Heatmap: Cluster_342 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.09 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.02 0.0 0.14 1.0 0.26 0.28 0.04 0.1 0.67 0.2 0.31 0.15 0.07 0.26 0.19 0.12 0.4 0.17 0.23 0.14 0.22 0.22 0.15 0.15 0.25
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.23 0.0 0.02 0.0 0.48 0.5 0.55 0.44 0.26 0.62 1.0 0.75 0.48 0.77 0.31 0.3 0.85 0.05 0.58 0.55 0.75 0.06 0.32 0.55 0.1 0.12 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.1 0.55 0.52 0.23 0.04 0.13 0.5 0.03 0.05 0.05 0.08 0.32 0.67 0.05 0.37 0.19 0.23 0.07 0.25 0.44 0.05 0.11 1.0
0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.88 0.08 0.06 0.04 0.03 0.02 1.0 0.0 0.0 0.39 0.38 0.21 0.25 0.31 0.25 0.25 0.22
0.03 0.06 0.05 0.11 0.08 0.14 0.16 0.26 0.2 0.13 0.92 0.54 0.32 0.72 0.09 0.26 1.0 0.5 0.4 0.57 0.28 0.19 0.32 0.07 0.27 0.16 0.2 0.05 0.14 0.44 0.08 0.16 0.25
0.13 0.1 0.12 0.13 0.1 0.1 0.7 0.03 0.02 0.06 0.69 0.53 0.7 0.6 0.24 0.73 1.0 0.39 0.54 0.56 0.52 0.77 0.75 0.34 0.45 0.35 0.45 0.25 0.34 0.43 0.32 0.33 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.27 0.3 0.42 0.11 0.12 0.13 0.06 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.63 0.18 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.04 0.43 0.03 0.57 0.59 0.04 0.18 0.22 0.04 0.02 0.78
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.81 0.51 0.34 0.4 0.06 0.39 1.0 0.39 0.37 0.39 0.34 0.33 0.46 0.09 0.63 0.58 0.58 0.1 0.13 0.41 0.12 0.23 0.34
0.04 0.1 0.05 0.03 0.03 0.03 0.33 0.0 0.03 0.02 0.1 0.9 0.45 0.3 0.07 0.06 1.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.85 0.83 0.0 0.62 0.37 0.51 0.01 0.09 0.56 0.02 0.01 0.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.12 0.0 0.0 0.03 0.07 0.04 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.13 0.19 0.11 0.46 0.27 0.09 0.14 0.17 0.47 0.46 0.28
0.02 0.09 0.02 0.03 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.17 0.09 0.05 0.0 0.02 0.05 1.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.14 0.47 0.0 0.19 0.28 0.38 0.04 0.24 0.57 0.13 0.1 0.35
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.51 0.21 1.0 0.03 0.01 0.43 0.04 0.05 0.1 0.06 0.15 0.46 0.02 0.1 0.39 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.38 0.0 0.0 0.21 1.0 0.91 0.42 0.4 0.41 0.0 0.01 0.03 0.25 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 0.02 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.32 0.42 0.41 0.36 0.17 0.27 1.0 0.05 0.14 0.08 0.17 0.43 0.54 0.02 0.42 0.74 0.74 0.0 0.01 0.03 0.01 0.04 0.01
0.08 0.2 0.04 0.03 0.02 0.01 0.29 0.01 0.02 0.01 0.04 0.32 0.45 0.21 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.17 0.94 0.59 0.74 0.38 0.58 0.19 0.19 0.27 0.14 0.17 0.28
0.09 0.1 0.06 0.04 0.02 0.02 0.21 0.04 0.03 0.03 0.18 0.74 0.24 0.07 0.11 0.38 0.69 0.06 0.15 0.16 0.09 1.0 0.22 0.35 0.28 0.29 0.36 0.11 0.11 0.19 0.13 0.15 0.21
0.09 0.15 0.05 0.03 0.02 0.03 0.36 0.03 0.03 0.05 0.19 0.66 0.72 0.46 0.12 0.16 0.7 0.12 0.06 0.06 0.08 0.34 0.53 0.08 0.49 0.28 0.33 0.07 0.25 0.53 0.06 0.11 1.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.06 0.0 0.04 0.01 0.45 0.06 0.02 0.01 0.03 0.02 1.0 0.35 0.13 0.39 0.4 0.15 0.08 0.1 0.24 0.13 0.11
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.79 0.16 0.0 0.03 1.0 0.09 0.06 0.05 0.04 0.15 0.01 0.0 0.03 0.83 0.78 0.17 0.04 0.07 0.25 0.14 0.24
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 1.0 0.23 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.08 0.82 0.05 0.44 0.43 0.03 0.13 0.16 0.03 0.02 0.59
0.13 0.18 0.07 0.07 0.08 0.08 0.41 0.02 0.09 0.02 0.06 1.0 0.22 0.25 0.09 0.01 0.48 0.01 0.01 0.02 0.02 0.74 0.07 0.04 0.48 0.5 0.59 0.1 0.26 0.35 0.11 0.08 0.17
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 1.0 0.05 0.05 0.01 0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.19 0.06 0.07 0.06 0.04 0.14 0.02 0.02 0.04 0.23 0.55 0.39 0.45 0.34 0.22 0.67 0.19 0.36 0.37 0.34 0.27 1.0 0.11 0.34 0.29 0.3 0.18 0.26 0.37 0.3 0.23 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.19 0.21 0.0 0.02 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.0 0.24 0.28 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.31 0.45 0.21 0.01 0.01 0.62 0.01 0.01 0.01 0.01 0.19 1.0 0.47 0.55 0.33 0.48 0.18 0.16 0.19 0.14 0.19 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.03 0.25 0.39 0.2 0.01 0.01 0.54 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 1.0 0.4 0.48 0.38 0.59 0.12 0.12 0.15 0.09 0.1 0.19
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.01 0.0 0.14 0.48 0.21 0.29 0.01 0.07 1.0 0.02 0.02 0.04 0.07 0.1 0.29 0.03 0.42 0.33 0.35 0.03 0.05 0.24 0.07 0.15 0.19
0.05 0.16 0.05 0.03 0.02 0.04 0.82 0.04 0.02 0.01 0.29 1.0 0.56 0.8 0.03 0.2 0.99 0.29 0.16 0.19 0.14 0.39 0.43 0.09 0.61 0.59 0.6 0.1 0.21 0.6 0.16 0.28 0.46
0.35 0.38 0.14 0.11 0.13 0.35 0.72 0.07 0.04 0.12 0.04 1.0 0.4 0.34 0.11 0.05 0.86 0.0 0.11 0.1 0.04 0.44 0.25 0.1 0.48 0.75 0.87 0.13 0.24 0.48 0.15 0.2 0.48
0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.2 0.06 0.07 0.12 0.43 0.16
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.33 0.0 0.44 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.63 0.0 0.0 0.0 0.86 0.59 0.76 0.66 0.25 0.85 0.81 0.48 0.78 0.83 0.59 0.87 1.0 0.37 0.59 0.21 0.24 0.24 0.35 0.43 0.31 0.31 0.47
0.29 0.34 0.15 0.12 0.09 0.08 0.76 0.06 0.09 0.1 0.06 0.73 0.26 0.18 0.01 0.03 0.89 0.04 0.04 0.01 0.01 0.5 0.91 0.04 0.54 0.34 0.61 0.09 0.37 0.75 0.07 0.09 1.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.58 0.0 0.0 0.0 0.09 0.65 0.47 0.53 0.0 0.09 0.63 0.01 0.06 0.01 0.0 0.38 0.34 0.06 1.0 0.18 0.41 0.02 0.11 0.37 0.04 0.02 0.34
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.16 0.05 0.15 0.0 0.0 0.06 0.48 0.1 0.22 0.09 0.0 0.03 1.0 0.23 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.17 0.1 0.2 0.1 0.2 0.74 0.54 0.5 0.55 0.67 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.38 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.68 0.32 0.57 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.1 0.27 0.26 0.0 0.0 0.26 0.0 0.06 0.06 0.09 0.27 1.0 0.32 0.47 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.65 0.0 0.0 0.0 0.81 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.78 1.0 0.78 0.29 0.43 0.02 0.04 0.06 0.02 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.04 0.3 0.62 0.21 0.01 0.02 0.74 0.0 0.01 0.01 0.02 0.15 1.0 0.78 0.64 0.21 0.31 0.16 0.15 0.2 0.11 0.13 0.22
0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.62 0.01 0.0 0.02 0.48 1.0 0.5 0.94 0.0 0.29 0.93 0.27 0.21 0.17 0.13 0.49 0.07 0.02 0.62 0.44 0.54 0.06 0.11 0.28 0.11 0.17 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 1.0 0.46 0.09 0.0 0.04 0.27 0.0 0.01 0.0 0.01 0.13 0.24 0.0 0.51 0.25 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.67 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.94 0.83 0.74 0.38 0.5 0.01 0.04 0.08 0.02 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.26 0.92 0.0 0.21 0.05 0.1 0.03 1.0 0.0 0.17 0.04 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.1 0.02 0.02 0.01 0.04 0.31 0.01 0.02 0.01 0.27 0.65 0.97 0.33 0.48 0.26 1.0 0.16 0.11 0.1 0.12 0.68 0.69 0.09 0.7 0.41 0.5 0.07 0.04 0.1 0.04 0.06 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.38 0.64 0.49 0.4 0.01 0.2 1.0 0.24 0.13 0.14 0.14 0.37 0.23 0.04 0.53 0.75 0.67 0.07 0.1 0.33 0.13 0.11 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.38 0.84 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.01 0.23 0.14 0.02 0.71 0.51 0.44 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.03
0.13 0.17 0.02 0.01 0.03 0.03 0.97 0.04 0.02 0.08 0.36 1.0 0.32 0.8 0.22 0.16 0.82 0.21 0.17 0.13 0.15 0.76 0.16 0.14 0.88 0.58 0.64 0.08 0.29 0.4 0.1 0.07 0.43
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.14 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.26 0.1 0.36 0.13 0.29 0.77 0.81 0.72 0.76 1.0 0.68
0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01 0.0 0.1 0.55 0.26 0.23 0.07 0.04 1.0 0.13 0.1 0.06 0.01 0.45 0.38 0.13 0.36 0.29 0.46 0.06 0.14 0.39 0.14 0.28 0.31
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.63 1.0 0.99 0.52 0.09 0.37 0.72 0.24 0.37 0.53 0.32 0.71 0.98 0.2 0.73 0.31 0.4 0.11 0.19 0.54 0.16 0.28 0.53
0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.13 0.04 0.05 0.01 0.05 1.0 0.21 0.86 0.0 0.0 0.54 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.04 0.67 0.37 0.35 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.03
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.58 0.19 0.25 0.12 0.07 1.0 0.06 0.0 0.09 0.03 0.33 0.45 0.02 0.65 0.19 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.34 0.43 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.39 0.19 0.78 0.63 0.39 0.34 0.06 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02
0.02 0.05 0.01 0.03 0.03 0.02 0.72 0.06 0.03 0.0 0.04 0.71 0.46 0.23 0.0 0.15 0.96 0.0 0.01 0.0 0.01 0.55 1.0 0.01 0.54 0.62 0.69 0.02 0.09 0.45 0.06 0.04 0.92
0.02 0.03 0.03 0.04 0.05 0.08 0.04 0.09 0.11 0.33 0.0 0.1 0.67 0.07 0.01 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.47 0.0 0.91 0.18 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.44 0.39 0.32 0.3 0.16 0.64 0.22 0.14 0.22 0.31 0.47 0.51 0.54 0.22 0.17 1.0 0.21 0.22 0.2 0.24 0.78 0.85 0.27 0.8 0.35 0.36 0.41 0.56 0.64 0.48 0.49 0.77
0.08 0.26 0.02 0.04 0.04 0.02 0.2 0.04 0.14 0.11 0.16 0.73 0.8 0.5 0.01 0.02 0.94 0.14 0.06 0.08 0.07 1.0 0.6 0.19 0.54 0.18 0.26 0.15 0.16 0.72 0.19 0.46 0.68
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.01 0.0 0.37 1.0 0.43 0.65 0.09 0.13 0.57 0.06 0.04 0.06 0.07 0.6 0.46 0.32 0.64 0.17 0.2 0.21 0.26 0.46 0.3 0.32 0.38
0.01 0.03 0.02 0.01 0.04 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.14 0.16 1.0 0.13 0.52 0.87 0.33 0.11 0.2 0.06 0.18 0.34 0.47 0.19 0.29 0.35 0.18 0.33 0.26
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.19 0.88 0.92 0.73 0.0 0.19 1.0 0.09 0.06 0.06 0.01 0.6 0.12 0.1 0.59 0.56 0.61 0.03 0.15 0.49 0.15 0.22 0.35
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.06 0.0 0.02 0.01 0.22 0.2 0.16 0.67 0.52 0.11 0.18 0.28 0.28 0.1 0.05 0.14 0.58 1.0 0.34 0.27 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.24 0.66 0.88 0.52 0.02 0.12 1.0 0.09 0.06 0.09 0.08 0.5 0.68 0.22 0.61 0.45 0.68 0.19 0.17 0.58 0.23 0.35 0.59
0.01 0.09 0.01 0.02 0.02 0.02 0.26 0.0 0.06 0.0 0.02 0.91 0.31 0.12 0.04 0.04 0.78 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.16 0.1 0.43 0.6 0.68 0.21 0.45 0.37 0.15 0.16 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)