Heatmap: Cluster_304 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
1.09 1.03 1.08 0.96 0.61 1.04 0.31 1.01 0.62 0.42 -1.21 -0.66 -1.32 -1.51 -0.83 -1.66 -1.59 -0.58 -1.4 -1.0 -1.35 -0.84 -1.24 -1.18 -0.26 -2.48 -1.82 0.42 0.68 0.08 0.32 0.12 0.05
-0.12 0.05 0.57 0.65 0.73 0.79 -0.01 0.56 0.38 0.72 -0.33 -0.27 -0.75 -0.04 0.19 -0.79 -0.42 -0.28 -0.75 -0.59 -0.65 -0.38 -0.08 -0.57 -0.75 -0.22 -0.28 -0.17 0.1 0.23 -0.12 -0.32 0.37
1.89 2.32 1.77 1.09 1.42 0.98 1.69 -0.03 1.47 -1.11 -5.29 1.27 -3.11 -0.78 -5.26 -3.76 -1.61 - - - - -1.21 -0.71 -5.51 -0.67 -1.94 -1.96 -5.45 -2.48 -1.23 -4.23 -3.67 -2.87
0.37 0.67 0.5 0.88 0.3 0.42 -0.19 0.44 0.36 0.78 -0.94 -0.58 -1.06 -1.1 0.44 -0.89 -0.98 -0.61 -0.88 -0.92 -0.86 -0.66 -0.83 -1.23 -0.79 -0.16 -0.19 0.3 0.55 0.57 0.36 0.51 0.47
0.81 1.72 0.76 1.64 1.16 1.81 -0.16 1.1 0.92 1.03 -1.06 -0.7 -1.98 -1.12 -0.87 -1.99 -1.17 -0.83 -1.27 -1.48 -0.98 -1.24 -1.45 -1.31 -0.81 -1.33 -1.12 -1.52 -0.84 -0.68 -1.32 -1.46 -0.7
0.05 0.52 0.54 1.23 0.15 0.04 -0.29 0.14 -0.36 1.48 -0.13 -0.3 -0.7 -0.76 -0.52 -0.12 -1.09 -0.08 -0.21 -0.49 -0.52 -0.43 -0.66 -0.35 -0.33 -0.86 -0.88 0.26 0.02 -0.1 0.47 0.25 0.16
1.41 1.87 1.55 1.81 1.06 1.13 -0.59 0.85 0.5 1.1 -2.23 -1.38 -2.67 -1.67 -1.39 -2.45 -0.46 -1.77 -2.47 -2.24 -2.01 -1.52 -1.56 -2.64 -1.41 -0.58 -0.43 -0.83 -0.43 -0.41 -0.69 -0.75 -0.37
1.07 1.15 0.98 0.89 0.99 1.33 -0.01 0.55 0.44 0.43 0.32 0.08 -0.03 -0.17 0.27 0.55 -2.12 0.01 0.23 -0.64 0.02 -0.54 -4.21 0.27 -0.25 -1.05 -0.69 -3.49 -3.55 -4.27 -3.24 -5.75 -4.34
0.33 0.75 0.49 0.97 1.1 1.45 -1.45 0.59 0.11 0.45 -1.48 -0.72 -2.24 -1.2 -0.73 -1.44 -0.29 -0.05 -2.17 -1.08 -1.45 -1.12 -1.86 -1.68 -1.56 -0.07 -0.08 0.48 0.75 0.54 0.37 0.33 0.76
0.82 0.82 0.61 0.87 0.77 1.11 -0.56 0.44 0.23 0.45 0.09 -0.41 -0.38 -0.25 -0.31 0.12 -0.73 0.16 0.2 0.3 -0.14 -0.27 -0.48 -0.93 -0.24 -0.31 -0.26 -1.43 -0.99 -0.78 -1.41 -1.18 -0.96
2.48 2.02 2.04 1.31 1.51 1.63 -2.3 0.98 -0.92 0.36 -4.95 -3.27 -4.93 -3.85 -3.85 -3.94 -1.95 - - -3.95 -4.91 -3.95 - -4.1 -2.81 -1.74 -1.34 -0.33 -1.02 -0.4 -0.66 -0.29 0.73
1.0 1.5 0.8 0.87 0.3 0.59 -0.01 0.7 0.48 1.0 -1.94 -1.01 -1.07 -1.53 -1.91 -1.92 -0.23 -0.11 -1.24 -1.56 -1.01 -0.95 -0.84 -0.94 -0.6 -0.24 -0.17 0.07 0.69 0.39 0.04 -0.45 -0.01
0.78 0.67 0.77 0.58 0.44 0.72 0.27 0.3 0.18 0.23 -0.29 -0.38 -0.83 -0.3 0.13 -0.21 -0.5 -0.07 -0.5 -0.54 -0.35 -0.2 -0.29 -0.35 -0.4 -0.45 -0.45 -0.42 -0.07 -0.03 -0.28 -0.31 -0.02
-0.09 0.19 0.4 0.98 0.99 1.45 -0.96 0.34 0.48 0.71 -0.32 -1.59 -1.03 -0.99 -1.79 -0.9 -1.39 -0.3 -0.4 -0.75 -0.87 -1.37 -1.99 -1.42 -0.57 -2.29 -1.93 0.74 0.79 0.76 0.74 0.66 0.64
0.95 1.48 1.06 1.39 1.06 0.79 -0.46 0.67 0.06 0.66 -2.07 -0.91 -1.15 -0.96 -2.26 -4.56 -2.19 -3.81 -1.64 -1.71 -1.16 -0.03 -0.63 -1.42 -1.79 -0.66 -1.24 0.1 1.07 0.52 0.45 -0.23 0.37
0.42 0.26 0.76 1.15 0.74 0.34 -0.59 0.68 0.22 0.68 -0.42 -0.83 -1.24 -0.96 -0.64 -1.01 -0.7 -0.47 -1.15 -0.86 -0.5 -0.48 -1.02 -0.9 -0.91 -0.52 -0.28 0.06 0.75 0.76 -0.05 0.12 0.91
1.01 1.24 0.89 1.08 0.61 0.59 -0.46 0.75 0.6 0.51 -1.65 -0.96 -1.57 -1.09 -1.19 -1.75 0.17 -0.94 -1.48 -1.68 -1.61 -0.73 -0.84 -1.64 -0.62 -0.17 0.01 0.17 0.44 0.47 0.13 -0.13 0.44
0.11 1.05 0.5 0.98 0.86 1.22 -0.61 0.8 0.59 0.88 -0.96 -1.25 -1.1 -1.26 -1.53 -0.94 -0.93 -0.54 -1.08 -1.5 -1.26 -1.05 -1.39 -1.21 -1.7 -0.87 -0.75 0.53 0.71 0.66 0.47 0.32 0.48
1.1 1.32 1.07 1.29 1.26 1.7 -1.24 1.0 1.24 0.89 -1.4 -1.83 -3.51 -0.96 -1.16 -1.94 -0.69 -1.2 -1.91 -1.72 -1.66 -1.8 -2.2 -4.06 -1.61 -0.51 -0.35 -0.27 0.01 -0.16 -0.21 -0.46 -0.16
1.0 1.46 1.08 1.21 0.81 1.16 0.24 0.89 0.72 1.25 -1.48 -0.56 -0.53 -0.73 -0.88 -2.19 -1.2 -1.07 -1.86 -1.91 -1.45 -0.39 -0.53 0.25 -1.03 -2.16 -1.85 -0.78 -0.2 -0.21 -0.81 -1.05 -0.23
0.71 0.89 0.95 1.02 0.9 1.26 0.13 0.45 0.44 1.01 -0.82 -0.41 -0.98 -1.02 -0.25 -1.44 -0.89 -1.05 -1.33 -1.1 -1.38 -0.42 -0.49 -1.16 -0.22 -0.08 -0.12 -0.38 -0.3 -0.08 -0.38 -0.36 -0.09
0.61 0.61 0.67 0.74 0.47 0.35 -0.09 0.87 0.27 0.56 -0.94 -0.08 -0.95 -0.19 -0.21 -0.89 -0.3 -0.7 -0.92 -0.89 -0.74 0.25 -0.61 -0.83 -0.4 -0.61 -0.62 0.04 0.45 0.23 -0.13 -0.01 0.36
0.79 0.98 0.91 0.87 0.57 0.62 -1.09 1.18 0.83 1.36 -1.97 -1.31 -1.88 -0.61 -1.54 -2.42 -0.85 -1.44 -2.14 -2.32 -2.22 -0.97 -0.93 -1.24 -1.38 -0.86 -0.78 0.2 0.81 0.79 0.48 0.27 0.68
-0.04 -0.06 0.49 0.73 0.64 0.48 0.34 -0.15 -0.39 -0.2 -0.81 -0.08 -0.46 -0.4 -0.48 -0.6 -0.41 -0.64 -0.8 -0.59 -0.6 -0.15 -0.28 -0.17 -0.4 -0.14 -0.18 0.33 0.59 0.61 0.34 0.26 0.72
0.48 0.74 0.34 0.46 0.44 0.89 -0.01 0.45 0.45 0.35 -0.36 -0.12 -0.51 -0.27 -0.2 -0.48 -0.31 -0.42 -0.88 -0.67 -0.62 0.01 0.03 -0.52 -0.42 -0.22 -0.14 -0.17 0.08 0.09 -0.16 -0.46 0.02
0.99 0.48 0.97 0.95 0.94 1.38 -0.64 0.69 0.5 1.14 -1.39 -1.0 -1.47 -0.87 1.12 -1.28 -1.42 -1.22 -1.4 -1.67 -1.41 -1.01 -0.71 -1.31 -0.88 -1.05 -1.09 0.07 0.35 -0.08 -0.07 -0.48 0.2
0.76 0.7 0.84 0.84 0.32 0.22 -0.03 0.84 0.32 0.53 -1.22 -0.33 -0.79 -0.26 -0.62 -1.18 -0.2 -0.86 -1.21 -1.41 -1.09 -0.27 -0.13 -0.95 -0.43 -0.23 -0.06 0.03 0.45 0.4 0.16 -0.19 0.35
1.35 1.69 0.84 1.16 1.22 2.02 0.06 1.45 1.65 2.15 -4.33 -0.85 -5.01 -1.71 -3.33 -4.37 -4.17 -4.54 -4.77 -4.99 -5.41 -1.03 -2.59 -0.68 -3.12 -1.81 -1.85 -1.79 -1.13 -1.18 -1.63 -1.79 -1.33
1.19 0.99 1.21 1.23 0.85 0.7 0.48 1.03 0.45 0.96 -1.29 -0.46 -0.84 -0.9 -1.04 -1.39 -0.05 -1.17 -1.42 -1.13 -1.34 -0.32 -0.19 -1.46 -0.53 -0.03 0.11 -1.23 -0.82 -0.55 -1.37 -1.16 -0.2
0.2 -0.29 0.69 0.85 0.83 0.87 -0.25 0.69 0.75 0.69 -0.03 -0.36 -1.41 -0.55 0.06 -0.8 -0.22 0.02 0.11 0.02 0.32 -0.93 -1.16 -1.41 -0.77 -0.44 -0.49 -0.16 -0.31 -0.53 -0.34 -0.12 0.15
0.67 0.8 0.88 0.8 0.68 0.44 -0.37 0.61 0.41 0.94 -1.05 -0.66 -1.21 -1.12 -0.7 -1.27 -0.63 -0.59 -1.27 -1.37 -1.03 -1.01 -0.51 -0.61 -1.04 -0.15 -0.13 0.35 0.55 0.39 0.33 0.07 0.53
0.9 0.96 0.87 1.06 0.57 0.65 0.03 0.8 0.58 0.74 -0.87 -0.46 -1.2 -1.04 -0.98 -0.91 -0.6 -1.02 -1.29 -1.11 -1.06 -0.36 -0.25 -1.15 -0.32 -0.17 0.14 -0.37 -0.1 0.19 -0.26 -0.07 0.09
0.5 0.43 0.86 1.04 0.96 1.37 0.42 0.42 0.12 0.51 -0.16 -0.2 -1.25 -0.37 -0.33 -0.88 -0.33 -0.52 -0.82 -0.79 -0.85 -0.41 -0.52 -0.83 -0.13 -0.77 -0.54 -0.36 -0.16 -0.1 -0.3 -0.61 -0.19
0.95 1.25 1.3 1.81 1.17 1.96 -0.94 0.98 0.78 1.12 -2.73 -1.57 -4.04 -2.8 -2.55 -4.63 -0.78 -2.46 -3.14 -3.07 -2.27 -1.75 -2.65 -3.52 -2.65 -0.34 -0.03 -0.54 -0.01 0.12 -0.34 -0.56 0.5
1.17 1.3 1.28 0.96 0.89 1.03 -0.23 1.17 0.94 0.69 -1.55 -1.16 -1.64 -1.23 -1.78 -1.91 -0.71 -0.9 -1.52 -1.25 -1.25 -1.13 -0.66 -2.0 -1.32 -0.3 -0.28 -0.15 0.12 -0.11 -0.23 -0.29 -0.0
1.07 1.69 0.93 1.34 0.84 1.09 -0.47 0.96 0.68 0.77 -1.09 -1.26 -1.27 -1.08 -1.03 -1.84 -1.11 -1.96 -0.9 -0.81 -1.14 -1.26 -0.84 -1.87 -0.89 -0.42 -0.49 -0.46 -0.03 -0.22 -0.09 -0.34 -0.01
0.76 0.95 1.1 1.24 1.57 1.66 0.25 0.86 0.62 -0.07 -4.3 -1.47 -2.58 -1.76 - -4.67 -0.89 -4.51 -4.61 -3.47 -3.96 -2.42 -1.69 -1.48 -1.77 -0.86 -0.69 0.23 1.04 0.75 -0.05 0.25 1.11
0.09 -0.35 0.42 0.46 0.58 0.74 -0.39 0.75 0.29 0.79 -0.42 -0.11 -1.66 -0.21 0.08 -0.61 -1.31 -0.22 -0.47 -0.38 -0.4 -0.31 -0.52 -1.14 -1.12 -0.69 -0.75 0.47 0.56 0.49 0.51 0.34 0.3
0.11 -0.97 1.3 1.05 0.96 1.21 -1.67 1.46 1.52 0.61 -4.23 -2.51 -1.75 -2.28 -0.46 -4.56 -1.4 -4.06 -3.47 -4.13 -4.2 -1.07 -2.54 -3.2 -0.86 -1.12 -0.73 0.3 1.49 1.43 0.06 -0.2 1.01
0.9 0.98 0.75 0.86 0.92 1.4 -0.21 1.35 1.08 1.44 -1.47 -0.56 -2.58 -1.04 -0.62 -1.81 -1.07 -1.14 -1.77 -1.62 -1.61 -0.53 -1.5 -1.58 -1.34 -0.57 -0.45 -0.33 -0.01 -0.06 -0.22 -0.47 -0.2
1.08 1.19 0.75 0.91 0.57 0.87 -0.32 0.5 0.3 0.71 -0.76 -0.42 -1.57 -0.83 -0.3 -1.18 -0.21 -0.59 -1.11 -0.9 -0.84 -0.7 -0.77 -2.02 -0.55 -0.41 -0.34 -0.04 0.27 0.34 -0.21 -0.2 0.28
0.52 0.41 0.55 0.73 0.33 0.92 -0.19 0.68 0.26 1.19 -0.77 -0.29 -1.23 -0.4 -0.33 -1.0 -0.74 -0.64 -0.98 -0.84 -0.86 -0.42 -0.62 -1.28 -1.29 -0.03 0.08 -0.05 0.3 0.39 0.11 -0.01 0.53
1.87 1.68 1.95 1.65 0.98 0.37 0.3 0.57 0.58 0.01 -2.79 -1.75 0.12 -4.59 -3.85 -3.35 0.07 -2.77 -2.07 -2.31 -2.33 -0.5 0.06 -0.3 0.83 -0.53 -0.23 -2.67 -2.68 -1.57 -2.63 -2.6 -2.2
1.32 1.53 1.24 1.3 0.57 0.71 -0.8 0.54 0.4 0.54 -2.06 -2.09 -2.67 -2.71 -1.12 -3.02 -1.73 -1.85 -2.77 -2.33 -2.01 -2.48 -1.72 -1.01 -1.62 -1.27 -1.24 0.75 0.61 0.53 1.06 0.95 0.61
1.12 1.32 0.67 0.58 0.91 0.78 0.14 0.58 0.1 0.2 -1.81 -0.48 -1.2 -1.01 -0.57 -1.75 -0.02 -0.4 -1.69 -1.99 -1.21 -0.26 -0.02 -1.09 -1.02 -0.72 -0.68 0.09 0.54 0.45 0.11 -0.21 0.43
1.14 1.16 1.18 1.01 0.56 0.54 -1.02 0.94 0.5 0.89 -1.61 -1.49 -1.08 -1.83 -1.67 -1.79 -0.94 -1.76 -1.78 -1.89 -1.72 -1.25 -0.88 -1.37 -0.73 -0.82 -0.79 0.42 0.69 0.79 0.47 0.32 0.6
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0.26 0.42 0.52 0.86 0.64 0.66 -0.36 0.54 0.36 0.52 -0.8 -0.48 -1.79 -0.77 -0.47 -1.28 -0.47 -1.02 -1.09 -1.24 -0.94 -0.73 -0.81 -1.31 -0.91 0.07 -0.03 0.66 0.81 0.6 0.48 0.31 0.69
0.87 1.32 1.07 1.72 1.22 1.98 0.89 0.27 0.07 0.42 -0.16 0.41 -0.71 -1.6 0.12 0.1 -3.06 -1.36 -1.13 -0.4 -1.66 0.24 -1.72 0.26 0.59 - -6.94 - - - -5.82 - -
0.53 0.57 0.68 0.99 1.01 1.4 0.16 0.79 0.86 0.51 -1.04 -0.3 -1.29 -0.24 -0.59 -0.9 -1.16 -0.46 -0.71 -1.05 -0.93 -0.48 -0.48 -0.86 -1.02 -0.92 -0.83 -0.09 0.09 0.05 -0.14 -0.36 -0.13
0.64 0.79 0.69 0.69 0.76 1.34 0.59 0.89 0.89 0.59 -0.56 0.31 -0.82 -0.34 -0.42 -0.39 -0.83 -0.3 -0.66 -0.87 -0.69 -0.3 -0.4 -0.81 -0.09 -0.83 -0.68 -1.16 -0.75 -0.51 -1.0 -1.11 -0.78
0.72 1.14 0.54 1.48 0.75 1.19 -0.13 1.14 1.08 1.45 -1.88 -0.61 -1.91 -0.63 -0.99 -2.09 -0.85 -2.54 -2.57 -2.71 -2.6 -0.22 -0.71 -1.95 -0.47 -0.98 -0.67 -0.28 0.14 -0.14 -0.58 -0.71 0.58
0.63 0.8 0.8 1.2 0.73 0.95 -0.71 0.46 0.43 0.52 -0.99 -0.41 -0.83 -0.59 -0.42 -1.58 -1.04 -1.13 -1.17 -1.06 -1.03 -0.63 -0.49 -0.06 -0.68 -0.66 -0.85 0.12 0.35 0.43 0.18 0.12 0.44
1.59 1.88 1.3 1.37 1.16 1.74 1.2 0.58 0.39 -0.1 -4.98 0.26 -2.53 0.05 -5.08 - -1.67 -8.71 - -8.88 -6.52 0.6 0.01 -0.2 -0.18 -1.36 -1.05 -3.2 -1.2 -1.14 -3.47 -4.9 -0.77
0.07 -0.42 0.55 0.47 0.74 0.68 -0.66 1.5 1.33 0.9 -1.18 -1.22 -2.32 -0.85 -0.82 -1.41 -1.59 -1.19 -1.85 -1.35 -1.12 -1.18 -1.22 -1.19 -1.39 -0.64 -0.75 0.59 1.02 0.7 0.5 0.49 0.9
0.99 0.66 0.87 0.68 0.38 0.22 -0.44 0.35 0.1 -0.28 0.15 -1.22 -0.8 -0.76 -0.3 -0.89 -0.12 0.25 0.16 0.13 0.15 -0.96 -0.38 -1.2 -0.43 -0.1 -0.13 0.13 -0.11 -0.13 0.14 -0.09 -0.25
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0.74 0.91 0.32 0.58 0.33 0.55 0.41 0.29 0.2 0.05 -0.87 0.27 -0.39 -0.02 -1.16 -0.58 -0.18 -1.2 -1.14 -1.28 -1.15 0.09 0.16 -0.03 -0.21 -0.45 -0.45 -0.1 0.35 0.31 -0.06 -0.21 0.28
1.06 1.28 0.91 0.8 0.77 1.23 0.77 0.83 0.78 0.76 -1.48 0.53 -0.97 -0.06 -2.2 -1.32 -1.19 -0.92 -2.09 -1.17 -1.76 -0.53 -0.5 -1.99 -0.51 -0.69 -0.7 -0.68 -0.29 -0.4 -0.77 -0.68 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.