Heatmap: Cluster_233 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
1.0 0.34 0.63 0.15 0.9 0.79 -0.43 1.14 0.93 0.15 -0.71 -0.89 -0.9 -1.24 -0.88 -0.38 -0.72 -0.43 -0.03 -0.8 -0.14 -1.63 -1.31 -1.24 -0.79 -0.06 -0.11 0.29 0.28 0.13 0.17 0.04 -0.01
1.71 0.2 1.38 0.45 1.24 0.74 -0.13 1.22 1.5 0.35 -1.48 0.05 -1.73 -0.27 -1.43 -1.93 -1.1 -2.91 -2.37 -2.08 -2.16 -0.28 -0.25 -1.62 -0.47 -0.32 -0.07 -0.71 -0.4 -0.16 -0.73 -0.72 -0.18
0.81 -1.3 0.87 1.2 3.16 -1.14 1.24 1.68 1.34 -2.63 -1.29 -0.73 -1.41 -0.72 0.14 -0.65 -1.56 -2.36 -1.43 -3.24 -1.46 -0.15 -1.52 -2.4 -0.05 -5.05 -5.67 -1.9 -2.44 -2.13 -1.85 -2.02 -1.81
1.47 0.96 1.51 1.23 2.15 0.44 -3.33 1.51 1.66 1.12 -2.83 -3.67 -4.07 -3.56 -3.91 -4.0 -1.21 -3.18 -4.98 -4.52 -7.43 -2.65 -1.0 -4.03 -4.21 -0.74 -0.63 0.06 0.22 -0.23 0.09 -0.15 -0.24
1.93 1.43 2.38 1.73 2.45 0.41 - 1.94 1.45 1.15 - - -6.65 - - - -2.02 -5.52 - -4.69 - -6.69 - - - -2.94 -3.28 -1.72 -1.37 -2.31 -1.59 -1.51 -1.83
-0.1 -0.52 0.96 0.95 1.04 0.93 -1.05 0.49 0.53 0.67 -0.72 -0.46 -1.02 -0.88 -0.21 -0.77 -0.93 -0.82 -0.33 -0.63 -1.0 -0.45 -0.47 -0.8 -0.12 0.18 0.09 0.14 0.14 0.17 0.3 0.08 -0.02
1.66 -1.28 1.57 0.73 1.93 -0.66 1.39 2.15 1.43 -0.88 -2.65 -2.02 -2.76 -3.45 -0.64 -5.35 -0.72 -5.19 -4.29 -5.35 -4.32 -0.68 -1.52 -1.16 -0.55 -2.49 -1.61 -0.03 -0.36 -0.16 0.33 -0.39 -0.48
0.11 -0.75 0.08 -0.25 0.67 0.37 0.18 0.56 0.55 -0.16 0.07 0.26 -0.36 -0.06 0.1 0.11 -0.8 0.29 0.09 0.12 0.13 0.05 -0.43 0.06 0.02 -0.42 -0.46 -0.29 -0.04 -0.12 -0.38 -0.4 -0.25
1.12 -0.48 1.2 0.56 1.95 -0.46 0.88 1.23 1.28 -0.78 -0.73 -0.04 -1.1 -0.04 0.62 -0.69 -1.97 -0.56 -0.91 -0.57 -1.13 -0.33 -1.28 0.63 -0.29 -0.93 -1.22 -1.41 -1.47 -1.54 -1.47 -0.98 -1.76
0.9 0.68 0.81 0.32 0.63 0.18 0.07 0.74 0.43 0.43 -0.64 0.19 -0.32 -0.53 -0.78 -0.32 -1.51 -0.98 -0.71 -0.24 -0.57 -0.23 -6.92 -0.7 -0.49 0.04 0.16 -0.03 0.35 0.18 0.06 -0.26 0.28
1.43 0.48 1.03 0.58 1.1 -0.88 0.93 0.71 0.43 -0.32 -1.11 0.04 -0.38 -0.86 -0.34 -1.22 -1.09 -1.22 -0.75 -0.45 -0.38 0.05 -0.33 -0.18 0.26 -0.73 -0.77 -0.43 0.01 -0.19 -0.45 -0.66 -0.17
0.03 -0.36 0.15 -0.04 0.86 0.66 0.36 1.03 0.84 0.39 -0.22 -0.11 -0.31 0.08 -0.77 0.01 -0.52 -0.04 -0.51 -0.32 -0.36 0.04 -0.26 -0.69 -0.29 -0.22 0.05 -0.56 -0.22 -0.17 -0.31 -0.24 -0.27
1.06 -1.9 1.71 1.48 2.61 -0.97 2.11 0.46 0.51 -3.07 -6.65 0.41 0.19 -1.85 - - 0.35 - - - - 1.75 -1.96 -1.18 0.9 -3.43 -2.28 -4.97 -6.57 -6.29 - -6.12 -1.41
1.24 1.5 - - 1.37 1.47 0.25 1.7 0.88 0.82 - - - - 1.27 - 0.08 2.71 - -0.05 -0.01 0.03 - - - -3.25 -1.48 - - -0.95 -1.17 - -
0.09 -0.71 0.8 0.82 0.87 0.62 1.07 0.63 0.32 0.14 0.19 0.26 -1.74 -0.83 0.42 0.13 -1.83 1.14 0.22 0.61 0.48 -1.21 -2.37 -1.76 -1.54 -2.86 -2.41 -0.59 -0.28 -0.16 -0.55 -0.57 -0.1
0.66 0.27 0.61 0.23 0.7 0.71 0.3 0.64 0.46 0.1 -0.39 -0.02 -1.22 -0.33 -0.5 -0.72 -1.09 -0.46 -0.81 -0.55 -0.59 -0.24 -0.62 -1.46 -0.7 -0.03 -0.09 0.06 0.46 0.36 0.14 -0.11 0.55
0.9 0.28 0.73 0.9 0.86 1.38 0.53 1.41 0.38 0.07 -1.57 -0.69 -1.34 -1.93 -0.56 -1.22 -0.65 -0.98 -1.52 -1.14 -1.33 -1.2 -1.45 -0.32 -0.78 -1.11 -0.95 0.43 0.44 0.13 0.34 0.25 0.07
0.49 0.07 0.55 0.19 0.34 0.08 -0.08 0.57 0.43 0.19 -0.12 -0.21 -0.11 -0.39 -0.22 0.01 -0.74 0.04 -0.06 0.12 0.19 -0.05 0.3 -0.85 0.04 -0.61 -0.67 -0.12 0.1 -0.08 -0.3 -0.38 -0.06
0.56 0.07 0.3 -0.22 0.66 0.8 -0.17 0.94 0.9 0.22 0.03 -0.37 -1.06 -0.55 -0.46 -0.22 -0.56 -0.54 -0.63 -0.5 -0.66 -0.69 -0.77 -1.2 0.13 -0.17 -0.04 0.17 0.34 0.29 0.1 -0.22 0.28
0.66 -1.35 1.38 0.09 2.16 0.91 0.95 1.56 0.61 -0.63 -0.19 -0.09 -2.31 -1.52 -2.01 -0.61 -1.81 -3.67 - -2.62 -3.81 -0.57 -0.32 -4.0 -1.97 -0.81 -0.77 0.68 0.21 -0.16 0.51 0.28 -0.24
0.65 0.23 0.6 0.34 0.76 0.56 0.22 1.0 0.81 0.13 -1.11 -0.14 -0.39 0.04 -0.9 -1.23 -0.64 -0.74 -1.19 -1.58 -0.88 -0.12 0.06 -0.27 -0.22 -0.12 0.02 -0.17 0.28 0.23 -0.18 -0.4 0.15
-0.11 -0.39 0.17 0.25 0.7 0.44 0.25 -0.08 -0.29 -0.47 0.33 0.11 -0.09 0.32 0.06 0.0 -0.6 0.33 0.33 -0.01 0.21 0.14 0.07 -0.27 0.17 -1.16 -1.04 -0.22 -0.26 -0.06 -0.08 -0.2 -0.07
- - -0.87 1.18 4.71 0.5 - - - -0.44 - - - - - - -3.69 - - - - - - - - -0.65 -1.44 - - - - - -0.31
-0.72 - 1.17 - 2.38 - 1.01 3.62 2.26 -0.08 - - -0.73 - - - -3.01 - - - - 1.51 - - 0.39 - - - - - - - -
0.39 -0.1 0.38 0.32 0.67 0.36 0.11 0.5 0.35 0.25 -0.43 0.0 -0.44 -0.32 -0.21 -0.31 -0.28 -0.34 -0.37 -0.52 -0.5 0.04 -0.42 -0.75 0.3 -0.28 -0.16 0.0 0.2 0.14 0.12 -0.08 0.06
2.62 - 0.65 - 1.11 - - 4.03 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.82 0.56 0.68 0.74 1.27 0.95 0.46 0.61 -0.01 0.17 -1.29 -0.46 -0.97 -0.92 -0.68 -0.65 -1.19 -0.8 -1.21 -1.2 -0.99 -0.62 -0.96 -1.71 -0.06 -0.52 -0.47 0.35 0.33 0.13 0.19 0.23 0.6
0.58 0.06 0.44 -0.07 0.46 0.59 0.55 0.64 0.38 0.24 -0.02 0.32 0.25 0.42 -0.64 -0.07 -0.7 -0.33 -0.41 -0.13 -0.08 0.43 0.09 0.39 -0.15 -0.72 -0.7 -1.14 -0.51 -0.45 -0.92 -1.06 -0.62
0.14 -0.63 0.46 0.01 0.3 -0.04 0.17 0.18 -0.23 0.18 0.12 0.05 0.11 -0.1 0.55 0.29 -0.46 0.05 -0.12 0.08 -0.05 -0.01 0.13 0.11 0.21 -0.38 -0.38 -0.28 -0.05 -0.26 -0.35 -0.42 -0.22
0.04 -0.55 0.49 0.83 0.85 0.48 0.34 1.41 0.48 0.55 -2.38 -0.98 -0.24 -1.27 -0.04 -1.29 -0.66 -1.8 -3.04 -3.07 -2.61 0.04 -0.03 0.26 -0.13 -0.55 -0.71 1.05 0.07 -0.37 1.04 0.05 0.11
0.93 0.36 1.22 0.92 1.57 0.61 -0.27 1.16 1.14 -0.06 -1.21 -0.89 -1.35 -0.87 -0.62 -1.04 -1.59 -1.22 -1.37 -1.09 -1.04 -0.76 -1.15 -1.49 -1.05 -0.21 -0.45 0.11 0.3 -0.06 0.01 0.11 -0.17
0.52 -0.51 0.64 0.04 0.69 0.63 0.28 1.16 0.99 0.43 -0.4 0.12 0.06 0.09 -0.28 0.11 -0.55 -0.38 -0.83 -0.92 -0.68 0.15 -0.61 -0.12 0.33 -0.15 -0.28 -0.6 -0.68 -0.89 -0.6 -0.72 -0.83
0.14 - -0.58 -0.2 4.8 0.01 - - - - - - 0.3 - - - -1.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.18 -0.12 0.39 0.21 0.38 0.16 0.23 0.59 0.1 0.02 -0.71 0.21 -0.25 -0.11 -0.25 -0.52 -0.69 -0.09 -0.36 -0.43 -0.17 0.21 -0.29 -0.01 0.03 -0.3 -0.28 -0.01 0.34 0.33 0.03 -0.04 0.16
0.49 0.12 0.5 0.02 0.43 0.25 0.56 0.65 0.56 0.3 0.67 0.14 0.1 0.23 0.16 0.28 -0.93 0.19 0.28 0.27 0.02 0.1 -0.25 -0.33 -0.34 -0.54 -0.73 -1.12 -1.22 -0.99 -1.32 -1.73 -0.89
-1.53 -2.09 -1.54 0.74 1.68 2.04 -0.66 1.91 0.74 0.48 0.0 -1.8 -0.41 -1.47 -1.09 -1.18 -0.8 0.04 -1.01 -1.19 0.15 -2.47 -0.91 -1.24 -0.23 -0.58 -0.7 0.12 -0.86 0.03 0.02 0.36 -1.17
1.3 -0.48 0.5 -0.52 1.94 0.52 1.03 0.89 0.73 -1.06 -1.28 -0.37 -0.15 -0.24 -0.61 -1.22 -1.59 -1.07 -1.23 -1.62 -1.16 -0.49 -0.44 -0.34 -0.14 -0.23 -0.37 -0.28 0.32 0.04 -0.25 -0.6 0.04
0.16 0.38 0.13 0.08 0.52 0.89 0.31 1.01 0.48 0.91 0.08 -0.12 -0.79 -0.61 -0.33 0.3 -1.02 -0.51 -0.31 0.46 0.39 0.0 -0.05 -0.64 -1.31 -0.78 -0.45 -0.55 -0.05 -0.16 -0.7 -0.87 -0.58
- - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.56 -0.12 0.6 -0.06 0.98 0.31 0.64 0.71 0.88 -0.4 -0.1 0.71 -0.16 0.2 -0.29 0.27 -1.34 0.15 0.37 -0.01 0.28 0.48 -0.66 0.29 0.04 -1.03 -1.03 -1.48 -1.32 -1.34 -1.69 -1.63 -1.18
0.52 0.17 0.38 0.86 1.55 2.12 1.76 1.5 0.99 0.18 -3.21 0.16 -0.15 -0.4 -2.79 -5.97 -1.48 -4.48 -4.32 -4.65 -4.36 -0.75 -0.75 0.69 -0.07 -1.18 -1.03 -2.01 -1.23 -0.84 -1.77 -1.43 -0.89
0.8 -0.38 0.55 0.08 0.48 0.42 0.6 1.11 0.55 0.56 -0.18 0.34 -0.23 0.15 0.21 -0.17 -0.63 -0.02 -0.49 0.1 -0.21 0.37 0.05 -0.21 0.11 -0.29 -0.21 -1.46 -1.22 -1.36 -1.52 -1.63 -1.4
0.65 0.19 0.14 -0.25 0.27 0.21 0.31 0.36 0.27 -0.22 -0.34 0.2 -0.31 0.41 -0.06 -0.23 -0.65 -0.14 -0.38 -0.52 -0.39 0.1 0.17 -0.14 -0.22 -0.17 -0.17 -0.09 0.19 0.11 -0.16 -0.35 0.24
0.66 -0.1 0.38 0.04 0.58 0.25 0.69 0.82 0.85 -0.28 -0.7 0.09 0.17 -0.15 -0.12 -0.57 -0.71 -0.74 -0.49 -0.44 -0.33 0.51 0.38 0.08 0.61 -0.3 -0.36 -0.79 -0.52 -0.51 -0.49 -0.7 -0.92
- -2.36 - -1.34 0.37 -0.77 -0.29 2.05 2.04 0.33 - - - - - - -0.66 4.01 - 0.67 0.7 - - - - -3.84 -2.66 - - - - - -
0.65 -0.19 0.5 -0.0 0.69 0.26 0.22 0.78 0.41 -0.27 -0.46 0.06 -0.48 -0.48 -0.34 -0.38 -0.39 -0.33 -0.66 -0.66 -0.74 -0.37 -0.1 -0.05 -0.43 -0.13 0.01 0.1 0.31 0.14 0.04 -0.09 0.47
0.34 -0.16 0.59 0.22 0.82 -0.03 0.22 0.63 0.55 0.15 -0.12 0.21 -0.19 -0.03 -0.29 -0.07 -0.61 -0.19 -0.28 -0.02 -0.06 0.34 0.32 -0.5 0.08 -0.49 -0.57 -0.77 -0.21 -0.12 -0.64 -0.87 -0.17
0.45 -0.14 0.3 0.05 0.41 0.55 0.04 0.5 0.24 -0.09 -0.11 0.08 -0.25 -0.12 -0.39 -0.01 -0.42 0.16 -0.44 -0.48 -0.15 -0.03 -0.11 -0.23 0.18 -0.03 -0.07 -0.27 0.14 0.01 -0.29 -0.44 0.11
-0.29 -0.52 -0.2 0.62 1.33 1.91 -0.24 1.41 0.52 0.23 -1.31 0.52 -0.01 -0.99 -1.73 -2.67 -0.35 -1.98 -2.17 -2.07 -2.09 0.14 0.7 -1.55 0.5 0.37 0.35 -1.16 -0.29 -0.02 -0.79 -1.12 -0.26
0.63 -1.93 1.55 1.2 2.39 1.41 2.63 2.35 1.28 0.79 -6.58 -0.96 -6.36 -2.64 -8.59 - -7.4 -7.52 -7.62 -7.69 -7.66 0.41 -4.91 -7.26 -2.47 -5.68 -3.25 -3.6 -8.57 -9.72 -4.39 -4.39 -4.64
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0.91 -1.09 0.8 1.48 2.56 0.29 0.77 1.54 0.92 -0.47 -1.09 -0.16 -0.98 -1.0 0.0 -3.99 0.25 -2.51 -2.61 -2.68 -3.97 -0.09 -0.94 -1.25 -1.55 -1.85 -2.22 -0.17 -1.04 -0.82 -0.11 -1.32 -0.79
-0.1 -0.44 0.05 -0.19 0.48 0.71 -0.01 0.57 0.45 -0.04 -0.4 -0.11 -0.22 -0.35 -0.25 0.06 -0.41 -0.03 -0.33 -0.14 -0.2 -0.18 -0.14 0.52 -0.48 -0.26 -0.08 -0.07 0.12 0.29 -0.04 -0.21 0.29
1.1 0.23 1.32 1.0 1.3 0.68 -0.93 0.53 0.75 -0.01 -0.29 0.4 -1.84 -0.15 -0.12 -0.08 -1.97 0.26 -0.02 -0.14 0.15 -0.91 -1.73 -1.76 -0.58 0.54 0.54 -0.81 -2.04 -1.92 -1.12 -1.37 -2.31
1.2 0.09 0.35 0.38 1.34 1.34 0.5 3.19 2.18 1.54 -6.31 -0.85 -0.86 -6.27 -5.87 -6.36 -0.63 -8.48 -7.93 -8.0 - -1.76 -2.72 -3.97 0.17 -2.49 -1.83 -8.56 -7.96 -5.97 - -10.6 -3.17
-0.18 -0.89 0.25 0.14 1.08 0.24 -0.55 1.66 0.87 0.05 0.54 -0.86 -0.93 -0.24 -0.08 0.46 -0.54 0.44 0.33 0.31 -0.29 -1.9 -0.48 -1.02 -0.88 -0.09 -0.15 -0.77 -0.03 -0.59 -0.68 -0.51 -0.33
-3.07 -6.46 -0.83 1.15 2.32 2.61 -0.57 2.39 1.3 0.67 -3.19 0.03 0.63 -5.32 -3.58 -3.53 0.08 - -4.61 - -5.97 -5.26 -1.25 1.12 0.86 -3.56 -2.34 -7.98 - -6.88 -7.77 -6.83 -1.88
0.05 -0.85 0.16 0.01 0.85 0.95 -0.11 1.19 0.38 0.24 -1.01 -0.91 -0.55 -0.82 0.51 0.0 -0.87 -0.28 -1.24 -0.56 -0.73 -0.16 -1.26 1.05 -0.17 -0.7 -0.63 0.06 -0.14 -0.16 0.45 0.47 -0.08
0.14 -1.04 0.37 0.53 0.14 -1.19 1.45 -0.47 -0.22 -0.31 1.05 0.47 -0.97 -2.41 -0.03 1.08 -1.56 1.25 0.32 -0.06 0.77 -0.98 -1.3 -1.51 -1.06 -2.08 -1.99 -0.03 0.19 -0.03 -0.24 -0.51 0.34
0.24 -0.63 0.17 0.04 0.74 0.57 0.33 0.66 0.39 0.09 -0.32 0.09 -0.27 -0.12 0.13 -0.18 -0.76 0.02 -0.31 -0.54 -0.14 -0.1 -0.32 0.49 0.04 -0.44 -0.55 -0.15 0.19 -0.12 -0.05 -0.35 -0.41
-1.94 -5.23 0.78 1.45 2.43 1.41 -0.93 2.19 1.36 1.28 -5.69 -0.77 -2.97 -4.7 - -5.79 -0.95 -5.63 -6.32 - -7.35 -3.44 -1.07 - -0.94 0.45 0.47 -1.31 0.45 -1.09 -1.41 0.74 -0.56
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1.89 0.31 1.86 1.24 2.84 0.22 -1.22 1.86 1.73 -0.04 -2.9 -1.41 -3.61 -2.11 -2.4 -2.85 -2.11 -2.54 -2.14 -2.71 -2.46 -3.57 -3.99 -2.87 -3.21 0.45 -0.08 -2.89 -3.71 -4.0 -3.87 -3.01 -3.87
0.86 0.53 0.74 0.02 0.79 0.93 -0.27 1.08 1.04 -0.39 -0.66 -0.4 0.16 -0.26 -0.38 -0.65 -0.72 -0.63 -0.89 -1.69 -1.25 -0.27 -0.58 0.03 -0.38 -0.11 -0.22 -0.23 0.07 -0.12 -0.19 -0.32 -0.34
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0.36 -0.04 0.4 0.19 0.41 0.23 -0.11 0.37 0.2 0.14 -0.43 -0.43 -0.44 -0.01 -0.31 -0.05 -1.41 -0.22 -0.48 -0.51 -0.37 -0.25 -0.6 0.6 -0.58 -0.12 -0.13 0.26 0.55 0.41 0.08 0.01 0.39
1.28 -2.05 2.17 1.49 2.66 0.36 0.83 1.08 0.49 -0.65 - -1.85 -2.05 -0.73 - -4.89 -1.86 - - - - -1.08 - -2.35 -2.3 -3.25 -2.63 -0.35 0.23 0.43 0.18 0.03 0.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.