Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.56 0.66 0.59 -4.18 -1.7 0.85 0.76 0.67 0.92 0.65 0.41 0.87 -0.4 0.72 0.45 0.24 0.43 0.29 0.22 0.09 0.17 0.95 0.23 -1.2 -0.94 -0.34 -0.49 0.11 0.23 -0.12 -1.68 -0.84 -1.11 -1.02 -1.27 -0.35 -0.43 -0.19 -0.36 -0.26 -0.95 -0.59 -0.16 -0.96 -0.22 -1.15 -0.1 -0.06 -0.46 -0.15 0.03 0.2 0.01 -0.13
1.55 -0.7 -3.06 -3.92 -0.34 1.35 1.01 -0.15 0.21 -0.74 -0.59 0.06 0.32 -0.15 0.52 0.24 0.26 0.3 -0.1 0.02 0.42 -0.14 0.12 -0.51 -0.68 -0.98 -0.39 -0.16 -0.04 -0.09 1.04 -0.7 -0.24 -0.47 -0.2 0.58 -0.8 -0.45 -0.88 -0.37 -0.19 -0.42 -0.2 -0.29 -0.26 -0.24 -0.15 0.01 -0.09 0.07 -0.02 0.25 0.14 0.36
0.5 0.05 -0.78 -5.3 -0.82 0.64 0.71 0.29 0.54 -0.1 0.11 0.38 -0.54 -0.21 0.04 -0.25 0.16 0.1 0.12 0.37 0.19 0.28 0.05 -0.28 -0.54 0.18 -0.17 -0.04 -0.06 0.07 -0.45 -0.42 -0.05 -0.1 -0.01 -1.07 0.2 0.16 0.24 0.15 -0.35 -0.04 0.16 -0.32 0.24 -0.33 0.13 0.3 -0.02 0.13 0.19 -0.34 -0.09 -0.05
1.3 1.17 -0.58 -4.43 0.13 0.91 1.45 0.09 1.09 0.15 0.11 0.75 -0.33 0.17 -0.02 0.19 -0.03 0.03 0.09 0.37 0.31 0.29 -0.08 -0.31 -0.17 -0.54 -0.84 -0.22 -0.38 -0.39 0.33 -0.98 -0.27 -0.56 -0.51 -0.33 -0.64 -0.39 -0.66 -0.63 -0.24 -0.54 -0.34 -0.34 -0.37 -0.46 -0.35 -0.29 -0.38 -0.4 -0.27 -0.44 -0.1 0.01
1.47 0.98 -1.99 -5.14 -1.83 1.17 1.29 0.2 0.74 -0.38 -0.14 0.67 -0.32 0.75 0.36 0.39 0.43 0.41 0.77 0.38 0.42 0.28 0.05 -0.27 0.56 -1.28 -1.55 -0.39 -0.82 -0.68 0.47 -1.07 -0.18 -0.53 -0.57 -0.57 -1.34 -1.93 -1.41 -1.24 0.5 -1.06 -0.62 0.4 -1.05 0.15 -0.64 -0.31 -0.35 -0.04 0.16 -0.29 -0.14 -0.27
0.55 0.21 -0.4 -5.08 -1.2 0.82 1.06 0.01 0.27 -0.13 -0.23 0.46 -0.57 -0.17 0.45 0.62 0.4 0.5 0.61 -0.18 0.12 0.45 -0.18 -0.16 -0.36 0.47 -0.78 -0.67 -0.2 -0.51 0.14 0.46 -0.21 0.4 0.11 0.35 -0.23 0.46 0.27 -0.62 -0.7 -0.85 -0.73 -0.23 -0.24 -0.83 -0.76 -0.27 -0.37 -0.14 -0.24 0.28 -0.08 -0.11
1.15 0.74 -0.15 -4.83 -1.21 0.74 0.98 0.35 1.14 0.29 0.32 1.19 -0.23 0.22 -0.01 -0.24 0.08 -0.1 -0.18 0.54 0.54 -0.14 -0.11 -0.07 -0.54 -0.18 -0.8 -0.15 -0.24 -0.23 -0.41 -0.54 -0.07 -0.38 -0.13 -0.91 -0.1 -0.3 -0.18 -0.36 -0.14 -0.31 -0.23 -0.32 -0.27 -0.48 -0.1 -0.03 -0.35 -0.44 -0.3 -0.4 -0.17 -0.19
0.97 0.91 -7.82 -5.68 -3.38 0.89 1.01 -0.57 -0.13 -0.94 -1.02 -0.37 0.05 -0.1 0.64 0.45 0.69 0.62 0.6 -0.66 -0.26 -0.07 0.02 0.16 0.25 -1.0 -1.54 -0.07 -0.38 -0.01 0.28 -2.05 0.47 0.1 0.42 -2.77 -0.85 -1.02 -0.69 -0.69 0.36 -0.68 -0.19 0.38 -0.69 0.25 -0.22 0.04 0.11 0.07 -0.28 0.44 1.02 1.09
1.51 0.55 -1.5 -5.54 -0.68 0.93 1.82 -0.27 1.14 -0.01 -0.1 1.49 -1.43 0.33 1.0 0.9 0.88 0.69 0.46 -0.7 -0.5 0.14 0.16 -0.98 -0.44 -0.55 -2.12 -0.49 -0.56 -0.64 -0.93 -2.22 -0.66 -1.15 -0.88 -0.78 -0.67 -0.88 -0.61 -1.21 -0.62 -1.0 -0.75 -0.15 -1.12 -0.86 -0.8 -0.43 -0.27 0.13 0.07 0.82 0.47 0.14
0.73 0.64 -0.8 -3.94 -1.78 1.14 0.67 0.36 0.2 0.18 0.07 0.05 -1.03 0.45 1.12 1.28 1.23 1.31 0.74 0.99 1.17 0.04 -0.34 -1.08 -1.11 -1.29 -1.05 -0.14 -0.42 -0.36 -0.88 -1.04 -0.55 -0.98 -0.93 -1.67 -0.68 -1.39 -1.08 -0.55 -0.68 -0.0 0.01 -0.91 -0.73 -1.19 -0.14 -0.1 -0.44 -0.59 -0.69 0.44 0.4 0.22
1.04 0.86 0.55 -5.37 -1.08 0.75 0.73 0.5 0.75 0.25 0.2 0.7 -0.28 0.75 -0.01 -0.09 0.05 0.02 -0.24 -0.03 0.04 0.48 -0.38 -0.36 0.22 -0.45 -0.87 -0.57 -0.23 -0.56 0.62 -0.53 -0.32 -0.28 -0.42 0.51 -0.43 -0.18 -0.39 -0.59 0.33 -0.68 -0.5 0.43 -0.36 0.21 -0.71 -0.4 -0.45 -0.38 -0.32 -0.45 -0.45 -0.43
0.18 0.04 0.84 -5.05 -0.36 0.82 0.68 -0.16 0.61 -0.31 -0.18 0.62 -0.27 -0.23 0.34 0.38 0.54 0.61 -0.2 -0.28 0.01 0.26 0.35 -1.01 -0.54 -0.63 0.01 0.04 0.17 -0.05 -0.55 -0.17 -0.64 -0.78 -0.7 -0.03 -0.78 -0.42 -0.57 0.08 -0.35 -0.1 -0.03 -0.38 0.42 -0.33 -0.2 0.34 0.43 0.46 0.46 -0.16 -0.26 -0.24
0.38 0.55 -1.96 -3.89 -0.64 1.03 1.91 0.42 0.89 0.71 0.9 0.76 -1.16 0.81 -0.35 -0.59 0.1 -0.38 -0.19 -0.59 -0.87 1.07 -0.25 0.07 -0.5 -0.46 -0.37 -0.58 -0.14 -0.35 0.65 0.14 -0.04 1.15 -0.15 -0.8 -0.79 -0.55 -0.82 0.13 -0.59 -0.42 -0.6 -0.19 -0.02 -0.72 -0.48 -0.37 -0.64 -0.46 -0.4 -0.93 -0.88 -1.11
0.3 0.98 -0.45 -3.47 -0.54 0.88 1.59 0.48 1.16 0.9 1.03 1.08 -0.64 0.65 -0.51 -0.47 -0.34 -0.65 -0.01 -0.36 -0.53 0.93 -0.04 0.23 -0.38 -0.78 -0.26 -0.48 -0.05 -0.23 0.4 -0.15 -0.35 1.08 -0.32 -1.09 -1.0 -0.74 -0.94 -0.04 -0.61 -0.53 -0.69 -0.37 -0.2 -0.67 -0.6 -0.5 -0.56 -0.39 -0.36 -0.84 -0.66 -1.07
0.81 -0.5 -1.72 -5.17 -0.16 1.15 1.0 -0.02 0.69 -0.08 0.05 0.55 -0.16 1.41 0.9 0.72 0.9 0.88 -0.16 -0.07 0.13 0.27 0.01 -0.81 -2.22 0.39 -0.38 -0.37 -0.48 -0.09 -0.62 -1.3 -0.39 -1.04 -0.57 -1.73 0.04 0.17 0.39 -0.21 -2.02 -0.3 -0.17 -2.2 0.03 -2.06 -0.38 0.04 0.93 0.15 -0.47 -0.66 -0.42 -0.15
1.12 1.15 -2.14 -3.7 -1.64 1.04 1.4 0.3 0.39 -0.24 -0.19 0.25 -0.64 0.18 0.43 0.41 0.39 0.27 -0.23 0.43 0.37 0.13 -0.01 -0.25 -0.44 0.12 -1.07 -0.38 -0.81 -0.36 -0.09 -1.78 0.01 -0.26 -0.06 -1.45 0.14 -0.15 0.22 -0.69 -0.14 -0.58 -0.57 0.06 -0.75 -0.35 -0.44 -0.33 -0.54 0.1 0.11 0.41 0.35 0.21
0.8 0.62 1.24 -5.14 -1.55 1.14 1.68 0.3 1.14 0.85 0.83 1.28 -0.37 -0.14 0.36 0.31 0.18 0.16 0.65 -0.12 0.09 -0.46 0.27 -1.04 -0.45 -0.46 -1.49 -0.64 -0.45 -0.59 -1.61 -2.55 -0.57 -1.61 -0.93 -1.73 -0.44 -0.5 -0.38 -0.93 -0.8 -0.82 -0.72 -0.46 -0.86 -1.11 -0.87 -0.39 -0.66 0.02 0.21 0.86 0.41 0.05
0.63 -0.34 -3.5 -4.82 0.11 1.06 0.88 0.84 1.05 0.75 0.74 0.95 -0.38 0.51 0.25 0.15 0.32 0.11 0.27 0.76 0.55 0.99 -0.19 -1.29 -1.12 -0.76 -0.12 -0.44 -0.34 -0.28 0.36 -0.28 -0.82 -1.21 -0.92 -1.3 -0.83 -0.87 -0.45 -0.09 -0.99 0.08 -0.46 -1.35 0.21 -1.16 -0.62 -0.16 -0.2 0.74 0.77 -0.24 -0.84 -1.64
1.47 0.6 - -4.18 -1.76 1.41 1.18 0.9 1.34 0.27 0.18 1.27 -0.64 1.43 1.09 0.93 0.73 0.95 1.02 1.56 1.38 1.14 -0.64 -1.1 -1.51 -2.03 -2.21 -1.03 -0.81 -0.95 -1.01 -1.06 -0.69 -0.85 -1.09 -1.92 -1.88 -1.85 -1.83 -1.46 -1.48 -1.5 -1.17 -0.84 -1.5 -1.52 -1.06 -0.79 -0.34 -0.37 -0.67 -1.13 -1.14 -1.28
1.4 1.18 0.85 -0.31 -1.71 0.83 1.1 0.48 0.92 -0.1 0.31 0.64 0.2 0.39 -0.1 0.05 0.1 -0.08 -0.02 0.35 0.24 0.09 -0.02 -1.11 0.12 -0.52 -1.26 -0.24 0.02 -0.39 0.49 -1.28 -0.95 -0.98 -1.09 -0.96 -0.85 -0.68 -0.87 -0.71 -0.21 -0.87 -0.49 0.1 -0.37 -0.25 -0.6 -0.11 -0.29 -0.07 0.05 0.05 -0.12 -0.52
1.53 1.26 -1.63 -3.51 -3.73 1.25 0.62 1.02 1.29 0.98 1.14 1.05 0.87 2.61 0.55 0.62 0.65 0.51 1.08 0.21 0.6 1.12 -1.15 -0.59 -0.84 -1.96 -2.47 -1.52 -1.61 -1.7 0.13 -0.93 -0.94 -1.73 -1.5 -0.22 -2.45 -2.69 -2.56 -2.27 -0.92 -2.28 -1.73 -0.95 -2.4 -1.09 -1.63 -1.66 -1.64 -1.49 -1.38 -1.27 -1.07 -1.06
1.15 0.68 0.07 -4.15 -0.8 0.86 1.1 0.16 0.64 -0.25 -0.08 0.52 -0.33 0.1 0.44 0.48 0.51 0.46 0.2 0.7 0.59 0.25 -0.01 -1.15 -0.36 -0.31 -0.45 0.04 -0.02 -0.1 -0.7 -1.1 -0.76 -1.41 -1.06 -1.06 -0.33 -0.49 -0.31 -0.44 0.01 -0.1 -0.05 -0.06 -0.29 -0.42 -0.08 0.0 -0.27 0.05 -0.0 -0.03 -0.1 -0.25
1.17 0.63 -0.31 -3.75 -0.98 1.05 1.35 0.25 0.94 -0.06 -0.43 0.61 0.22 0.1 0.57 0.43 0.52 0.5 0.74 0.93 1.1 0.69 -0.26 -0.95 0.13 -1.08 -0.76 -0.58 -0.92 -0.76 0.06 -1.19 -0.79 -0.66 -1.13 0.07 -1.39 -1.04 -1.38 -1.56 0.42 -1.37 -0.89 0.32 -1.25 0.47 -0.96 -0.7 -0.66 -0.1 0.07 -0.39 -0.04 -0.44
0.61 0.03 0.48 -4.8 -1.15 1.14 1.08 0.26 0.21 0.13 -0.26 0.14 0.13 0.57 0.85 0.53 0.99 0.93 0.35 0.29 0.71 0.42 0.45 -0.28 -1.11 -1.05 -0.73 0.42 0.31 0.23 -1.45 -0.29 -0.51 -0.55 -0.6 -1.93 -0.92 -1.07 -1.04 -0.51 -1.19 -0.6 0.08 -1.42 -0.6 -1.4 -0.06 0.17 -0.35 -0.06 0.16 0.41 -0.1 -0.49
0.0 -0.21 -0.1 -4.67 -0.19 0.74 0.86 -0.38 0.16 -0.7 -0.37 -0.08 0.32 0.66 0.87 0.8 0.91 0.76 0.56 0.21 0.42 0.59 0.02 -0.72 -0.67 -0.14 0.06 -0.27 -0.56 -0.2 0.37 -0.65 -0.55 -1.09 -0.69 -0.08 -0.5 -0.51 -0.07 0.01 -0.5 -0.17 -0.27 -0.46 0.34 -0.42 -0.43 0.02 0.67 -0.17 -0.53 -0.86 -0.2 0.03
1.18 0.59 -0.63 -4.63 -2.56 0.74 0.89 -0.15 0.62 -0.42 -0.19 0.42 -0.26 -0.01 0.17 0.17 0.19 0.15 0.47 0.13 0.39 0.29 -0.14 0.07 0.24 -0.31 -0.91 -0.3 -0.4 -0.52 0.43 -0.34 0.3 -0.45 -0.01 0.4 -0.64 -0.28 -0.62 -0.81 0.48 -0.68 -0.4 0.22 -0.52 0.33 -0.41 -0.23 -0.33 0.12 0.09 -0.24 -0.03 -0.01
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1.29 0.94 -2.07 -4.9 0.14 0.83 1.08 0.54 0.95 0.39 0.47 1.02 -0.76 0.65 0.4 0.38 0.32 0.25 0.49 -0.08 -0.09 0.59 -0.26 -0.04 -0.12 -1.08 -0.96 -0.51 -0.82 -0.58 0.76 -1.05 0.18 -0.36 0.01 -0.71 -1.12 -1.16 -1.19 -0.78 0.13 -0.67 -0.62 -0.13 -0.79 -0.15 -0.67 -0.57 -0.27 -0.2 -0.49 -0.55 -0.28 -0.04
0.93 0.95 0.57 -3.92 -0.76 0.64 0.88 -0.0 0.99 0.15 0.53 0.71 -0.1 1.13 0.11 0.05 -0.07 -0.02 0.69 -0.17 0.0 0.29 -0.18 -0.43 -0.11 -0.66 -0.68 -0.33 -0.28 -0.43 0.25 -0.66 -0.05 -0.53 -0.29 -0.53 -0.57 -0.62 -0.64 -0.65 0.06 -0.64 -0.42 0.02 -0.48 -0.07 -0.31 -0.25 -0.6 -0.33 -0.16 -0.06 -0.18 -0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.