Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.03 0.96 2.0 -3.14 0.61 -0.16 0.0 -0.37 0.08 -0.33 -0.38 -0.11 -1.38 -0.4 0.13 0.1 0.04 0.08 0.79 -0.43 -0.47 0.04 -0.34 0.24 -0.63 -0.43 -0.48 -0.09 -0.02 -0.16 0.34 -0.0 0.72 0.58 0.54 -0.55 -0.25 -0.27 -0.29 -0.06 -0.52 -0.14 0.06 -0.48 -0.04 -0.44 0.1 0.14 -0.35 -0.29 -0.19 -0.43 -0.56 -0.8
0.77 0.98 1.36 -3.38 0.09 0.03 0.46 0.59 0.57 0.53 0.5 0.62 -0.8 0.74 -0.02 -0.1 -0.08 -0.07 0.46 0.21 0.13 0.59 -0.33 -0.57 -0.77 -0.53 -0.42 -0.06 0.16 -0.21 -0.56 -0.34 -0.17 -0.09 -0.23 -0.85 -0.4 -0.05 -0.46 -0.03 -0.58 -0.09 -0.05 -0.63 -0.03 -0.69 0.04 -0.04 -0.52 -0.45 -0.28 -0.38 -0.63 -0.84
0.41 1.33 1.66 -4.92 0.28 -0.44 -0.29 -0.34 -0.28 -0.51 -0.42 -0.46 -1.59 -0.48 -0.06 -0.05 -0.21 -0.14 0.21 -0.52 -0.43 -0.48 0.16 0.48 -0.48 -0.37 0.03 0.38 0.27 0.06 -0.35 -0.2 0.6 0.66 0.46 -0.99 -0.11 0.02 -0.36 -0.02 -0.54 0.15 0.28 -0.55 0.05 -0.78 0.34 0.25 -0.12 0.07 0.29 0.08 -0.29 -0.69
0.48 1.01 1.02 -5.14 -0.11 -0.02 0.47 0.1 0.26 0.02 -0.08 0.28 -0.71 0.16 -0.1 -0.22 0.03 -0.14 0.1 0.19 0.18 0.27 -0.05 -0.16 -0.09 -0.28 -0.46 0.16 0.14 -0.1 -0.29 -0.27 0.07 0.04 -0.06 -0.87 -0.17 -0.06 -0.25 -0.25 -0.02 -0.03 0.15 -0.1 -0.12 -0.19 0.17 0.13 -0.26 -0.28 -0.09 0.08 -0.0 -0.23
0.72 1.35 2.1 -3.87 0.2 -0.15 -0.34 -0.62 -0.74 -0.81 -0.6 -0.69 -1.67 -0.92 -0.3 -0.25 -0.55 -0.35 0.11 -0.56 -0.58 -0.54 0.01 0.33 -0.17 -0.14 -0.25 0.17 0.05 -0.0 0.1 -0.13 0.64 0.47 0.39 -0.33 -0.08 -0.02 -0.25 -0.1 -0.08 0.11 0.11 -0.23 -0.06 -0.3 0.23 0.07 -0.18 -0.05 0.17 0.03 -0.17 -0.3
0.84 0.79 1.24 -2.85 0.12 -0.2 0.03 0.24 -0.02 0.12 0.17 0.07 -1.19 0.29 -0.18 0.25 -0.08 -0.06 0.05 -0.4 -0.37 0.29 -0.2 -0.24 -1.14 -0.15 0.28 0.14 0.28 0.0 -0.67 -0.1 0.19 0.16 0.18 -1.09 0.06 0.15 -0.06 0.47 -0.76 0.46 0.29 -0.69 0.56 -0.98 0.32 0.23 -0.3 -0.23 -0.24 -0.49 -0.61 -0.9
0.83 2.03 2.64 -3.92 0.23 -0.38 -0.61 -0.06 -0.84 -0.74 -1.17 -1.11 -2.14 0.75 -0.09 -0.19 -0.4 -0.07 0.4 -0.92 -0.84 -0.27 -0.16 0.66 -0.84 -1.24 -1.31 0.11 0.53 -0.07 -0.09 -1.21 0.41 0.88 0.53 -0.68 -0.75 -0.55 -0.79 -0.73 -1.38 -0.3 0.21 -1.02 -0.46 -1.12 0.15 0.38 -0.77 -0.62 0.14 0.31 -0.53 -1.15
0.63 0.93 1.2 -2.91 0.04 -0.26 0.36 0.06 0.12 0.08 -0.02 0.15 -0.94 0.02 -0.15 -0.4 -0.21 -0.24 0.17 -0.11 -0.21 0.12 -0.19 -0.22 0.0 -0.17 -0.49 -0.06 0.27 -0.13 0.05 -0.13 0.09 0.11 0.0 0.31 -0.14 0.42 -0.2 -0.05 0.18 -0.21 0.02 -0.06 0.01 0.13 0.01 0.04 -0.28 -0.27 -0.19 -0.28 -0.31 -0.55
0.05 0.29 0.61 -3.1 -0.33 -0.21 0.0 -0.56 -0.21 -0.63 -0.57 -0.23 -0.9 0.62 -0.24 -0.21 -0.25 -0.23 0.21 -0.31 -0.23 -0.05 0.08 0.1 -0.53 -0.21 0.17 0.38 0.57 0.24 -0.12 0.0 0.5 0.53 0.42 0.01 -0.04 0.2 -0.17 0.19 -0.38 0.29 0.42 -0.38 0.44 -0.39 0.46 0.38 0.11 -0.01 -0.08 -0.1 -0.28 -0.4
0.47 1.59 2.18 -3.99 0.24 -0.09 0.17 0.47 0.4 0.36 0.35 0.47 -1.11 0.39 0.11 -0.22 0.12 0.1 0.65 0.39 0.32 0.2 -0.52 -0.49 -1.28 -0.24 -0.91 -0.2 -0.2 -0.37 -0.84 -1.11 -0.19 -0.29 -0.22 -0.81 -0.03 -0.02 -0.09 -0.17 -0.93 -0.03 -0.11 -1.01 -0.1 -1.26 0.04 -0.09 -0.44 -0.54 -0.35 -0.42 -0.72 -1.04
0.27 0.99 2.64 -2.05 -0.03 -0.15 0.18 -0.7 0.38 -0.04 -0.37 0.29 -2.08 -0.54 0.02 0.09 0.02 -0.09 0.84 -1.0 -0.86 -0.52 -0.58 -0.43 -2.16 1.29 -0.3 -0.41 -0.3 -0.69 -1.74 -0.73 -0.1 -0.23 -0.2 0.24 0.97 1.46 1.02 -0.08 -1.39 -0.18 -0.39 -1.63 0.08 -1.73 -0.34 -0.28 -0.29 -0.54 -0.53 -1.51 -1.73 -1.97
0.74 0.83 1.47 -4.44 0.28 -0.12 0.18 0.37 0.5 0.2 0.23 0.44 -0.43 -0.16 -0.3 -0.52 -0.2 -0.26 0.64 0.58 0.29 0.64 -0.51 -0.47 -0.28 0.12 -0.67 -0.16 -0.22 -0.22 -0.21 -0.76 -0.15 -0.38 -0.23 -0.15 0.29 0.2 0.21 -0.13 -0.02 -0.02 -0.22 -0.28 -0.34 -0.09 -0.02 -0.31 -0.6 -0.48 -0.31 -0.32 -0.47 -0.73
1.21 0.8 0.18 -4.69 -0.96 -0.44 -0.01 0.66 0.14 0.21 0.49 0.42 -0.09 -0.93 -0.16 -0.03 -0.22 -0.12 -0.33 0.14 0.39 -0.34 0.08 0.37 -0.88 0.06 -0.48 0.06 0.48 0.37 -0.9 0.14 0.18 0.59 0.46 -1.36 -0.23 0.2 -0.09 0.16 -1.02 -0.06 0.18 -0.56 0.29 -1.35 0.2 0.3 -0.16 -0.01 0.09 -0.15 -0.57 -0.78
0.32 0.61 0.55 -4.67 -0.08 -0.49 -0.01 -0.47 -0.08 -0.68 -0.65 -0.21 -0.71 0.06 -0.3 -0.29 -0.26 -0.27 0.16 -0.45 -0.36 -0.25 0.04 0.14 -0.59 0.47 0.1 0.2 0.25 0.03 0.53 -0.2 0.45 0.31 0.39 -0.28 0.38 0.38 0.42 0.2 -0.53 0.26 0.21 -0.4 0.39 -0.56 0.21 0.34 0.16 0.11 0.23 -0.03 -0.29 -0.46
0.59 0.76 0.79 -3.64 -0.07 -0.02 0.35 0.32 0.29 0.32 0.28 0.3 -0.86 0.35 0.16 0.08 0.17 0.12 0.39 -0.22 -0.16 0.2 -0.06 -0.12 -0.06 -0.42 -0.32 -0.12 0.11 -0.22 -0.21 -0.15 0.04 0.06 -0.17 0.07 -0.48 -0.18 -0.46 -0.2 0.14 -0.18 -0.12 0.04 0.01 0.22 -0.14 -0.03 -0.23 -0.17 -0.11 -0.36 -0.35 -0.42
0.75 0.71 2.1 -3.38 0.04 -0.45 0.57 0.05 0.4 -0.16 -0.11 0.38 -1.93 0.09 -0.16 -0.13 -0.16 -0.25 0.7 -1.0 -0.93 1.13 -0.66 -0.69 -1.22 0.94 0.03 -0.35 -0.36 -0.5 -1.48 -0.9 -0.57 -0.68 -0.56 0.26 0.81 1.24 0.91 0.22 -0.71 0.28 -0.41 -0.81 0.25 -0.92 -0.21 -0.42 -0.16 -0.5 -0.56 -1.44 -1.61 -1.74
0.47 1.16 1.92 -3.4 0.4 0.29 0.08 -0.03 0.47 -0.3 -0.27 0.53 -1.48 0.27 -0.1 -0.21 -0.26 -0.27 0.44 0.41 0.23 -0.76 -0.25 0.16 -1.12 -0.39 -0.76 0.12 0.05 -0.36 -0.22 -0.16 0.66 0.43 0.42 -0.34 -0.02 -0.28 -0.3 -0.49 -1.07 0.1 0.15 -0.8 -0.12 -1.26 0.24 0.1 -0.68 -0.33 -0.08 -0.18 -0.72 -1.06
0.58 0.3 -0.02 -5.27 -0.2 -0.04 0.38 -0.21 0.19 -0.55 -0.53 0.14 -0.6 -0.1 -0.07 -0.16 0.01 -0.02 0.4 -0.34 -0.16 -0.24 0.23 0.16 -0.7 -0.08 0.06 0.28 0.43 0.06 0.12 0.26 0.48 0.49 0.31 -0.27 -0.21 0.21 -0.16 0.24 -0.54 0.21 0.22 -0.4 0.35 -0.56 0.17 0.36 -0.11 0.22 0.38 -0.1 -0.7 -0.93
0.25 0.72 0.78 -5.67 -0.1 -0.11 0.21 -0.22 0.21 -0.28 -0.22 0.32 -0.83 -0.33 -0.47 -0.56 -0.4 -0.42 0.28 -0.17 -0.18 0.14 0.0 0.05 -0.24 -0.2 -0.25 0.07 0.38 -0.05 0.21 -0.14 0.3 0.52 0.28 -0.02 -0.23 0.2 -0.18 0.08 0.18 0.02 0.11 -0.04 0.27 0.05 0.06 0.24 -0.14 -0.05 0.05 -0.1 -0.05 -0.23
0.91 0.63 2.03 -4.82 0.14 -0.1 0.16 0.03 0.25 -0.15 -0.23 0.31 -2.1 0.5 0.19 0.09 0.22 0.17 0.89 -0.35 -0.31 1.16 -0.92 -0.38 -1.81 0.47 -0.41 -0.41 -0.07 -0.53 -0.75 -0.42 0.01 -0.02 -0.15 -0.85 0.71 1.0 0.67 0.33 -1.2 0.22 -0.29 -1.3 0.3 -1.42 -0.14 -0.26 -0.75 -0.54 -0.57 -1.63 -2.02 -2.33
0.77 0.49 2.34 -4.03 -0.04 0.11 0.33 -0.02 0.03 -0.24 -0.29 0.11 -2.1 0.57 0.31 0.25 0.32 0.24 0.67 -0.48 -0.45 1.05 -0.92 -0.49 -1.88 0.71 -0.39 -0.43 -0.26 -0.51 -1.32 -0.99 -0.18 -0.22 -0.23 -0.88 0.89 1.04 0.94 0.32 -1.41 0.14 -0.39 -1.44 0.18 -1.59 -0.24 -0.32 -0.69 -0.59 -0.49 -1.35 -1.61 -2.09
0.51 0.74 1.01 -3.49 0.12 0.03 0.29 0.23 0.18 0.13 0.05 0.19 -0.91 -0.02 -0.06 -0.16 -0.12 -0.19 0.16 -0.1 -0.04 0.27 -0.19 -0.31 -0.08 -0.27 -0.34 -0.0 0.17 -0.12 -0.07 -0.34 -0.07 0.05 -0.16 -0.21 -0.17 0.32 -0.24 0.02 0.31 -0.01 -0.02 0.12 0.14 0.36 0.09 0.12 -0.28 -0.29 -0.2 -0.26 -0.32 -0.51
0.92 1.18 1.83 -5.22 0.46 0.08 0.26 0.25 0.12 -0.05 0.07 -0.11 -1.38 0.3 0.36 0.33 0.29 0.26 0.75 -0.24 -0.28 0.03 -0.3 0.44 -0.78 -0.39 -0.2 -0.12 -0.28 -0.27 -0.51 -0.71 0.45 0.13 0.38 -1.24 -0.47 -0.32 -0.45 -0.24 -0.63 -0.03 -0.26 -0.7 -0.21 -0.86 -0.09 -0.26 -0.35 -0.09 0.02 -0.54 -0.57 -0.91
0.6 1.09 1.63 -4.6 -0.03 -0.29 0.35 -0.27 -0.27 -0.3 -0.44 -0.16 -0.64 -0.17 -0.14 -0.07 -0.24 -0.19 0.04 -0.33 -0.25 -0.46 0.04 -0.2 0.15 -0.13 -0.36 -0.03 0.14 -0.14 0.27 -0.6 -0.14 -0.19 -0.24 0.43 -0.1 0.14 -0.13 -0.2 0.29 -0.21 -0.11 0.22 -0.02 0.47 -0.09 0.02 -0.15 -0.01 0.14 -0.03 -0.13 -0.38
0.3 0.49 1.17 -3.22 -0.37 -0.54 0.09 -0.66 -0.22 -0.8 -0.8 -0.31 -0.87 -0.01 -0.51 -0.46 -0.39 -0.54 0.08 -0.41 -0.39 -0.47 0.15 0.02 -0.32 0.01 0.2 0.43 0.38 0.39 0.11 -0.01 0.43 0.3 0.31 -0.79 0.27 0.27 0.2 0.37 -0.23 0.4 0.49 -0.27 0.36 -0.25 0.5 0.46 -0.06 0.18 0.37 -0.08 -0.45 -0.78
0.12 1.6 2.57 -3.7 0.67 0.13 -0.14 -0.82 -0.09 -1.21 -0.81 -0.39 -1.25 -1.5 -0.48 -0.63 -0.75 -0.71 0.09 -0.81 -0.86 -1.06 0.05 0.04 -0.68 0.15 -0.47 0.01 0.17 -0.15 0.02 -0.61 0.34 0.75 0.12 0.11 0.09 0.38 -0.07 -0.25 -0.41 -0.27 0.07 -0.72 0.1 -0.52 0.01 0.03 -0.37 -0.02 0.26 -0.02 -0.28 -0.52
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0.63 0.93 1.78 -4.8 0.39 0.2 0.82 0.18 0.43 0.35 0.08 0.59 -1.68 0.43 0.2 0.19 0.23 0.21 0.77 -0.49 -0.47 1.12 -0.79 0.29 -1.74 0.38 -0.45 -0.55 -0.4 -0.76 -0.9 0.08 0.45 0.38 0.45 -0.83 0.08 0.77 0.15 -0.35 -1.35 -0.17 -0.6 -1.42 -0.11 -1.79 -0.48 -0.49 -0.63 -0.69 -0.65 -1.22 -1.53 -1.74
0.66 0.44 2.36 -2.86 0.54 -0.22 0.08 0.74 0.45 0.38 0.69 0.84 -1.64 0.38 -1.69 -1.95 -1.58 -1.24 0.26 -0.44 -0.59 0.73 -0.94 -0.84 -1.67 -0.56 0.19 -0.07 0.56 -0.17 -1.28 -0.77 -0.18 -0.07 -0.18 -1.54 -0.11 0.48 -0.02 0.88 -0.96 0.61 0.23 -1.3 1.04 -1.01 0.23 0.29 -0.7 -0.66 -0.86 -0.96 -1.23 -1.19
0.24 0.43 0.26 -5.68 -0.3 -0.17 0.37 -0.55 -0.17 -0.69 -0.55 -0.1 -0.01 -0.87 -0.39 -0.32 -0.37 -0.42 -0.13 -0.3 -0.09 -0.2 0.21 0.26 -0.44 0.56 0.31 0.09 0.49 0.08 0.9 0.15 0.09 0.43 0.19 -0.55 0.27 0.65 0.45 0.3 -0.68 0.09 -0.02 -0.45 0.58 -0.63 -0.11 0.21 0.08 0.2 0.17 -0.16 -0.36 -0.38
-0.02 1.65 2.72 -4.24 0.14 -0.74 -0.29 -1.14 -0.71 -1.09 -1.01 -0.94 -1.84 -0.45 -0.16 -0.18 -0.28 -0.24 0.03 -0.93 -0.99 -1.47 -0.28 1.14 -0.55 -0.72 -1.04 -0.35 -0.42 -0.56 0.56 -0.11 1.45 1.24 1.63 -0.32 -0.7 -0.77 -0.75 -0.79 -0.51 -0.6 -0.28 -0.69 -0.67 -0.24 -0.3 -0.22 -0.37 -0.49 -0.21 -0.31 -0.44 -0.55
0.66 0.95 1.1 -3.25 -0.26 -0.13 0.22 0.22 0.27 0.04 -0.01 0.33 -1.17 -0.73 -0.26 -0.31 -0.32 -0.26 0.15 -0.05 0.05 -0.26 -0.14 0.05 -0.59 -0.31 -0.04 0.05 0.46 0.12 -0.03 0.11 0.31 0.39 0.28 -0.36 -0.13 0.37 -0.19 0.3 -0.36 0.12 0.08 -0.39 0.24 -0.42 0.13 0.11 -0.22 -0.27 -0.17 -0.21 -0.47 -0.67
0.73 0.74 1.37 -3.48 0.06 0.1 0.43 -0.16 0.36 -0.42 -0.48 0.35 -1.1 0.15 0.19 0.16 0.21 0.13 0.56 -0.57 -0.29 -0.2 -0.21 -0.05 -0.64 0.6 -0.35 -0.31 -0.07 -0.51 -0.22 0.06 0.17 0.02 0.07 0.28 0.29 0.99 0.39 -0.24 -0.41 -0.39 -0.34 -0.41 -0.01 -0.44 -0.36 -0.17 -0.15 -0.27 -0.27 -0.66 -0.73 -0.79
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.