1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_248 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
LOC_Os01g04760.1 (LOC_Os01g04760)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g04970.1 (LOC_Os01g04970)
 1.97 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g05300.1 (LOC_Os01g05300)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g34300.1 (LOC_Os01g34300)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g46490.1 (LOC_Os01g46490)
 1.55 5.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g48400.1 (LOC_Os01g48400)
 -1.15 4.33 - - 4.04 - - - - - - - - - - - - -1.98 - - -0.35 - - 1.67 - - - - - - - 1.9 - - - - - - - 0.53 - - 1.39 - - - - - -
LOC_Os01g55250.1 (LOC_Os01g55250)
 1.76 5.08 - - - - - 3.01 - - - - - - - - - -1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.73 - - - - -
LOC_Os01g64240.1 (LOC_Os01g64240)
 1.83 5.27 - - - - - - 1.79 - -0.49 - - - - - - 0.26 - - - - 0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g66950.1 (LOC_Os01g66950)
 1.95 5.03 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g17410.1 (LOC_Os02g17410)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g19160.1 (LOC_Os02g19160)
 1.63 4.84 0.65 - - - - - - - -1.67 - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g20790.1 (LOC_Os02g20790)
 1.51 5.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g32790.1 (LOC_Os02g32790)
 2.41 5.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g37340.1 (LOC_Os02g37340)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g58420.1 (LOC_Os02g58420)
 0.4 5.27 3.1 - - - - - - - -1.16 - - - - - - - - -3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g08510.1 (LOC_Os03g08510)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g41500.1 (LOC_Os03g41500)
 -0.19 4.53 - - - - - - - - -1.01 3.17 - 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g48580.1 (LOC_Os03g48580)
 1.82 5.13 - - - - - - 2.63 0.93 -1.78 - - - - - 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g63890.1 (LOC_Os03g63890)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g04650.1 (LOC_Os04g04650)
 0.51 5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g07500.1 (LOC_Os04g07500)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g10490.1 (LOC_Os04g10490)
 -1.72 3.98 1.06 - 3.99 2.26 -0.0 - - - -2.35 - - 1.84 - - - -1.16 - - - - - - - - - - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g20520.1 (LOC_Os04g20520)
 - 5.53 - - - - - - - - 1.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g20550.1 (LOC_Os04g20550)
 1.13 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g22150.1 (LOC_Os04g22150)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g33100.1 (LOC_Os04g33100)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g49050.1 (LOC_Os04g49050)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g09340.1 (LOC_Os05g09340)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g10350.1 (LOC_Os05g10350)
 -1.37 4.4 - - 2.87 - - - - - - - - 4.06 - - - - - 0.61 - 0.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g11150.1 (LOC_Os05g11150)
 1.27 4.89 - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g11240.1 (LOC_Os05g11240)
 -0.26 4.19 - 1.25 4.36 - - - - 2.63 -0.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g11920.1 (LOC_Os05g11920)
 - 5.26 - - - - - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g29950.1 (LOC_Os05g29950)
 2.01 5.3 - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g04860.1 (LOC_Os06g04860)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g07840.1 (LOC_Os06g07840)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g22280.1 (LOC_Os06g22280)
 - 4.17 - - - - - - - - - - - 4.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g29100.1 (LOC_Os06g29100)
 - 3.82 - - - - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g36250.1 (LOC_Os06g36250)
 3.1 5.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g39830.1 (LOC_Os06g39830)
 1.56 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g05310.1 (LOC_Os07g05310)
 - 5.52 - - - - - - - - 1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g07370.1 (LOC_Os07g07370)
 1.73 5.17 - - - - - - - - -1.88 - - - - - - 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g19080.1 (LOC_Os07g19080)
 0.94 4.51 3.2 -0.66 - 2.48 1.75 - 1.5 - -1.62 - - - - - - - - -3.87 - - - - - - - - - - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g26530.1 (LOC_Os07g26530)
 2.84 5.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g44080.1 (LOC_Os07g44080)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g08930.1 (LOC_Os08g08930)
 - 5.02 - - - - - - - - - - - 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g10000.1 (LOC_Os08g10000)
 - 5.22 - - - - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g19660.1 (LOC_Os08g19660)
 2.39 5.26 - - - - - - - - 0.39 1.78 - - - - - - - -3.77 - - -0.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g27880.1 (LOC_Os08g27880)
 1.92 5.48 - - - - - - - - -0.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g08330.1 (LOC_Os09g08330)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g12000.1 (LOC_Os09g12000)
 2.32 5.38 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g12850.1 (LOC_Os09g12850)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g24280.1 (LOC_Os09g24280)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g28320.1 (LOC_Os09g28320)
 2.6 5.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g33660.1 (LOC_Os09g33660)
 - 5.57 - - - - - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g02890.1 (LOC_Os10g02890)
 0.07 4.54 - - - 4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 - - - - - -
LOC_Os10g04500.1 (LOC_Os10g04500)
 - 5.12 - - - - - - 3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g07982.1 (LOC_Os10g07982)
 1.31 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g10570.1 (LOC_Os10g10570)
 0.6 5.37 - - - - - - - - -0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.45 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g10794.1 (LOC_Os10g10794)
 2.57 5.03 - - - - - 1.03 - - - - - - - - - - - - - - - 1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.65 - - - - -
LOC_Os10g22440.1 (LOC_Os10g22440)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g26740.1 (LOC_Os10g26740)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g38510.1 (LOC_Os10g38510)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g38664.1 (LOC_Os10g38664)
 1.11 4.66 - - - 3.39 - - - - -0.21 1.86 - - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - 2.09 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - -
LOC_Os11g07630.1 (LOC_Os11g07630)
 2.51 5.27 - - - - - - - - -1.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g14770.1 (LOC_Os11g14770)
 -0.51 4.18 - - 3.8 3.83 - - - - - - - - - - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g19280.1 (LOC_Os11g19280)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g20740.1 (LOC_Os11g20740)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g22770.1 (LOC_Os11g22770)
 -1.76 4.78 - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - - -0.45 - - - - - - - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g30100.1 (LOC_Os11g30100)
 0.17 4.69 - - - 4.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g32700.1 (LOC_Os11g32700)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g36290.1 (LOC_Os11g36290)
 0.13 5.48 1.37 - - - - - - - -0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g37944.1 (LOC_Os11g37944)
 - 4.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - - - -
LOC_Os11g39800.1 (LOC_Os11g39800)
 - 4.44 - 3.83 - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g40520.1 (LOC_Os11g40520)
 2.38 5.37 - - - - - - - - 1.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g45570.1 (LOC_Os11g45570)
 - 5.48 2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g05950.1 (LOC_Os12g05950)
 2.53 5.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g14310.1 (LOC_Os12g14310)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g34680.1 (LOC_Os12g34680)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.