Heatmap: Cluster_64 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-0.38 -0.38 -0.72 -1.14 -0.89 -1.06 0.34 -1.07 -1.09 -1.16 -0.94 0.46 0.46 0.05 -0.48 -0.02 -0.4 -0.43 -0.16 -0.35 -0.21 0.57 0.46 -0.26 0.17 0.44 0.47 0.3 0.84 0.79 0.52 0.31 0.76
-0.98 -1.04 -1.47 -1.6 -1.4 -1.76 0.78 -1.39 -1.25 -1.14 -0.31 0.68 0.04 0.47 -0.16 -0.18 0.03 -0.44 -0.32 -0.24 -0.39 0.54 0.49 0.31 -0.37 0.48 0.39 0.32 0.9 0.9 0.4 0.14 0.93
-2.25 -1.7 -3.87 -4.31 -3.91 -3.23 -0.4 -2.36 -3.29 -3.23 -0.88 0.2 -0.74 -0.14 -1.4 -2.09 -0.25 -1.44 -1.03 -1.31 -0.58 -0.48 0.14 -0.75 -0.52 1.02 0.95 1.35 2.03 1.65 1.46 0.82 1.63
-1.32 -0.56 -3.64 -4.19 -4.59 -3.46 0.33 -3.57 -3.74 -3.13 -4.47 0.94 0.31 0.97 -4.0 -2.4 -1.02 -2.72 -4.73 -4.79 -4.18 1.42 0.31 1.6 -0.3 0.81 0.78 0.73 1.59 1.44 0.35 0.19 1.54
-3.07 -3.0 -3.44 -5.07 -4.29 -2.73 -1.04 - -4.25 -4.04 0.25 -0.1 -0.05 0.44 -0.35 -0.05 0.24 -0.6 -0.29 -0.35 -0.26 -0.37 -0.01 0.74 -0.68 1.0 0.93 1.12 1.38 1.16 1.08 0.79 1.33
0.66 0.78 -0.83 -0.01 -1.32 -0.85 -2.71 -1.08 -4.08 -0.53 -2.02 -1.94 -4.33 -3.26 -2.67 - -0.66 -3.18 -4.29 -2.77 - -2.02 -2.06 -2.19 -4.22 1.44 1.45 1.52 1.71 1.66 1.21 1.1 2.03
-0.64 -0.24 -0.97 -0.59 -0.81 -0.21 -0.56 -0.57 -0.66 -0.17 -0.57 -0.66 -1.12 -0.67 -0.59 -1.05 0.46 -0.63 -0.59 -0.49 -0.69 -0.46 0.18 -1.4 -0.59 0.71 0.7 0.92 1.14 1.12 1.17 0.83 1.01
-2.84 -3.31 -4.84 -5.76 -5.37 -4.15 -0.36 -3.93 -4.94 -6.44 -0.31 0.12 -0.3 0.21 -0.87 -1.67 -0.62 -1.51 -0.87 -0.24 -0.87 0.63 0.9 0.13 -0.57 0.56 0.43 1.11 1.72 1.68 0.72 0.83 1.99
-1.2 -1.08 -1.63 -2.03 -1.77 -2.08 -0.68 -1.67 -1.61 -1.58 -0.03 0.34 -0.54 0.02 0.11 0.3 -0.37 -0.45 0.24 0.42 0.12 0.03 -0.06 -0.34 -0.59 0.98 0.84 0.74 0.76 0.83 0.82 0.94 1.01
-0.12 0.13 -0.72 -0.55 -0.5 -0.49 -0.21 -0.69 -0.78 0.1 -0.08 0.31 -0.3 0.16 -1.19 -0.75 -0.06 0.18 -0.12 -0.15 -0.05 0.24 0.09 -1.21 -0.32 0.05 0.17 0.19 1.19 0.97 0.29 0.02 0.89
-0.77 -0.82 -2.01 -2.68 -2.62 -2.05 0.41 -3.27 -3.45 -3.43 -0.96 -0.04 0.13 0.28 -0.72 -0.83 -0.06 -0.36 -1.13 -0.74 -0.69 0.16 -0.49 0.31 -0.46 0.92 0.88 1.3 1.45 1.33 1.0 0.72 1.12
-1.09 -0.16 -2.4 -2.46 -2.89 -1.23 0.67 -2.62 -2.18 -2.29 -1.24 0.22 0.03 -0.29 -0.47 -2.01 0.31 -1.63 -1.62 -1.85 -1.64 0.39 1.04 1.03 -0.01 1.13 1.3 0.43 1.12 1.29 0.57 0.06 1.06
-1.88 -2.18 -2.75 -2.18 -3.58 -5.93 1.15 - -5.39 -7.22 -2.0 0.0 -0.79 -0.63 -2.14 -1.87 0.49 -3.01 -1.42 -1.45 -1.42 -0.92 0.73 0.72 -1.42 1.4 1.34 1.01 2.03 1.48 0.7 0.56 1.5
-1.6 -1.73 -4.6 -2.41 -2.64 -2.08 -0.29 -6.08 -6.63 - -2.38 -1.91 -2.71 -2.42 -2.42 -5.32 0.43 -1.7 -5.26 -2.52 -5.29 -1.26 -0.71 -0.96 -2.02 1.65 1.51 1.62 2.51 1.64 1.35 1.3 1.75
-0.34 -0.62 -0.67 -0.8 -0.82 -1.26 0.06 -1.67 -1.84 -1.63 -0.74 0.21 -0.48 0.12 0.0 -0.35 -0.1 -0.68 -0.39 -0.29 -0.39 0.28 0.1 -0.21 -0.4 0.6 0.55 0.87 1.36 0.96 0.63 0.28 1.11
-0.99 -1.02 -1.45 -1.52 -1.51 -0.74 0.18 -1.38 -1.2 -0.79 -0.05 0.19 -0.53 0.32 -0.71 -0.92 -0.16 -0.2 -0.4 0.24 -0.11 0.48 0.44 -0.12 -0.43 0.76 0.82 0.4 0.9 1.19 0.5 0.37 0.96
-1.16 -1.65 -1.93 -2.7 -2.01 -1.07 0.27 -2.03 -2.04 -1.31 0.2 0.54 0.14 0.74 -0.37 0.26 -0.5 0.0 -0.01 0.02 0.07 0.78 0.73 0.55 -0.45 0.7 0.67 0.1 0.65 0.79 0.22 -0.07 0.71
-0.73 -0.74 -1.37 -1.82 -1.3 -0.88 0.18 -1.65 -1.54 -1.67 0.14 0.17 0.04 0.32 0.41 0.44 -0.54 0.16 0.24 0.23 0.18 0.3 0.29 0.7 -0.53 0.39 0.34 0.25 0.71 0.67 0.35 -0.03 0.67
-5.6 -4.77 -6.79 -7.39 -6.52 -6.88 0.31 -7.56 -8.0 -7.16 -0.12 0.35 -0.72 0.39 0.09 0.56 -0.42 0.07 0.53 0.57 0.49 0.05 0.0 -1.16 -0.63 0.99 0.89 0.68 0.89 1.11 1.06 1.03 1.11
-3.39 -3.26 -4.64 -5.35 -4.08 -4.18 0.35 -3.26 -7.91 -4.59 -0.04 0.84 0.95 1.17 -1.89 -0.21 -0.3 -0.42 -0.71 0.07 0.14 0.94 0.98 0.19 -0.31 0.09 0.33 0.63 1.0 1.09 0.71 0.11 1.15
-0.25 -0.69 -1.18 -1.42 -1.31 -1.46 0.82 -1.31 -1.2 -0.76 -0.54 0.52 -0.5 0.17 0.47 -0.95 -0.34 -0.87 -0.5 -0.44 -0.48 0.28 0.62 -0.39 -0.27 0.69 0.57 0.78 0.86 0.64 0.61 0.48 0.97
-3.62 -3.14 -3.55 -4.08 -4.43 -6.01 0.47 -6.63 -6.85 - -1.65 0.33 -0.19 -0.81 -0.03 -0.63 0.19 -2.24 -1.32 -1.32 -1.11 1.0 0.61 1.45 -0.2 0.95 1.09 0.64 1.32 1.45 1.06 0.72 1.15
-0.74 -0.46 -3.15 -3.84 -3.28 -1.87 -0.24 -3.35 -2.06 -3.1 -1.75 0.21 -0.37 -0.17 -1.1 -1.46 0.85 -2.59 -2.67 -2.47 -2.73 -0.58 0.84 -0.89 -0.42 1.1 0.87 1.18 1.79 1.91 1.2 0.9 1.04
-0.46 -0.45 -0.92 -1.14 -1.07 -1.15 0.13 -0.87 -0.77 -1.12 -0.53 -0.08 -0.16 0.24 -0.54 -0.35 -0.14 -0.3 -0.45 -0.56 -0.37 0.09 0.01 -0.24 -0.46 0.55 0.67 0.71 1.17 1.17 0.72 0.38 1.04
-0.75 -0.7 -0.85 -1.18 -1.38 -1.54 0.24 -0.96 -1.27 -0.65 -0.29 0.04 0.07 0.17 -0.04 -0.47 -0.24 -0.66 -0.41 -0.04 -0.04 0.39 0.53 0.54 -0.47 0.75 0.72 0.45 0.8 0.68 0.42 0.46 0.82
-0.96 -0.5 -1.72 -2.0 -2.52 -2.35 -0.13 -3.08 -3.06 -1.86 -0.58 0.51 0.07 0.17 0.22 -0.82 0.23 -0.5 0.0 -0.19 -0.27 0.69 0.5 -0.34 -0.05 0.58 0.6 0.62 1.03 1.14 0.59 0.48 1.24
-0.25 0.01 -0.94 -1.03 -1.05 -0.65 0.05 -0.85 -0.9 -0.55 -0.43 0.24 0.34 0.08 0.06 -0.39 0.0 -0.29 -0.5 -0.46 -0.39 0.55 0.65 -0.03 -0.17 0.39 0.45 0.34 0.69 0.77 0.22 0.12 0.78
-0.77 -0.92 -1.33 -1.51 -1.53 -1.66 0.79 -1.8 -1.93 -2.0 0.07 0.11 0.03 0.3 -0.67 0.29 -0.03 0.16 -0.01 0.27 0.32 0.28 0.32 -0.12 0.01 0.37 0.44 0.59 0.86 0.76 0.35 0.34 0.66
-1.12 -1.14 -1.84 -1.82 -1.84 -1.93 0.69 -2.9 -2.43 -2.96 -0.06 0.46 -0.24 0.63 0.16 0.39 -0.52 0.13 -0.06 0.31 0.47 0.35 0.96 0.14 -0.29 0.34 0.32 0.5 0.74 0.68 0.3 0.13 0.78
-1.46 -1.49 -2.37 -2.57 -2.42 -2.9 -0.99 -3.62 -3.46 -1.71 -1.42 -0.71 -1.39 -0.14 -0.97 -1.37 0.28 -1.13 -1.13 -1.11 -0.93 -0.21 -0.32 -1.46 -1.45 0.85 1.05 1.42 1.62 1.82 1.46 1.19 1.91
-0.97 -0.81 -1.57 -1.37 -1.72 -1.42 -0.6 -1.76 -2.08 -0.75 -0.56 -0.36 -0.86 -0.03 -0.83 -1.27 0.28 -0.48 -0.46 -0.46 -0.55 -0.14 -0.29 -1.39 -1.14 0.73 0.98 0.96 1.4 1.49 1.18 0.9 1.57
-0.86 -0.72 -1.46 -1.67 -1.38 -0.81 0.16 -1.39 -1.02 -0.99 -0.47 0.53 0.24 0.74 -0.2 -0.39 -0.38 -0.99 -0.78 -0.61 -0.69 0.57 0.71 -0.38 0.27 0.4 0.39 0.41 0.86 0.99 0.43 0.41 1.26
-1.83 -1.76 -2.67 -3.1 -2.9 -2.82 -0.25 -3.42 -4.83 -2.32 -0.51 0.22 -0.11 0.16 0.0 -0.5 -0.13 -0.6 -0.2 -0.07 -0.1 0.34 0.35 -0.92 -0.86 0.53 0.79 0.93 1.24 1.38 1.06 0.91 1.64
-4.39 -4.9 -5.6 -6.43 -5.21 -7.15 -0.55 -6.21 -6.24 -4.06 0.24 0.23 -0.12 -0.62 0.5 0.67 -0.22 0.35 0.62 0.78 0.76 -0.16 -0.11 0.7 -0.06 0.67 0.69 0.71 0.87 0.94 0.63 0.69 0.94
-0.21 0.03 -0.94 -0.9 -0.87 -0.26 -0.1 -0.44 -0.43 -0.47 -0.2 0.02 -0.95 -0.16 -0.14 -0.7 -0.27 -0.1 -0.43 -0.28 -0.16 -0.23 -0.07 -1.17 -0.5 0.7 0.78 0.51 1.05 1.05 0.55 0.32 0.95
-1.6 -1.8 -2.62 -2.96 -2.56 -2.3 0.95 -3.41 -4.27 -5.14 -0.99 0.31 0.27 0.42 -0.87 -1.0 -0.18 -1.35 -1.12 -1.37 -1.16 0.23 0.42 0.96 -0.69 0.73 0.73 1.02 1.5 1.21 1.09 0.78 1.21
-3.77 -3.64 -4.69 -5.06 -4.94 -5.83 -1.44 -5.08 -5.67 -4.71 0.29 -0.12 -0.42 0.54 0.5 1.02 -0.08 0.66 0.86 1.09 0.89 -0.9 0.55 0.65 -0.89 0.33 0.19 0.35 1.17 0.92 0.55 0.42 0.55
-2.36 -3.39 -3.73 -4.28 -4.41 -5.32 0.29 -4.61 -4.45 -3.37 -0.61 0.52 0.81 1.19 -1.63 -0.25 -0.35 -0.57 -0.35 0.21 -0.36 1.02 0.99 0.58 -0.57 0.34 0.45 0.79 1.22 1.03 0.56 0.16 1.11
-3.59 -3.68 -5.4 -5.42 -6.42 -4.71 0.15 -5.83 -7.02 -7.81 -0.02 0.44 0.1 0.89 -0.43 0.04 -0.6 -0.39 0.21 0.03 0.2 0.1 0.21 0.11 -1.05 0.63 0.64 0.51 1.54 1.58 0.81 0.43 1.32
-1.33 -1.58 -2.56 -2.41 -2.01 -2.37 0.27 -2.23 -2.8 -1.55 -1.06 -0.22 -0.48 -0.24 -0.68 -0.32 -0.11 -0.78 -0.62 -0.26 -0.93 -0.07 0.19 -0.08 -0.77 0.87 0.73 1.01 1.54 1.22 1.24 0.93 1.62
-0.23 -0.29 -0.98 -1.76 -1.32 -0.88 0.41 -1.38 -1.5 -1.47 -0.23 0.42 0.49 0.68 -0.13 0.03 -0.23 -0.47 -0.32 -0.4 -0.36 0.52 0.45 0.57 0.0 0.31 0.25 0.3 0.64 0.55 0.37 0.23 0.74
-2.09 -1.56 -1.98 -1.9 -2.6 -1.95 -0.41 -2.49 -1.45 -0.8 -0.13 -0.12 -0.53 -0.4 -0.74 -0.82 0.06 0.28 0.27 -0.06 -0.31 -0.14 0.06 -1.03 -1.21 0.71 0.71 1.09 1.47 1.29 0.97 0.68 1.53
-2.01 -2.03 -2.74 -3.57 -3.6 -2.63 -0.07 -4.15 -3.14 -2.61 -1.12 -0.24 -0.03 -0.42 -0.46 -0.53 0.61 -0.93 -1.55 -1.7 -0.86 0.38 1.2 0.85 0.06 0.88 0.93 0.89 1.37 1.24 1.06 0.72 1.21
-3.64 -3.34 -4.73 -4.54 -5.42 -5.17 1.22 -6.8 - -7.16 -0.91 0.12 -0.73 -0.86 -0.89 -1.2 -0.0 -1.23 -1.02 -0.57 -0.94 -0.46 0.06 0.98 -0.98 1.0 0.98 0.92 2.0 1.46 0.77 0.76 1.69
-1.53 -1.53 -3.53 -3.78 -3.48 -4.37 0.05 -4.13 -3.32 -2.4 -1.36 0.75 0.21 0.34 -1.53 -1.01 0.49 -1.36 -2.28 -2.11 -2.4 0.76 1.65 0.86 -0.64 0.51 0.62 1.09 1.32 1.18 0.99 0.97 0.84
-1.41 -0.92 -2.02 -1.42 -2.37 -1.25 0.92 -2.55 -3.38 -1.74 -0.34 0.47 -0.02 0.46 -0.46 -0.62 0.06 -0.37 -0.66 -0.79 -0.48 0.1 0.47 0.18 0.13 0.51 0.55 0.54 1.18 1.32 0.46 0.29 1.24
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-2.31 -2.12 -4.25 -4.61 -4.81 -5.11 0.69 -5.67 -6.94 -6.43 -2.51 0.22 -1.04 -0.04 -3.07 -2.37 0.44 -2.24 -3.75 -2.3 -2.5 0.61 1.12 1.04 -1.03 0.9 1.1 0.95 1.5 1.76 1.28 0.97 1.5
-1.1 -0.69 -1.29 -1.64 -2.21 -1.97 0.21 -1.61 -2.25 -1.37 -0.16 0.47 -0.26 -0.05 -0.14 -0.41 0.1 -0.11 -0.36 -0.14 -0.26 0.49 0.75 -0.1 0.33 0.39 0.43 0.73 0.94 0.88 0.62 0.45 1.1
-1.51 -1.37 -2.17 -2.02 -1.85 -1.64 -0.52 -1.25 -1.22 -1.05 -1.24 -0.61 -1.37 -0.87 -1.49 -1.45 0.35 -0.84 -1.32 -1.4 -1.28 -0.68 0.65 -0.9 -1.41 0.94 0.99 1.14 1.63 1.79 1.32 0.94 1.69
-1.18 -0.99 -1.62 -2.34 -2.52 -3.52 0.08 -2.83 -3.04 -2.61 -0.72 -0.2 0.05 0.38 -0.61 -0.58 -0.28 -0.49 -0.03 -0.26 -0.26 0.27 0.49 0.07 -0.49 0.77 0.63 1.06 1.23 1.32 1.08 0.82 1.04
-0.72 0.01 -2.07 -2.09 -2.55 -1.83 -0.0 -1.59 -1.57 -1.32 -0.56 0.1 0.03 0.28 -1.86 -1.63 0.02 -1.79 -2.65 -1.75 -1.67 0.39 0.35 0.06 -0.24 0.43 0.76 0.95 1.29 1.51 1.28 0.76 1.53
-0.83 -0.54 -3.37 -2.77 -3.44 -2.85 -0.16 -2.27 -2.43 -1.24 -1.57 0.11 -0.48 0.54 -2.65 -2.96 0.31 -3.04 -1.9 -2.75 -2.37 0.21 0.47 -0.49 -0.15 0.48 0.94 1.17 1.59 1.77 1.39 0.85 1.66
-0.36 -0.36 -0.77 -1.52 -1.45 -0.47 0.35 -0.79 -0.86 -1.3 -0.36 0.09 0.05 0.08 -0.13 -0.65 -0.01 -0.33 -0.73 -0.98 -0.59 0.38 0.71 0.04 -0.18 0.37 0.54 0.59 0.98 0.86 0.51 0.2 1.09
-4.67 -4.27 -4.26 -5.64 -5.85 -3.49 0.46 -6.3 -4.53 -3.76 0.44 0.32 0.89 0.77 -0.8 0.81 -0.06 -0.06 0.51 0.51 0.64 0.59 0.88 0.75 0.06 0.78 0.75 -0.31 0.28 0.74 -0.28 -0.18 0.62
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-0.17 -0.05 -0.85 -0.93 -1.33 -1.2 0.08 -2.11 -1.91 -1.26 0.05 0.29 0.19 0.29 -0.2 -0.08 -0.3 -0.01 -0.38 -0.32 -0.13 0.25 0.42 -0.11 -0.18 0.45 0.46 0.58 0.85 0.74 0.47 0.34 0.88
-1.36 -1.72 -2.36 -2.57 -1.59 -1.23 0.3 -1.49 -1.6 -2.03 -0.02 0.84 0.33 0.52 0.5 0.47 -0.37 0.13 -0.15 -0.11 -0.02 0.26 0.55 0.42 -0.26 0.22 0.25 0.45 0.94 0.72 0.32 0.09 0.72
-1.53 -1.65 -1.22 -1.26 -1.33 -1.29 0.12 -1.89 -2.26 -2.02 -0.13 0.28 0.24 0.67 0.87 0.59 -0.05 0.1 -0.51 -0.14 -0.33 0.52 0.38 0.13 -0.27 0.16 0.28 0.58 0.78 0.77 0.51 0.41 0.62
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-1.12 -1.45 -1.57 -2.28 -2.1 -1.71 0.23 -1.61 -1.98 -1.41 0.11 0.62 -0.03 0.08 0.31 -0.23 -0.1 -0.21 -0.41 -0.11 -0.61 0.39 0.71 -0.49 0.47 0.63 0.68 0.59 0.93 0.81 0.7 0.59 0.66
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.