Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.19 -0.08 -0.52 -4.86 0.12 0.51 0.55 0.82 0.44 0.81 0.74 0.5 -0.32 0.73 0.43 0.37 0.52 0.42 0.43 0.19 0.28 1.17 -0.4 -0.39 -0.9 -0.32 -0.31 0.08 -0.05 0.02 -0.78 -0.38 0.04 -0.26 0.03 -1.24 -0.27 -0.23 -0.43 -0.05 -0.58 -0.03 -0.17 -0.84 -0.32 -0.68 0.12 -0.18 -0.35 -0.31 -0.28 -0.5 -0.76 -1.01
0.77 0.76 -2.16 -5.66 0.8 0.54 0.58 0.54 0.43 0.76 0.63 0.49 -0.78 0.64 0.6 0.75 0.91 0.83 1.18 -0.23 0.0 0.41 -0.14 0.03 -1.5 -0.41 -0.7 -0.2 -0.57 -0.1 -0.83 -1.2 0.35 -0.55 0.28 -2.41 -0.33 -0.67 -0.31 0.05 -1.64 -0.38 -0.37 -1.46 -0.38 -1.93 -0.13 -0.17 0.02 -0.07 -0.0 -0.34 -0.71 -0.79
-0.42 0.59 0.38 -4.53 1.11 0.69 1.57 0.82 0.93 1.5 1.37 0.69 -1.24 -0.74 0.27 0.25 0.35 0.5 1.08 0.19 0.21 -0.11 -0.58 -0.37 -1.22 -0.61 -1.1 -0.44 -0.58 -0.71 -1.2 1.35 -0.22 -0.69 -0.37 -2.0 -0.82 -0.74 -0.7 -0.83 -1.07 -0.72 -0.68 -1.25 -0.94 -1.42 -0.38 -0.59 -0.5 -0.36 -0.4 -0.54 -0.59 -0.66
0.35 0.94 0.58 -4.53 0.81 0.32 0.39 0.34 0.26 0.18 0.17 0.17 -1.49 -0.31 0.87 0.79 0.81 0.85 1.12 -0.09 -0.05 0.11 -0.26 0.02 -1.49 -0.32 -0.49 -0.1 0.25 -0.17 -0.89 -0.52 0.09 0.19 0.07 -1.96 -0.43 0.24 -0.38 -0.12 -1.33 -0.13 -0.05 -1.32 0.04 -1.59 -0.08 0.05 -0.17 -0.09 0.0 -0.52 -0.83 -1.11
0.3 0.52 -0.57 -4.77 0.78 0.62 0.78 1.03 0.33 0.92 0.81 0.21 -0.59 0.28 -0.04 0.24 -0.02 -0.1 0.94 -0.2 -0.09 0.69 -0.45 0.53 -1.86 -0.89 -0.5 -0.16 -0.02 -0.39 -0.29 0.53 0.86 0.67 0.65 -1.17 -1.07 -0.62 -0.92 0.06 -1.6 -0.2 -0.34 -1.73 0.2 -1.6 -0.15 -0.11 0.67 -0.52 -1.07 -1.87 -1.38 -0.96
0.37 0.38 -1.05 -5.04 1.02 0.55 0.97 0.74 0.5 0.7 0.46 0.55 -1.37 0.92 1.1 1.05 0.92 0.95 1.63 0.25 0.33 1.07 -0.52 -0.24 -0.63 -1.32 -1.76 -0.25 -0.71 -0.39 -1.27 -1.17 0.04 -0.65 -0.03 -3.35 -0.92 -1.34 -1.05 -1.05 -1.2 -0.82 -0.65 -0.97 -1.31 -1.62 -0.32 -0.53 -0.31 -0.38 -0.36 -0.21 -0.19 -0.18
1.0 0.88 0.26 -4.09 1.44 0.3 0.24 1.09 0.49 0.69 0.63 0.36 -1.41 0.58 0.73 0.73 0.6 0.74 1.42 0.4 0.3 0.08 -0.46 -0.27 -1.71 -1.3 -0.97 0.06 -0.01 -0.15 -1.57 -0.49 0.04 -0.21 -0.12 -3.27 -0.94 -1.02 -1.28 -0.5 -1.69 -0.26 -0.12 -1.79 -0.51 -2.03 0.1 -0.19 -0.32 -0.24 -0.11 -0.65 -1.05 -1.33
0.49 0.39 -0.02 -5.33 0.03 0.45 0.36 0.69 0.48 0.62 0.41 0.48 -0.91 0.71 0.19 0.26 0.23 0.17 0.39 0.02 0.21 1.23 -0.32 -0.27 -0.85 -0.49 -0.06 -0.07 0.27 -0.07 -0.35 -0.35 0.06 0.21 0.05 -1.08 -0.68 -0.21 -0.69 0.18 -0.55 0.16 -0.06 -0.53 0.18 -0.73 -0.01 0.02 -0.36 -0.32 -0.28 -0.58 -0.96 -1.22
0.5 0.67 0.23 -3.82 0.18 0.3 1.04 0.47 0.14 0.06 -0.16 0.43 -1.26 0.47 0.35 0.22 0.51 0.38 0.58 -0.23 -0.05 0.87 0.06 -0.52 0.22 -0.39 -0.61 -0.17 0.02 -0.26 -0.65 -0.73 -0.19 -0.35 -0.31 -0.75 -0.44 -0.39 -0.37 -0.21 0.11 -0.13 -0.18 0.22 -0.01 -0.17 -0.14 0.06 -0.19 -0.13 -0.11 -0.32 -0.39 -0.31
1.18 1.52 -0.3 -4.22 1.24 0.84 0.09 0.69 -0.04 0.73 0.85 0.17 -0.85 0.13 0.91 0.87 0.85 0.79 0.44 0.69 0.5 0.15 -0.52 -1.51 -1.37 -0.32 -1.03 -0.27 -0.24 -0.22 -1.89 -1.96 -0.78 -1.15 -0.72 -1.34 -0.35 -0.31 -0.34 -0.13 -1.17 0.07 -0.06 -1.3 -0.36 -1.28 0.03 -0.03 -0.37 -0.0 -0.2 -0.76 -1.07 -1.51
0.51 0.29 -1.37 -6.29 -0.25 0.85 0.66 1.11 0.76 1.1 0.96 0.69 -0.48 -0.04 0.38 0.16 0.43 0.32 0.48 -0.22 -0.02 0.09 0.09 -0.45 -2.05 -0.91 -0.59 0.52 -0.09 0.42 -2.03 -1.31 0.07 -0.37 -0.06 -2.61 -0.76 -0.91 -0.72 0.6 -1.95 0.25 0.31 -2.1 -0.12 -2.37 0.47 0.42 -0.01 0.44 0.47 -0.36 -0.78 -0.97
0.79 1.07 0.56 -4.45 1.13 0.52 0.53 0.59 0.54 0.72 0.6 0.55 -0.89 0.28 0.77 0.7 0.67 0.62 1.31 0.54 0.6 0.8 -0.55 -0.95 -1.56 -0.4 -0.77 -0.28 -0.47 -0.34 -1.72 -1.42 -0.67 -0.93 -0.72 -1.65 -0.14 -0.29 -0.28 -0.15 -1.3 -0.19 -0.33 -1.37 -0.47 -1.5 -0.11 -0.33 -0.46 -0.49 -0.53 -0.59 -0.76 -0.97
0.36 0.32 0.63 -4.85 -0.07 0.76 0.5 0.92 0.27 0.56 0.71 0.28 -0.77 0.56 0.33 0.28 0.37 0.32 0.66 0.24 0.36 0.92 -0.46 -0.11 -0.89 -1.0 -0.26 -0.02 0.23 -0.07 -0.9 -0.22 0.37 -0.01 0.29 -1.22 -0.92 -0.87 -1.08 -0.09 -0.26 0.11 -0.19 -0.75 -0.34 -0.71 0.16 -0.25 -0.37 -0.58 -0.48 -0.4 -0.57 -0.7
0.51 0.46 -0.38 -5.29 1.12 0.95 0.71 0.03 0.16 0.08 -0.12 0.12 -1.18 0.3 1.11 1.22 1.02 1.07 1.18 0.05 0.31 -0.17 -0.24 -0.53 -0.25 -1.25 -1.4 -0.39 -0.51 -0.41 -0.08 -1.08 -0.13 -0.63 -0.28 -1.75 -0.99 -1.11 -1.04 -0.85 -0.12 -0.74 -0.47 -0.45 -0.91 -0.08 -0.38 -0.35 -0.47 -0.14 -0.24 0.49 0.26 0.23
0.34 0.38 -0.9 -4.74 0.3 0.49 0.87 0.84 0.69 0.96 0.85 0.64 -0.53 0.04 -0.07 -0.34 -0.12 -0.07 -0.14 0.31 0.16 0.35 -0.3 0.57 -0.6 -1.21 -0.48 -0.0 -0.18 -0.05 -0.14 0.11 0.49 0.3 0.5 -1.19 -0.97 -1.18 -1.11 -0.12 -0.15 0.22 -0.07 -0.58 -0.09 -0.01 0.08 -0.17 -0.27 -0.28 -0.31 -0.53 -0.6 -0.61
0.38 1.75 0.84 -3.37 0.45 0.69 0.33 0.55 0.69 1.03 0.89 0.63 -0.76 0.18 0.55 0.49 0.51 0.47 0.52 0.29 0.13 -0.34 -0.45 -0.52 -0.75 -0.16 -0.72 -0.47 -0.52 -0.42 -0.37 -0.96 -0.45 -0.64 -0.42 -0.83 -0.37 -0.41 -0.32 -0.07 -0.59 -0.57 -0.65 -0.68 -0.38 -0.64 -0.57 -0.51 -0.58 -0.43 -0.33 -0.37 -0.43 -0.55
0.78 0.76 -0.65 -5.44 1.06 0.65 0.79 0.76 0.3 0.62 0.52 0.25 -1.01 0.58 1.01 0.99 1.0 1.03 1.28 -0.12 -0.02 0.43 -0.15 -0.09 -1.59 -0.95 -0.7 -0.05 -0.15 -0.02 -1.33 -0.99 -0.18 -0.42 -0.23 -2.57 -0.84 -1.01 -0.81 -0.29 -2.02 -0.39 -0.29 -1.88 -0.42 -2.34 -0.1 -0.1 -0.04 -0.12 -0.08 -0.49 -0.7 -0.91
0.87 0.67 0.3 -4.33 0.33 0.84 0.41 0.7 0.52 0.55 0.44 1.0 -0.78 0.58 0.06 -0.19 0.09 -0.23 -0.32 0.38 0.26 0.68 -0.5 -0.74 -1.25 -0.63 -0.15 0.05 0.14 0.19 -0.46 -0.19 -0.11 -0.26 0.04 -1.7 -0.82 -0.55 -0.73 0.61 -0.78 0.3 0.06 -1.05 0.46 -0.9 0.17 0.1 0.39 -0.32 -0.76 -1.01 -1.12 -1.06
0.52 1.18 0.81 -6.33 1.09 0.59 0.24 0.59 -0.16 0.45 0.01 0.08 -1.49 0.51 0.57 0.52 0.68 0.64 1.01 0.44 0.57 0.44 -0.66 0.27 -3.15 -0.13 -1.46 -0.01 -0.22 -0.1 -1.83 -0.43 0.58 0.18 0.62 -2.82 0.0 -0.1 0.07 -0.52 -2.71 -0.25 -0.12 -3.11 -0.62 -3.93 0.19 -0.1 -0.22 -0.46 -0.45 -0.44 -0.95 -1.31
0.76 0.71 -0.08 -5.13 1.02 0.51 0.37 0.25 0.4 0.45 0.17 0.56 -1.0 0.49 0.7 0.7 0.79 0.8 0.68 0.56 0.59 0.33 -0.28 -0.42 -1.2 -0.01 -0.9 -0.2 -0.29 -0.29 -1.31 -1.14 -0.2 -0.49 -0.23 -1.0 -0.16 -0.12 -0.11 -0.6 -1.1 -0.22 -0.12 -1.07 -0.44 -1.38 -0.11 -0.17 -0.19 -0.05 -0.05 -0.1 -0.4 -0.65
0.71 0.75 0.79 -5.13 0.63 0.24 0.42 0.18 0.77 0.24 0.03 0.75 -0.35 0.36 0.48 0.48 0.53 0.51 0.86 0.09 0.25 0.19 -0.15 -0.28 -0.73 -0.43 -0.0 -0.28 -0.31 -0.24 -0.47 0.11 -0.26 -0.52 -0.28 -1.47 -0.62 -0.39 -0.53 -0.2 -0.69 -0.21 -0.45 -0.74 0.0 -0.96 -0.48 -0.32 -0.28 -0.19 -0.25 -0.21 -0.01 -0.17
0.51 0.26 0.56 -2.92 0.72 0.71 0.74 0.25 0.49 -0.04 -0.3 0.61 -0.44 1.48 0.18 0.14 0.14 0.12 0.76 0.19 0.23 0.88 -0.49 0.46 -1.0 -0.77 -0.83 -0.53 -0.06 -0.58 -0.01 0.0 0.48 0.63 0.48 -1.14 -0.85 -0.66 -0.84 -0.75 -0.72 -0.6 -0.42 -1.01 -0.33 -0.98 -0.45 -0.14 -0.31 -0.32 -0.42 -0.4 -0.41 -0.72
0.4 1.25 1.44 -2.62 0.81 0.75 0.64 0.38 0.49 0.32 0.75 0.48 -0.64 0.43 -0.06 -0.13 -0.02 0.0 0.56 -0.04 -0.13 1.12 -0.63 -0.26 -0.48 -1.14 -0.43 -0.5 -0.46 -0.44 0.49 0.48 -0.11 -0.35 -0.16 -0.25 -1.14 -0.84 -1.29 -0.15 -0.45 -0.39 -0.68 -0.27 -0.47 -0.41 -0.43 -0.47 0.28 -0.35 -0.89 -1.4 -1.09 -0.7
0.98 1.07 -0.36 -5.7 0.66 0.7 1.24 0.52 0.61 1.08 1.52 0.39 -0.66 0.08 0.64 0.6 0.62 0.53 0.75 -0.2 -0.06 0.06 -0.27 -0.64 -2.12 -0.48 -0.62 -0.23 -0.3 -0.19 -1.85 0.31 -0.21 -0.56 -0.36 -2.54 -0.49 -0.58 -0.4 -0.14 -2.18 -0.19 -0.19 -1.92 -0.3 -2.4 -0.01 -0.09 -0.11 -0.24 -0.21 -0.72 -0.99 -1.29
0.74 0.4 0.25 -4.06 0.66 0.59 1.25 0.77 0.3 0.93 1.41 0.01 -1.07 -0.02 -0.03 -0.3 -0.06 -0.14 0.1 -0.28 -0.44 0.31 -0.8 0.24 -0.64 -0.53 -0.32 -0.6 -0.76 -0.53 -0.16 1.2 0.45 -0.26 0.58 -0.84 -0.49 -0.57 -0.56 -0.04 -0.09 -0.05 -0.62 -0.51 -0.55 -0.13 -0.32 -0.72 -0.22 -0.73 -0.82 -0.67 -0.46 -0.28
0.85 0.99 -1.18 -3.34 0.57 0.68 0.93 -0.18 0.34 0.08 -0.01 0.38 -1.23 0.83 0.62 0.62 0.74 0.64 1.13 -0.42 -0.14 0.87 -0.14 -0.25 -1.16 -0.51 -1.18 -0.2 0.15 -0.32 -0.08 -0.32 0.09 -0.25 -0.0 -1.2 -0.25 -0.2 -0.36 -0.69 -1.18 -0.32 -0.01 -0.83 -0.11 -1.58 0.03 0.22 -0.53 -0.32 -0.21 -0.22 -0.54 -0.86
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0.55 0.53 0.78 -4.79 0.37 0.67 0.6 0.44 0.43 0.22 0.03 0.38 -1.08 0.32 0.71 0.67 0.65 0.66 0.52 0.34 0.25 0.15 -0.43 -0.38 -0.19 -0.87 -1.04 -0.5 -0.68 -0.5 0.5 -0.16 0.14 -0.44 0.07 -0.8 -0.86 -0.95 -0.8 -0.81 0.01 -0.39 -0.49 -0.3 -0.76 0.0 -0.36 -0.36 -0.33 -0.27 -0.35 0.13 0.23 0.15
0.43 0.47 -2.78 -5.29 0.15 0.73 0.74 0.8 0.35 1.26 0.94 0.56 -0.2 -0.53 0.63 0.71 0.79 0.64 0.29 -0.37 -0.12 0.35 0.05 -0.0 -1.61 -1.12 -0.04 -0.04 -0.09 0.2 -1.03 -0.06 0.13 -0.23 0.11 -2.06 -0.97 -1.04 -0.9 0.53 -1.28 0.1 -0.21 -1.58 0.3 -1.63 -0.1 -0.06 0.22 -0.17 -0.42 -0.48 -0.64 -0.34
0.67 0.54 -1.65 -6.5 0.86 0.58 1.03 0.69 0.84 0.58 0.61 0.59 -0.11 -0.12 0.87 0.89 0.92 0.97 0.76 0.27 0.37 0.82 -0.26 0.04 -1.26 -0.79 -1.3 -0.39 -0.31 -0.44 -0.98 -0.96 -0.07 -0.09 -0.18 -2.0 -0.79 -0.7 -0.76 -0.72 -1.58 -0.83 -0.44 -1.49 -0.81 -1.55 -0.45 -0.33 -0.03 0.02 -0.03 -0.2 -0.2 -0.29
0.68 0.58 -1.65 -4.58 0.46 0.69 0.88 0.33 0.73 0.1 0.04 0.84 -0.84 0.74 0.15 0.2 0.34 0.23 0.61 0.3 0.23 1.33 -0.63 0.58 -1.58 -0.35 -0.89 -0.39 0.47 -0.49 -1.89 -0.53 0.61 0.73 1.04 -2.17 -0.46 0.03 -0.5 -0.29 -0.72 -0.44 -0.19 -1.16 -0.08 -0.97 -0.29 -0.01 -0.84 -0.6 -0.38 -1.02 -1.26 -1.64

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.