Heatmap: Cluster_240 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.04 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.08 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.04 0.0 0.14 0.15 0.34 1.0 0.85 0.46 0.46 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.24 0.0 0.08 0.05 0.0 0.06 0.06 0.12 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.04 0.28 0.59 1.0 0.4 0.4 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.04 0.02 0.01 0.01 0.08 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.33 1.0 0.92 0.41 0.21 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.34 1.0 0.61 0.45 0.15 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.71 1.0 0.32 0.27 0.31
0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.09 1.0 0.62 0.2 0.24 0.49
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.16 0.29 0.0 0.0 0.24 0.03 0.0 0.0 0.02 0.23 0.45 0.06 0.02 0.23 0.27 0.33 0.9 1.0 0.59 0.42 0.18
0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.48 1.0 0.56 0.55 0.51 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.08 0.05 0.06 0.1 0.01 0.1 0.18 0.05 0.08 0.09 0.07 0.0 0.1 0.0 0.0 0.04 0.4 1.0 0.2 0.28 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.02 0.0 0.11 0.17 0.04 0.0 0.1 0.09 0.06 0.01 0.0 0.0 0.08 0.12 0.1 0.43 0.59 1.0 0.49 0.55 0.38
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.43 0.29 0.0 0.03 0.29 0.01 0.03 0.02 0.01 0.19 0.21 0.35 0.07 0.18 0.18 0.37 1.0 0.81 0.48 0.35 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.61 1.0 0.07 0.04 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.04 0.06 0.65 1.0 0.09 0.06 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.05 0.04 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.03 0.64 1.0 0.08 0.04 0.17
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.01 0.07 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.21 1.0 0.75 0.15 0.09 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.08 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.04 0.23 1.0 0.76 0.17 0.06 0.44
0.04 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 0.23 0.0 0.02 0.01 0.59 1.0 0.48 0.36 0.15 0.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.03 0.45 1.0 0.88 0.4 0.21 0.65
0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.0 0.13 0.05 0.02 0.0 0.12 0.23 0.32 0.08 0.13 0.32 0.12 0.22 0.21 0.11 0.14 0.27 0.28 0.16 0.18 0.1 0.11 0.44 1.0 0.87 0.37 0.34 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.12 0.6 1.0 0.26 0.15 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.1 0.04 0.01 0.01 0.12 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.1 0.04 0.07 0.04 0.05 0.25 1.0 0.82 0.27 0.09 0.29
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.12 0.3 0.02 0.0 0.33 0.0 0.02 0.0 0.0 0.15 0.24 0.28 0.11 0.17 0.15 0.34 0.92 1.0 0.63 0.42 0.24
0.08 0.22 0.03 0.01 0.02 0.01 0.23 0.01 0.02 0.0 0.01 0.07 0.06 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.37 0.02 0.15 0.05 0.03 0.43 1.0 0.64 0.4 0.39 0.25
0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.02 0.05 0.04 0.36 1.0 0.72 0.44 0.3 0.19
0.02 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.01 0.03 0.23 0.01 0.04 0.06 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.11 0.1 0.55 1.0 0.97 0.49 0.58 0.3
0.18 0.22 0.17 0.11 0.1 0.05 0.27 0.03 0.06 0.05 0.18 0.16 0.18 0.24 0.08 0.23 0.11 0.18 0.11 0.1 0.14 0.26 0.23 0.06 0.11 0.13 0.13 0.48 0.91 1.0 0.57 0.44 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.07 0.0 0.09 0.04 0.11 0.04 0.01 0.0 0.0 0.06 0.11 0.06 0.07 0.01 0.34 1.0 0.02 0.02 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.9 0.64 0.46 1.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.12 0.01 0.04 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.02 0.04 0.05 0.08 0.11 0.5 1.0 0.42 0.43 0.3 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.06 0.03 0.01 0.07 0.03 0.01 0.05 0.01 0.01 0.03 0.03 0.05 0.04 0.26 0.61 1.0 0.36 0.35 0.35
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.06 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 0.07 0.07 0.48 0.92 1.0 0.39 0.53 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.03 0.03 0.12 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.06 0.11 1.0 1.0 0.2 0.04 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.02 0.28 1.0 0.4 0.4 0.31 0.44
0.04 0.01 0.12 0.05 0.13 0.1 0.03 0.01 0.01 0.0 0.04 0.04 0.08 0.01 0.5 0.07 0.03 0.07 0.08 0.02 0.03 0.08 0.05 0.16 0.06 0.04 0.05 0.09 0.87 1.0 0.13 0.18 0.26
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.52 1.0 0.43 0.52 0.32
0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.05 0.04 0.05 0.09 0.02 0.01 0.07 0.0 0.46 0.03 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.01 0.04 0.01 0.11 0.03 0.03 0.31 0.76 1.0 0.29 0.37 0.35
0.01 0.01 0.03 0.04 0.09 0.12 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.02 0.03 0.02 0.12 0.03 0.03 0.02 0.02 0.05 0.08 0.3 0.04 0.12 0.12 0.63 0.87 1.0 0.6 0.8 0.33
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.21 0.14 0.0 0.02 0.27 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.2 0.18 0.07 0.18 0.18 0.38 1.0 0.86 0.49 0.38 0.22
0.04 0.08 0.0 0.01 0.02 0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.06 0.14 0.13 0.04 0.22 0.1 0.16 0.04 0.07 0.03 0.05 0.08 0.06 0.09 0.12 0.09 0.13 0.52 0.96 1.0 0.36 0.47 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.33 1.0 0.09 0.04 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.71 1.0 0.24 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.0 0.0 0.0 0.14
0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.16 0.09 0.34 0.09 0.09 0.11 0.04 0.09 0.11 0.02 0.07 0.07 0.31 0.03 0.24 0.06 0.06 0.17 0.74 1.0 0.26 0.15 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.39 0.99 1.0 0.56 0.3 0.46
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.04 0.0 0.03 0.01 0.15 0.0 0.0 0.02 0.0 0.18 0.01 0.0 0.04 0.01 0.01 0.28 1.0 0.9 0.29 0.39 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.02 0.28 1.0 0.45 0.38 0.27 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.13 0.04 0.03 0.16 0.13 0.03 0.04 0.02 0.05 0.03 0.06 0.0 0.04 0.05 0.03 0.69 1.0 0.78 0.75 0.87 0.42
0.07 0.15 0.04 0.09 0.05 0.03 0.0 0.08 0.08 0.22 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.11 0.55 0.99 1.0 0.52 0.46 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.05 0.0 0.06 0.0 0.01 0.03 0.02 0.29 1.0 0.42 0.38 0.27 0.51
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.1 0.08 0.03 0.01 0.02 0.03 0.01 0.19 0.09 0.07 0.06 0.06 0.02 0.0 0.1 0.16 0.13 0.59 1.0 0.6 0.27 0.38 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.04 0.09 0.81 1.0 0.32 0.19 0.44
0.01 0.08 0.01 0.03 0.04 0.09 0.14 0.02 0.16 0.01 0.02 0.0 0.1 0.0 0.09 0.11 0.13 0.0 0.02 0.05 0.07 0.09 0.53 0.0 0.04 0.08 0.09 0.36 0.89 1.0 0.43 0.51 0.39
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.64 0.43 0.61 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.3 1.0 0.75 0.27 0.47 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.64 1.0 0.33 0.23 0.37
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.0 0.12 0.01 0.01 0.13 0.56 1.0 0.13 0.07 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.09 0.45 1.0 0.1 0.01 0.06
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.01 0.06 0.05 0.01 0.03 0.02 0.01 0.06 0.01 0.01 0.03 0.03 0.05 0.04 0.25 0.58 1.0 0.32 0.33 0.36
0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.07 0.17 0.11 0.04 0.02 0.02 0.11 0.05 0.0 0.12 0.02 0.17 0.11 0.08 0.07 0.0 0.0 0.4 1.0 0.71 0.35 0.18 0.62
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.33 1.0 0.06 0.08 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.04 0.08 0.0 0.04 0.11 0.02 0.18 0.04 0.01 0.0 0.61 1.0 0.56 0.38 0.7 0.48
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.02 0.05 0.03 0.02 0.01 0.06 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.07 0.13 0.14 0.39 0.82 1.0 0.4 0.52 0.22
0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.07 0.06 0.13 0.07 0.12 0.08 0.26 0.08 0.07 0.08 0.07 0.08 0.23 0.14 0.1 0.18 0.15 0.59 1.0 0.66 0.54 0.31 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.07 0.08 0.2 1.0 0.71 0.43 0.27 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)