Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.52 0.93 1.49 -3.07 0.3 0.28 0.3 -0.13 -0.24 -0.53 -0.32 -0.06 -0.62 0.21 -0.43 -0.54 -0.42 -0.43 -0.28 -0.12 -0.39 -0.05 -0.25 0.22 0.31 -0.74 -0.24 -0.37 -0.31 -0.52 1.0 -0.23 0.47 0.54 0.46 -0.63 -0.58 -0.48 -0.73 -0.49 0.69 -0.23 -0.41 0.47 -0.26 0.85 -0.2 -0.25 -0.6 -0.55 -0.24 0.11 0.11 -0.09
0.7 0.59 0.83 -4.38 -0.2 0.55 1.06 -0.43 0.11 -0.48 -0.34 -0.19 -0.86 0.19 0.23 0.2 0.21 0.24 0.39 -0.49 -0.27 0.13 -0.14 -0.31 -0.69 0.44 -0.75 -0.47 -0.28 -0.53 0.11 -0.68 0.19 0.1 -0.05 1.16 0.14 0.54 0.34 -0.25 -0.03 -0.45 -0.28 -0.09 -0.0 -0.13 -0.43 -0.01 -0.45 -0.24 -0.1 -0.32 -0.44 -0.62
0.3 0.29 1.11 -2.59 -0.0 0.38 0.78 -0.55 -0.1 -0.79 -0.59 -0.24 -0.76 0.35 -0.44 -0.39 -0.43 -0.44 -0.31 -0.41 -0.18 0.91 -0.32 -0.52 0.29 -0.15 -0.12 -0.47 -0.16 -0.5 0.62 -0.36 0.06 0.02 -0.14 0.33 -0.39 0.07 -0.21 -0.01 0.94 -0.06 -0.32 0.87 0.31 0.84 -0.33 -0.02 -0.45 -0.38 -0.38 -0.53 -0.08 0.05
0.73 0.49 -1.21 -5.29 -0.85 0.36 0.7 0.5 0.34 0.29 0.29 0.63 -2.06 -0.41 -0.59 -0.37 -0.43 -0.51 -0.5 -0.19 -0.59 0.14 -0.76 0.58 0.82 -1.16 -0.97 -0.42 -0.78 -0.63 1.48 -0.59 0.8 0.4 0.66 -0.58 -0.79 -1.32 -0.97 -0.82 1.7 -0.38 -0.57 1.08 -0.77 1.46 -0.38 -0.66 -0.85 -0.58 -0.47 -0.57 -0.53 -0.61
0.69 0.75 0.18 -4.42 -0.52 0.38 0.4 -0.18 -0.44 -0.52 -0.79 -0.37 -1.53 0.44 -0.04 -0.39 -0.1 -0.05 0.05 -0.48 -0.46 0.58 -0.03 0.25 0.05 -0.38 -0.15 -0.12 -0.05 -0.16 0.86 0.09 0.93 0.62 0.71 -0.91 -0.48 -0.41 -0.57 -0.03 0.23 -0.01 -0.11 0.28 0.19 -0.01 0.02 0.11 0.04 -0.0 0.02 -0.27 -0.34 -0.4
0.04 -0.3 -1.25 -4.84 -1.6 0.12 0.26 -0.25 0.34 0.02 -0.01 0.33 -0.17 -0.35 -0.86 -0.84 -0.95 -0.91 -0.75 -0.28 -0.38 0.14 -0.58 0.7 0.47 -0.37 -0.61 -0.75 -0.65 -0.77 1.97 0.69 0.93 1.03 0.75 -0.0 -0.59 -0.56 -0.46 -0.52 1.36 -0.56 -0.64 1.01 -0.2 1.21 -0.76 -0.42 -0.0 -1.25 -2.49 -2.19 -0.26 0.72
0.54 0.33 0.11 -4.68 0.04 0.5 0.88 -0.68 -0.16 -0.93 -0.6 -0.05 -1.12 0.03 -0.23 -0.28 -0.24 -0.29 0.23 -0.28 -0.25 0.39 -0.39 -0.7 -0.01 0.29 -0.04 -0.44 -0.08 -0.49 0.09 -0.67 -0.22 -0.4 -0.25 0.25 0.5 0.52 0.5 0.06 1.02 0.14 -0.21 0.74 0.42 0.62 -0.21 -0.08 -0.32 -0.35 -0.25 -0.39 0.17 -0.04
0.51 0.59 1.27 -4.66 0.25 0.36 0.3 -0.6 -0.44 -1.0 -0.93 -0.29 -1.03 0.17 -0.44 -0.2 -0.28 -0.35 -0.19 -0.72 -0.64 -0.39 -0.24 0.44 -0.3 -0.09 -0.04 -0.46 0.2 -0.5 0.85 0.32 0.81 0.7 0.74 0.45 -0.15 0.4 -0.14 -0.05 0.16 -0.09 -0.14 0.12 0.24 -0.03 -0.29 -0.04 -0.03 -0.07 -0.18 -0.56 -0.46 -0.61
0.43 0.55 1.44 -4.19 0.21 0.46 0.88 -0.62 -0.31 -0.94 -0.64 -0.33 -0.99 0.18 -0.24 -0.22 -0.35 -0.26 0.13 -0.7 -0.54 0.26 -0.39 -0.19 0.14 0.08 -0.22 -0.59 -0.28 -0.7 0.48 -0.19 0.24 0.21 0.04 0.99 -0.28 0.02 -0.18 -0.21 0.88 -0.3 -0.42 0.71 0.23 0.68 -0.5 -0.11 -0.4 -0.23 -0.4 -0.68 -0.25 -0.26
0.37 0.42 -0.16 -2.52 0.28 0.44 0.61 -0.37 0.13 -0.03 0.08 0.15 -0.99 -0.08 -0.11 -0.26 -0.05 -0.13 0.3 -0.36 -0.47 -0.06 -0.23 -0.41 0.08 -0.04 -0.49 -0.38 -0.06 -0.53 0.44 -0.39 0.06 0.42 -0.15 0.28 0.0 0.34 0.02 -0.06 0.88 -0.05 -0.14 0.62 0.33 0.62 -0.26 0.09 -0.57 -0.41 -0.36 -0.39 -0.06 -0.14
0.66 0.42 1.25 -2.25 0.19 0.63 0.52 -0.69 -0.0 -1.21 -0.63 -0.28 -0.64 0.44 -0.22 -0.16 -0.07 -0.07 0.03 -0.37 -0.21 0.1 -0.2 -0.56 -0.4 0.11 0.13 -0.39 -0.02 -0.29 0.58 -0.38 -0.07 -0.15 -0.19 0.19 0.03 0.24 0.12 0.01 0.29 0.03 -0.07 0.24 0.3 0.32 -0.23 -0.04 0.05 0.05 -0.02 -0.44 -0.37 -0.45
0.34 0.91 1.6 -3.74 -0.5 0.44 0.43 -0.56 -0.3 -0.67 -0.57 -0.65 -0.91 -0.2 -0.17 -0.24 -0.29 -0.25 0.21 -0.39 -0.26 -0.43 -0.03 -0.07 -0.28 0.15 -0.31 0.08 -0.06 -0.08 -0.12 -0.7 0.29 -0.1 0.2 -0.05 0.21 0.38 0.23 0.05 0.16 0.0 0.03 0.09 0.12 0.14 0.01 0.11 -0.03 0.06 0.29 0.03 -0.11 -0.25
0.26 0.89 1.08 -3.98 0.45 0.26 0.34 -0.13 -0.21 -0.23 -0.5 -0.03 -0.91 0.11 -0.24 -0.11 -0.12 -0.29 0.05 -0.43 -0.35 0.36 -0.36 0.15 0.03 -0.13 -0.16 -0.4 -0.23 -0.43 0.88 -0.08 0.68 0.4 0.33 -0.06 -0.15 0.05 -0.27 -0.07 0.52 -0.08 -0.33 0.28 0.07 0.27 -0.2 -0.21 -0.48 -0.42 -0.32 -0.5 -0.22 -0.5
0.07 0.34 1.43 -3.43 -1.43 0.84 0.92 -0.97 -0.3 -1.31 -1.32 -0.76 -0.75 0.82 -0.18 -0.29 0.15 -0.12 -0.15 -1.06 -0.71 0.96 -0.08 -0.7 -0.97 0.39 -0.61 -0.64 -0.33 -0.48 1.52 0.03 0.61 0.19 0.22 0.35 -0.05 0.13 0.11 0.21 -0.27 -0.07 0.01 0.06 0.3 -0.43 0.05 0.35 -0.3 -0.17 -0.08 -0.68 -0.7 -0.72
0.6 0.65 1.09 -3.58 -0.45 0.59 0.48 -0.44 0.28 -0.63 -0.28 0.23 -0.63 0.67 0.11 0.09 0.11 0.06 0.36 -0.14 0.02 0.03 -0.24 -0.52 -0.21 -0.28 -0.4 -0.29 -0.43 -0.35 0.15 -0.5 0.16 -0.1 -0.0 -0.09 -0.14 -0.3 -0.21 -0.05 0.64 -0.04 -0.21 0.33 -0.06 0.47 -0.21 -0.09 -0.19 -0.27 -0.15 -0.12 -0.15 -0.26
0.04 0.0 0.68 -4.84 -0.91 0.19 0.64 -0.48 0.94 0.2 -0.14 1.07 -0.17 -0.14 -1.13 -1.1 -1.07 -1.13 -0.66 0.3 0.41 0.43 -0.73 -1.02 0.2 -0.07 0.17 -1.06 -0.36 -1.06 0.45 1.18 -0.53 0.14 -0.56 1.45 -0.41 0.26 -0.37 -0.41 1.2 -0.18 -0.76 0.51 0.14 1.07 -0.98 -0.68 -1.15 -0.86 -0.84 -0.23 -0.17 -0.14
-0.38 0.12 0.97 -2.31 0.48 0.34 1.03 -0.3 0.92 0.3 0.27 1.2 -0.73 -0.13 -1.65 -1.55 -1.52 -1.54 -0.75 0.43 0.1 0.39 -0.5 -0.53 0.91 -0.71 0.03 -1.02 -0.55 -0.98 1.07 0.24 -0.49 -0.14 -0.49 1.03 -1.06 -0.47 -1.01 -0.4 1.26 -0.51 -1.05 0.87 -0.37 1.31 -1.04 -0.89 -1.15 -1.0 -0.88 -0.47 0.09 -0.05
0.52 0.65 0.99 -1.86 0.45 0.51 0.85 -0.13 -0.16 -0.25 -0.16 -0.11 -0.88 0.25 0.22 0.3 0.21 0.21 0.3 -0.44 -0.34 0.54 -0.44 -0.42 0.35 -0.4 -0.46 -0.54 -0.53 -0.59 0.59 -0.89 -0.15 -0.24 -0.39 0.89 -0.55 -0.46 -0.44 -0.31 0.82 -0.31 -0.66 0.61 -0.15 0.71 -0.68 -0.39 -0.65 -0.41 -0.39 -0.37 -0.17 -0.16
0.27 0.65 1.37 -4.73 0.04 0.72 0.58 -0.69 -0.05 -1.01 -0.73 -0.14 -0.72 0.29 0.09 0.07 0.06 0.04 0.22 -0.51 -0.31 0.32 -0.1 -0.62 -0.61 0.2 -0.32 -0.19 -0.17 -0.24 -0.14 -0.7 0.06 -0.1 -0.31 0.0 0.25 0.21 0.28 0.12 0.22 0.16 -0.02 0.11 0.31 -0.01 -0.09 0.21 0.03 -0.02 -0.06 -0.43 -0.19 -0.15
0.39 0.4 1.21 -3.0 -0.18 0.45 0.95 -0.22 0.24 0.23 0.17 -0.09 -1.07 0.09 -0.31 -0.27 -0.29 -0.25 -0.13 -0.53 -0.27 0.55 -0.13 -0.54 -0.03 -0.15 -0.14 -0.45 -0.18 -0.43 0.44 -0.13 -0.16 0.03 -0.14 0.26 -0.13 0.01 -0.06 -0.04 0.66 -0.01 -0.36 0.56 0.18 0.39 -0.27 -0.1 -0.7 -0.33 -0.27 -0.32 -0.16 -0.19
-0.5 -1.52 -4.76 -6.63 -0.07 0.22 0.24 0.08 0.35 0.44 0.56 -0.2 -0.7 -1.33 -0.52 -0.57 -0.64 -0.89 -0.37 -0.46 -0.51 0.68 -0.1 0.89 1.24 -0.89 -0.11 -0.42 -1.12 -0.43 1.27 0.63 0.56 -0.51 0.85 0.99 -0.75 -1.0 -0.95 -0.67 1.23 -0.28 -0.96 0.97 -1.41 1.2 -0.55 -1.46 -0.48 -0.93 -1.12 0.28 0.45 0.85
0.35 0.1 0.08 -4.99 -0.26 0.64 0.67 -0.65 0.18 -1.09 -0.66 -0.09 -0.57 0.12 -0.41 -0.37 -0.46 -0.44 -0.0 -0.53 -0.4 0.01 0.07 -0.19 0.22 0.27 -0.16 -0.18 0.04 -0.24 0.62 -0.35 0.08 -0.02 -0.08 0.11 0.08 0.7 0.22 -0.06 0.48 -0.14 -0.21 0.45 0.26 0.5 -0.25 -0.02 -0.06 0.16 0.18 -0.12 0.24 0.17
0.65 0.83 0.9 -2.36 0.06 0.43 0.48 -0.03 -0.33 -0.2 -0.4 -0.25 -0.88 0.21 0.1 0.05 0.17 0.11 0.35 0.08 -0.12 -0.04 -0.53 0.04 0.27 -0.25 -0.35 -0.53 -0.53 -0.65 0.02 -0.13 0.62 0.14 0.39 0.38 -0.29 -0.21 -0.36 -0.36 0.74 -0.11 -0.47 0.57 -0.08 0.6 -0.4 -0.43 -0.64 -0.53 -0.5 -0.38 -0.2 -0.16
0.95 1.03 1.87 -2.84 0.12 0.64 0.88 0.12 0.18 -0.22 -0.03 0.1 -0.52 0.69 -0.21 -0.02 -0.48 -0.03 0.06 0.09 -0.01 0.19 -1.04 0.05 0.0 -0.31 -1.09 -0.94 -1.16 -1.06 0.47 -0.16 0.64 0.0 0.29 0.25 -0.41 -0.01 -0.48 -1.06 0.85 -0.57 -0.69 0.6 -0.75 0.61 -0.78 -0.85 -1.06 -1.04 -1.08 -0.83 -0.63 -0.88
0.04 0.15 0.34 -1.06 0.59 0.68 0.75 -0.15 0.3 0.14 -0.63 0.28 0.02 1.0 -0.25 -0.13 -0.3 -0.2 0.51 0.14 0.14 1.34 -0.15 -1.81 -0.05 0.13 -0.37 -0.72 -0.27 -0.68 -0.77 -1.12 -1.33 -0.86 -1.33 1.36 -0.12 0.27 0.11 -0.2 0.43 -0.62 -0.56 0.44 0.19 0.48 -0.65 -0.27 -1.0 -0.39 -0.33 -0.3 -0.33 -0.38
0.56 0.62 0.71 -2.24 -0.43 0.39 0.78 -0.52 0.39 0.09 0.14 0.18 -0.91 -0.27 -0.26 -0.3 -0.37 -0.38 0.03 -0.34 -0.41 0.88 -0.43 -0.18 0.04 -0.32 -0.53 -0.72 -0.35 -0.85 1.39 0.05 0.13 0.57 -0.01 0.14 -0.28 -0.06 -0.37 -0.37 1.0 -0.21 -0.64 0.65 0.02 0.73 -0.58 -0.43 -1.02 -0.78 -0.61 -0.35 -0.23 -0.25
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0.35 0.72 1.2 -4.3 0.2 0.35 0.51 -0.06 0.34 0.08 -0.07 0.32 -0.94 0.18 -0.53 -0.52 -0.44 -0.5 0.02 -0.31 -0.35 0.24 -0.4 0.66 0.12 -0.87 -0.22 -0.5 -0.12 -0.58 1.05 0.4 0.58 0.64 0.72 -0.29 -0.88 -0.53 -0.84 -0.43 0.36 -0.4 -0.59 0.06 -0.07 0.42 -0.65 -0.38 -0.56 -0.63 -0.56 -0.25 0.14 0.21
0.76 0.6 1.38 -2.46 0.23 0.47 0.31 -0.13 0.14 -0.3 -0.33 0.3 -1.13 0.14 -0.2 -0.12 -0.28 -0.3 0.22 -0.21 -0.13 0.23 -0.64 0.41 -0.83 0.16 -0.27 -0.48 0.01 -0.58 0.86 0.46 0.69 0.66 0.93 -0.5 0.13 0.65 0.09 -0.3 -0.58 -0.17 -0.39 -0.69 -0.17 -0.85 -0.28 -0.35 -0.55 -0.34 -0.29 -0.66 -0.94 -1.32
0.2 1.13 1.59 -4.15 0.0 0.33 0.8 -0.32 0.89 0.38 0.36 0.92 -1.31 0.09 -0.57 -0.58 -0.6 -0.5 -0.13 0.36 0.1 -0.13 -0.26 -0.69 0.58 -0.84 -0.41 -0.69 -0.62 -0.81 0.39 -0.47 -0.48 -0.46 -0.52 -0.48 -0.76 -0.95 -0.96 -0.61 1.23 -0.28 -0.57 0.89 -0.33 1.02 -0.48 -0.53 -1.16 -0.68 -0.59 -0.14 0.15 0.24
0.17 0.48 0.36 -4.38 0.17 0.91 0.42 -0.01 0.1 -0.49 -0.44 0.08 -1.35 1.12 0.29 0.27 0.45 0.17 0.45 -0.25 -0.08 -0.13 -0.28 -0.31 -0.18 0.4 -0.53 -0.4 0.01 -0.12 0.14 0.01 0.22 -0.07 0.06 -0.05 0.01 0.43 0.04 -0.33 -0.22 -0.26 -0.28 0.11 0.16 -0.32 -0.17 -0.02 -0.19 -0.2 -0.22 -0.47 -0.49 -0.62
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-0.64 -0.33 0.35 -3.42 -0.36 0.35 0.34 -0.19 0.59 0.13 0.07 0.7 -0.39 -0.49 -1.27 -1.48 -1.26 -1.31 -0.88 -0.65 -0.61 0.64 -0.31 -0.24 0.6 -0.28 0.12 -0.66 0.17 -0.69 1.14 0.74 -0.14 0.56 -0.03 0.98 -0.5 0.24 -0.35 -0.18 1.09 -0.25 -0.49 0.74 0.38 1.09 -0.59 -0.21 -0.74 -0.65 -0.82 -0.34 -0.03 0.2
0.52 0.54 0.97 -3.5 0.07 0.31 0.43 -0.41 -0.25 -0.9 -0.51 -0.09 -0.86 -0.28 -0.49 -0.37 -0.41 -0.35 0.12 -0.26 -0.37 -0.18 -0.43 0.31 0.11 -0.56 -0.43 -0.43 -0.14 -0.5 1.31 0.23 0.65 0.92 0.65 0.4 -0.47 -0.08 -0.58 -0.18 0.67 -0.13 -0.14 0.39 0.12 0.54 -0.23 -0.05 -0.63 -0.63 -0.42 -0.23 -0.2 -0.39
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-0.07 -0.81 -2.98 -4.27 -0.84 0.62 0.79 0.17 0.01 -0.44 -0.28 0.04 -1.02 -0.02 -0.33 -0.29 -0.3 -0.26 -0.6 -0.19 -0.14 0.36 -0.27 0.65 0.45 -1.53 -0.55 -0.44 -0.53 -0.86 1.8 0.95 0.83 0.94 0.74 0.29 -1.55 -1.34 -1.56 -0.89 1.06 -0.59 -0.64 0.66 -0.43 1.13 -0.77 -0.23 -0.55 -0.37 -0.25 -0.1 0.15 0.27
-0.12 0.07 0.07 -5.4 -0.33 0.4 0.74 0.06 0.68 0.57 0.48 0.59 -0.23 -0.42 -0.96 -0.87 -0.78 -0.96 -0.72 -0.56 -0.52 0.51 -0.16 0.1 0.75 -0.08 -0.32 -0.91 0.16 -0.65 0.37 0.82 -0.78 0.79 -0.52 1.51 -0.64 0.66 -0.36 0.04 0.75 -0.87 -0.88 0.69 0.0 0.68 -1.1 -0.43 -1.46 -0.83 -0.61 -0.32 -0.12 -0.24
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.