Heatmap: Cluster_68 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.0 -0.36 -0.01 -3.77 -3.22 0.31 0.84 0.36 0.4 -0.1 0.32 0.16 -0.11 -0.97 -0.33 -0.34 -0.35 -0.05 -1.52 -0.45 -0.23 1.16 0.01 -0.32 -0.63 0.65 0.04 -0.1 0.39 0.3 -0.35 -0.11 -0.33 -0.16 -0.18 -0.24 0.5 0.84 0.78 0.29 -0.58 -0.26 -0.01 -0.62 0.19 -0.25 0.06 0.15 0.64 0.39 -0.05 -0.47 -0.5 -0.27
-0.14 -1.29 -3.08 -5.69 -0.59 0.22 0.39 -0.3 0.45 -0.31 -0.09 0.16 -0.03 -0.6 -0.13 -0.33 -0.11 -0.35 -0.79 -0.07 -0.18 0.57 0.2 -0.36 -0.42 0.6 0.61 -0.0 -0.21 0.11 -0.85 -0.43 -0.69 -0.38 -0.4 0.04 0.32 0.61 0.63 0.62 -0.58 0.33 -0.18 -0.43 0.69 -0.59 -0.17 -0.04 0.7 0.25 0.05 0.1 0.67 1.14
0.93 0.18 -0.55 -3.35 -1.12 0.4 -0.73 -0.47 0.03 -0.25 -0.21 -0.47 0.13 -1.53 -1.26 -1.58 -1.25 -1.22 -1.93 -0.49 -0.59 -2.67 0.88 0.34 0.21 0.71 1.05 0.66 -0.24 0.78 -0.13 0.0 0.0 -0.49 0.22 -0.87 0.41 -0.3 0.35 0.68 0.06 0.18 -0.13 -0.04 -0.1 0.21 0.26 -0.23 0.88 0.35 0.33 0.12 0.22 0.58
0.42 -0.36 -5.16 -0.83 -3.41 0.38 -0.35 -0.66 1.01 -1.07 -0.84 0.64 0.69 0.39 -0.06 -0.14 0.39 -0.14 0.38 -0.23 -0.53 -1.3 0.14 -0.89 -0.0 0.17 0.69 0.12 0.58 0.48 -0.22 -0.65 -0.64 0.04 -0.18 -0.87 0.08 0.04 0.23 0.18 -0.79 -0.48 0.05 0.09 0.82 0.18 0.08 0.06 -0.13 0.44 0.52 0.3 0.06 -0.18
0.64 0.1 -0.06 -3.97 -1.05 -0.35 -0.36 -1.11 -0.6 -2.37 -1.47 -1.0 -1.78 -1.49 -0.47 -0.24 0.11 -0.39 -0.6 -0.63 -1.58 -1.26 0.62 0.55 0.61 -0.56 0.07 0.5 0.15 0.24 0.51 -1.12 0.4 0.17 0.14 -0.55 -0.78 -1.19 -0.57 0.18 0.88 0.24 0.01 0.74 -0.11 0.92 -0.12 0.54 0.36 0.15 0.64 0.95 1.1 1.12
0.6 0.9 -0.78 -1.33 - 0.12 -2.35 -0.38 0.58 -1.05 -0.33 0.52 -0.76 -2.18 0.37 -1.03 0.08 -1.31 -1.08 -1.59 0.18 -0.85 0.62 0.83 0.31 0.68 -0.11 -0.08 0.37 0.05 -0.71 -1.21 -0.58 -0.5 -0.05 -0.63 0.37 0.38 0.92 0.08 -0.12 0.08 -0.31 -0.33 0.08 -0.28 0.41 -0.17 0.45 0.23 0.46 0.61 0.89 0.95
-1.91 -1.53 -3.69 -1.14 -4.56 0.44 1.44 -0.84 -0.42 -0.49 -1.96 -0.06 1.57 0.71 -1.72 -1.34 -1.3 -1.67 -1.44 1.26 1.4 -0.08 0.48 -1.28 0.79 0.5 -1.28 -0.6 0.04 -0.2 0.11 -0.3 -0.98 -0.54 -1.05 0.63 -0.0 -0.0 -0.33 -0.59 0.71 -1.11 0.25 1.01 0.1 0.41 -0.76 0.1 0.09 0.08 -0.2 0.62 0.59 0.29
-0.33 -0.03 -4.73 -2.97 - 0.52 1.32 -0.72 0.97 -0.99 -0.24 0.63 0.07 -0.44 -0.27 -0.66 0.09 0.07 -0.81 -0.7 -0.27 -3.19 0.26 -0.18 0.62 -0.35 -0.81 0.41 -0.12 -0.09 -0.29 -1.33 0.18 -0.28 -0.77 0.53 -0.18 -0.6 -0.48 -0.62 1.53 -0.45 -0.15 0.91 -0.69 0.97 -0.03 0.1 -0.0 0.4 0.45 0.34 0.53 0.61
-0.08 -3.29 - -4.19 -10.77 0.13 0.36 0.69 0.49 0.36 0.55 0.49 0.04 0.56 -0.85 -1.48 -0.51 -1.01 -0.24 -0.43 -0.39 -0.22 0.04 0.23 -0.56 0.19 -0.05 0.33 -0.25 0.41 -0.44 -0.34 0.8 -0.38 0.78 1.58 -0.18 -0.27 0.3 0.39 0.51 0.19 0.38 -0.27 0.14 -0.14 0.35 0.22 -0.49 -0.13 0.26 -0.17 -0.53 -0.75
0.15 -2.73 -2.45 -2.29 -6.65 0.61 0.26 -0.79 0.3 -0.69 -0.47 0.1 -0.13 -0.42 -0.18 -0.44 0.21 -0.0 0.41 -1.72 -1.31 0.02 0.5 0.3 -0.67 0.58 0.02 0.5 -0.05 0.21 -0.56 -0.35 0.64 -0.32 0.27 0.69 0.55 0.22 0.82 -0.31 -0.26 0.23 0.4 -1.25 0.15 -0.3 0.54 0.31 0.04 0.71 0.77 0.25 -0.04 -0.2
-0.54 -0.69 -1.92 -3.83 0.11 0.52 0.13 -0.5 0.35 -0.34 -0.41 0.45 -0.34 -0.07 -0.08 -0.14 -0.12 -0.11 0.08 0.24 0.17 -0.05 -0.25 -0.45 -0.04 0.43 0.31 -0.53 -0.66 -0.36 0.69 -0.09 -0.08 -0.58 -0.04 -0.55 0.47 0.16 0.56 0.21 0.25 0.4 -0.15 -0.09 0.35 0.39 -0.14 -0.16 0.25 0.07 -0.17 0.17 0.45 0.6
-1.12 -1.63 -2.09 -4.81 0.01 0.69 0.01 -0.54 -0.67 -0.54 -1.37 -0.18 -0.19 0.91 0.9 0.62 1.27 1.0 -0.18 0.21 0.66 -0.15 -0.13 -1.46 -1.58 1.13 -0.29 -0.41 0.36 0.22 -1.53 -0.99 -1.03 -0.51 -0.75 0.55 1.0 1.09 1.29 0.38 -0.72 -0.26 -0.3 -0.7 0.34 -0.91 -0.18 0.32 -0.67 -0.61 -0.31 0.11 -0.52 -0.92
-0.91 -1.18 -1.52 -6.94 0.1 0.72 -0.14 -0.35 0.09 -0.43 -0.81 0.13 0.68 0.67 0.73 0.56 1.05 0.88 -0.09 0.61 0.82 -0.13 -0.24 -1.44 -1.43 0.97 -0.36 -0.33 0.2 0.23 -1.34 -1.08 -1.05 -0.61 -0.81 0.55 0.87 0.95 1.05 0.29 -0.59 -0.27 -0.29 -0.65 0.07 -0.65 -0.18 0.15 -0.72 -0.69 -0.4 0.07 -0.61 -0.95
1.25 1.28 0.79 -0.7 - -0.49 -1.08 0.25 - 0.68 0.26 - - -1.86 -0.2 0.16 1.2 0.87 - -1.17 0.03 - 1.33 -1.5 -2.6 0.87 0.18 0.44 0.58 0.19 -2.02 -2.19 -3.18 -1.41 -3.02 -0.71 0.49 1.25 0.8 0.66 - 0.58 0.46 -2.14 0.75 -2.01 0.77 0.98 -0.74 -1.56 -1.0 1.5 0.25 -0.19
0.29 -0.01 -0.44 -4.09 -0.36 0.21 0.62 0.21 0.83 0.11 0.32 0.53 0.18 -0.59 -0.35 -0.48 -0.33 -0.23 0.06 0.01 0.06 -0.19 0.24 -1.43 -0.49 0.05 0.29 0.04 -0.05 0.18 -0.77 -0.76 -1.46 -1.33 -1.28 -0.02 -0.0 -0.02 0.28 0.71 -0.39 0.27 0.12 -0.51 0.9 -0.13 0.13 0.36 0.08 0.45 0.64 0.23 0.02 0.02
-0.92 -0.6 -2.24 -5.64 -1.66 0.53 0.45 0.42 -0.56 -0.05 -0.12 -0.61 -0.11 -0.42 0.19 0.27 0.25 0.31 1.1 -0.82 -0.57 0.74 -0.0 -0.06 -0.26 0.13 -0.23 0.4 0.18 0.4 0.4 -0.88 0.47 -0.97 0.24 -0.0 0.56 -0.2 0.33 0.28 0.08 0.2 0.16 -0.87 -0.29 -0.15 0.52 0.16 0.34 0.26 -0.16 -0.16 -0.23 -0.19
0.44 0.05 -3.85 -4.86 -9.5 0.78 0.79 -0.23 -0.34 -0.11 -0.3 -0.03 -0.01 -0.16 0.21 0.37 0.33 0.39 -0.1 -0.6 -0.37 -0.46 -0.28 -0.99 -1.81 0.53 0.88 -0.15 0.01 0.16 -2.01 -0.5 -0.72 -1.07 -0.83 -1.51 0.74 0.92 0.95 1.23 -1.5 1.21 0.12 -1.43 1.45 -1.58 0.15 0.1 1.06 -0.1 -0.69 -0.82 -0.65 -0.38
0.08 -1.04 -4.14 -3.6 -1.45 0.24 0.37 -0.54 -0.21 -0.35 -0.4 -0.17 0.11 0.51 -0.85 -0.58 -0.93 -0.99 -0.88 -0.11 -0.11 -0.12 0.31 -0.9 -0.29 0.27 0.97 0.35 0.46 0.54 0.83 -0.15 -0.43 -0.27 -0.33 0.14 0.3 0.36 0.37 0.93 -0.17 0.53 0.24 0.1 0.82 0.1 0.51 0.28 -0.17 0.08 -0.08 0.08 -0.24 -0.25
-1.47 -1.21 -1.92 -5.44 -0.42 0.38 0.19 0.24 -0.2 0.37 0.45 0.25 0.07 0.13 0.65 0.74 0.63 0.64 1.49 -0.66 -0.22 -1.71 0.23 -1.75 -1.51 0.5 0.64 0.43 -0.19 0.39 -2.87 0.03 -1.28 -1.97 -1.52 -0.56 0.73 -0.21 0.46 0.53 -0.96 0.63 -0.04 -1.02 0.51 -1.5 0.44 0.07 -0.46 -0.15 0.23 0.62 0.3 -0.12
1.38 -0.07 -1.58 -2.05 -1.66 -0.2 -0.22 -0.81 -1.17 -0.12 -0.6 -0.64 -1.7 -0.26 -1.2 -0.69 -0.99 -0.81 -0.49 -0.72 -0.23 -1.12 0.15 -0.43 -0.2 0.55 0.74 0.47 0.57 0.16 -1.01 -0.89 -0.28 -0.37 -0.25 -0.92 0.5 0.92 0.34 0.98 0.04 1.07 0.68 -0.54 1.19 -0.15 0.32 0.56 -0.15 -0.1 0.25 0.2 0.44 0.54
-1.75 -1.38 -4.41 -2.26 -0.26 0.77 0.72 -0.0 0.27 0.77 1.0 0.0 0.52 -0.39 0.31 0.13 0.35 0.32 -1.91 -0.85 -0.16 0.28 -0.0 -0.53 -3.49 0.92 0.08 -0.35 0.23 0.26 -0.88 0.45 -0.99 0.88 -0.61 -1.26 0.73 1.11 1.18 0.74 -3.77 -0.13 -0.49 -2.01 0.73 -4.0 -0.38 -0.08 0.67 0.77 -0.09 -1.45 -1.17 -0.82
2.03 -0.65 -0.1 -2.93 -2.36 -1.31 - -0.02 1.2 -1.5 0.66 1.36 -0.92 -2.46 -0.68 -0.82 -0.94 -1.44 - 0.07 -1.56 -2.33 0.98 0.8 -0.98 1.03 0.14 0.82 0.11 0.65 -1.94 0.13 -0.87 -0.08 -0.4 0.34 0.59 1.12 0.68 -1.16 -1.33 -0.57 0.37 -2.23 0.44 -2.31 0.81 0.13 0.22 -0.88 0.4 0.47 -0.22 -0.27
-3.28 - - -2.34 - -0.32 1.23 -0.23 - -0.42 -2.13 - 1.49 -2.51 - -1.04 -2.45 -1.0 - -0.61 1.77 - 0.66 0.24 -0.05 1.48 0.64 0.49 0.67 -0.43 0.65 0.53 -0.01 0.48 0.12 0.3 0.37 1.77 1.31 0.52 -0.82 -0.31 0.03 0.12 0.41 -2.97 0.09 0.46 -0.8 -0.51 -0.2 -0.25 -0.41 0.32
-0.6 0.04 0.81 -6.29 -0.68 0.12 0.42 -0.3 0.32 -0.27 -0.27 0.33 0.08 -0.95 0.0 0.02 0.05 -0.07 -1.01 0.01 0.09 -0.75 0.41 -1.04 -0.38 0.28 0.74 0.03 -0.11 0.21 0.17 -0.55 -1.02 -0.97 -1.06 -0.49 0.27 0.08 0.5 0.53 -0.29 0.39 -0.03 -0.36 0.61 -0.22 -0.07 0.13 0.52 0.31 0.17 0.21 0.42 0.54
0.16 0.17 0.59 -2.87 -1.42 0.92 0.36 -0.65 -0.16 -0.2 -0.38 -0.1 0.78 0.26 0.66 0.45 0.8 0.58 -0.22 0.0 0.64 -1.13 0.15 -0.24 -2.58 0.87 0.37 -0.21 -0.82 -0.14 -1.24 -1.25 -0.31 -1.16 -0.02 -3.08 1.01 0.56 1.02 0.23 -2.43 0.3 -0.39 -2.36 0.54 -2.07 -0.1 -0.23 1.05 -0.56 -1.38 -1.51 -0.22 0.88
1.99 -1.62 - 1.0 -3.95 -1.78 - - -1.56 - - - -0.34 0.62 - - - -1.67 - -1.51 0.18 - 0.41 -0.47 0.05 0.69 0.42 0.25 0.7 0.79 0.2 -0.12 -0.19 -0.64 -0.33 -0.88 0.46 0.69 0.84 1.08 0.01 0.23 0.26 0.49 1.32 -0.47 0.31 0.93 0.53 0.81 0.77 0.7 0.58 0.41
-0.3 -0.88 -1.87 -6.71 -2.67 -0.13 0.24 -0.15 0.09 -0.58 -0.28 -0.01 0.06 -0.4 0.26 0.15 0.27 -0.01 -0.8 -0.7 -0.34 -0.62 0.71 -0.8 -0.69 0.83 0.78 0.51 -0.22 0.52 -0.29 -0.62 -0.2 -1.71 -0.5 -0.57 0.59 0.09 0.9 0.92 -0.84 0.51 0.37 -1.06 0.8 -1.14 0.25 0.46 0.83 0.5 0.49 -0.26 0.02 0.43
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0.24 -1.16 -3.03 -2.05 - 0.53 1.27 -1.58 -0.63 -3.45 -0.68 - 0.29 -1.7 -1.24 -0.58 -1.25 -2.28 -1.65 -0.97 -0.81 -3.16 1.0 -0.9 1.0 -1.05 1.48 0.76 -0.03 0.57 -0.2 -0.41 -0.63 -1.02 -0.82 0.09 -0.62 -1.82 -0.87 -0.11 0.86 0.82 0.78 1.51 0.53 -0.23 -0.03 -0.01 -0.61 0.76 1.28 1.4 0.72 0.51
-0.84 -2.97 - -2.58 -0.42 0.52 0.31 -0.6 -0.87 -2.57 -2.14 0.08 -0.32 -2.52 -0.3 -0.5 -1.79 -0.51 -2.89 -1.77 -1.05 -0.23 0.3 -0.92 -0.37 1.33 0.43 0.67 0.17 0.72 0.07 -1.0 -0.42 -1.42 -0.44 0.97 0.9 0.75 1.22 1.09 -0.43 0.82 0.85 -1.16 0.34 -0.61 0.88 0.38 0.87 -0.15 0.48 -0.25 0.49 0.54
-0.15 -0.47 -7.73 -4.96 -9.09 0.35 -0.18 -0.0 1.21 -0.36 0.6 1.14 0.89 -0.02 -1.02 -0.85 -1.09 -0.9 -0.17 -0.27 -0.28 -0.57 0.37 -0.16 0.6 -0.43 0.03 -0.22 0.35 0.18 1.18 -0.61 -0.36 -0.27 -0.24 -0.25 -0.87 -0.99 -0.73 0.79 0.44 -0.54 -0.19 1.13 0.48 0.54 -0.25 0.21 -0.16 0.3 0.22 -0.41 0.02 -0.11
-1.1 -0.86 -5.62 -4.76 -8.58 0.0 -0.98 0.27 1.15 -0.24 0.22 1.39 0.51 -0.07 -0.29 -0.64 -0.47 -0.62 0.05 -0.1 -0.15 -1.74 0.7 -0.59 0.38 0.02 0.4 -0.13 0.26 0.33 -0.11 -0.91 -0.83 -0.8 -0.76 -0.51 -0.37 -0.78 -0.27 0.68 0.27 0.1 0.1 0.73 0.76 0.07 0.07 0.41 0.51 0.87 0.76 -0.09 0.14 -0.19
-0.67 -0.81 -3.44 -6.72 -8.52 -0.19 -2.06 -0.4 2.33 -0.37 0.61 2.27 1.64 0.37 -0.69 -0.83 -0.97 -1.15 -0.33 0.45 0.49 -3.2 0.43 -0.71 0.24 -1.23 0.07 -0.43 -0.37 0.18 0.29 -1.01 -1.3 -1.1 -1.01 -1.66 -1.52 -2.18 -1.67 0.13 0.45 -0.36 -0.11 0.56 0.0 0.45 -0.06 -0.09 0.32 0.63 0.44 -0.29 0.15 -0.17
-2.13 -1.25 -5.24 -6.85 -8.55 -0.17 -10.68 -0.19 1.3 -0.24 0.23 1.34 0.5 -0.36 -0.59 -1.01 -0.87 -1.1 -0.74 -0.38 -0.08 - 0.91 -0.46 0.22 0.29 0.56 0.38 0.43 0.57 -0.05 -0.79 -0.73 -0.67 -0.6 -0.19 -0.19 -0.43 -0.09 0.9 0.33 0.28 0.13 0.67 0.63 0.06 0.16 0.54 0.64 1.02 0.82 -0.16 0.11 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.