Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00269710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.445)
0.33 0.38 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.59 0.14 0.03 0.03 0.09 0.1 1.0 0.42 0.08 0.05 0.07
AMTR_s00001p00269720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.446)
0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.37 0.42 0.08 0.04 0.02 0.37 0.1 1.0 0.51 0.09 0.15 0.02
AMTR_s00002p00241560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.307)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.49 0.86 0.14 0.05 0.1 0.39 0.21 1.0 0.37 0.11 0.22 0.07
AMTR_s00003p00117760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.82)
0.47 0.33 0.78 0.17 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.19 0.12 0.01 0.05 0.0 0.15 1.0 0.15 0.09 0.15 0.0
AMTR_s00003p00260700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.340)
0.41 0.3 0.19 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.2 0.46 0.0 0.01 0.01 0.39 0.88 1.0 0.18 0.05 0.47
AMTR_s00004p00074220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.55)
0.32 0.15 0.12 0.06 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.55 0.8 0.03 0.16 0.08 1.0 0.68 0.68 0.46 0.17 0.23
AMTR_s00007p00241440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.254)
0.24 0.16 0.14 0.02 0.06 0.02 0.04 0.01 0.03 0.04 0.6 0.79 0.38 0.1 0.28 0.09 0.35 1.0 0.71 0.37 0.21 0.64
AMTR_s00007p00253830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.294)
0.11 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.13 0.0 0.01 0.08 0.2 1.0 0.29 0.12 0.51 0.13
AMTR_s00007p00266330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.372)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.2 0.02 0.04 0.12 0.0 0.06 0.97 1.0 0.56 0.14 0.01
AMTR_s00007p00267580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.382)
0.04 0.0 0.01 0.08 0.26 0.0 0.06 0.0 0.14 0.07 0.52 0.83 0.21 0.27 0.19 0.22 0.76 0.96 1.0 0.64 0.65 0.24
AMTR_s00008p00021210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.3 0.11 0.03 0.03 0.05 0.07 1.0 0.43 0.03 0.61 0.01
AMTR_s00008p00250900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.188)
0.09 0.04 0.01 0.03 0.02 0.0 0.02 0.04 0.02 0.03 0.36 0.2 0.17 0.12 0.04 0.13 0.2 1.0 0.4 0.64 0.37 0.01
AMTR_s00009p00227030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.176)
0.35 0.34 1.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.45 0.31 0.24 0.0 0.02 0.05 0.29 0.93 0.56 0.04 0.06 0.03
AMTR_s00010p00108760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.61)
0.0 0.28 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.53 0.23 0.02 0.01 0.01 0.06 0.15 1.0 0.57 0.48 0.11 0.01
AMTR_s00017p00205360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.124)
0.0 0.0 0.0 0.41 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.58 0.34 0.11 0.04 0.03 0.76 0.87 1.0 0.38 0.08 0.56
AMTR_s00019p00233430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.323)
0.08 0.03 0.0 0.02 0.09 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.6 0.46 0.18 0.22 0.13 0.99 0.43 1.0 0.59 0.12 0.15 0.05
AMTR_s00023p00141210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.78)
0.67 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 0.55 0.02 0.0 0.01 0.31 0.11 0.84 0.89 0.14 0.57
AMTR_s00023p00212280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.156)
0.12 0.16 0.58 0.0 0.02 0.05 0.03 0.02 0.03 0.02 0.3 0.16 0.07 0.01 0.02 0.0 0.27 1.0 0.4 0.05 0.18 0.0
0.29 0.23 0.36 0.18 0.05 0.0 0.04 0.01 0.15 0.08 0.76 0.72 0.31 0.24 0.27 0.31 0.92 1.0 0.92 0.66 0.34 0.18
AMTR_s00027p00238760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.134)
0.0 0.0 0.05 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.46 0.43 0.08 0.02 0.11 0.7 1.0 0.76 0.09 0.04 0.59
AMTR_s00027p00246860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.158)
0.47 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.32 0.33 0.4 1.0 0.15 0.03 0.09 0.0 0.35 0.52 0.21 0.04 0.0 0.01
AMTR_s00027p00247670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.160)
0.18 0.24 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.42 1.0 0.19 0.0 0.08 0.0 0.27 0.87 0.38 0.03 0.0 0.01
AMTR_s00029p00227050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.356)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.31 0.11 0.0 0.17 0.01 0.02 1.0 0.58 0.0 0.0 0.11
AMTR_s00032p00024840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.7)
0.06 0.06 0.02 0.05 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.22 0.18 0.06 0.12 0.0 0.49 1.0 0.45 0.01 0.0 0.0
AMTR_s00033p00231280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.226)
0.09 0.14 0.12 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.35 0.31 0.15 0.12 0.02 0.01 1.0 0.39 0.26 0.46 0.01
AMTR_s00034p00082120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.22)
0.11 0.13 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.07 1.0 0.08 0.01 0.02 0.0 0.14 0.51 0.3 0.03 0.0 0.05
AMTR_s00038p00161690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.99)
0.2 0.26 0.8 0.21 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.37 0.08 0.01 0.08 0.0 0.12 1.0 0.26 0.01 0.01 0.0
0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.31 0.08 0.0 0.03 0.0 0.07 1.0 0.58 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00040p00200250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.202)
0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.29 0.16 0.01 0.13 0.0 0.11 1.0 0.57 0.02 0.0 0.0
AMTR_s00041p00188340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.161)
0.31 0.15 0.2 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.32 0.05 0.0 0.03 0.0 0.21 1.0 0.59 0.01 0.01 0.0
AMTR_s00047p00152060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.74)
0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.29 0.23 0.28 0.0 0.0 0.02 0.31 1.0 0.28 0.05 0.0 0.02
AMTR_s00048p00046670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.15)
0.21 0.03 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.29 0.16 0.02 0.05 0.0 0.42 1.0 0.76 0.32 0.27 0.0
AMTR_s00051p00066360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.24)
0.22 0.14 0.43 0.4 0.12 0.0 0.06 0.04 0.06 0.06 0.53 0.55 0.34 0.15 0.13 0.17 0.71 0.99 1.0 0.49 0.34 0.13
AMTR_s00053p00062360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.33)
0.35 0.21 0.12 0.0 0.04 0.01 0.11 0.0 0.11 0.09 0.53 0.59 0.26 0.18 0.09 0.32 0.47 1.0 0.51 0.25 0.48 0.05
AMTR_s00053p00197030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.147)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.58 0.07 0.02 0.02 0.07 0.1 1.0 0.52 0.05 0.08 0.02
AMTR_s00055p00102180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.37)
0.01 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.66 0.38 0.15 0.0 0.09 0.01 0.29 1.0 0.56 0.01 0.03 0.09
AMTR_s00056p00131980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.100)
0.14 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.81 0.06 0.0 0.01 0.01 0.19 1.0 0.81 0.08 0.23 0.12
AMTR_s00057p00123940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.102)
0.11 0.07 0.05 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.28 0.31 0.24 0.08 0.1 0.55 1.0 0.73 0.41 0.16 0.02
AMTR_s00057p00137740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.121)
0.06 0.0 0.0 0.56 0.29 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.45 0.77 0.18 0.09 0.3 0.1 0.18 0.71 1.0 0.31 0.2 0.51
AMTR_s00066p00081470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.60)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.46 0.43 0.27 0.14 0.32 0.11 0.62 1.0 0.89 0.64 0.46 0.2
AMTR_s00068p00147540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.103)
0.28 0.33 0.01 0.47 0.05 0.0 0.07 0.0 0.09 0.08 0.4 0.38 0.3 0.06 0.04 0.22 0.67 0.83 1.0 0.3 0.51 0.33
AMTR_s00069p00181050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.175)
0.0 0.0 0.88 0.14 0.13 0.0 0.17 0.53 0.5 0.43 0.82 0.91 0.24 0.07 0.27 0.04 1.0 0.8 0.44 0.08 0.11 0.14
AMTR_s00071p00075870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.48)
0.47 0.13 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.33 0.13 0.01 0.0 0.18 0.06 1.0 0.45 0.13 0.15 0.07
AMTR_s00071p00081130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.57)
0.33 0.13 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.46 0.27 0.01 0.01 0.1 0.04 1.0 0.47 0.09 0.1 0.09
AMTR_s00071p00081750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.58)
1.0 0.72 0.14 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.36 0.73 0.03 0.05 0.08 0.09 0.94 0.45 0.33 0.2 0.15
AMTR_s00071p00156280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.144)
0.1 0.18 0.0 0.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0 0.16 0.08 0.04 0.0 0.1 0.47 0.47 0.14 0.03 0.14
AMTR_s00077p00063420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.40)
0.01 0.11 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.21 0.14 0.03 0.13 0.01 0.03 1.0 0.28 0.1 0.01 0.02
AMTR_s00077p00068900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.48)
0.08 0.14 0.03 0.0 0.32 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.19 0.17 0.14 1.0 0.0 0.02 0.98 0.49 0.57 0.04 0.0
AMTR_s00079p00192440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.121)
0.03 0.45 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.41 0.55 0.05 0.15 0.0 0.45 1.0 0.72 0.11 0.02 0.11
AMTR_s00083p00051470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.17)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.64 0.54 0.3 0.29 0.22 0.49 0.21 1.0 0.53 0.04 0.17 0.12
AMTR_s00099p00160640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.161)
0.2 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.48 0.25 0.27 0.02 0.05 0.02 0.55 1.0 0.61 0.47 0.24 0.04
0.55 0.27 0.27 0.09 0.06 0.16 0.29 0.02 0.24 0.26 0.96 1.0 0.53 0.19 0.25 0.16 0.69 0.84 0.61 0.87 0.14 0.82
AMTR_s00107p00095070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00107.26)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.48 0.12 0.0 0.0 0.02 0.32 1.0 0.29 0.05 0.05 0.05
AMTR_s00110p00143020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.118)
0.09 0.13 0.32 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.45 0.66 0.1 0.0 0.01 0.43 0.45 1.0 0.43 0.03 0.05 0.02
AMTR_s00119p00127910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.100)
0.34 0.09 0.14 0.16 0.44 0.12 0.01 0.0 0.01 0.01 0.47 1.0 0.13 0.19 0.67 0.1 0.15 0.6 1.0 0.18 0.34 0.35
AMTR_s00120p00062220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.26)
0.16 0.0 0.0 0.01 0.26 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.42 1.0 0.32 0.18 0.2 0.26 0.33 0.47 0.68 0.28 0.21 0.33
AMTR_s00122p00085720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.33)
0.0 0.09 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.56 0.51 0.01 0.05 0.04 0.64 1.0 0.35 0.02 0.01 0.12
AMTR_s00135p00077620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00135.39)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.26 0.04 0.0 0.06 0.0 0.57 1.0 0.55 0.09 0.28 0.01
AMTR_s00155p00055670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.29)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.61 0.78 0.81 0.02 0.32 0.05 0.08 1.0 0.83 0.34 0.06 0.57
AMTR_s00171p00031180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.9)
0.28 0.17 0.15 0.09 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.86 0.88 0.37 0.06 0.16 0.01 0.32 1.0 0.36 0.32 0.27 0.0
AMTR_s00175p00065840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00175.38)
0.23 0.25 0.23 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.55 0.27 0.01 0.06 0.05 0.12 1.0 0.39 0.09 0.11 0.05
AMTR_s00324p00011200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00324.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.29 0.13 0.0 0.03 0.0 0.11 0.35 1.0 0.13 0.01 0.55
AMTR_s00802p00001450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00802.1)
0.01 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.3 0.19 0.0 0.02 0.02 0.09 1.0 0.3 0.09 0.11 0.01
AMTR_s00858p00001360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00858.1)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.5 0.57 0.77 0.04 0.05 0.06 0.85 0.86 1.0 0.46 0.26 0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)