Heatmap: Cluster_244 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-0.17 -0.44 -0.29 -0.55 -0.28 0.15 0.32 -0.02 -0.02 -0.55 0.08 0.17 -0.82 0.04 -0.07 0.18 -0.04 0.18 0.08 -0.06 -0.04 -0.2 -0.3 -0.58 -0.29 -0.31 -0.22 0.36 0.5 0.44 0.48 0.18 0.74
0.01 -0.07 -0.23 -0.5 -0.47 -0.79 -0.42 0.08 -0.53 0.06 0.06 -0.5 -1.3 -0.61 1.07 0.11 0.55 0.03 0.6 0.03 0.27 -0.27 -0.48 -0.97 -0.29 0.48 0.48 0.26 -0.04 0.29 -0.07 0.12 0.41
0.65 0.72 0.41 0.46 0.46 0.94 -0.65 0.44 0.08 0.4 -0.87 -0.95 -1.49 -1.23 0.04 -1.04 -0.39 -0.71 -0.9 -0.99 -0.91 -1.15 -1.09 -1.41 -0.65 0.28 0.18 0.55 0.75 0.58 0.54 0.48 0.44
0.36 0.26 0.23 0.28 0.99 0.44 0.63 -0.27 0.1 -0.16 -0.86 -0.85 -0.57 -0.43 -0.84 -0.88 0.79 -0.44 -0.82 -1.0 -1.02 -0.33 -0.13 -1.34 -0.53 0.34 0.57 0.02 0.46 0.46 0.05 0.05 0.5
0.77 1.06 -0.1 0.18 -0.15 1.13 -0.15 0.25 -0.52 1.24 -3.83 0.85 -5.56 0.87 -3.72 -5.81 -1.9 - - -7.4 -7.37 -1.3 -4.43 -4.24 -2.95 -0.16 -0.82 1.04 0.28 0.92 1.43 1.54 0.95
-0.67 -0.43 -0.14 0.11 0.24 0.58 -0.02 -0.03 -0.18 -0.21 -0.66 0.12 -1.01 -0.09 -0.15 -0.71 0.19 -0.07 -0.47 -0.34 -0.4 0.11 -0.72 -0.18 -0.59 -0.3 -0.13 0.4 0.58 0.86 0.49 0.55 0.81
0.26 -0.38 0.99 1.11 0.18 0.99 -0.37 -0.35 -1.1 0.92 -1.18 -0.74 -0.18 -0.44 -0.33 -0.58 -0.53 -0.98 -0.76 -0.86 -0.1 -0.4 -1.14 -0.63 -0.21 -0.26 -0.0 0.43 0.33 0.37 0.37 0.43 0.45
0.23 -0.03 0.57 0.27 0.6 0.61 0.2 0.68 0.41 0.24 -0.52 -0.15 -1.29 -0.31 -0.54 -0.95 -0.63 -0.46 -0.85 -0.6 -0.64 -0.38 -0.49 -1.08 -0.91 -0.03 0.02 0.22 0.58 0.62 0.37 0.21 0.58
0.01 -0.13 0.09 -0.17 0.21 0.01 -0.06 -0.09 -0.45 -0.43 -0.58 -0.1 -0.83 -0.61 -0.79 -1.15 0.12 -0.48 -0.28 -0.36 -0.72 -0.33 0.09 -0.68 -0.94 0.09 0.12 0.81 0.95 0.99 0.77 0.58 0.76
0.92 0.39 1.34 0.59 1.12 0.5 -0.6 0.36 -0.34 -0.52 -4.31 -0.96 -3.42 -2.73 -5.15 -4.24 -1.09 - -5.18 -5.24 -4.8 -2.98 -3.16 -4.67 -3.7 0.36 0.69 1.05 1.68 1.43 0.46 0.6 1.67
0.36 0.33 0.23 0.16 -0.79 -0.72 1.08 -0.87 -1.33 0.29 -2.58 -0.1 -2.09 -1.07 -1.32 -2.84 -0.06 -0.95 -1.35 -2.35 -1.45 0.08 -0.66 -2.51 -0.25 0.3 0.53 1.21 0.82 0.96 1.27 1.39 0.59
-0.37 0.04 0.43 0.65 0.65 1.44 -0.85 -0.27 -0.61 1.02 -1.15 -1.21 -1.22 -1.1 -0.65 -0.9 0.67 -2.88 -1.48 -1.42 -1.27 -0.49 -1.57 - 0.1 0.51 1.06 0.2 0.3 0.75 0.73 0.0 0.82
0.62 0.36 0.69 0.67 0.7 1.25 -0.14 0.53 0.36 0.35 -0.98 -0.5 -1.28 -0.09 -0.43 -1.09 -0.27 -0.18 -0.97 -0.76 -0.87 -0.74 -0.59 -0.93 -1.08 0.2 0.25 -0.16 0.21 0.27 -0.07 -0.21 0.31
0.09 -0.35 -0.26 0.26 -0.18 0.46 0.71 -0.72 -1.03 -0.28 -1.19 -0.05 0.12 0.16 0.34 -0.77 -0.27 -1.26 -0.22 -0.21 -0.2 0.25 0.22 0.23 -0.21 -0.03 0.03 0.24 0.53 0.44 0.35 0.13 0.34
-0.85 -0.48 -0.64 -0.59 -0.08 0.75 0.25 -0.24 -0.19 -0.64 0.15 0.2 -0.67 0.04 0.33 0.22 0.48 0.41 -0.06 0.09 0.07 -0.13 -0.14 -0.7 -0.3 -0.28 -0.05 0.16 0.06 0.38 0.05 0.23 0.49
-0.23 -0.02 -0.15 0.24 0.18 0.41 0.19 -0.27 -0.42 0.17 -0.28 0.29 -0.49 0.4 0.06 -0.12 -0.23 -0.14 -0.4 -0.21 -0.29 0.23 0.03 -0.45 -0.18 -0.13 -0.05 0.19 0.35 0.24 0.11 -0.08 0.29
-0.14 -1.13 0.23 0.48 1.05 1.32 1.26 0.24 -0.06 -0.51 -1.44 0.22 -0.21 -0.28 -0.58 -0.61 0.56 -0.81 -0.95 -0.89 -1.0 0.05 -1.4 0.68 0.44 0.74 0.77 -1.32 -0.94 -0.19 -1.28 -1.15 -0.5
-0.49 -0.0 -0.63 -0.0 0.22 0.55 -0.45 0.27 -0.72 -0.03 -0.36 -0.14 -0.73 -0.35 -0.04 -0.22 0.17 -0.39 -0.25 -0.29 -0.14 0.24 -0.38 -0.83 -0.22 -0.1 0.23 0.4 0.71 0.82 0.37 0.19 0.57
0.27 -0.06 0.45 0.24 0.3 0.03 0.44 0.25 -0.37 0.13 -0.16 0.18 -0.26 -0.3 0.25 -0.2 -0.44 0.08 -0.43 -0.13 -0.33 -0.06 0.09 -1.45 0.05 0.13 0.23 -0.49 -0.03 0.29 -0.05 -0.2 0.24
0.31 0.42 0.44 0.51 0.45 0.98 0.13 0.38 0.05 0.28 -0.45 0.03 -0.76 -0.5 -0.48 -0.72 0.32 -0.34 -0.64 -0.28 -0.54 -0.12 -0.4 -1.19 -0.12 0.16 0.3 -0.16 0.17 0.1 -0.35 -0.69 0.27
0.52 -0.08 0.67 0.38 0.47 0.78 0.44 0.29 0.19 0.23 -0.52 -0.17 -1.25 -0.21 -0.37 -0.59 -0.71 -0.26 -0.56 -0.64 -0.5 -0.73 -0.7 -0.93 -0.83 0.41 0.44 -0.12 0.51 0.37 -0.0 -0.11 0.48
-0.38 -0.5 -0.38 0.08 0.11 0.44 -0.22 0.02 -0.31 0.06 -0.25 -0.13 -1.19 -0.17 0.11 -0.23 0.05 -0.18 -0.22 -0.13 -0.05 -0.34 -0.64 -0.94 -0.67 0.02 0.21 0.59 0.69 0.61 0.61 0.52 0.59
0.69 0.66 0.49 0.7 1.04 -0.05 1.85 -1.7 -2.29 -2.48 -1.34 -0.27 0.5 -0.43 -0.93 -0.3 0.1 -0.65 -0.79 -1.62 -0.43 0.73 0.54 0.31 0.19 -0.3 0.03 -0.72 -0.82 -0.34 -0.66 -0.63 -0.26
-0.07 -0.11 -0.13 -0.17 0.32 0.51 -0.25 -0.03 0.19 -0.26 -0.59 -0.64 -2.03 -0.13 -0.71 -0.71 0.13 -0.31 -0.13 -0.57 -0.06 -0.99 -1.2 -1.07 -1.61 0.03 0.01 0.78 1.17 0.89 0.56 0.47 1.19
0.52 0.64 0.52 0.45 0.43 1.33 0.32 0.21 -0.11 0.05 -0.43 -0.25 -1.67 -1.17 -0.6 -0.28 0.35 -0.42 -0.95 -0.59 -0.9 -0.5 -0.26 -1.32 -0.27 -0.39 0.17 -0.08 0.3 0.32 -0.0 0.2 0.28
-0.45 0.21 -0.66 -0.46 -0.23 0.79 -0.31 -0.39 -0.05 -0.56 -0.31 -0.44 -0.46 -0.25 -0.56 -1.11 0.29 -1.01 -0.59 -0.78 -0.99 -0.45 0.03 0.33 -0.51 -0.0 0.18 0.67 0.95 1.1 0.38 0.6 0.93
-0.24 0.0 -0.57 -0.82 -0.35 0.13 -0.03 -0.12 0.06 -0.06 0.15 0.12 -2.0 -0.52 -0.4 0.13 -0.36 0.52 0.3 -0.35 0.25 -1.53 -1.36 -0.98 -1.46 -0.24 -0.05 0.77 1.03 0.88 0.7 0.44 0.78
-0.18 -0.28 -0.11 0.44 0.18 0.76 0.36 0.09 0.2 0.76 0.11 0.25 -0.43 -0.12 0.2 0.24 -0.94 0.12 0.04 -0.23 -0.03 -0.12 -0.33 -0.17 -0.38 -0.84 -0.77 -0.4 0.08 0.2 -0.29 -0.34 0.2
0.49 0.27 0.88 0.4 0.89 0.45 0.66 -0.89 -0.8 -1.51 -1.5 -0.18 -0.29 -1.04 0.07 -0.97 0.35 -1.72 -1.62 -1.84 -1.19 -0.09 0.05 0.33 -0.16 0.22 0.25 0.43 0.44 0.35 0.22 0.26 0.49
0.64 0.48 0.78 1.18 0.78 1.06 0.04 -0.2 -0.04 0.69 -1.37 -0.98 -1.76 -0.96 -0.89 -2.04 -0.3 -1.59 -1.58 -1.2 -1.46 -0.81 -0.64 -1.42 -1.21 -0.05 0.06 0.49 0.74 0.65 0.53 0.51 0.56
0.92 0.53 0.43 0.35 0.64 1.18 -0.75 0.52 0.31 -0.26 -0.9 -1.1 -1.7 -1.21 -0.36 -0.94 0.5 -0.76 -0.65 -0.53 -0.54 -2.24 -0.56 -1.38 -1.33 0.43 0.42 0.28 0.4 0.46 0.33 0.18 0.48
1.12 0.37 1.18 0.41 1.02 0.7 0.3 0.66 0.51 0.18 -1.27 -0.98 -1.71 -0.92 -0.25 -0.98 0.15 -0.38 -0.67 -0.56 -0.89 -0.72 -0.88 -1.69 -0.76 0.65 0.83 -0.43 -0.21 -0.29 -0.47 -0.52 -0.25
0.78 0.05 1.16 0.75 1.26 1.02 -0.94 0.18 0.33 0.59 -0.97 -0.97 -2.44 -0.67 -1.29 -2.73 -0.73 -0.65 -1.87 -2.06 -1.03 -1.48 -1.15 -3.2 -1.58 0.05 0.09 0.2 0.97 0.94 0.36 0.12 1.07
-0.19 -0.8 0.23 0.35 0.39 0.71 -0.11 -0.18 -0.18 -0.12 0.19 -0.03 -0.33 -0.18 0.07 0.2 0.03 0.22 0.3 0.33 0.38 -0.5 -0.62 -1.13 -0.53 -0.03 0.17 -0.31 -0.08 0.22 -0.14 0.05 0.15
0.07 -0.04 0.25 0.31 0.56 1.01 -0.31 0.42 0.29 0.08 -0.64 -0.49 -1.26 -0.25 -0.71 -1.11 0.35 -0.83 -1.17 -0.84 -1.03 -0.34 -0.49 -1.09 -0.32 0.18 0.48 0.2 0.56 0.7 0.35 0.32 0.62
0.35 0.33 0.73 0.55 0.27 -0.25 0.21 0.38 0.13 -0.41 -0.72 -0.12 -0.27 -0.07 0.11 -0.82 -0.12 -0.7 -0.67 -1.03 -0.59 0.1 0.22 -0.65 0.2 -0.04 0.07 0.01 0.29 0.38 -0.04 -0.13 0.33
0.73 0.6 0.43 0.38 0.59 0.96 0.42 0.63 0.31 0.35 -1.04 0.02 -0.42 0.19 -0.94 -1.15 -0.42 -0.99 -1.23 -1.11 -1.18 0.09 0.27 -0.34 -0.36 -0.19 -0.1 -0.27 0.21 0.18 -0.36 -0.5 0.17
-0.07 0.05 0.6 0.65 0.71 0.81 -0.07 0.33 -0.23 0.04 -1.3 -0.23 -0.29 0.08 -0.04 -1.27 -0.09 -0.54 -1.37 -1.3 -1.06 0.1 -0.33 -0.18 -0.43 -0.48 -0.28 0.41 0.54 0.35 0.42 0.31 0.44
-0.08 0.33 -0.1 -0.18 0.01 -0.2 -0.22 0.65 -0.12 0.7 -0.13 0.21 -1.56 0.31 -0.41 -0.27 0.07 0.09 -0.72 -1.52 -0.95 -0.4 -0.24 -0.66 -0.53 -0.17 0.01 0.44 0.66 0.79 0.41 0.02 0.58
-0.43 -1.4 -0.09 -0.28 0.55 -0.09 0.37 -1.34 -1.47 -0.91 -0.77 0.01 -0.6 0.15 -0.41 -0.75 -0.31 -0.87 -1.01 -0.77 -0.73 0.01 0.32 -0.86 -0.36 0.06 0.08 0.84 1.33 0.94 0.81 0.56 1.17
0.35 -0.25 0.5 0.5 0.66 0.53 0.01 0.42 0.25 0.14 -1.01 -0.22 -1.71 0.02 -0.67 -1.33 0.27 -0.8 -1.24 -0.83 -1.02 -0.37 -0.56 -0.94 -0.52 -0.01 0.15 0.46 0.46 0.6 0.41 0.46 0.76
0.14 0.02 0.55 1.0 0.93 1.24 0.03 0.02 -0.46 0.39 -0.29 -0.1 -0.69 -0.83 -0.68 0.0 -0.56 -0.1 -0.35 -0.48 -0.22 -0.87 -0.81 -0.61 -0.58 -0.03 0.02 -0.12 0.1 0.21 -0.26 -0.22 0.34
-0.89 0.21 0.28 0.03 0.92 0.28 0.06 -0.84 -1.92 -0.25 -2.14 -0.31 -0.9 -0.24 -3.13 -0.97 -2.84 -0.94 -2.87 -0.75 -2.37 -0.53 -0.84 -1.56 -0.54 0.18 0.2 1.0 1.54 1.34 1.06 1.19 1.18
0.71 0.37 0.58 0.39 0.31 1.03 -0.3 0.24 0.04 0.24 -0.4 -0.68 -0.79 -0.76 -0.24 -1.23 -0.05 0.15 -0.31 -0.72 -0.71 -0.76 -0.56 -1.29 -0.11 0.13 0.15 0.33 0.4 0.05 0.41 -0.07 0.21
-0.37 -0.05 -0.56 -0.07 0.05 0.78 0.55 -0.09 0.01 -0.01 -0.13 -0.03 -1.19 -0.06 0.2 0.02 -0.14 0.27 -0.27 -0.31 -0.3 -0.55 -0.31 -0.88 -0.46 -0.19 0.05 -0.0 0.57 0.7 -0.06 -0.01 0.78
-0.22 -0.49 0.58 0.87 0.83 0.61 0.62 0.31 -0.03 0.0 -0.62 0.08 -0.49 -0.45 0.25 -0.05 0.33 0.15 -0.69 -0.73 -0.29 0.02 -1.17 -0.68 0.11 0.29 0.45 -0.37 -0.52 -0.52 -0.33 -0.41 -0.23
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0.04 0.31 0.08 -0.39 -0.1 0.53 0.21 0.27 0.13 0.37 -0.06 0.12 -1.44 0.47 -0.01 0.21 0.01 -0.84 -0.11 -0.55 0.19 -0.06 0.08 -0.78 -0.42 0.59 0.34 -0.65 0.12 0.13 -0.33 -0.35 -0.02
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0.0 -0.22 -0.02 -0.07 0.32 0.4 0.44 0.25 -0.16 -0.43 -0.44 0.17 0.23 0.29 -0.79 -0.02 -0.07 -0.39 -0.44 -0.43 -0.52 0.32 0.5 0.73 -0.02 -0.29 -0.19 -0.27 0.09 0.13 -0.22 -0.35 0.16
-0.07 0.16 0.07 0.27 0.3 0.38 0.23 -0.1 0.18 -0.33 -0.74 -0.44 -1.04 -0.32 -0.33 -0.09 0.24 0.07 -0.68 -0.48 -0.1 -0.37 -0.37 -0.51 0.09 -0.0 0.17 0.07 0.55 0.6 0.24 0.13 0.6
-0.07 -0.1 -0.27 -0.05 0.5 1.16 0.05 0.11 0.31 0.12 -0.28 0.02 -1.02 -0.54 0.12 -0.46 -0.75 -0.07 -0.67 -0.78 -0.59 -0.62 -0.84 -0.44 -0.66 -0.22 -0.16 0.11 0.75 0.94 0.32 0.26 0.61
-0.03 -0.38 0.2 0.13 0.47 0.51 0.01 0.16 0.04 0.0 -0.2 0.07 -0.8 -0.14 -0.41 -0.08 -1.22 -0.33 -0.34 -0.33 -0.48 -0.3 -0.46 -0.56 -0.64 0.14 -0.04 0.23 0.67 0.72 0.33 0.27 0.69
0.06 -0.28 0.15 -0.22 -0.07 0.24 0.0 0.08 -0.17 0.03 -0.54 -0.19 -0.87 -0.87 0.05 -0.7 -0.31 0.21 -0.3 -0.94 -0.03 -0.28 -0.26 -0.49 -1.01 0.29 0.55 0.4 0.72 0.76 0.5 0.29 0.69
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0.46 -0.01 -0.03 -0.23 0.43 0.06 0.35 0.75 0.11 -0.57 -0.51 0.38 0.2 0.33 -0.63 -0.05 -0.39 -0.63 -0.72 -1.15 -0.76 0.76 0.36 0.42 0.08 -0.01 -0.1 -0.02 0.16 -0.34 -0.43 -0.59 0.05
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-0.01 -0.45 -0.4 -0.15 0.11 0.5 0.62 -0.54 -0.23 -0.99 -1.61 -0.01 -0.04 -0.1 -0.42 -1.88 0.14 -1.0 -2.27 -1.22 -1.78 0.27 -0.35 1.26 -0.7 0.12 0.22 0.74 0.77 0.52 0.88 0.48 0.55
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.