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Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.53 0.84 1.81 -1.98 0.5 0.64 0.67 -0.36 0.07 -0.93 -0.42 0.06 -0.62 -0.03 0.13 0.23 0.25 0.16 0.55 -0.21 -0.12 0.53 -0.3 -0.87 -0.29 0.29 -0.12 -0.53 -0.23 -0.5 -0.49 -0.78 -0.69 -0.5 -0.93 0.76 0.01 0.36 0.03 -0.32 -0.01 -0.34 -0.53 0.06 0.27 -0.21 -0.56 -0.28 -0.36 -0.33 -0.33 -0.44 -0.14 -0.33
0.63 0.56 0.62 -3.45 0.35 0.75 0.79 -0.06 0.24 -0.19 -0.16 -0.05 -0.68 -0.32 0.2 0.15 0.19 0.1 0.49 -0.24 -0.17 0.49 -0.02 -0.79 -0.64 0.16 -0.02 -0.02 0.35 0.14 -1.12 -1.11 -0.6 -0.44 -0.38 -0.32 0.19 0.28 0.21 0.15 -0.38 0.0 0.05 -0.24 0.42 -0.52 0.01 0.22 -0.04 0.09 -0.02 -0.3 -0.41 -0.51
0.75 0.97 0.26 -3.76 0.42 0.77 0.73 0.07 0.51 -0.19 0.05 0.31 -0.74 -0.08 0.23 0.25 0.14 0.2 0.61 0.02 0.19 0.97 -0.43 -1.15 -0.5 0.27 -0.42 -0.3 -0.14 -0.31 -0.83 -1.26 -0.39 -0.81 -0.59 -0.44 0.31 0.47 0.34 -0.11 0.08 -0.14 -0.22 -0.11 -0.04 -0.29 -0.1 -0.04 -0.7 -0.34 -0.27 -0.2 -0.22 -0.6
0.56 0.72 -0.41 -4.34 0.37 1.11 0.74 0.02 0.49 -0.08 -0.23 0.79 -0.77 -0.12 0.42 0.1 0.44 0.54 -0.46 0.21 0.12 0.34 -0.27 -1.72 0.22 0.27 -1.18 -0.62 -0.14 -0.56 -0.16 -1.03 -1.23 -1.26 -1.48 0.45 0.05 0.26 0.24 -0.74 0.69 -0.8 -0.51 0.56 -0.49 0.33 -0.63 -0.15 -0.66 0.16 0.11 0.28 -0.08 0.05
0.61 0.54 0.12 -4.27 0.24 0.68 0.94 0.11 0.48 -0.24 0.02 0.46 -0.05 0.27 -0.06 -0.02 0.05 -0.08 0.21 -0.06 0.22 0.55 -0.01 -0.56 -0.11 -0.22 0.0 -0.11 0.09 -0.04 -0.08 -0.82 -0.35 -0.7 -0.49 -0.2 -0.28 -0.04 -0.22 -0.0 -0.23 -0.1 -0.22 -0.19 0.2 -0.33 -0.16 0.06 0.07 0.13 -0.12 -0.28 -0.19 -0.23
0.44 0.03 -0.03 -4.33 0.49 1.0 0.7 -0.11 -0.19 -0.93 -0.59 0.06 -0.88 -0.1 0.22 0.03 0.41 0.28 0.56 0.18 0.07 0.07 -0.08 -0.89 -0.18 0.13 -0.43 -0.24 -0.21 -0.23 0.14 -0.45 -0.26 -0.81 -0.4 -0.28 -0.05 0.31 0.15 -0.16 0.16 -0.28 -0.17 0.0 0.13 -0.04 -0.27 0.14 0.1 0.26 0.2 0.2 0.3 0.24
0.12 0.47 0.56 -5.11 0.11 0.81 0.51 -0.06 0.37 0.1 0.08 0.54 -0.95 -0.33 0.17 -0.11 0.16 0.12 0.54 0.13 0.08 0.31 -0.33 -1.2 -0.18 0.31 -0.3 -0.36 -0.3 -0.3 -0.57 -1.13 -0.79 -1.05 -0.77 -0.13 0.5 0.48 0.52 -0.03 0.03 -0.03 -0.32 0.04 0.04 0.05 -0.22 -0.21 -0.18 -0.2 -0.3 0.16 0.38 0.52
0.38 0.76 0.66 -4.34 0.29 0.7 0.76 -0.01 0.4 -0.37 -0.24 0.29 -0.46 0.26 -0.01 0.08 0.15 0.1 0.54 0.04 0.31 0.67 -0.22 -1.07 -0.04 0.35 -0.42 -0.45 -0.29 -0.53 0.08 -1.16 -0.75 -0.99 -0.76 -0.08 0.13 0.5 0.27 -0.25 0.26 -0.24 -0.33 0.11 -0.01 0.02 -0.35 -0.14 -0.36 -0.2 -0.2 -0.04 -0.07 -0.17
0.47 0.5 0.74 -5.01 0.47 0.91 0.73 0.17 0.55 -0.29 -0.02 0.4 -0.44 -0.09 0.19 0.12 0.34 0.21 0.19 0.08 0.27 0.75 -0.32 -0.75 0.01 -0.48 -0.47 -0.37 -0.31 -0.42 -0.18 -0.47 -0.32 -0.56 -0.42 -0.18 -0.57 -0.34 -0.58 -0.4 0.3 -0.34 -0.46 0.09 -0.19 0.21 -0.42 -0.34 -0.15 -0.19 -0.19 0.22 0.38 0.23
0.19 0.1 -1.54 -3.84 0.91 0.69 0.6 0.41 0.51 0.64 0.27 0.49 -0.66 0.08 0.41 0.37 0.3 0.31 0.07 0.17 0.2 0.84 -0.58 -1.02 -0.18 -0.12 -0.3 -0.64 -0.47 -0.52 -0.6 -0.64 -0.73 -0.98 -0.79 0.8 -0.14 0.14 0.07 -0.06 0.6 -0.09 -0.74 -0.04 -0.1 0.65 -0.59 -0.54 0.09 -0.41 -0.6 -0.25 -0.21 -0.11
0.36 -0.34 -0.47 -4.79 0.57 0.99 0.71 -0.39 0.5 -1.01 -0.6 0.41 -0.32 -0.42 0.28 0.26 0.34 0.41 0.66 0.53 0.53 0.37 -0.54 -1.29 0.41 0.21 -0.84 -1.13 -0.95 -0.81 -0.06 -1.24 -1.04 -1.59 -1.13 0.74 -0.25 0.21 -0.02 -0.92 0.82 -0.88 -1.03 0.65 -0.54 0.88 -0.95 -0.66 -0.06 -0.12 -0.44 0.25 0.8 0.98
0.73 0.42 0.15 -3.49 1.5 0.82 0.38 0.08 0.73 -0.07 -0.06 0.65 -0.4 0.03 0.32 0.2 0.33 0.13 1.05 0.57 0.21 0.42 -1.11 -0.99 -0.83 0.67 -1.6 -1.04 -0.88 -1.06 -0.46 -0.72 -0.6 -0.34 -1.01 -0.14 0.78 0.89 0.7 -1.25 0.44 -0.55 -1.06 -0.26 -0.85 -0.06 -0.87 -1.09 -1.33 -1.12 -0.76 0.05 0.15 -0.15
0.31 0.32 0.53 -4.36 0.93 0.9 0.74 -0.67 0.72 -0.87 -0.42 0.43 0.08 0.32 0.19 0.32 0.27 0.26 0.96 0.29 0.42 -0.44 -0.22 -1.34 -0.13 -0.04 -0.43 -0.69 -0.35 -0.58 0.09 -0.86 -0.81 -1.19 -1.08 0.01 -0.21 0.26 -0.11 -0.62 0.37 -0.52 -0.52 0.27 0.09 0.23 -0.76 -0.39 -0.18 -0.16 -0.06 0.06 0.36 0.07
0.11 -0.39 -0.43 -3.81 0.71 1.12 0.73 0.02 0.41 -0.11 -0.03 0.42 -0.13 0.03 0.71 0.81 0.77 0.74 0.57 0.78 0.84 0.27 -0.33 -1.91 -0.54 0.34 0.29 -0.63 -0.86 -0.44 -0.92 -0.89 -1.34 -2.35 -1.84 -0.29 -0.01 0.09 0.26 -0.1 -0.26 -0.11 -0.58 -0.64 0.02 -0.12 -0.64 -0.49 0.13 0.04 -0.27 -0.12 0.03 0.03
0.25 0.83 0.33 -1.91 0.42 1.02 0.83 -0.5 0.27 -0.46 -0.08 0.41 0.15 0.17 -0.0 0.34 -0.01 0.07 0.6 0.45 0.35 0.52 -0.28 -1.55 -0.23 0.16 0.36 -0.3 -0.35 -0.42 -0.61 -0.77 -1.25 -1.58 -1.59 0.01 0.19 -0.06 0.19 0.03 0.05 -0.09 -0.34 -0.23 0.21 0.02 -0.35 -0.25 -0.16 -0.13 -0.31 -0.16 0.17 -0.12
0.79 0.54 0.66 -4.43 0.44 0.82 0.75 0.17 0.32 0.09 -0.31 0.43 -0.16 0.57 0.04 -0.04 0.16 -0.04 0.16 0.23 0.49 0.54 -0.49 -0.78 -0.64 0.22 -0.14 -0.37 -0.05 -0.38 -0.71 0.05 -0.38 -0.4 -0.37 0.3 0.09 0.32 0.07 -0.19 -0.05 -0.2 -0.43 -0.23 -0.11 -0.26 -0.41 -0.19 -0.9 -0.76 -0.66 0.03 -0.17 -0.41
0.23 0.23 0.98 -3.55 0.04 1.05 0.49 -0.66 0.47 -0.61 -0.24 0.19 -0.07 -0.52 0.24 0.17 0.09 0.09 0.11 -0.27 0.06 -0.3 0.01 -1.25 0.01 -0.49 0.27 -0.36 -0.28 -0.23 0.25 0.58 -1.06 -0.32 -1.17 0.17 -0.41 -0.29 -0.27 -0.01 0.25 -0.25 -0.39 0.07 0.09 0.44 -0.54 -0.2 -0.33 -0.15 -0.13 0.3 0.62 0.74
0.21 0.32 0.24 -3.98 0.65 0.93 0.5 -0.27 0.12 -0.59 -0.34 0.07 -1.02 -0.11 0.3 0.22 0.3 0.28 0.75 0.15 0.12 0.2 -0.65 -0.86 0.09 0.2 -0.56 -0.68 -0.56 -0.7 0.01 -1.1 -0.42 -0.76 -0.65 -0.41 0.3 0.23 0.3 -0.42 0.97 -0.03 -0.57 0.51 -0.19 0.62 -0.5 -0.55 -0.58 -0.68 -0.43 0.14 0.79 0.53
0.49 0.57 1.82 -3.58 0.41 0.68 0.85 -0.45 0.38 -0.69 -0.33 0.21 -0.6 -0.05 0.24 0.06 0.02 0.08 0.3 -0.03 -0.11 0.39 -0.15 -1.14 -0.13 -0.07 -0.27 -0.4 -0.34 -0.48 -0.61 -1.05 -0.49 -0.84 -0.63 0.24 -0.16 0.12 -0.1 -0.27 0.46 -0.36 -0.49 0.36 0.11 0.26 -0.45 -0.28 -0.28 -0.31 -0.39 -0.07 0.15 0.08
0.15 0.63 1.31 -3.99 0.03 0.7 0.7 -0.05 0.15 -0.35 -0.34 0.14 -0.93 -0.19 0.25 0.03 0.22 0.19 0.4 -0.09 0.14 0.39 -0.15 -0.78 -0.27 0.11 -0.08 -0.37 -0.02 -0.37 -0.49 -0.49 -0.25 -0.66 -0.39 0.12 0.03 0.26 0.12 -0.01 0.19 -0.06 -0.28 0.04 0.33 -0.12 -0.28 -0.07 -0.34 -0.17 -0.15 -0.19 -0.05 -0.1
0.55 0.1 -0.57 -4.84 0.1 0.88 0.93 0.35 0.64 0.05 0.09 0.44 -0.49 0.19 0.05 0.05 0.01 -0.05 0.04 0.08 0.26 0.92 -0.21 -0.95 -0.55 -0.07 -0.01 -0.28 0.14 -0.24 -0.42 -0.1 -0.59 -0.38 -0.63 0.33 -0.14 0.17 -0.01 0.04 -0.44 0.03 -0.15 -0.39 0.43 -0.39 -0.25 0.06 0.04 0.12 -0.12 -0.43 -0.42 -0.39
0.13 0.26 -0.75 -4.36 0.79 0.75 0.55 -0.07 0.86 0.82 0.38 0.93 -0.67 -0.59 0.17 0.17 0.22 0.08 0.09 -0.03 -0.06 -0.05 -0.33 -1.32 -0.95 0.24 -0.03 -0.59 -0.29 -0.44 -0.91 -0.26 -0.96 -1.15 -0.94 1.48 0.18 0.55 0.36 0.22 -0.19 0.11 -0.44 -0.58 0.26 -0.31 -0.45 -0.35 -0.26 -0.36 -0.52 -0.23 -0.06 -0.1
0.23 0.76 1.75 -3.48 0.59 0.55 0.69 -0.41 0.02 -0.74 -0.17 -0.02 -0.52 -0.18 -0.1 -0.01 -0.1 -0.09 0.55 -0.2 0.02 0.13 -0.33 -1.22 -0.28 0.16 -0.12 -0.24 -0.25 -0.34 -0.78 -1.03 -0.62 -1.22 -0.93 0.25 0.21 0.15 0.2 -0.01 0.5 0.02 -0.23 0.15 0.19 0.26 -0.27 -0.2 -0.28 -0.25 -0.05 -0.06 0.18 0.05
0.3 -0.23 -0.96 -4.31 1.11 1.08 0.82 0.13 0.79 0.17 0.22 0.51 0.22 0.62 0.66 0.7 0.49 0.63 0.32 0.49 0.61 0.4 -0.27 -1.57 -0.97 0.11 -0.43 -0.52 -0.43 -0.32 -1.26 -1.72 -1.35 -1.42 -1.32 -0.91 0.09 0.22 0.43 -0.24 -0.39 -0.26 -0.58 -0.91 -0.24 -0.29 -0.34 -0.41 -0.06 0.17 0.05 0.02 -0.15 -0.31
0.48 0.33 0.13 -2.75 0.43 0.71 0.68 -0.41 0.1 -0.69 -0.65 0.24 -0.47 0.46 0.18 0.23 0.16 0.19 0.55 -0.13 0.13 0.15 -0.2 -0.77 -0.09 0.08 -0.02 -0.45 -0.31 -0.35 -0.07 -0.71 -0.45 -0.74 -0.55 -0.14 0.11 0.2 0.3 0.07 0.37 0.09 -0.25 0.2 0.22 0.29 -0.23 -0.19 -0.0 -0.12 -0.04 -0.0 0.09 -0.2
0.57 1.05 1.77 -3.42 0.54 0.45 0.71 -0.32 -0.25 -0.75 -0.47 -0.39 -0.87 -0.03 0.36 0.34 0.35 0.34 0.77 -0.22 0.06 0.52 -0.42 -1.02 -0.46 0.34 -0.2 -0.48 -0.34 -0.41 -0.41 -1.03 -0.43 -0.98 -0.63 -0.34 0.35 0.61 0.41 -0.0 -0.09 -0.04 -0.29 -0.23 0.3 -0.4 -0.35 -0.11 -0.58 -0.35 -0.32 -0.52 -0.4 -0.53
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0.58 1.09 1.78 -3.77 0.63 0.56 0.68 -0.08 -0.07 -0.68 -0.33 -0.14 -0.64 -0.06 0.51 0.48 0.45 0.44 0.73 0.13 0.29 0.38 -0.39 -1.4 -0.57 0.37 -0.39 -0.26 -0.51 -0.44 -1.68 -1.57 -0.68 -1.69 -0.91 -0.71 0.38 0.35 0.37 -0.13 0.0 0.02 -0.26 -0.2 -0.06 -0.27 -0.09 -0.19 -0.27 -0.39 -0.33 -0.41 -0.34 -0.51
0.89 0.6 -0.0 -3.48 0.82 1.19 1.02 0.44 0.59 0.3 0.47 0.75 -0.2 -0.27 0.25 0.24 -0.04 0.04 0.08 0.49 0.57 0.57 -0.24 -1.72 -0.26 -0.23 -0.77 -0.34 -0.19 -0.23 -1.02 -1.47 -1.33 -1.49 -1.37 -1.62 -0.35 0.08 -0.27 -0.45 0.08 -0.27 -0.23 -0.06 -0.33 -0.05 -0.29 -0.24 -0.2 -0.01 -0.13 0.12 0.18 0.0
0.31 0.06 0.55 -3.52 1.23 0.63 0.37 -0.47 -0.33 -1.17 -0.75 -0.18 -0.93 0.34 0.27 0.29 0.16 0.1 0.77 -0.44 -0.12 0.59 -0.55 -0.74 -0.26 0.21 -0.03 -0.43 -0.1 -0.52 0.31 -0.53 0.01 -0.44 -0.33 -0.28 0.16 0.58 0.25 0.04 0.4 0.11 -0.28 0.12 0.34 0.28 -0.33 -0.18 -0.35 -0.35 -0.23 -0.37 -0.04 -0.2
0.75 0.17 -0.44 -5.45 0.51 0.77 0.6 0.02 0.58 -0.12 -0.19 0.4 -0.13 0.36 0.36 0.28 0.51 0.42 0.53 0.34 0.31 0.14 -0.49 -0.89 -0.23 0.26 -0.16 -0.44 -0.51 -0.28 -1.32 -1.33 -0.7 -1.25 -0.57 -0.25 0.12 0.27 0.23 -0.32 0.21 -0.3 -0.5 -0.1 -0.23 0.38 -0.43 -0.4 0.16 -0.19 -0.24 0.15 0.33 0.18
0.23 0.0 -0.34 -4.09 0.44 1.38 0.46 -0.22 0.66 -0.36 -0.57 0.37 0.1 -0.44 0.15 0.2 0.17 0.3 0.26 0.38 0.61 0.13 0.01 -0.5 -0.36 -0.13 -0.34 -0.48 -0.21 -0.45 -0.01 -0.2 -0.31 -0.04 -0.64 -1.06 -0.28 -0.16 -0.17 -0.39 -0.64 -0.41 -0.48 -0.19 0.18 -0.66 -0.62 -0.17 -0.29 -0.13 -0.02 0.57 0.9 0.94
0.3 0.18 0.22 -3.36 0.64 0.96 0.87 -0.03 0.61 -0.29 -0.0 0.49 -0.04 0.15 0.17 0.42 0.35 0.37 0.56 0.49 0.55 0.66 -0.43 -0.78 0.51 -0.57 -0.71 -0.89 -0.59 -0.8 0.33 -0.61 -0.79 -0.89 -1.0 -0.17 -0.81 -0.51 -0.56 -1.04 0.77 -1.02 -1.02 0.63 -0.5 0.69 -0.97 -0.65 -0.52 -0.42 -0.4 0.26 0.32 0.33
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0.62 0.87 1.49 -2.85 0.56 0.72 0.49 -0.09 -0.19 -0.61 -0.53 -0.07 -0.67 -0.02 0.2 0.17 0.15 0.24 0.58 -0.15 0.01 0.47 -0.54 -0.56 -0.59 0.45 -0.25 -0.51 -0.33 -0.55 -0.33 -0.43 0.0 -0.44 -0.1 0.61 0.34 0.45 0.38 -0.19 -0.17 -0.16 -0.41 -0.26 0.01 -0.42 -0.35 -0.32 -0.4 -0.19 -0.24 -0.62 -0.53 -0.78

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.