Heatmap: Cluster_492 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Young Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Meristem
Rhizome
Crozier
Young Root
Mature Root
-0.77 -2.96 -0.89 0.27 0.15 0.02 0.4 0.33 0.3 0.36 0.4
Dcu_g00833 (BOB1)
-0.52 -1.52 -0.45 0.09 0.14 0.12 0.15 0.3 0.27 0.33 0.23
-0.41 -1.93 -0.52 0.1 0.09 -0.14 0.28 0.2 0.39 0.33 0.4
-0.2 -1.1 -0.26 0.01 0.12 0.07 0.13 0.1 0.24 0.29 0.16
-0.21 -1.77 -0.43 -0.08 0.07 0.14 0.16 0.16 0.29 0.37 0.32
Dcu_g01805 (APTX)
-0.66 -2.61 -0.55 0.08 0.08 0.2 0.31 0.24 0.34 0.42 0.3
-0.66 -2.63 -0.7 0.3 0.21 -0.19 0.34 0.29 0.41 0.45 0.2
-0.28 -1.96 -0.59 0.15 0.08 0.23 0.18 0.27 0.35 0.29 0.11
-0.5 -1.92 -0.96 -0.07 -0.06 0.03 0.29 0.26 0.46 0.44 0.51
-0.17 -1.87 -0.72 0.14 0.18 0.08 0.17 0.23 0.23 0.32 0.29
-0.37 -2.16 -0.56 0.09 0.08 0.14 0.27 0.18 0.38 0.28 0.31
-0.54 -2.12 -0.75 0.11 0.05 0.0 0.36 0.23 0.36 0.4 0.4
Dcu_g02938 (RLI2)
-0.45 -1.37 -0.34 0.03 0.07 -0.04 0.16 0.17 0.32 0.4 0.29
-0.38 -2.57 -0.74 0.16 0.08 0.0 0.1 0.23 0.58 0.4 0.3
Dcu_g03095 (LRS1)
-0.44 -1.38 -0.55 0.25 0.22 0.05 0.28 0.05 0.17 0.29 0.28
Dcu_g03165 (SMC5)
-0.44 -3.55 -1.21 -0.0 0.03 0.13 0.36 0.16 0.49 0.55 0.45
Dcu_g03169 (ARABIDILLO1)
-0.55 -1.55 -0.73 0.13 0.06 -0.0 0.36 0.09 0.49 0.31 0.32
-0.14 -2.81 -0.51 0.02 0.12 0.04 0.28 0.05 0.32 0.39 0.39
-0.22 -3.66 -1.48 -0.07 0.06 0.11 0.34 0.17 0.79 0.35 0.3
Dcu_g03217 (TAF1)
-0.03 -4.17 -1.45 0.02 0.18 -0.04 0.28 0.17 0.72 0.27 0.37
-0.97 -3.22 -1.77 0.01 0.02 0.43 0.48 0.35 0.38 0.58 0.34
Dcu_g04069 (UPF3)
-0.56 -2.04 -0.58 0.18 0.19 0.04 0.29 0.2 0.46 0.14 0.33
Dcu_g04096 (CIP111)
-0.5 -1.64 -0.73 0.14 0.1 0.14 0.15 0.31 0.53 0.29 0.13
-0.67 -1.26 -0.41 0.28 0.39 -0.21 0.4 -0.01 0.2 0.28 0.18
-0.41 -1.05 -0.51 0.2 0.19 -0.08 0.32 0.09 0.27 0.25 0.15
-0.62 -3.16 -0.91 0.05 -0.15 -0.2 0.32 0.3 0.67 0.46 0.53
-0.42 -1.56 -0.56 0.08 0.09 -0.03 0.31 0.25 0.32 0.31 0.28
-0.41 -2.04 -0.61 0.23 0.11 0.04 0.34 0.2 0.4 0.26 0.18
-0.41 -0.92 -0.35 0.14 0.19 -0.25 0.47 0.01 0.34 0.17 0.09
-0.39 -1.56 -0.53 0.17 0.12 0.04 0.21 0.28 0.24 0.3 0.25
0.0 -3.34 -0.91 -0.0 0.1 0.0 0.3 0.15 0.6 0.29 0.29
Dcu_g06999 (ELF5)
-0.14 -1.87 -0.7 0.05 0.07 0.07 0.29 0.15 0.41 0.35 0.18
-0.15 -1.02 -0.5 0.02 -0.01 0.26 0.09 0.13 0.36 0.16 0.18
Dcu_g07106 (ELP2)
-0.49 -1.52 -0.35 0.38 0.29 -0.34 0.38 0.07 0.3 0.2 0.15
-0.27 -2.58 -0.72 -0.11 -0.18 0.26 0.14 0.35 0.56 0.32 0.37
Dcu_g07164 (ALY3)
-0.36 -2.72 -0.9 -0.19 -0.25 -0.03 0.21 0.33 0.66 0.46 0.55
Dcu_g07181 (SDG2)
-0.19 -3.25 -1.36 -0.12 0.11 -0.06 0.4 0.3 0.77 0.16 0.36
Dcu_g07730 (NEDD1)
-0.31 -1.53 -0.45 0.1 0.07 0.09 0.2 0.22 0.27 0.27 0.27
Dcu_g08962 (GTA2)
-0.49 -2.73 -0.77 0.18 0.3 0.2 0.3 0.24 0.24 0.31 0.26
Dcu_g08964 (LHW)
-0.64 -2.65 -0.98 -0.04 -0.24 -0.15 0.2 0.26 0.51 0.69 0.66
Dcu_g08979 (DDB1A)
-0.32 -2.09 -0.44 0.08 0.02 -0.12 0.29 0.23 0.37 0.41 0.28
-0.25 -3.32 -1.01 0.05 0.1 0.16 0.38 0.15 0.55 0.3 0.3
Dcu_g09317 (RKP)
-0.23 -1.92 -0.61 0.05 0.22 0.34 0.0 0.22 0.24 0.25 0.29
Dcu_g09379 (ATX5)
-0.39 -3.53 -1.44 -0.03 0.11 0.17 0.59 0.19 0.49 0.24 0.45
Dcu_g09670 (UBP25)
-0.44 -2.19 -0.47 0.04 0.03 -0.03 0.18 0.12 0.37 0.42 0.53
-1.02 -3.38 -0.79 0.03 -0.08 0.12 0.37 0.33 0.54 0.52 0.43
Dcu_g09858 (LINC2)
-0.14 -3.34 -1.15 -0.0 0.08 0.18 0.04 0.15 0.69 0.4 0.36
Dcu_g10325 (CPL3)
-0.44 -3.21 -0.91 -0.17 -0.01 -0.11 0.3 0.34 0.82 0.32 0.39
Dcu_g10961 (EDA7)
-0.36 -1.65 -0.42 -0.03 -0.03 -0.12 0.1 0.39 0.3 0.47 0.36
-0.6 -2.46 -0.73 0.21 0.28 0.11 0.28 0.16 0.24 0.53 0.18
-0.31 -1.9 -0.59 0.1 0.1 0.11 0.25 0.16 0.34 0.22 0.38
Dcu_g11726 (PUM23)
-0.29 -2.41 -0.65 -0.06 -0.01 -0.08 0.06 0.35 0.37 0.57 0.46
Dcu_g11951 (SMP2)
-0.51 -2.82 -0.48 0.07 0.04 0.02 0.33 0.3 0.26 0.44 0.39
Dcu_g12352 (TPR16)
-0.31 -2.77 -0.86 0.38 0.3 0.24 0.18 0.15 0.34 0.18 0.19
-0.31 -2.45 -0.98 -0.12 -0.01 0.3 0.04 0.34 0.39 0.45 0.48
-0.62 -1.78 -0.43 0.0 0.03 -0.02 0.38 0.22 0.35 0.43 0.29
-0.67 -2.53 -0.61 0.15 0.16 0.16 0.28 0.31 0.24 0.36 0.35
Dcu_g13960 (PSD2)
-0.32 -2.18 -0.37 0.03 0.02 0.24 0.21 0.21 0.26 0.38 0.23
Dcu_g15867 (PTP1)
-0.49 -1.73 -0.77 0.21 0.19 0.22 0.26 0.27 0.28 0.23 0.2
Dcu_g18942 (SNL4)
-0.25 -3.96 -1.03 0.0 -0.05 0.13 0.22 0.27 0.6 0.4 0.42
-0.26 -2.96 -0.93 0.02 -0.22 -0.2 0.27 0.19 0.59 0.55 0.54
Dcu_g20587 (CAF1)
-0.64 -2.15 -0.68 -0.19 -0.0 -0.23 0.3 0.22 0.69 0.41 0.53
Dcu_g20924 (CHR11)
-0.91 -3.72 -1.49 -0.04 0.05 0.22 0.47 0.37 0.52 0.53 0.38
Dcu_g22478 (EMB3011)
-0.45 -2.46 -0.59 0.22 0.2 0.15 0.25 0.12 0.24 0.29 0.39
Dcu_g23418 (ELF7)
-0.39 -2.28 -0.7 0.15 0.09 -0.0 0.22 0.14 0.42 0.35 0.44
Dcu_g24233 (EMF2)
-0.56 -2.1 -0.86 -0.17 -0.14 -0.08 0.49 0.29 0.49 0.51 0.42
Dcu_g24521 (RAD5)
-0.49 -2.18 -0.68 0.03 0.04 0.22 0.42 0.1 0.36 0.36 0.32
Dcu_g32270 (NRPC2)
-0.73 -3.02 -1.0 0.25 0.24 -0.01 0.53 0.28 0.27 0.47 0.21
-0.78 -2.2 -0.61 0.27 0.11 -0.12 0.22 0.08 0.57 0.44 0.34
-0.48 -3.2 -0.77 0.17 0.09 0.27 0.28 0.24 0.37 0.39 0.25
-0.49 -3.13 -0.73 0.18 0.18 0.06 0.2 0.38 0.34 0.41 0.28
-0.53 -2.09 -0.76 -0.35 -0.33 0.06 0.39 0.33 0.38 0.65 0.5
-0.53 -3.45 -0.7 0.09 -0.03 0.19 0.19 0.4 0.64 0.27 0.25
-0.55 -2.11 -0.61 0.09 0.1 0.1 0.33 0.2 0.27 0.4 0.36
Dcu_g39737 (AHG2)
-0.51 -2.38 -0.64 0.04 0.13 0.16 0.38 0.29 0.52 0.17 0.21
-0.63 -2.02 -0.72 -0.03 -0.17 0.15 0.18 0.21 0.57 0.51 0.41
-0.05 -2.41 -0.75 0.01 -0.04 0.02 0.07 -0.01 0.62 0.41 0.44
Dcu_g42653 (TAF4)
-0.75 -2.75 -0.89 0.28 0.26 -0.08 0.26 0.28 0.3 0.5 0.39
-0.17 -2.23 -0.64 0.0 0.23 0.15 0.12 0.36 0.22 0.24 0.32
-0.2 -3.75 -1.07 0.16 0.25 -0.01 0.46 0.14 0.6 0.1 0.28
-0.8 -2.65 -1.08 0.33 0.2 0.07 0.4 0.27 0.41 0.41 0.2
-0.26 -2.53 -0.77 0.08 0.18 -0.07 0.33 0.3 0.25 0.42 0.31
-0.24 -1.56 -0.37 0.06 0.12 -0.01 0.16 0.04 0.29 0.31 0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.