 -1.03 0.17 1.12 1.33 1.13 -0.57 1.64 -0.34 0.9 -2.27 -1.57 -1.36 -1.0 -0.85 0.27 0.3 -0.31 0.04 -0.78 -0.48 -0.28 -0.62 -0.82 -2.01 -0.34 -0.44 -0.12 1.16 -0.86 2.03 -0.49 -0.98 -0.56 -0.48 -1.39 -0.74 0.08 -0.35
0.65 0.12 0.63 1.29 -0.06 0.98 -0.67 -0.74 -0.35 -0.35 -0.36 -4.44 -8.59 0.25 0.22 -0.34 0.08 0.57 0.8 0.41 0.09 -0.65 0.45 0.46 0.02 -1.38 0.67 0.35 -0.18 -4.71 -0.06 -0.72 -0.04 -0.07 0.16 0.23 -1.23 -0.82 0.14 0.58 -0.48 -0.84 -0.02 -0.36
AT2G27470 (NF-YB11)
0.06 -2.72 -1.54 0.36 -9.31 -0.29 -1.94 -3.57 -3.3 -3.52 -3.44 -4.18 -6.34 -0.14 -0.7 0.79 1.2 1.57 0.82 0.1 -0.68 -0.45 -0.9 -1.13 -1.09 -0.9 0.78 1.25 -0.32 -9.34 0.18 -1.04 -0.57 -2.96 0.63 3.28 -2.6 -1.17 1.1 0.97 -1.48 -1.59 -0.55 -1.73
-1.54 -2.57 -1.72 -0.96 -5.34 -1.14 -0.89 -0.14 -0.49 -0.34 -0.54 -4.52 -3.74 -0.08 0.64 -0.77 -0.4 -0.01 0.06 -0.09 0.73 1.64 0.52 0.7 -1.37 -0.89 0.37 -0.03 -0.26 -8.45 0.67 -0.48 -0.09 1.08 -0.63 2.62 -0.39 -0.91 0.99 -0.28 -1.38 0.9 -0.84 -0.63
0.98 1.05 2.15 0.17 1.45 1.12 -0.3 -1.39 -1.45 -0.96 -1.98 -3.33 -2.54 -1.44 -0.72 -2.01 -1.5 -1.07 -1.48 -1.04 -1.83 0.6 0.52 2.45 2.09 0.24 -1.56 -2.29 -0.6 0.27 -0.99 -3.3 -0.3 -1.48 -1.85 -0.99 -4.26 -3.8 -2.99 -0.04 -0.9 -1.0 -0.08 0.73
-0.87 -1.65 -0.92 -0.03 1.13 -0.54 -0.66 -2.12 -2.57 -2.95 -2.94 -0.64 -3.43 -0.32 -0.84 0.32 0.28 0.63 0.56 0.42 0.32 -0.54 -0.15 -1.03 -1.04 -1.38 0.84 1.17 -0.1 - -0.13 -3.1 -0.34 -1.96 0.75 3.19 -2.54 -3.63 0.65 0.21 -0.17 -0.55 -0.02 -0.09
AT2G43940 (HOL3)
1.34 1.5 1.68 1.23 -4.55 1.38 -2.28 -1.02 -0.46 -0.38 -0.53 -4.64 - 0.11 0.93 -0.22 0.35 0.18 -0.13 -0.6 0.03 0.59 -0.31 -0.09 0.36 -1.77 -0.06 0.41 0.44 -5.83 0.33 -2.5 -0.14 -0.57 -0.92 -1.26 -5.43 -2.84 0.7 0.19 -0.85 -0.19 -1.33 0.55
0.09 -0.8 0.4 0.52 0.6 0.4 -0.6 -1.36 -1.02 -1.63 -1.65 -4.43 -2.09 -0.42 -1.12 0.55 0.75 1.06 0.67 -0.03 0.34 0.5 -0.7 -0.15 -0.48 -0.74 1.14 1.45 -0.04 - 0.12 -1.94 -0.4 -1.84 0.77 1.3 -3.29 -2.07 1.35 0.02 -1.04 0.01 0.18 -0.29
0.72 -0.81 -0.12 1.33 0.55 0.92 -0.89 -0.85 -0.34 -0.19 -0.4 -2.94 -2.04 -0.38 -0.02 0.31 0.32 0.52 0.6 0.02 -0.34 0.41 -0.21 -0.09 -0.35 -1.09 0.62 0.44 0.2 -5.83 -0.06 -0.99 -0.47 -0.0 0.73 1.52 -1.88 -1.56 0.22 0.51 -1.17 -0.08 -0.6 -0.51
AT2G45330 (emb1067)
0.68 1.89 0.49 -0.18 -4.22 -0.32 -1.26 0.9 0.13 0.32 0.65 -1.78 -1.03 -0.47 0.41 -1.08 -0.93 -0.44 -0.69 -0.77 0.07 0.3 -0.21 -0.31 -0.9 -0.58 -0.15 -0.31 -0.16 -0.79 -0.34 -0.89 -0.53 0.58 -0.55 1.91 -0.57 -1.35 -0.44 0.19 -0.59 0.39 -0.46 0.7
AT2G45400 (BEN1)
2.36 1.53 2.28 -0.47 - 1.26 -2.43 -2.56 -2.14 -3.47 -3.3 -1.5 0.99 -0.13 -9.3 -2.94 -2.3 -1.53 -2.17 -1.47 -1.75 -2.64 -2.63 0.28 -2.98 0.55 -0.74 -0.96 0.99 - 0.01 -4.52 -1.13 -6.12 -0.31 2.59 -7.54 -6.42 -2.4 1.08 0.45 -1.84 -0.09 1.56
-0.16 -0.43 0.19 0.94 1.22 0.26 -0.91 0.09 -0.21 -0.28 -0.24 -2.36 -2.33 -0.01 -0.24 -0.04 0.32 0.6 0.22 -0.14 0.06 0.81 -0.47 -0.31 -0.75 -0.94 0.51 0.37 -0.42 -1.73 -0.05 -0.45 -0.3 -0.57 -0.22 1.11 -0.43 -0.28 0.23 0.31 -0.39 0.34 0.07 0.17
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AT3G27380 (SDH2-1)
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AT5G15440 (EDL1)
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0.48 1.68 0.52 -0.16 -0.56 -1.32 -1.54 0.95 0.24 0.5 0.61 0.38 -0.68 0.03 0.48 -1.21 -0.93 -0.07 -0.09 -0.66 -0.13 -0.24 -0.26 -0.2 -0.73 -0.53 0.25 -0.18 -0.04 -0.46 -0.27 -0.45 -0.38 0.58 0.08 1.01 -0.01 -1.33 -0.13 0.23 -1.67 -0.18 -0.31 -0.25
AT5G40650 (SDH2-2)
0.73 0.65 1.15 0.76 1.21 1.09 -0.66 -1.13 -0.88 -0.4 -0.2 -2.62 0.18 0.13 -0.27 -0.07 -0.02 -0.27 -0.08 -0.43 0.09 0.54 -0.09 0.2 0.58 -0.29 -0.24 -0.19 0.57 -1.95 -0.2 -1.88 -0.43 0.84 -0.3 0.65 -3.23 -3.6 -0.04 0.37 -1.09 -0.41 -0.8 -0.29
1.44 1.81 1.64 -0.22 1.08 0.24 -3.29 -3.95 -4.3 -4.05 -2.97 -4.51 -2.33 -0.75 -1.48 0.07 0.12 0.16 -0.78 -1.42 -0.64 0.23 -1.1 -0.47 0.04 1.05 -0.08 0.19 -0.03 1.25 -0.5 -2.84 -1.41 0.9 -1.72 0.91 -8.61 -6.21 0.44 1.51 -0.41 -1.88 -1.3 1.16
-0.14 -0.74 -0.84 0.74 -1.01 0.18 -0.63 -0.8 0.14 -0.05 -0.16 -3.09 -3.4 -0.2 0.73 0.07 0.36 0.69 0.82 0.4 0.22 0.72 0.01 -0.25 -1.17 -0.51 1.18 1.04 -0.2 -6.27 -0.1 -0.2 -0.28 -1.49 0.83 -0.05 -0.34 -0.1 0.84 0.05 -1.4 0.52 -0.14 -0.58
AT5G47650 (NUDT2)
-1.55 -0.91 -0.56 -0.86 2.48 -0.67 -0.18 0.52 0.68 0.87 0.5 2.02 1.48 -0.18 0.56 -0.83 -0.8 -0.39 -0.81 -0.99 -0.29 -2.12 -0.25 -0.72 -1.61 -2.35 -0.57 -1.62 -0.62 -5.75 -0.02 -0.79 0.19 -0.06 -0.69 1.52 -0.25 -0.8 -1.14 -1.33 -0.98 -2.4 0.28 -1.44
AT5G60620 (GPAT9)
0.58 0.55 0.99 0.23 1.81 0.1 -0.9 -0.22 -0.15 -0.17 -0.0 -2.68 -4.49 0.56 0.66 -0.43 -0.06 0.05 -0.11 -0.31 -0.13 0.78 0.01 0.4 0.38 -0.84 0.14 -0.0 -0.02 -2.32 -0.04 -1.21 -0.04 0.31 -0.23 -1.27 -1.45 -1.66 -0.15 0.06 -0.39 0.15 -0.73 0.38
0.48 -1.05 -0.33 0.59 0.75 0.34 -0.04 -1.16 -0.53 -0.24 -0.12 -2.18 0.06 -1.01 0.02 0.54 0.49 0.83 0.48 0.06 0.3 0.79 0.03 -0.1 -0.17 -0.31 0.37 -0.01 -0.14 -4.25 -0.33 -0.85 -0.27 1.03 0.74 0.23 -1.57 -1.45 -0.08 -0.04 -0.68 0.65 -0.48 -0.52

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.