Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-0.15 -0.14 -2.33 -5.3 1.1 1.15 0.35 -0.95 0.62 -0.77 -0.38 0.5 -0.4 0.0 0.57 0.6 0.4 0.51 0.67 0.38 0.59 -1.01 -0.11 -1.61 -0.26 -0.0 -0.42 -0.72 -0.86 -0.39 0.37 -0.12 -1.02 -1.6 -1.63 0.03 -0.07 -0.3 -0.09 -0.9 0.11 -0.91 -0.56 -0.11 -0.91 0.47 -0.74 -0.45 0.09 0.38 0.06 0.71 1.09 1.06
-0.88 -1.69 -2.26 -4.46 -0.13 1.2 0.89 -0.09 0.66 0.06 -0.08 0.51 -0.26 -1.11 0.24 0.07 0.15 0.1 -0.51 0.13 0.03 0.69 0.01 -1.42 0.34 -0.25 -0.49 -0.44 -0.77 -0.17 -0.25 -1.05 -1.14 -1.84 -1.03 -0.44 -0.24 -0.54 -0.01 -0.33 0.54 -0.37 -0.8 0.19 -0.5 0.85 -0.78 -0.69 0.16 0.15 0.17 1.06 1.46 1.54
0.13 0.32 0.49 -5.28 1.25 0.96 0.55 -0.02 0.46 -0.23 -0.12 0.4 -0.48 0.27 0.18 0.25 0.44 0.31 1.29 0.17 0.19 0.68 -0.59 -0.79 -0.4 -0.02 -0.33 -0.54 -0.5 -0.53 -0.4 -0.96 -0.32 -0.79 -0.56 0.03 -0.01 0.15 0.04 -0.33 -0.02 -0.12 -0.51 -0.27 -0.27 -0.07 -0.42 -0.51 -0.42 -0.35 -0.29 -0.31 -0.07 -0.16
-0.44 -0.53 -1.28 -5.02 0.43 0.9 0.41 -0.4 0.34 -0.37 -0.52 0.15 -0.12 -1.31 0.4 0.25 0.39 0.37 -0.5 0.29 0.16 -0.08 -0.19 -0.16 -0.13 1.24 -0.15 -0.49 -0.86 -0.61 -0.34 -1.21 -0.81 -0.86 -0.74 0.67 0.78 0.77 1.14 -0.33 0.22 -0.13 -0.69 -0.06 -0.17 0.25 -0.75 -0.56 -0.34 -0.28 -0.56 -0.16 0.62 1.0
-3.63 - -0.32 0.23 -6.07 2.7 -1.21 - 0.22 -1.61 -0.83 -1.42 -3.53 -5.02 - - -1.43 - -1.81 -2.75 - - 0.74 -0.75 0.18 -2.46 -2.26 0.13 -1.66 -1.84 0.36 2.62 0.39 0.23 0.94 -0.33 -4.82 -4.72 - -4.61 -1.66 -2.73 -2.51 -0.93 -2.61 -4.52 -2.34 -1.47 0.66 0.95 -0.39 2.84 2.71 1.82
-0.14 -0.66 -1.76 -3.96 0.08 0.81 0.77 -0.77 -0.3 -1.28 -1.08 -0.44 -0.56 -0.45 0.45 0.4 0.61 0.45 0.19 -0.29 -0.03 0.01 -0.12 -0.77 -0.35 0.59 0.04 -0.46 -0.65 -0.21 -0.21 -0.42 -0.66 -1.34 -0.86 0.3 0.38 0.25 0.66 0.08 0.12 -0.12 -0.56 -0.26 0.19 0.02 -0.54 -0.26 0.22 0.07 -0.02 0.68 1.27 1.38
-0.8 -1.3 -0.87 -5.16 0.46 1.18 0.56 -0.14 0.17 0.05 0.07 0.06 0.25 -0.16 0.66 0.5 0.68 0.53 0.07 0.37 0.42 0.09 -0.22 -0.93 -0.45 0.19 -0.19 -0.59 -0.89 -0.2 -0.01 -0.62 -0.66 -1.69 -0.72 0.03 0.0 0.05 0.27 -0.21 -0.02 0.03 -0.78 -0.41 -0.24 -0.1 -0.67 -0.79 0.51 0.2 -0.37 0.17 0.78 1.18
-0.28 -0.11 -0.49 -5.17 0.92 0.99 0.06 -0.21 0.46 -0.32 -0.3 0.33 -0.17 0.09 0.76 0.44 0.74 0.72 0.7 0.24 0.37 0.02 -0.4 -0.27 -0.1 -0.32 -0.25 -0.7 -0.44 -0.5 0.16 -0.14 -0.24 -0.44 -0.21 -0.29 -0.5 0.2 -0.24 -0.24 0.37 -0.3 -0.58 -0.13 -0.06 0.49 -0.64 -0.38 0.15 -0.18 -0.37 -0.39 -0.1 0.06
0.08 -0.12 -0.59 -4.9 0.75 0.9 0.53 -0.18 0.68 0.16 -0.02 0.78 -0.52 0.04 0.34 0.32 0.41 0.24 0.24 -0.09 -0.05 -0.11 -0.31 -0.61 -0.39 0.01 -0.05 -0.61 -0.24 -0.43 -0.12 0.37 -0.55 -0.37 -0.56 0.48 -0.22 0.05 -0.02 -0.14 0.23 -0.24 -0.44 -0.09 0.21 0.14 -0.56 -0.31 -0.09 -0.02 -0.25 -0.02 0.03 0.09
0.33 0.18 -0.2 -4.41 1.37 0.99 0.62 -0.22 0.14 -0.38 -0.2 -0.08 -0.47 0.15 0.52 0.68 0.42 0.51 1.24 -0.15 0.05 0.44 -0.55 -0.96 -0.33 -0.03 -0.34 -0.47 -0.37 -0.53 -0.42 -0.74 -0.26 -0.79 -0.44 -0.1 -0.02 0.11 0.04 -0.42 0.11 -0.06 -0.35 -0.24 -0.17 -0.01 -0.3 -0.39 -0.4 -0.4 -0.31 -0.03 0.14 0.02
-0.23 0.05 -0.39 -4.52 0.92 1.02 0.41 -0.66 0.47 -0.34 -0.23 0.41 -0.35 -0.69 0.32 0.23 0.26 0.25 0.69 0.16 0.11 -0.21 -0.24 -0.5 0.04 -0.08 -0.19 -0.54 -0.35 -0.43 0.63 -0.38 -0.3 -0.78 -0.5 0.31 -0.09 -0.2 -0.07 -0.27 0.32 -0.16 -0.47 0.09 -0.05 0.47 -0.49 -0.39 0.24 0.01 -0.28 0.0 0.29 0.41
-0.46 -0.64 -2.27 -4.44 0.63 0.85 -0.14 -0.31 0.12 -0.13 -0.33 0.32 0.24 0.01 0.48 0.69 0.3 0.29 -0.29 0.29 0.14 -0.21 -0.2 -0.43 -0.85 0.5 0.18 -0.66 -0.71 -0.15 -0.87 -0.76 -0.48 -1.09 -0.23 -0.44 0.44 0.06 0.55 0.22 -0.22 0.08 -0.75 -1.0 0.27 -0.02 -0.56 -0.41 0.48 0.37 0.13 0.54 0.92 1.03
-0.41 -0.76 -1.22 -2.27 1.72 1.25 -0.0 -0.18 0.41 -0.05 0.01 0.56 -0.67 -0.22 0.1 0.31 0.24 0.22 0.6 0.48 0.52 -0.07 -0.47 -1.13 0.03 0.31 -0.77 -0.38 -0.55 -0.52 -0.27 -0.76 -0.71 -0.79 -0.79 -0.4 0.42 0.38 0.27 -0.54 0.48 -0.24 -0.45 -0.07 -0.61 0.16 -0.14 -0.37 -0.26 -0.23 -0.37 -0.15 0.47 0.54
-0.24 -0.66 -1.66 -4.59 1.22 1.01 0.33 -0.35 0.23 -0.48 -0.15 0.3 -0.02 0.15 0.81 0.74 0.77 0.59 0.08 0.52 0.74 -0.17 -0.29 -1.04 -0.24 -0.85 -0.28 -0.57 -0.9 -0.37 0.86 -0.44 -0.34 -1.75 -0.63 -0.88 -0.9 -1.14 -0.8 -0.44 0.26 -0.35 -0.49 -0.09 -0.43 0.23 -0.42 -0.37 0.42 -0.36 -0.73 0.32 0.95 1.23
0.42 0.31 0.55 -5.29 0.94 1.05 0.16 0.47 0.24 0.19 0.24 -0.03 -0.24 -0.62 0.28 0.3 0.2 0.31 -0.05 0.16 0.2 0.08 -0.52 -0.43 0.06 -0.31 -0.55 -0.64 -0.43 -0.46 0.01 -0.31 -0.25 -0.38 -0.13 0.02 -0.67 -0.16 -0.44 -0.38 0.35 -0.49 -0.55 0.14 -0.27 0.44 -0.47 -0.33 0.29 0.21 -0.45 -0.13 0.11 0.38
0.0 0.47 -0.37 -4.06 1.5 1.24 0.01 0.16 0.08 0.28 0.01 0.23 -0.72 -0.36 0.41 0.75 0.36 0.49 0.94 0.23 0.32 -0.1 -0.24 -0.45 0.17 -1.0 -0.68 -0.3 -0.45 -0.1 0.16 -0.37 -0.08 -0.37 0.1 -0.17 -1.19 -1.18 -1.02 -0.53 -0.15 -0.65 -0.13 -0.09 -0.58 0.17 -0.19 -0.06 -0.01 0.14 -0.11 -0.26 -0.12 -0.1
0.0 -0.41 -1.55 -5.22 0.38 0.91 0.45 0.13 0.65 -0.0 0.24 0.73 -0.34 -0.3 0.36 0.47 0.25 0.27 0.4 -0.21 0.01 0.18 -0.04 -0.56 -1.03 -0.39 0.76 -0.14 -0.22 0.18 -0.08 0.31 -0.46 -0.32 -0.34 -0.05 -0.41 -0.3 -0.3 0.6 -0.76 0.29 -0.08 -0.82 0.69 -0.54 -0.05 0.0 0.14 -0.17 -0.29 -0.36 -0.13 -0.08
-0.51 -0.45 -0.87 -3.71 1.02 0.98 -0.04 -0.68 0.42 -0.09 -0.11 0.27 -0.37 -0.92 0.24 0.2 0.36 0.25 0.18 0.51 0.57 -0.93 -0.4 -0.99 -0.35 0.11 0.27 -0.47 -1.19 -0.24 0.16 -0.31 -0.81 -1.67 -0.89 0.77 -0.09 -0.6 0.14 0.13 0.53 0.1 -0.67 -0.05 -0.03 0.7 -0.47 -0.62 0.2 -0.0 -0.09 0.37 0.83 0.88
0.37 0.05 -1.06 -4.92 0.93 0.75 0.35 -0.29 0.34 -0.42 -0.07 0.2 -0.07 -0.54 0.11 0.17 0.2 0.17 0.39 0.38 0.23 -0.02 -0.32 -0.47 -0.34 0.15 0.02 -0.41 -0.43 -0.37 0.07 -0.18 -0.22 -0.67 -0.27 0.26 0.03 0.18 0.16 0.02 0.31 0.0 -0.39 -0.11 0.16 0.34 -0.41 -0.28 0.18 -0.42 -0.5 -0.19 0.33 0.51
0.29 0.75 0.09 -3.54 0.59 0.96 0.29 0.32 0.53 -0.06 0.19 0.27 -0.81 -0.19 -0.17 -0.32 -0.05 -0.41 0.71 0.71 0.53 0.29 -0.35 -0.18 0.4 -0.12 -0.06 -0.2 -0.4 -0.43 -0.45 -0.86 -0.32 -0.58 -0.43 -0.41 -0.04 -0.09 -0.18 -0.47 0.59 -0.08 -0.54 0.32 -0.37 0.6 -0.46 -0.65 -0.74 -0.58 -0.21 -0.11 0.29 0.25
-0.43 -0.58 -2.09 -4.68 0.83 0.49 0.57 -0.52 0.37 -0.41 -0.25 0.31 0.26 0.24 0.02 0.16 0.2 0.13 0.24 0.83 0.51 -0.05 -0.05 -0.78 0.02 0.41 -0.21 -0.48 -1.03 -0.32 -0.83 -0.99 -0.67 -1.19 -0.51 0.52 0.13 0.02 0.12 -0.28 0.63 -0.22 -0.39 0.17 -0.31 0.79 -0.17 -0.33 0.14 0.1 0.05 0.01 0.47 0.64
-0.19 -1.12 -2.02 -3.97 0.58 1.15 0.89 -0.2 0.65 -0.28 -0.12 0.74 -0.25 -0.38 -0.24 -0.53 -0.26 -0.35 0.1 0.33 0.12 0.31 -0.39 0.31 0.36 -0.38 -0.31 -0.41 -0.71 -0.58 -0.39 -0.56 0.14 -0.42 0.16 -1.19 -0.56 -0.59 -0.5 -0.46 1.21 -0.24 -0.64 0.43 -0.42 0.94 -0.52 -0.67 -0.2 -0.21 -0.35 0.19 0.91 1.2
-0.07 0.21 0.56 -4.8 0.87 1.17 0.58 -0.26 0.46 -0.34 -0.25 0.24 -0.29 -0.09 0.76 0.74 0.69 0.67 0.62 0.01 0.19 -0.1 -0.23 -1.57 -0.27 -0.23 -0.25 -0.5 -0.4 -0.33 -0.08 -0.45 -0.87 -1.32 -1.02 -0.58 -0.44 -0.18 -0.14 -0.07 -0.05 -0.2 -0.34 -0.23 0.14 -0.02 -0.46 -0.13 0.14 0.04 -0.2 0.07 0.2 0.27
0.13 -0.16 -1.74 -4.72 0.91 1.23 0.55 -0.62 0.66 -0.76 -0.31 0.34 0.19 0.29 0.5 0.44 0.51 0.5 0.77 0.42 0.64 -0.19 -0.23 -0.64 -0.15 -0.48 -0.69 -0.65 -0.98 -0.52 -0.01 -0.39 -0.23 -1.45 -0.69 -0.81 -0.48 -0.79 -0.52 -0.86 0.32 -0.69 -0.74 -0.24 -0.76 0.23 -0.74 -0.66 0.01 -0.01 -0.11 0.88 1.17 1.02
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-0.52 -0.49 -0.46 -4.18 1.51 0.97 0.21 -0.91 0.04 -0.76 -0.35 0.08 -0.41 -0.45 0.38 0.34 0.46 0.3 0.93 -0.1 0.12 0.09 -0.41 -1.29 -0.62 0.55 -0.1 -0.48 -0.41 -0.32 -0.78 -0.78 -0.72 -1.29 -0.9 0.61 0.57 0.78 0.72 0.03 0.06 0.05 -0.31 -0.22 0.16 0.02 -0.31 -0.16 0.03 -0.29 -0.57 -0.06 0.3 0.41
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-0.08 -0.03 -1.35 -6.34 0.08 0.78 0.49 -0.45 0.12 -0.47 -0.33 -0.14 -0.08 -0.21 0.41 0.46 0.43 0.33 0.24 -0.38 -0.19 0.43 0.23 -0.47 -1.59 0.12 0.73 -0.17 -0.19 -0.08 -0.36 -0.18 -0.18 -0.66 -0.42 0.31 -0.01 0.29 0.45 0.59 -1.45 0.4 -0.02 -1.46 1.09 -1.51 -0.18 0.23 0.59 0.01 -0.26 -0.64 0.17 0.42
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-0.07 0.11 -0.82 -4.68 -0.0 0.79 0.33 -0.29 0.63 -0.26 -0.08 0.55 -0.27 -0.78 -0.01 -0.11 0.06 -0.0 0.49 0.22 0.32 -0.48 0.01 -1.69 0.22 0.39 -0.73 -0.09 -0.31 -0.21 -0.87 -1.37 -1.26 -1.66 -1.46 0.42 0.19 0.36 0.22 -0.47 0.82 -0.18 -0.14 0.48 -0.43 0.45 -0.17 -0.23 -0.43 0.14 0.19 0.53 0.98 0.98
0.22 0.21 -0.01 -3.7 0.26 0.46 0.02 0.08 0.45 0.15 0.15 0.51 -0.47 -0.59 -0.25 -0.22 -0.29 -0.27 0.23 -0.03 0.05 0.21 -0.16 -0.7 -0.12 0.18 -0.0 -0.17 -0.02 -0.1 -0.55 -0.53 -0.26 -0.36 -0.23 0.24 0.09 0.38 0.21 0.17 0.01 0.09 -0.08 0.08 0.42 0.01 -0.05 0.08 -0.17 -0.04 -0.06 0.17 0.31 0.28
0.27 -0.17 -0.3 -4.6 0.51 1.06 0.37 -0.33 0.32 -0.13 -0.24 0.32 -0.41 -0.15 0.74 0.56 0.59 0.66 0.56 -0.33 -0.13 -0.28 -0.48 -0.87 0.09 -0.15 -0.65 -0.66 -0.31 -0.35 -0.8 -1.04 -0.79 -0.73 -0.77 -0.51 -0.14 -0.21 0.02 -0.07 0.81 -0.48 -0.51 0.46 0.08 0.68 -0.49 -0.3 0.31 -0.02 -0.61 0.0 0.55 0.9
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.