Heatmap: Cluster_337 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.16 0.16 0.21 0.01 0.09 0.26 0.0 0.19 0.19 0.09 0.16 0.0 0.02 0.2 0.11 0.08 0.52 0.75 1.0 0.48 0.68 0.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.09 0.29 0.05 0.11 0.33 0.0 0.18 0.0 0.04 0.06 0.1 0.1 0.12 0.01 0.05 0.54 0.87 0.82 0.33 0.46 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.17 0.23 0.11 0.35 0.35 0.0 0.81 0.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.71 0.01 0.0 1.0 0.73 0.84 0.8 0.63 0.84
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.18 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.03 0.19 0.0 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.12 0.01 0.01 0.32 0.6 1.0 0.43 0.34 0.81
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.04 0.02 0.07 0.27 0.05 0.08 0.19 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.59 0.7 1.0 0.73 0.75 0.92
0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.09 0.01 0.01 0.0 0.09 0.14 0.06 0.2 0.07 0.05 0.47 0.11 0.05 0.13 0.06 0.07 0.1 0.0 0.11 0.05 0.04 0.67 0.77 1.0 0.68 0.72 0.66
0.06 0.06 0.04 0.06 0.05 0.1 0.1 0.04 0.03 0.03 0.03 0.11 0.25 0.13 0.08 0.03 0.3 0.03 0.03 0.03 0.03 0.17 0.25 0.33 0.12 0.21 0.24 1.0 0.6 0.59 0.88 0.87 0.6
0.31 0.27 0.31 0.54 0.34 0.59 0.24 0.23 0.29 0.42 0.37 0.17 0.15 0.21 0.28 0.28 0.71 0.4 0.36 0.32 0.33 0.17 0.24 0.12 0.26 0.23 0.22 0.74 0.81 0.9 0.72 1.0 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.01 0.01 0.04 0.05 0.2 0.3 0.18 0.14 0.43 0.32 0.0 0.02 0.21 0.0 0.13 0.11 0.63 0.64 1.0 0.77 0.73 0.87
0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.04 0.6 0.65 0.81 0.5 0.67 1.0
0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.09 0.03 0.0 0.07 0.02 0.1 0.38 0.05 0.12 0.43 0.26 0.0 0.01 0.04 0.01 0.06 0.05 0.61 0.7 0.98 0.74 0.79 1.0
0.05 0.1 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.07 0.04 0.02 0.19 0.08 0.05 0.12 0.08 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.65 0.81 1.0 0.73 0.73 0.92
0.04 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.25 0.03 0.01 0.0 0.26 0.22 0.22 0.38 0.19 0.33 0.4 0.17 0.25 0.28 0.22 0.26 0.38 0.15 0.27 0.22 0.25 0.98 0.88 0.77 1.0 0.97 0.78
0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.09 0.03 0.0 0.01 0.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.0 0.13 0.03 0.1 0.28 0.5 1.0 0.4 0.42 0.88
0.11 0.06 0.1 0.09 0.14 0.09 0.25 0.06 0.09 0.04 0.26 0.41 0.34 0.29 0.19 0.24 0.57 0.23 0.27 0.35 0.26 0.24 0.23 0.21 0.29 0.26 0.28 0.85 0.86 1.0 0.91 0.99 0.94
0.22 0.18 0.23 0.26 0.21 0.32 0.26 0.23 0.22 0.21 0.24 0.4 0.26 0.4 0.2 0.24 0.57 0.22 0.25 0.25 0.25 0.25 0.15 0.12 0.22 0.32 0.32 0.75 0.76 0.91 0.93 1.0 0.9
0.03 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.37 0.0 0.0 0.0 0.03 0.22 0.14 0.35 0.15 0.07 0.45 0.03 0.01 0.04 0.06 0.21 0.15 0.24 0.11 0.05 0.09 0.57 0.85 1.0 0.49 0.54 0.97
0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.04 0.16 0.1 0.02 0.02 0.01 0.22 0.02 0.03 0.06 0.15 0.12 0.19 0.15 0.03 0.01 0.05 0.74 0.82 0.84 0.59 0.62 1.0
0.22 0.18 0.15 0.12 0.15 0.13 0.31 0.14 0.1 0.07 0.29 0.31 0.22 0.32 0.29 0.32 0.48 0.36 0.32 0.31 0.28 0.32 0.37 0.33 0.22 0.32 0.33 0.93 1.0 0.92 0.97 0.92 0.84
0.23 0.23 0.15 0.13 0.13 0.13 0.35 0.17 0.11 0.1 0.25 0.44 0.19 0.45 0.25 0.31 0.44 0.25 0.31 0.37 0.34 0.3 0.4 0.37 0.23 0.34 0.33 0.83 1.0 0.9 0.69 0.79 0.99
0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.23 0.02 0.03 0.04 0.13 0.41 0.31 0.49 0.17 0.16 0.28 0.2 0.14 0.14 0.21 0.47 0.26 0.16 0.38 0.23 0.3 0.97 0.88 0.71 1.0 0.9 0.62
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.03 0.0 0.03 0.15 0.23 0.1 0.18 0.03 0.0 0.25 0.09 0.08 0.05 0.03 0.23 0.2 0.05 0.1 0.02 0.03 0.87 0.94 0.96 0.66 0.7 1.0
0.12 0.11 0.13 0.14 0.23 0.04 0.35 0.09 0.07 0.06 0.05 0.2 0.25 0.13 0.11 0.05 0.39 0.01 0.02 0.02 0.04 0.28 0.39 0.27 0.2 0.26 0.25 0.7 1.0 0.86 0.71 0.65 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.14 0.0 0.13 1.0 0.21 0.2 0.19 0.13 0.19 0.12 0.17 0.14 0.1 0.08 0.25 0.36 0.89 0.29 0.75 0.6
0.07 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.21 0.0 0.1 0.21 0.6 0.0 0.0 0.05 0.13 0.91 0.87 0.54 0.8 0.79 0.67
0.0 0.32 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.82 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.11 0.1 0.26 0.5 0.72 0.27 0.59 1.0
0.04 0.07 0.06 0.06 0.06 0.05 0.33 0.02 0.02 0.01 0.08 0.16 0.11 0.22 0.06 0.1 0.29 0.03 0.15 0.17 0.06 0.18 0.0 0.22 0.1 0.02 0.13 0.83 0.86 0.93 0.68 0.78 1.0
0.11 0.04 0.06 0.07 0.13 0.04 0.34 0.05 0.04 0.03 0.16 0.05 0.29 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.15 0.33 0.09 0.18 0.0 0.17 0.25 0.06 0.06 0.48 0.76 0.6 0.25 0.95 0.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.4 0.0 0.0 0.43 0.0 1.0
0.05 0.02 0.02 0.01 0.05 0.0 0.1 0.07 0.09 0.0 0.02 0.0 0.04 0.31 0.1 0.05 0.25 0.06 0.08 0.03 0.08 0.07 0.09 0.03 0.06 0.05 0.09 0.52 0.76 0.91 0.54 0.61 1.0
0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.09 0.02 0.04 0.13 0.32 0.27 0.03 0.0 0.19 0.36 0.68 0.55 0.46 0.36 0.32 0.24 0.0 0.09 0.14 0.08 0.09 0.62 0.78 1.0 0.99 0.76 0.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.51 0.95 1.0 0.57 0.69 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.05 0.64 0.02 0.05 0.18 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.51 0.7 1.0 0.69 0.75 0.98
0.04 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.22 0.14 0.14 0.1 0.18 0.0 0.5 0.19 0.03 0.0 0.0 0.16 0.31 0.02 0.07 0.03 0.03 0.56 0.6 1.0 0.7 0.58 0.86
0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.09 0.0 0.07 0.08 0.19 0.22 0.05 0.11 0.27 0.45 0.56 0.19 0.27 0.1 0.35 0.03 0.04 0.03 0.3 0.05 0.06 0.73 0.89 1.0 0.76 0.67 0.39
0.03 0.03 0.03 0.09 0.12 0.22 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.15 0.07 0.03 0.01 0.24 0.01 0.05 0.04 0.06 0.14 0.24 0.19 0.12 0.12 0.16 0.69 1.0 0.96 0.76 0.54 0.63
0.04 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.09 0.13 0.09 0.0 0.17 0.44 0.04 0.18 0.0 0.0 0.06 0.33 0.0 0.0 0.02 0.06 0.35 0.56 0.58 0.36 1.0 0.78
0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.03 0.1 0.09 0.04 0.05 0.07 0.49 0.09 0.03 0.06 0.07 0.09 0.08 0.12 0.07 0.11 0.1 0.8 1.0 0.96 0.93 0.79 0.83
0.03 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.17 0.0 0.02 0.0 0.05 0.25 0.16 0.06 0.09 0.14 0.5 0.04 0.16 0.03 0.14 0.19 0.13 0.21 0.13 0.2 0.19 0.89 0.99 1.0 0.88 0.84 0.93
0.02 0.05 0.02 0.04 0.07 0.03 0.35 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.13 0.0 0.08 0.01 0.4 0.05 0.0 0.04 0.0 0.03 0.08 0.17 0.12 0.04 0.06 0.57 0.59 0.54 0.31 0.2 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.03 0.03 0.75 1.0 0.88 0.68 0.74 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.56 0.78 0.16 1.0 0.16
0.29 0.29 0.16 0.18 0.11 0.14 0.3 0.08 0.09 0.28 0.42 0.43 0.09 0.11 0.19 0.52 0.45 0.41 0.32 0.08 0.23 0.13 0.06 0.07 0.41 0.1 0.1 0.72 1.0 0.88 0.72 0.73 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.02 0.19 0.0 0.19 0.16 0.3 0.41 0.11 0.16 0.21 0.11 0.33 0.02 0.14 0.0 0.0 0.72 0.86 1.0 0.65 0.72 0.88
0.13 0.06 0.09 0.06 0.09 0.08 0.24 0.03 0.03 0.01 0.11 0.14 0.22 0.24 0.27 0.36 0.25 0.19 0.18 0.21 0.18 0.22 0.37 0.26 0.33 0.23 0.26 0.98 0.74 0.5 1.0 0.92 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.09 0.31 0.42 0.71 0.21 0.38 1.0
0.04 0.06 0.04 0.07 0.03 0.08 0.12 0.02 0.04 0.01 0.04 0.22 0.15 0.1 0.01 0.02 0.45 0.03 0.04 0.03 0.03 0.25 0.21 0.04 0.38 0.03 0.03 0.33 0.71 0.99 0.42 0.42 1.0
0.03 0.04 0.02 0.02 0.04 0.0 0.24 0.0 0.05 0.04 0.38 0.13 0.29 0.18 0.3 0.26 0.45 0.07 0.2 0.1 0.33 0.11 0.04 0.17 0.14 0.06 0.11 1.0 0.86 0.99 0.84 0.88 0.86
0.07 0.06 0.1 0.1 0.07 0.02 0.43 0.04 0.04 0.07 0.09 0.26 0.19 0.32 0.25 0.2 0.47 0.32 0.19 0.15 0.16 0.35 0.22 0.1 0.2 0.21 0.25 0.7 0.79 0.85 0.7 0.66 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.05 0.03 0.32 0.82 0.33 0.26 0.32 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.23 0.2 0.0 0.28 0.27 0.61 0.14 0.04 0.13 0.09 0.16 0.17 0.11 0.0 0.11 0.09 0.91 0.94 0.97 1.0 0.75 0.97
0.03 0.04 0.02 0.04 0.02 0.01 0.18 0.01 0.0 0.03 0.26 0.18 0.24 0.08 0.14 0.21 0.39 0.11 0.28 0.27 0.17 0.22 0.25 0.38 0.54 0.22 0.21 0.93 0.84 0.75 1.0 0.94 0.79
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.02 0.2 0.17 0.04 0.27 0.29 0.22 0.06 0.06 0.02 0.04 0.06 0.2 0.02 0.04 0.83 0.95 0.91 0.73 0.78 1.0
0.16 0.2 0.11 0.08 0.08 0.04 0.29 0.08 0.09 0.08 0.1 0.22 0.22 0.12 0.02 0.07 0.49 0.08 0.03 0.03 0.02 0.26 0.49 0.36 0.12 0.21 0.27 0.62 0.78 1.0 0.56 0.65 0.91
0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.14 0.29 0.07 0.07 0.0 0.21 0.25 0.02 0.03 0.44 0.7 0.57 0.51 0.31 1.0
0.2 0.05 0.14 0.1 0.21 0.0 0.25 0.23 0.21 0.01 0.19 0.33 0.09 0.1 0.13 0.13 0.9 0.24 0.1 0.25 0.13 0.38 0.0 0.08 0.16 0.04 0.07 0.71 0.74 0.78 0.64 0.74 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.1 0.38 0.09 0.06 0.26 0.06 0.15 0.09 0.12 0.21 0.23 0.03 0.12 0.15 0.09 0.71 0.9 0.83 0.52 0.49 1.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.64 0.74 0.72 0.5 0.65 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)