Heatmap: Cluster_331 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.45 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
2.88 2.86 1.76 0.68 0.98 0.99 7.08 0.0 0.59 0.16 2.57 5.13 38.62 1.8 0.22 1.15 52.2 0.0 0.0 0.2 0.0 0.9 28.54 9.72 49.22 6.33 9.74 0.16 0.56 0.3 0.0 0.0 2.49
0.0 0.0 0.01 0.12 0.04 0.0 0.05 0.27 0.22 0.93 0.15 1.12 67.23 1.56 0.05 0.0 31.42 0.03 0.0 0.18 0.11 5.56 5.33 8.5 47.94 10.77 10.98 3.7 0.15 0.26 0.74 7.12 1.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 14.73 0.0 0.0 0.05 13.43 0.15 0.09 0.0 0.0 0.23 12.83 0.74 36.08 0.14 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.0 0.04 0.5 0.77 0.04 0.02 1.45 7.39 0.24 1.3 1.22 25.48 0.14 0.0 0.0 23.2 0.0 0.05 0.02 0.02 0.01 1.17 0.04 29.14 1.69 1.97 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
1.12 1.41 0.46 0.65 0.74 0.0 3.04 0.89 1.72 0.06 19.52 6.09 3.54 21.69 3.92 2.53 15.94 25.58 6.46 8.54 5.14 10.85 3.44 2.52 4.5 4.82 5.54 13.49 14.35 14.53 11.96 14.15 16.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.02 0.03 0.11 0.03 0.08 0.05
0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.29 0.17 0.0 0.0 0.07 0.0 0.31 0.08 0.33 0.07 0.07 0.17 0.07 0.0 0.0 0.05 0.03 0.23 0.21 0.45 0.11 0.28 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.11 0.06 0.0 6.05 0.1 36.65 0.0 0.0 2.17 20.81 1.64 3.34 1.51 3.05 0.85 2.51 1.45 42.45 2.3 5.02 0.14 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08
0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.18 0.05 1.34 0.0 0.58 0.16 1.03 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 2.36 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.12 0.14 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.14 0.05 0.14 0.04 0.05 0.21 0.02 0.1 0.05 0.02 0.46 0.05 0.05 0.18 0.05 0.2 0.11 0.12 0.1 0.0 0.0 0.58 0.38 0.53 0.32 0.32 0.5
0.23 0.21 0.05 0.02 0.02 0.0 1.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.76 0.0 0.0 0.0 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.93 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 7.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.1 1.7 1.31 0.8 0.64 1.04 1.19 0.75 1.65
0.79 1.33 0.65 0.58 0.34 0.21 0.57 0.03 0.02 0.18 0.2 0.21 0.64 1.13 0.22 0.0 2.18 0.1 1.1 0.0 0.05 0.56 5.44 1.95 0.05 0.53 0.51 1.42 4.91 3.78 1.49 1.2 3.71
0.05 0.06 0.0 0.04 0.01 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.21 0.0 0.46 0.58 0.0 0.44 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.2 0.08 0.1 0.05 0.04 0.16 0.52 0.54 0.14 0.26 0.77
0.77 0.79 0.57 0.39 0.82 0.34 1.59 0.99 1.05 0.23 0.78 2.39 2.08 1.58 2.72 0.52 4.43 1.34 1.01 0.58 1.22 1.48 0.88 1.87 1.87 0.45 0.13 0.54 1.54 1.1 1.51 1.08 0.77
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.05 0.03 0.26 0.29 0.27 0.1 0.08 0.56
0.07 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 170.63 2.38 0.0 0.0 113.07 0.0 0.0 0.0 0.0 10.89 10.31 0.24 121.27 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.05 0.19 0.31 0.24 0.1 0.05 0.03 0.01 0.31 3.41 1.6 0.45 1.3 0.14 0.83 3.1 0.35 1.2 0.31 0.96 2.22 0.31 0.06 1.01 0.19 0.16 2.4 1.96 3.27 2.33 2.84 2.97
10.01 8.81 4.95 3.26 1.02 0.97 6.88 0.24 0.81 0.34 0.29 0.0 14.69 0.38 0.12 0.29 10.35 0.05 0.19 0.0 0.05 0.08 0.09 0.02 26.8 0.66 0.6 0.41 0.18 0.29 0.21 0.35 0.52
0.25 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 5.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.44 2.85 0.04 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.02 0.11 0.17 0.18 0.09 0.05 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.05 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.05 0.58 0.38 0.49 0.48
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.21 0.96 0.24 0.02 0.78 0.03 0.0 0.11 0.05 0.41 0.26 0.32 0.15 0.02 0.01 0.27 0.16 0.15 0.36 0.12 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.17 0.13 0.19 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.12 0.17 0.25 0.21 0.06 0.09 0.26 0.09 0.09 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.09 0.02 0.07 0.05
0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.92 0.0 0.0 0.18 4.75 0.0 0.0 0.18 0.28 0.0 0.0 0.0 7.8 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 2.19 0.0 0.0 0.23 1.35 0.0 0.0 0.4 0.64 0.48 0.0 0.0 2.83 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 2.66 0.12 12.75 0.0 0.12 0.54 12.07 1.87 0.26 0.07 0.44 0.89 3.59 0.1 22.76 0.12 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.43 0.77 1.16 0.28 0.55 0.0 0.61 0.07 0.2 0.0 0.17 0.0 0.07 0.0 0.0 1.33 0.0 0.16 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.9 2.76 2.89 1.06 1.01 4.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.07 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.2 0.16 0.3 0.0 0.04 0.21 0.04 0.09 0.08 0.1 0.07 0.08 0.05 0.02 0.09 0.0 0.04 0.1
8.31 6.55 4.54 2.45 0.89 0.54 14.59 0.43 0.67 0.14 0.0 0.0 14.56 0.0 0.0 0.0 9.53 0.0 0.4 0.0 0.0 0.25 0.09 0.0 27.64 0.53 0.48 0.39 0.2 0.25 0.24 0.16 0.21
1.03 0.52 0.38 0.17 1.04 0.24 0.6 0.76 0.81 0.04 0.84 1.41 0.33 0.84 0.26 0.38 1.96 1.49 0.26 0.38 0.25 0.19 5.75 0.34 0.27 0.38 0.26 1.35 2.16 1.71 1.88 2.47 2.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.52 0.0 8.34 0.0 0.26 0.18 5.2 0.05 0.16 0.16 0.05 0.0 0.71 0.0 7.8 0.01 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.05 0.07 0.05 0.0 0.01 0.0 0.26 0.05 0.04 0.0 0.32 0.43 0.45 0.31 0.0 0.0 0.45 0.0 0.26 0.0 0.09 0.28 0.29 0.0 0.62 0.0 0.0 0.02 0.05 0.21 0.0 0.12 0.11
2.18 1.06 2.94 4.46 2.72 1.45 40.78 3.49 2.25 1.07 17.29 52.04 161.62 19.39 4.57 5.3 72.71 8.28 11.63 5.03 9.44 81.28 46.26 55.42 138.52 18.16 20.88 12.17 8.24 13.29 13.19 15.18 14.19
1.34 1.53 0.37 0.5 0.4 0.79 1.22 0.28 1.1 0.29 1.48 3.8 1.16 1.32 0.77 1.13 2.8 1.89 1.34 1.37 1.26 2.37 0.97 0.52 3.22 0.86 1.02 1.75 1.77 3.65 2.35 2.13 3.88
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.88 0.03 0.17 0.5 0.09 0.2 0.1 0.07 0.0 0.02 0.24 0.15 0.0 0.07 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 8.08 0.43 28.01 0.43 0.14 2.55 13.56 2.55 1.81 1.12 2.48 0.4 1.48 0.0 13.68 0.26 0.32 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 0.19 1.23 0.54 0.31 0.13 0.23 0.01 0.0 0.0 0.38 0.0 2.35 0.02 0.0 0.34 2.08 0.3 0.28 0.02 0.23 0.42 0.53 0.0 2.41 0.08 0.46 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 52.18 0.0 0.0 0.0 78.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 78.77 11.87 9.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.16 0.6 0.34 0.3 0.09 0.09 0.19 0.1 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.42 0.0 0.2 0.73 0.81 0.21 0.15 0.28 0.38 0.31 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 1.45 0.05 5.63 0.0 0.1 0.38 2.22 1.46 0.96 1.3 0.6 0.03 0.15 0.04 3.08 0.11 0.22 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)