Heatmap: Cluster_123 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.02 0.11 0.55 -4.59 0.26 0.62 -0.01 0.24 0.52 0.46 0.28 0.67 -0.62 -0.21 0.12 0.06 0.11 0.02 0.15 0.05 0.11 0.05 -0.26 -0.64 -1.02 0.3 0.48 -0.35 -0.21 -0.14 -0.55 0.26 -0.47 -0.33 -0.31 -0.21 0.14 0.11 0.34 0.6 -0.75 0.44 -0.2 -0.83 0.78 -0.79 -0.19 -0.04 0.38 0.1 -0.36 -0.65 -0.64 -0.36
0.12 0.08 0.79 -2.8 0.11 1.11 0.47 -0.08 0.39 -0.3 0.19 0.08 0.31 -0.73 0.54 0.48 0.3 0.31 -0.01 -0.03 0.15 -0.23 0.21 -0.01 -1.21 0.23 0.09 -0.25 -0.08 -0.07 -0.65 -0.46 -0.33 0.06 0.08 -0.87 0.21 0.15 0.33 0.16 -1.23 -0.07 -0.33 -1.21 0.42 -1.28 -0.31 0.02 0.68 0.17 -0.53 -1.15 -0.49 0.32
-0.04 0.34 -0.23 -4.1 1.16 1.08 0.45 0.6 0.37 0.62 0.52 0.53 -0.25 0.68 0.61 0.52 0.72 0.55 1.01 0.24 0.36 0.56 -0.45 -0.83 -1.15 -0.54 -0.43 -0.13 -0.12 -0.19 -0.7 -1.0 -0.45 -0.67 -0.5 -1.21 -0.39 -0.3 -0.44 -0.02 -0.95 0.0 -0.17 -1.12 -0.13 -0.95 -0.11 -0.22 -0.27 -0.12 -0.12 -0.3 -0.78 -1.01
-0.1 0.74 1.04 -3.8 1.29 0.88 0.17 -0.27 -0.02 -0.28 -0.4 -0.05 -0.78 -0.25 0.82 0.85 0.78 0.81 1.24 -0.18 -0.16 -0.38 -0.03 -0.34 -1.02 -0.33 -0.53 -0.05 -0.16 -0.16 -1.41 -0.53 -0.13 -0.41 -0.26 -0.82 -0.44 -0.45 -0.43 -0.14 -0.69 -0.2 -0.14 -0.88 -0.13 -0.71 -0.08 0.14 0.23 0.26 0.05 -0.44 -0.25 -0.25
0.9 1.16 1.1 -3.39 1.14 0.8 0.15 0.4 0.43 0.04 0.07 0.36 -0.97 0.24 0.72 0.68 0.55 0.66 1.38 0.48 0.49 0.56 -0.88 -0.63 -1.2 -0.36 -0.89 -0.41 -0.47 -0.48 -0.95 -0.79 -0.01 -0.47 -0.22 -0.95 -0.26 -0.33 -0.26 -0.27 -0.47 -0.17 -0.37 -0.77 -0.35 -0.75 -0.19 -0.38 -0.82 -0.89 -0.79 -0.9 -1.16 -1.2
0.64 0.67 0.15 -3.73 1.62 0.95 0.3 0.53 0.41 -0.05 -0.0 0.25 -1.04 -0.01 0.44 0.27 0.52 0.41 1.41 0.3 0.28 0.6 -0.67 -0.08 -0.71 -0.46 -0.67 -0.46 -0.33 -0.52 0.15 -0.31 0.25 0.11 0.15 -1.58 -0.42 -0.22 -0.52 -0.62 -0.53 -0.21 -0.4 -0.6 -0.54 -0.87 -0.39 -0.42 -0.56 -0.47 -0.31 -0.59 -0.63 -1.0
0.53 0.61 -1.12 -4.38 0.93 0.75 0.33 0.35 0.28 0.22 0.05 0.21 -0.96 0.19 0.42 0.45 0.61 0.61 1.27 -0.07 -0.07 0.04 -0.05 -0.36 -1.25 -0.08 -0.32 0.05 -0.25 0.06 -0.96 -0.82 0.12 -0.62 0.04 -1.55 0.03 -0.22 0.06 0.27 -1.06 0.15 -0.13 -0.89 -0.09 -1.44 0.08 -0.03 0.15 0.15 0.14 -0.28 -0.39 -0.63
0.25 0.84 0.96 -3.67 0.8 0.71 0.17 -0.01 0.21 -0.23 -0.17 0.31 -0.87 0.49 0.12 -0.02 0.36 0.34 0.79 0.06 0.26 0.22 -0.45 -0.53 -0.99 -0.25 -0.22 -0.05 0.07 -0.27 -0.27 -0.51 0.19 -0.1 0.11 -1.06 -0.07 -0.16 -0.11 0.24 -0.54 0.23 0.12 -0.57 0.25 -0.47 0.17 0.19 -0.2 -0.32 -0.2 -0.58 -0.8 -1.03
0.81 0.78 1.12 -3.92 0.92 0.71 0.67 0.51 -0.01 0.34 0.02 0.22 -0.57 -0.26 0.34 0.26 0.36 0.29 0.48 -0.06 -0.2 0.5 -0.36 -0.48 -0.95 0.0 -0.0 -0.17 -0.03 -0.23 -1.1 -0.64 -0.28 -0.46 -0.24 -0.72 0.07 0.0 0.08 0.14 -0.73 0.07 -0.08 -0.89 0.2 -0.89 -0.04 -0.15 -0.06 -0.24 -0.21 -0.63 -0.67 -0.97
0.24 -0.06 0.43 -4.75 -0.37 1.02 0.3 0.43 -0.08 0.33 0.08 -0.05 -0.81 -0.44 0.18 0.24 0.3 0.3 0.37 -0.02 0.2 0.37 -0.13 -0.73 -0.85 0.02 1.03 0.21 -0.53 0.37 -1.14 0.35 0.28 -1.2 0.16 -0.49 0.2 -0.55 0.04 0.69 -0.38 0.96 -0.37 -1.04 -0.03 -0.89 0.28 -0.57 -0.28 -0.16 -0.22 -0.16 -0.57 -0.69
0.37 -0.5 -1.2 -5.7 0.73 0.55 0.39 0.0 0.58 -0.13 -0.07 0.45 -0.67 0.29 0.46 0.5 0.52 0.45 0.21 -0.3 -0.13 0.54 -0.08 0.23 -0.68 -0.47 -0.07 -0.37 -0.37 -0.33 0.59 0.42 0.58 0.22 0.67 -0.74 -0.61 -0.38 -0.31 0.03 -0.56 -0.12 -0.33 -0.59 0.1 -0.55 -0.4 -0.1 0.22 0.17 0.1 -0.57 -0.53 -0.57
0.8 1.18 1.21 -3.59 0.8 0.69 0.45 0.06 0.51 -0.18 -0.08 0.48 -1.11 -0.05 0.64 0.5 0.62 0.51 0.92 0.18 0.19 0.15 -0.37 -0.16 -1.2 -0.17 -0.58 -0.25 -0.09 -0.44 -0.72 -0.76 0.1 -0.01 0.02 -1.32 -0.15 -0.0 -0.16 -0.27 -0.89 -0.19 -0.23 -0.96 -0.2 -1.17 -0.2 -0.16 -0.36 -0.36 -0.21 -0.54 -0.7 -1.06
0.31 0.15 0.15 -5.19 0.31 0.9 0.61 0.31 0.5 0.2 0.15 0.5 -0.0 -0.03 0.43 0.42 0.43 0.35 0.05 0.18 0.31 0.62 -0.1 -0.87 -0.95 0.18 0.12 -0.24 -0.02 -0.28 -0.74 -0.32 -0.64 -0.6 -0.65 -0.05 -0.07 0.48 0.11 0.25 -0.62 0.06 -0.25 -0.67 0.47 -0.72 -0.35 -0.02 0.28 -0.23 -0.52 -1.02 -0.67 -0.49
1.0 1.33 1.48 -2.19 0.79 0.67 0.62 -0.59 0.08 -0.84 -0.59 -0.1 -0.77 0.33 -0.06 -0.12 -0.05 -0.03 0.36 -0.16 -0.13 0.28 -0.29 -0.4 -0.44 -0.65 -0.29 -0.1 -0.09 -0.22 0.03 -0.39 0.32 -0.0 -0.05 -1.04 -0.44 -0.48 -0.6 -0.17 -0.08 0.03 0.04 -0.12 0.1 -0.18 0.02 0.06 -0.02 -0.1 -0.13 -0.55 -0.46 -0.62
0.31 0.94 0.73 -3.78 0.99 0.83 0.38 0.4 0.19 0.25 0.16 0.07 -0.78 0.22 0.63 0.58 0.63 0.64 1.01 0.25 0.33 0.11 -0.48 -0.02 -1.59 -0.6 -0.96 -0.13 -0.17 -0.18 -0.37 -0.38 0.32 -0.14 0.21 -1.79 -0.5 -0.66 -0.53 -0.35 -0.93 -0.2 0.0 -1.04 -0.33 -1.2 0.05 0.07 0.02 -0.02 -0.38 -0.62 -0.57 -0.6
0.68 0.74 -0.2 -4.04 0.64 0.76 0.38 0.54 0.49 0.47 0.46 0.6 -1.18 -0.11 0.36 -0.15 0.37 0.23 0.34 0.56 0.26 0.67 -0.4 -0.22 -0.87 -0.51 -0.88 0.14 -0.12 -0.14 -1.26 -1.03 0.17 -0.12 0.03 -1.6 -0.22 -0.21 -0.64 -0.12 0.12 0.16 0.11 -0.34 -0.32 -0.45 0.27 -0.13 -0.55 -0.38 -0.14 -0.12 -0.11 -0.48
0.11 0.42 -0.11 -3.65 0.81 1.03 0.89 0.11 0.67 0.59 0.15 0.66 -0.33 -0.86 0.3 0.29 0.13 0.23 0.75 -0.16 0.3 0.04 -0.21 -0.68 -1.14 0.34 -0.05 -0.49 0.01 -0.43 -0.88 -0.53 -0.64 -0.9 -0.82 0.33 0.13 0.57 0.41 -0.02 -0.49 -0.11 -0.39 -0.83 0.47 -0.94 -0.64 -0.24 -0.29 -0.22 -0.15 -0.26 -0.25 -0.38
0.28 0.77 1.19 -3.73 0.86 0.69 0.25 0.18 0.37 0.05 -0.03 0.33 -0.75 0.27 0.45 0.38 0.35 0.42 1.1 0.21 0.33 0.58 -0.45 -0.47 -0.79 -0.46 -0.29 0.05 -0.04 -0.21 -0.51 -0.65 -0.0 -0.25 -0.13 -1.68 -0.28 -0.36 -0.37 -0.11 -0.63 0.13 -0.03 -0.74 -0.03 -0.87 0.07 -0.03 -0.42 -0.36 -0.24 -0.45 -0.65 -0.97
0.37 0.9 1.14 -3.6 0.9 0.85 0.44 0.23 0.28 -0.09 -0.19 0.1 -1.25 0.57 0.8 0.76 0.74 0.8 1.28 0.21 0.45 0.64 -0.57 -0.36 -1.06 -0.55 -0.47 -0.36 -0.34 -0.5 -0.63 -0.41 0.05 -0.33 -0.17 -0.51 -0.45 -0.49 -0.43 -0.39 -0.78 -0.19 -0.4 -1.01 -0.38 -1.11 -0.23 -0.33 -0.54 -0.59 -0.39 -0.53 -0.56 -0.95
1.15 0.97 0.36 -4.1 0.72 0.87 0.68 0.25 0.27 0.29 0.04 0.24 -0.43 -0.22 0.44 0.44 0.46 0.37 0.98 0.2 0.38 0.17 0.02 -0.7 -0.71 0.11 -0.77 -0.14 -0.18 -0.17 -0.83 -1.16 -0.42 -0.8 -0.5 -1.11 0.01 0.08 0.04 -0.15 -1.13 -0.36 -0.32 -0.81 -0.54 -1.34 -0.24 -0.17 -0.23 0.01 0.17 0.02 -0.23 -0.49
0.46 0.81 1.25 -5.65 0.49 0.75 0.72 0.41 -0.01 0.15 -0.05 -0.11 0.13 0.22 0.92 0.84 0.87 0.89 1.01 -0.21 0.13 0.63 0.1 -0.5 -1.51 -0.33 -0.17 -0.05 -0.22 0.01 -1.81 -0.92 -0.35 -1.01 -0.28 -1.44 -0.32 -0.75 -0.26 0.18 -1.32 -0.17 -0.48 -2.42 -0.32 -1.7 -0.18 -0.2 0.06 0.37 0.31 -0.86 -1.26 -1.42
0.26 0.71 0.32 -4.58 0.48 0.8 0.79 0.16 0.61 0.06 0.28 0.6 -0.3 0.59 0.24 0.31 0.24 0.24 0.34 0.04 0.17 0.25 -0.1 -0.42 -0.16 -0.26 -0.54 -0.25 -0.15 -0.2 0.08 -0.61 -0.17 -0.28 -0.36 -0.26 -0.4 -0.11 -0.37 -0.39 0.09 -0.45 -0.37 -0.05 -0.29 -0.08 -0.36 -0.21 -0.34 -0.22 -0.1 -0.09 -0.32 -0.62
0.61 1.16 1.12 -4.03 1.08 0.89 0.63 0.12 0.44 0.13 -0.09 0.41 -0.63 -0.17 0.66 0.63 0.67 0.67 0.94 0.25 0.28 0.08 -0.26 -0.73 -1.37 -0.38 -0.2 -0.29 -0.14 -0.24 -1.16 -0.44 -0.35 -0.65 -0.37 -1.56 -0.71 -0.5 -0.46 -0.08 -1.25 -0.03 -0.22 -1.2 0.07 -1.48 -0.21 -0.07 0.02 0.05 -0.13 -0.55 -0.75 -0.9
0.53 0.35 -0.14 -3.51 0.1 1.04 0.57 0.03 0.44 -0.15 -0.03 0.25 -0.31 0.08 0.59 0.42 0.61 0.56 0.51 0.04 0.23 0.05 -0.18 -0.14 -0.74 -0.23 -0.18 -0.17 -0.28 -0.07 -0.09 -0.58 0.17 -0.38 0.07 -1.62 -0.28 -0.38 -0.13 0.16 -0.32 -0.05 -0.26 -0.69 0.17 -0.23 -0.19 -0.04 0.5 -0.01 -0.44 -0.66 -0.28 -0.11
0.06 0.5 -0.82 -3.26 0.76 0.98 0.61 -0.15 0.37 -0.08 -0.32 0.54 0.26 -0.0 0.66 0.75 0.66 0.64 0.33 0.31 0.45 0.33 -0.18 -0.69 -1.94 0.15 0.17 -0.39 -0.11 -0.05 -2.26 -0.69 -0.43 -1.19 -0.61 -0.52 -0.15 0.09 0.05 0.32 -1.61 0.13 -0.21 -1.67 0.73 -1.64 -0.25 0.07 0.82 -0.0 -0.39 -0.67 -0.35 -0.13
0.32 0.33 0.19 -4.87 1.35 0.91 0.37 -0.08 0.14 0.09 -0.08 0.25 -0.72 -0.36 0.7 0.58 0.65 0.67 0.46 -0.07 0.15 0.11 -0.56 -0.31 -0.86 -0.05 -0.28 -0.53 -0.23 -0.29 -0.15 -0.04 0.02 -0.39 -0.07 -0.72 0.14 -0.04 0.21 0.02 -0.28 0.05 -0.33 -0.53 0.05 -0.74 -0.37 -0.22 -0.01 -0.09 -0.47 -0.46 -0.44 -0.36
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1.34 1.25 -0.04 -2.69 1.36 0.87 0.51 -0.2 -0.02 -0.29 -0.62 -0.33 -1.91 0.4 0.85 0.85 0.74 0.85 0.74 -0.39 -0.34 0.32 -0.08 0.33 -2.01 0.16 -0.83 -0.11 -0.99 -0.57 -0.65 -1.37 0.8 -0.87 0.59 -2.66 -0.08 -0.73 -0.03 -0.57 -0.93 -0.33 -0.32 -1.45 -0.62 -1.7 -0.32 -0.29 -0.04 -0.07 -0.04 -0.32 -0.23 -0.26
0.42 0.74 0.77 -3.76 0.94 0.83 0.43 0.41 0.53 0.21 0.03 0.42 -0.78 0.33 0.66 0.58 0.65 0.63 1.25 0.34 0.5 0.31 -0.55 -0.45 -1.26 -0.3 -0.37 -0.17 -0.17 -0.36 -1.35 -1.07 -0.04 -0.26 -0.12 -1.12 -0.13 -0.06 -0.28 -0.21 -0.94 -0.08 -0.16 -1.02 -0.08 -1.17 -0.04 -0.14 -0.56 -0.55 -0.38 -0.56 -0.81 -1.15
0.45 0.24 0.25 -4.12 -0.02 1.0 0.9 0.05 0.94 0.23 0.05 0.92 -0.35 0.42 0.2 0.23 0.21 0.25 0.52 0.35 0.53 0.18 0.03 -0.74 -0.93 -0.77 0.1 0.12 -0.44 -0.17 -0.87 0.43 -0.11 -0.97 -0.26 -1.24 -0.68 -0.81 -0.71 -0.2 -0.76 -0.05 -0.04 -0.97 -0.07 -0.89 -0.08 -0.13 0.04 0.15 0.33 0.0 -0.23 -0.35
0.71 0.75 1.39 -3.32 -0.5 1.22 0.46 -0.28 0.62 -0.39 -0.14 0.08 0.45 -0.65 0.78 0.78 0.71 0.61 0.04 -0.01 0.26 0.04 0.15 -1.6 -1.73 -0.53 0.63 0.01 -0.34 0.16 -1.66 -1.26 -1.43 -2.38 -1.3 -2.1 -0.52 -0.94 -0.2 0.53 -1.77 0.59 0.0 -2.0 0.74 -1.74 0.09 0.11 0.96 0.17 -0.25 -0.93 -0.37 -0.2
0.16 0.45 0.87 -3.95 -0.59 0.59 0.29 0.34 0.13 0.53 0.07 0.34 -1.06 0.05 -0.01 -0.23 -0.09 -0.05 0.36 -0.06 0.06 0.59 -0.43 -0.22 -1.07 -0.14 0.32 -0.15 -0.19 -0.22 0.41 0.86 0.42 -0.11 0.47 0.25 -0.18 -0.14 -0.21 0.2 -0.45 0.38 -0.08 -0.92 0.22 -0.8 0.16 -0.07 -0.4 -0.59 -0.59 -0.42 -0.63 -0.67
0.13 -0.29 0.28 -3.21 0.7 1.0 0.35 -0.03 0.18 -0.35 -0.24 0.13 -0.55 -0.01 0.11 0.19 0.32 0.14 0.34 -0.19 -0.12 0.47 -0.24 -0.79 -0.74 0.32 0.4 -0.14 0.03 0.03 -0.52 -0.56 -0.55 -0.95 -0.65 -0.16 0.28 0.54 0.5 0.59 -0.49 0.28 -0.05 -0.61 0.67 -0.44 -0.08 0.16 0.05 0.11 -0.03 -0.66 -0.44 -0.55
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0.28 0.13 -0.27 -5.01 1.01 0.76 0.65 -0.03 0.46 -0.31 -0.29 0.18 -0.47 0.4 0.74 0.78 0.81 0.77 1.27 -0.19 -0.07 0.74 -0.05 -0.36 -1.08 -0.15 -0.11 -0.08 0.2 -0.11 -1.53 -1.08 -0.13 -0.61 -0.03 -1.28 -0.38 -0.26 -0.24 0.11 -0.7 -0.0 -0.19 -0.97 0.11 -0.84 -0.17 0.06 -0.25 0.33 0.21 -0.74 -1.14 -1.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.