Heatmap: Cluster_354 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 1.0 0.02 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.73 0.18 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.42 1.0 0.23 0.05 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.47 0.22 0.08 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.07 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 1.0 0.05 0.09 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.21 1.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.18 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.14 0.01 0.0 0.01 0.27 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.11 1.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.17 0.16 1.0 0.27 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.21 0.04 0.0 0.01 0.28 0.0 0.0 0.01 0.01 0.2 0.17 1.0 0.15 0.03 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.1 0.01 0.01 0.27 0.54 0.21 0.21 0.31 0.24 0.0 1.0 0.69 0.16 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.01 0.14 0.01 0.0 0.44 0.6 0.2 0.25 0.41 0.33 0.0 1.0 0.95 0.13 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.56 0.19 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.99 0.94 0.16 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.1 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.11 1.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.22 0.04 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.19 1.0 0.11 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 1.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.09 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 1.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.1 0.02 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.07 0.05 0.02 0.01 0.2 0.02 0.03 0.0 0.02 0.08 0.04 1.0 0.07 0.06 0.11 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.08 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 1.0 0.09 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.44 0.1 0.05 0.09 0.59 0.06 0.07 0.04 0.06 0.5 0.31 1.0 0.38 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 1.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.04 0.1 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.08 1.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.04 0.02 0.01 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 1.0 0.05 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.26 0.13 0.5 0.01 0.13 0.38 0.08 0.09 0.1 0.05 0.42 0.58 1.0 0.07 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.14 0.02 0.02 0.01 0.01 0.25 0.01 0.0 0.0 0.01 0.39 0.17 0.16 0.0 0.01 0.56 0.0 0.0 0.0 0.01 0.19 0.21 1.0 0.51 0.09 0.14 0.05 0.28 0.2 0.06 0.04 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.2 0.2 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.67 1.0 0.36 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.12 0.04 0.0 0.3 0.62 0.21 0.18 0.25 0.21 0.0 0.67 1.0 0.14 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.5 0.11 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.29 0.59 0.4 0.03 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.21 0.09 0.0 0.01 0.59 0.04 0.0 0.03 0.0 0.37 0.36 1.0 0.37 0.15 0.12 0.01 0.01 0.06 0.0 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.13 0.05 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 1.0 0.29 0.18 0.21 0.05 0.3 0.1 0.04 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.2 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.1 0.0 0.01 0.34 0.49 0.23 0.29 0.42 0.24 0.0 1.0 0.73 0.17 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.02 0.38 0.01 0.12 0.01 0.24 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.19 1.0 0.11 0.09 0.1 0.07 0.05 0.06 0.09 0.1 0.06
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 1.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.4 0.02 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.48 1.0 0.33 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.92 0.1 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.25 0.02 0.0 0.0 0.44 0.03 0.0 0.01 0.02 0.19 0.15 1.0 0.57 0.03 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 1.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.63 1.0 0.4 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.78 0.82 0.27 0.33 0.34 0.07 0.17 0.43 0.08 0.11 0.27
0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 1.0 0.0 0.01 0.02 0.47 0.02 0.0 0.43 0.28 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 1.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.11 1.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.22 0.01 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.28 0.23 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 1.0 0.92 0.04 0.26 0.24 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.24 0.4 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.31 1.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.24 0.07 0.01 0.02 0.42 0.0 0.0 0.01 0.03 0.25 0.25 1.0 0.25 0.14 0.1 0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.49 0.22 0.29 0.01 0.01 0.5 0.02 0.0 0.0 0.0 0.59 0.44 1.0 0.29 0.16 0.25 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01
0.05 0.12 0.01 0.0 0.01 0.0 0.19 0.01 0.0 0.0 0.01 0.11 0.49 0.12 0.0 0.0 0.53 0.01 0.0 0.0 0.0 0.36 0.27 1.0 0.11 0.07 0.13 0.02 0.14 0.18 0.05 0.01 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 1.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0
0.08 0.05 0.02 0.03 0.03 0.11 0.1 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.18 0.0 0.2 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.13 1.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.18 0.58 0.22 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.28 1.0 0.16 0.19 0.25 0.02 0.23 0.11 0.08 0.0 0.17
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.09 1.0 0.15 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.01 0.05 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 1.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.08 0.01 0.01 0.01 0.05 0.23 0.01 0.01 0.03 0.01 0.17 0.19 0.1 0.01 0.0 0.52 0.01 0.01 0.02 0.01 0.29 0.33 1.0 0.28 0.08 0.07 0.01 0.02 0.05 0.01 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 1.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)