Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.62 0.18 1.3 -2.6 0.37 0.63 0.72 0.26 0.37 -0.14 -0.09 0.09 -0.06 0.42 0.87 0.78 0.85 0.49 0.39 0.16 -0.0 0.03 0.04 0.06 -3.46 -0.73 -0.1 0.36 -1.14 0.12 -0.9 -0.23 0.6 -0.94 0.61 -2.8 -0.65 -0.81 -0.45 0.38 -2.49 0.39 -0.12 -3.04 -0.75 -2.71 0.33 -0.21 0.23 0.31 0.32 -0.68 -1.13 -1.51
0.27 0.47 0.0 -4.25 1.01 0.38 0.37 -0.39 -0.15 -0.78 -0.41 -0.17 -0.62 -0.03 0.42 0.35 0.25 0.37 1.28 0.07 0.06 -0.72 -0.07 0.36 -0.61 -0.21 -0.36 -0.09 -0.04 -0.23 0.3 -0.28 0.61 0.26 0.35 -0.76 -0.14 -0.07 -0.14 -0.32 -0.47 -0.34 -0.08 -0.52 -0.1 -0.59 -0.06 -0.08 0.08 0.24 0.2 -0.13 -0.25 -0.52
0.37 0.6 0.37 -5.77 0.57 0.08 0.66 0.04 0.41 -0.17 -0.12 0.38 -0.73 0.02 0.08 0.08 0.1 0.09 0.43 0.08 0.0 0.54 -0.28 -0.34 0.41 -0.12 -0.44 -0.25 -0.22 -0.38 0.21 -0.57 -0.18 -0.26 -0.3 -0.59 -0.43 -0.1 -0.27 -0.34 0.74 -0.27 -0.31 0.43 -0.14 0.73 -0.35 -0.2 -0.34 -0.35 -0.19 -0.28 0.04 0.03
0.98 1.11 0.87 -4.58 0.44 0.06 0.72 0.41 0.5 0.27 0.26 0.52 0.06 0.41 0.28 0.22 0.31 0.28 0.77 0.35 0.36 0.36 -0.37 -0.19 -0.46 -0.52 -0.58 -0.29 -0.27 -0.47 -0.25 -0.68 -0.04 -0.22 -0.15 -0.24 -0.51 -0.41 -0.57 -0.49 -0.0 -0.42 -0.42 -0.33 -0.39 -0.05 -0.38 -0.37 -0.52 -0.43 -0.27 -0.55 -0.74 -0.91
0.15 1.04 1.2 -4.6 1.33 0.19 -0.24 -0.23 -0.03 -0.66 -0.3 -0.16 -1.63 -0.23 0.61 0.64 0.48 0.61 1.77 -0.2 0.05 -0.53 -0.63 0.31 -0.73 -0.62 -0.74 -0.28 -0.32 -0.54 0.28 -0.6 0.81 0.37 0.53 -0.89 -0.35 -0.74 -0.61 -0.55 -0.4 -0.09 -0.1 -0.57 -0.4 -0.52 0.06 -0.15 -0.67 -0.5 -0.18 -0.39 -0.44 -0.83
0.5 1.15 1.19 -3.13 1.1 0.01 0.22 0.3 0.54 0.18 0.29 0.62 -0.52 0.1 0.19 0.12 0.07 0.09 0.62 0.53 0.33 0.15 -0.52 -0.52 0.44 -0.13 -1.08 -0.47 -0.66 -0.65 0.24 -0.8 -0.39 -0.43 -0.62 -0.47 -0.34 -0.39 -0.36 -0.94 0.6 -0.79 -0.65 0.42 -0.94 0.52 -0.57 -0.56 -0.53 -0.61 -0.51 -0.44 -0.15 -0.12
0.07 0.09 0.07 -4.45 0.45 0.27 0.41 0.94 -0.35 0.72 0.58 -0.58 -1.9 0.11 0.75 0.81 0.76 0.79 1.84 0.0 0.21 -0.51 -0.47 0.84 -2.76 -1.77 -0.87 0.51 -0.53 0.25 -1.79 -0.92 1.37 0.03 1.36 -3.54 -0.88 -1.73 -1.34 0.27 -2.5 0.36 -0.1 -3.08 -1.17 -2.91 0.57 -0.31 -0.16 -0.51 -0.16 -0.61 -0.93 -1.42
0.47 0.72 0.82 -4.97 0.44 0.01 0.71 0.03 0.35 -0.3 -0.31 0.18 -0.81 -0.11 0.27 0.16 0.27 0.25 1.09 -0.03 0.01 0.3 -0.16 0.21 -0.86 -0.61 -0.08 0.15 0.16 0.03 -0.15 -0.27 0.52 0.23 0.37 -1.17 -0.43 -0.42 -0.61 0.01 -0.74 0.14 0.08 -0.8 -0.04 -0.93 0.23 0.05 -0.11 -0.01 0.05 -0.41 -0.64 -0.97
0.38 0.65 0.93 -5.12 0.12 0.01 0.55 0.31 0.38 0.33 0.08 0.57 -1.31 1.03 0.05 -0.03 0.09 0.05 0.54 -0.07 -0.04 0.88 -0.27 0.27 -0.34 -1.18 -0.59 -0.13 0.15 -0.28 0.31 0.18 0.54 0.3 0.34 -0.3 -1.0 -1.01 -1.12 -0.39 -0.11 -0.36 -0.22 -0.25 -0.26 -0.21 -0.22 -0.07 -0.27 -0.31 -0.35 -0.46 -0.55 -0.64
0.49 1.02 0.82 -4.21 1.07 0.04 0.33 0.28 0.58 0.08 0.25 0.5 -0.36 0.42 0.01 -0.07 -0.05 0.02 0.6 0.58 0.42 0.41 -0.53 -0.41 0.15 -0.07 -1.03 -0.33 -0.55 -0.6 -0.05 -0.67 -0.15 -0.32 -0.4 -0.32 0.01 -0.1 -0.12 -0.69 0.31 -0.46 -0.42 0.2 -0.67 0.2 -0.36 -0.42 -0.46 -0.48 -0.41 -0.46 -0.23 -0.25
0.46 1.21 1.28 -5.21 1.28 0.31 0.5 0.6 0.78 0.46 0.53 0.69 -0.65 -0.02 0.45 0.42 0.35 0.38 0.81 0.65 0.49 0.51 -0.57 -0.16 -0.42 -0.08 -1.01 -0.54 -0.55 -0.8 -0.68 -0.83 -0.31 -0.32 -0.57 -0.8 -0.31 -0.22 -0.3 -1.08 -0.57 -0.81 -0.71 -0.63 -0.76 -0.64 -0.71 -0.75 -0.5 -0.58 -0.52 -0.52 -0.29 -0.29
0.39 0.85 0.34 -6.05 1.2 0.05 -0.14 0.09 0.38 0.08 0.13 0.35 -0.68 0.04 0.26 0.21 0.13 0.25 1.06 0.39 0.39 -0.23 -0.34 -0.06 0.09 -0.74 -0.69 -0.04 -0.32 -0.25 0.23 -0.39 0.24 0.07 0.07 -1.09 -0.51 -0.69 -0.69 -0.47 -0.0 -0.13 -0.1 -0.18 -0.63 0.14 0.05 -0.15 -0.2 -0.28 -0.2 -0.14 -0.08 -0.17
0.27 0.65 0.01 -3.82 1.64 0.4 0.14 0.51 0.9 0.55 0.44 0.8 -1.22 0.81 0.46 0.61 0.4 0.42 1.25 0.45 0.48 1.13 -0.55 -0.38 -1.09 -1.07 -1.09 -0.33 -0.44 -0.43 -0.45 -0.33 -0.07 -0.55 -0.26 -2.14 -1.0 -0.82 -0.98 -0.65 -0.84 -0.61 -0.61 -1.19 -1.06 -0.9 -0.45 -0.56 -0.39 -0.4 -0.23 -0.05 0.07 -0.01
0.73 1.27 1.22 -3.28 0.81 0.15 0.56 0.43 0.71 0.27 0.39 0.59 -0.23 -0.01 0.14 0.1 0.08 0.12 0.8 0.46 0.37 0.73 -0.38 -0.32 -0.01 -0.46 -0.83 -0.28 -0.59 -0.46 -0.32 -0.84 -0.24 -0.47 -0.53 -0.85 -0.36 -0.57 -0.52 -0.79 -0.15 -0.57 -0.55 -0.17 -0.78 -0.2 -0.47 -0.56 -0.35 -0.36 -0.28 -0.3 -0.16 -0.2
0.3 0.78 1.01 -4.7 1.16 0.24 0.4 0.34 0.39 0.23 0.21 0.36 -0.99 -0.09 0.17 0.12 0.15 0.18 0.79 0.28 0.33 0.41 -0.49 -0.09 -0.96 -0.3 -0.27 -0.18 -0.02 -0.36 -0.59 -0.25 0.25 0.16 0.17 -0.99 -0.11 -0.07 -0.2 -0.08 -0.42 0.22 -0.12 -0.61 -0.04 -0.63 0.03 -0.16 -0.64 -0.48 -0.3 -0.43 -0.68 -0.98
0.56 0.94 0.49 -4.61 0.76 -0.18 0.04 0.36 0.29 0.15 0.21 0.51 -0.86 0.26 0.09 -0.06 -0.11 -0.17 1.01 0.62 0.55 0.73 -0.54 0.34 0.44 -1.07 -0.52 -0.21 -0.22 -0.49 0.07 -0.55 0.3 0.23 0.25 -0.62 -0.64 -0.86 -0.99 -0.74 0.24 -0.16 -0.31 0.07 -0.66 0.13 -0.12 -0.44 -0.61 -0.59 -0.39 -0.23 -0.24 -0.32
0.44 0.85 0.7 -4.29 1.13 0.01 0.05 0.38 0.49 0.2 0.28 0.34 -0.34 -0.34 0.23 0.08 0.07 0.08 0.8 0.26 0.25 0.56 -0.5 -0.03 0.07 -0.21 -0.87 -0.24 -0.43 -0.5 0.25 -0.54 0.14 0.03 -0.15 -1.36 0.07 -0.31 -0.19 -0.61 -0.07 -0.19 -0.22 -0.09 -0.66 -0.03 -0.12 -0.26 -0.3 -0.31 -0.19 -0.3 -0.25 -0.31
0.44 0.87 0.78 -3.82 0.81 0.04 0.54 0.5 0.61 0.36 0.47 0.6 -0.15 0.13 0.1 -0.04 0.03 0.01 0.68 0.44 0.26 0.56 -0.4 -0.42 0.29 -0.01 -0.73 -0.34 -0.46 -0.52 -0.01 -0.85 -0.42 -0.42 -0.64 -0.47 -0.11 -0.15 -0.15 -0.61 0.09 -0.41 -0.55 0.1 -0.58 0.06 -0.44 -0.49 -0.46 -0.37 -0.33 -0.37 -0.12 -0.12
0.31 0.85 0.91 -3.64 0.93 -0.07 0.31 0.33 0.55 0.18 0.28 0.52 -0.29 0.77 0.16 0.21 0.11 0.09 0.62 0.36 0.21 0.24 -0.45 -0.47 0.43 -0.14 -0.78 -0.51 -0.7 -0.75 0.07 -0.8 -0.45 -0.46 -0.7 -0.38 -0.01 -0.3 -0.17 -0.72 0.5 -0.43 -0.53 0.41 -0.73 0.37 -0.48 -0.53 -0.45 -0.4 -0.36 -0.38 -0.1 -0.14
0.64 0.41 0.4 -4.53 0.16 0.14 0.44 0.74 -0.18 0.73 0.37 -0.0 -1.29 0.23 0.54 0.61 0.49 0.47 0.83 -0.31 -0.18 1.03 -0.63 0.58 -2.05 -0.62 0.04 0.14 0.26 -0.1 -1.85 0.45 0.66 -0.08 0.67 -2.07 -0.42 -0.39 -0.63 -0.04 -1.22 0.44 0.13 -1.84 0.14 -1.77 0.27 -0.08 -0.28 -0.53 -0.59 -0.57 -1.1 -1.31
0.54 0.84 0.26 -5.85 1.2 0.18 0.69 0.61 0.73 0.52 0.56 0.65 -0.37 -0.33 0.43 0.4 0.36 0.36 1.03 0.48 0.41 0.73 -0.76 -0.64 0.41 -0.35 -1.11 -0.61 -0.87 -0.83 0.09 -1.05 -0.56 -0.8 -0.8 0.15 -0.44 -0.66 -0.44 -1.0 0.42 -0.71 -0.89 0.38 -1.09 0.4 -0.7 -0.8 -0.68 -0.61 -0.55 -0.57 -0.38 -0.4
0.34 0.77 0.62 -4.41 0.49 0.4 0.47 0.59 0.42 0.5 0.38 0.51 -0.46 0.7 0.65 0.52 0.67 0.64 1.06 0.26 0.4 0.72 -0.57 0.2 -0.87 -0.96 -0.76 -0.1 0.0 -0.36 -0.82 -0.42 0.23 0.07 0.18 -1.67 -0.68 -0.64 -0.89 -0.49 -0.9 -0.24 -0.18 -1.11 -0.39 -1.04 -0.03 -0.18 -0.06 -0.41 -0.52 -0.71 -0.86 -0.93
0.89 0.84 -0.75 -3.66 -0.2 0.15 0.1 0.56 0.54 0.28 0.39 0.5 -1.3 0.43 0.28 0.33 0.3 0.2 0.41 0.1 0.05 0.42 -0.31 0.1 -1.02 -0.67 -1.11 0.09 0.17 0.04 -0.64 -0.44 0.58 0.89 0.59 -2.46 -0.43 -0.33 -0.57 0.03 -0.59 -0.17 0.15 -0.59 -0.04 -0.75 0.28 0.22 -0.18 -0.54 -0.5 -0.39 -0.16 -0.21
1.24 0.91 -0.6 -5.8 0.26 0.52 0.97 0.63 0.89 0.5 0.42 0.9 -1.37 1.06 0.82 0.59 0.83 0.87 1.3 0.62 0.55 1.28 -0.49 -0.07 -0.46 -1.57 -2.43 -0.4 -0.51 -0.77 -0.31 -1.1 -0.01 -0.21 -0.26 -2.79 -1.35 -1.35 -1.49 -1.55 -1.16 -1.12 -0.58 -0.58 -1.35 -1.63 -0.51 -0.43 -0.53 -0.33 -0.23 -0.4 -0.72 -0.81
-0.04 0.82 0.55 -7.32 1.46 -0.06 0.21 -0.08 0.24 -0.31 -0.22 0.16 -1.69 -0.19 0.28 0.19 0.1 0.31 1.35 0.3 0.34 0.17 -0.98 0.24 0.51 -0.28 -1.34 -0.64 -0.77 -0.9 0.6 -0.73 0.58 0.3 0.4 -0.78 -0.41 -0.33 -0.4 -1.2 0.74 -0.5 -0.59 0.33 -0.96 0.81 -0.34 -0.53 -0.91 -0.88 -0.57 -0.42 -0.08 -0.14
0.12 0.43 0.16 -4.49 1.03 0.77 0.05 0.03 -0.06 -0.41 -0.14 -0.28 -0.76 -0.27 0.72 0.32 0.63 0.57 0.63 0.29 0.32 0.43 -0.55 -0.54 -1.36 0.38 -1.13 -0.27 -0.21 -0.34 -1.19 -0.71 0.3 -0.57 0.2 -2.0 0.46 0.41 0.62 0.14 -0.91 0.19 -0.03 -0.49 0.14 -1.07 0.21 0.18 0.65 -0.21 -0.83 -0.85 -0.36 0.27
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0.41 0.74 0.64 -3.53 1.27 0.17 0.47 0.17 0.14 -0.02 -0.1 0.17 -1.39 0.41 0.71 0.72 0.55 0.65 1.55 0.05 0.17 0.27 -0.46 0.14 -0.98 -0.77 -0.86 -0.03 -0.04 -0.3 -0.32 -0.48 0.44 0.19 0.24 -1.13 -0.64 -0.67 -0.78 -0.5 -0.75 -0.2 -0.15 -0.88 -0.44 -0.9 0.07 -0.14 -0.4 -0.35 -0.18 -0.48 -0.71 -1.05
0.12 0.29 0.08 -3.27 0.78 0.61 0.32 0.52 -0.0 0.44 0.41 0.48 -1.1 -0.03 0.2 -0.24 0.3 0.08 0.89 0.02 0.3 0.57 -0.38 -0.02 -1.24 -0.6 -0.17 0.06 0.03 -0.08 -0.29 0.01 0.45 0.26 0.43 -1.86 -0.29 -0.42 -0.51 0.31 -0.84 0.31 0.08 -0.86 0.15 -0.98 0.3 0.12 -0.27 -0.26 -0.03 -0.28 -0.71 -0.94
0.46 0.88 0.72 -5.1 1.13 0.44 0.28 0.1 0.36 0.05 -0.07 0.47 -1.08 0.49 0.57 0.6 0.45 0.56 1.08 0.22 0.36 0.09 -0.32 -0.13 -1.01 -0.5 -0.45 -0.24 0.01 -0.33 -0.55 -0.65 0.16 -0.11 0.0 -1.58 -0.34 -0.25 -0.44 -0.28 -0.54 -0.17 -0.21 -0.73 -0.18 -0.78 -0.15 -0.11 -0.33 -0.29 -0.14 -0.21 -0.4 -0.68
0.29 0.18 -0.03 -5.25 0.84 0.35 0.7 0.79 -0.19 0.24 0.34 -0.44 -1.49 0.38 0.37 0.81 0.4 0.3 1.26 -0.3 -0.24 1.49 -0.84 1.49 -2.01 -0.99 -1.39 -0.18 0.01 -0.46 -0.86 -1.45 1.36 0.31 1.46 -2.68 -0.83 -0.66 -0.87 -0.79 -1.63 -0.36 -0.41 -1.99 -0.67 -1.88 -0.13 -0.19 -0.19 -0.02 0.01 -0.96 -1.05 -1.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.