Heatmap: Cluster_260 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
AT1G02145 (EBS4)
0.21 -0.07 0.79 1.07 -0.75 0.55 -0.59 -0.09 0.31 0.15 0.26 -1.38 -5.06 0.28 0.54 0.0 0.29 0.44 0.59 0.12 0.55 -0.31 -0.11 -0.06 -0.03 -0.86 0.72 0.57 0.36 -2.95 0.06 -1.27 -0.03 -0.49 -0.34 0.37 -1.45 -1.64 0.67 0.01 -0.97 -0.69 -0.27 -0.14
AT1G03000 (PEX6)
-0.6 -0.28 -0.61 -0.24 0.98 -1.03 -0.21 0.45 0.49 0.35 0.45 -1.51 -2.66 -0.11 0.59 -0.41 -0.11 0.35 0.42 0.44 0.45 -0.21 0.12 -0.19 -0.56 -1.4 0.81 0.7 0.2 -8.61 0.12 -1.39 0.22 -0.89 0.25 0.44 -2.58 -1.52 0.38 1.05 -0.47 -0.12 0.57 0.22
0.01 -0.79 -0.42 0.38 0.41 -0.52 -0.8 -0.37 -0.02 -0.0 0.22 -2.41 -5.3 -0.08 0.44 -0.12 0.16 0.6 0.63 0.35 0.09 0.22 0.1 -0.16 -0.72 -0.11 0.85 0.83 0.2 -1.07 -0.07 -0.05 -0.08 0.15 0.23 0.18 -0.22 -0.23 0.53 0.39 -1.07 -0.11 0.21 -0.46
-0.07 -1.04 -0.26 0.54 1.3 -0.01 -0.47 -1.06 -0.22 -0.38 -0.7 -3.4 -1.1 -0.32 -1.26 0.32 0.47 0.78 0.2 -0.03 0.39 1.0 -0.59 -0.37 0.28 -0.69 0.82 1.09 0.09 -2.42 -0.24 -2.45 -0.59 -1.5 0.31 1.32 -3.13 -2.27 0.8 0.19 -0.93 0.79 0.07 0.14
AT1G13860 (QUL1)
0.79 0.23 0.51 -0.03 2.2 -0.26 0.41 -1.82 -2.1 -2.58 -2.43 -5.96 -3.37 0.77 0.13 0.17 0.57 0.77 1.1 0.51 0.58 0.66 -0.35 0.49 0.4 -0.86 0.76 -0.33 -0.08 -4.3 -0.11 -4.18 0.15 -1.85 0.46 -1.14 -4.41 -4.44 -0.73 -0.36 -0.89 0.34 0.04 0.24
-0.43 -1.04 -0.53 0.68 -1.02 -0.27 -0.84 -0.28 0.11 -0.42 -0.3 -5.73 -3.92 0.02 0.31 0.28 0.45 0.85 0.64 0.29 0.53 0.54 0.33 -0.04 -0.64 -1.32 1.44 1.07 -0.03 -5.91 0.05 -0.74 0.02 -0.9 0.27 0.44 0.08 -0.73 0.75 -0.11 -0.86 0.18 0.24 -0.32
-0.07 -1.08 0.06 1.09 2.09 0.43 -0.73 -1.27 -1.03 -1.46 -1.53 -2.4 -1.37 -0.1 -0.57 0.33 0.72 1.1 0.84 0.32 0.04 -0.64 -0.16 -0.27 -0.52 -1.51 0.86 1.02 -0.47 -6.94 0.06 -1.87 -0.23 -1.17 0.74 0.78 -2.3 -1.86 0.7 -0.17 -0.51 -0.67 0.36 -0.52
AT1G16780 (VHP2;2)
-1.69 -1.38 -0.19 -0.41 0.5 -0.63 -0.17 -2.29 -2.78 -3.31 -3.66 -3.77 - 0.57 -1.72 -0.01 0.71 1.15 1.01 0.73 0.44 0.08 0.03 0.47 0.63 -1.04 1.34 1.3 1.07 -5.93 0.46 -4.56 -0.01 -3.86 0.41 1.56 -6.49 -4.87 1.12 0.15 -0.25 -0.61 -0.07 0.37
AT1G18600 (RBL12)
0.28 0.0 0.45 0.35 -3.08 0.19 -0.16 -1.89 -2.14 -1.77 -1.53 -3.63 -1.58 -0.08 -0.31 0.38 0.88 1.3 0.64 0.33 0.44 -0.96 0.35 0.57 1.19 -0.56 0.58 0.79 1.24 -7.21 0.48 -2.5 0.21 -0.38 0.46 -0.69 -3.32 -2.24 0.9 0.35 -0.22 -1.13 0.04 -0.29
0.52 0.3 -0.82 0.47 - -0.55 -2.55 -2.18 -2.17 -2.54 -2.39 -2.65 -3.98 0.31 0.37 1.13 1.51 1.67 0.24 0.26 0.26 -0.07 -0.12 0.16 0.23 0.22 0.98 0.7 0.65 -5.36 0.12 -1.38 -0.46 -1.23 0.34 0.46 -2.0 -1.0 1.2 0.23 -0.74 -1.25 -0.17 0.33
0.58 -0.42 0.47 0.87 -4.14 0.49 -0.46 -1.56 -1.96 -2.04 -2.08 -4.53 -5.93 0.81 0.19 -0.04 0.14 0.72 0.69 0.31 0.58 -0.29 0.16 0.41 0.11 -1.08 0.99 1.12 1.04 - 0.77 -2.11 0.52 -1.62 0.33 0.75 -3.06 -2.82 1.15 0.38 -0.63 -0.63 -0.51 -0.29
AT1G26260 (CIB5)
0.09 -0.7 -0.11 1.43 0.28 -0.17 -1.7 -0.83 -0.23 -0.59 -0.81 -3.9 - -0.82 -0.76 -0.26 0.84 2.06 1.53 0.14 0.23 -0.33 -0.49 -0.86 -1.75 -1.98 1.14 0.58 -0.02 - -0.07 -1.5 -0.24 -3.71 1.88 -0.81 -2.4 -1.3 0.14 1.46 -1.7 -1.83 -0.25 -0.33
-0.1 -1.76 -0.76 0.37 0.24 0.0 -1.99 -0.38 -0.28 -0.35 -0.41 -6.4 -5.89 -0.44 0.6 0.82 1.1 1.0 0.47 -0.26 0.2 0.82 -0.97 -0.69 -0.4 -1.38 1.09 1.35 -0.32 -10.99 -0.13 -0.73 -0.74 -0.8 0.88 1.5 -0.76 -0.53 1.13 0.18 -1.98 -0.31 -0.44 -0.94
-1.22 -1.8 -1.43 0.57 -4.66 -0.4 -1.56 -2.08 -1.41 -1.78 -1.4 -0.77 -0.42 -0.93 -0.76 0.64 0.58 1.12 0.55 0.01 0.3 0.33 -1.11 -0.72 -0.92 -0.75 1.22 1.47 -0.01 -2.19 -0.6 0.7 -1.02 -0.63 1.1 1.78 1.12 0.59 1.27 -0.7 -1.16 -0.48 -0.84 -1.13
0.7 -0.04 0.06 -0.78 - -2.08 -2.05 -2.09 -2.6 -2.98 -3.27 -4.95 -6.66 -0.38 -1.19 0.39 0.47 1.19 0.23 -0.15 0.17 0.96 0.15 0.01 -0.33 -1.09 1.68 1.86 0.17 - 0.52 -1.02 -0.18 -3.49 1.44 0.76 -1.74 -1.19 1.84 -0.53 -0.33 -0.05 0.12 -0.3
AT1G48380 (HYP7)
0.26 -0.07 0.27 0.69 -7.02 0.22 -1.39 -0.88 -0.73 -0.55 -0.66 -4.24 -3.53 0.26 0.15 0.27 0.72 0.9 0.62 0.19 0.27 0.56 -0.16 0.11 -0.23 -1.0 0.89 1.12 -0.07 -4.33 0.02 -0.2 -0.26 -0.05 0.38 0.89 -0.33 -0.2 0.94 0.0 -1.34 -0.64 0.06 -0.68
0.15 -0.43 -0.11 0.45 -1.06 -0.03 -0.87 -0.32 0.02 0.1 0.1 -2.79 -1.86 0.01 0.3 0.09 0.4 0.79 0.24 -0.02 0.28 -0.08 0.13 0.63 0.2 -1.31 0.83 0.81 0.45 - 0.23 -1.48 0.03 -0.07 0.39 1.11 -2.03 -2.16 0.75 0.28 -0.7 -0.37 0.05 -0.13
0.16 -0.57 0.3 0.95 1.31 0.61 -0.6 -1.07 -0.73 -0.76 -1.0 -2.17 -5.44 0.23 0.04 0.06 0.52 0.55 0.39 0.19 0.09 0.13 -0.26 0.84 -0.03 -0.88 0.73 0.98 0.37 -6.33 0.03 -2.59 -0.15 -0.77 0.31 0.93 -2.65 -2.31 0.71 0.29 -0.93 -0.19 0.02 -0.57
0.25 -0.47 0.73 0.98 -0.18 0.61 -0.31 -3.33 -2.65 -2.71 -2.39 -1.74 0.65 -0.89 -2.73 0.51 1.02 1.12 -0.0 -0.75 0.54 1.14 -0.2 0.85 -0.05 -1.69 0.94 1.03 1.02 -4.18 -0.13 -2.99 -0.4 -0.47 0.96 -0.43 -3.85 -3.19 0.75 -0.38 -1.58 0.18 -0.09 -0.08
AT1G60860 (AGD2)
0.38 0.09 0.65 1.24 0.26 0.31 -1.68 -1.78 -1.48 -1.88 -1.84 -2.99 -1.96 0.27 0.34 0.46 0.56 1.44 1.18 0.53 0.61 0.73 -0.16 -0.36 -0.74 -1.38 1.51 1.14 0.1 -3.26 -0.5 -2.96 -0.67 -1.59 0.62 -0.51 -4.05 -3.42 0.36 -0.16 -1.18 -0.19 0.48 -1.11
0.08 0.28 0.58 -0.28 0.38 -0.07 -0.72 -0.81 0.09 0.38 -0.18 -3.47 -3.82 0.43 0.56 0.04 0.3 0.25 0.11 -0.17 0.69 0.48 -0.42 -0.1 0.21 -1.03 0.77 1.06 0.49 - 0.43 -1.01 0.1 -0.4 -0.22 0.7 -1.62 -1.18 1.25 -0.48 -1.36 -0.54 -0.19 -0.25
0.09 -2.33 -0.45 1.07 - 0.52 -1.25 -0.99 -0.91 -1.32 -1.59 -5.98 - -0.66 -0.66 1.18 1.12 1.24 0.7 0.12 0.36 0.43 -0.48 -1.03 -0.41 -1.28 1.29 1.73 -0.78 - -0.04 -1.46 -0.53 -2.15 1.46 -0.95 -1.1 -0.81 1.45 0.24 -1.19 0.2 0.42 -0.44
AT1G62670 (RPF2)
0.4 -0.87 -1.52 0.48 - 0.02 -0.29 -0.93 -0.51 -0.79 -1.07 - - -0.17 0.22 0.64 1.15 1.27 0.87 0.14 0.44 1.33 -0.5 -0.04 -0.08 -0.68 1.21 1.28 -0.02 - 0.01 -3.36 -0.2 -2.06 0.65 1.0 -4.44 -2.43 0.91 0.17 -1.39 0.5 -0.62 -0.33
-0.93 -0.33 0.62 -0.09 -2.97 -0.31 -1.48 0.68 1.09 1.28 0.65 0.64 -2.06 -1.98 0.29 -1.83 -0.5 -0.12 -0.15 -0.81 0.36 0.37 -1.52 -0.03 -2.89 -0.19 0.62 0.54 0.25 - 0.72 -0.98 -0.54 -0.66 1.1 0.61 1.27 -1.09 0.14 0.07 -2.44 1.03 -1.24 -0.69
0.32 -0.18 -0.04 -0.14 - -0.01 -0.08 -0.23 -0.13 0.06 -0.11 - -1.42 -0.69 -0.88 0.29 0.93 1.12 0.11 -0.44 0.5 0.96 -0.46 0.27 0.3 0.17 1.04 1.03 -0.25 -2.01 -0.03 -2.28 -0.61 -0.11 0.48 0.98 -2.8 -2.29 0.89 -0.09 -1.01 0.54 -1.03 0.14
-0.14 -1.18 -0.24 -0.02 - -0.1 -1.05 -0.56 -0.31 -0.8 -0.63 0.65 - -0.27 -0.93 0.01 0.97 1.3 0.75 0.25 0.2 0.68 -0.09 0.01 -0.2 -0.78 1.36 1.39 0.03 - -0.1 -2.88 -0.38 -4.53 0.45 0.75 -4.52 -2.34 1.1 0.5 -0.61 0.64 -0.02 0.23
-0.05 -0.37 -0.85 -0.03 - -0.17 0.55 -0.94 -0.26 -0.69 -0.99 - - -0.28 -0.85 0.9 1.12 1.45 0.26 -0.53 0.65 1.27 -0.55 0.26 -0.04 -0.56 1.14 1.14 -0.15 - -0.11 -2.95 -0.22 -1.34 0.8 -0.11 -5.56 -3.63 1.04 0.02 -0.47 1.3 -0.63 0.08
-0.24 -1.47 -0.61 1.25 - 0.39 -0.11 -0.99 -0.97 -2.23 -2.34 - - -0.48 -0.19 0.1 0.36 0.91 0.7 0.53 0.54 1.52 -0.27 -0.12 -1.0 -0.84 1.54 1.41 0.44 - -0.09 -3.86 -0.34 -3.31 1.02 0.4 -5.52 -2.26 1.18 0.3 -1.58 1.29 -0.24 -0.86
-0.44 -0.82 0.17 1.21 -1.68 0.69 -1.02 -2.21 -2.73 -4.06 -3.6 - - 0.07 -0.83 -0.89 -0.05 0.33 0.64 0.5 1.1 1.85 -0.07 1.15 0.11 -0.78 1.46 0.93 0.77 -0.36 0.16 -5.09 -0.02 -2.95 0.47 1.21 -6.92 -5.11 0.85 -0.79 -0.8 -0.17 -0.21 -0.76
0.22 -1.03 -0.84 0.16 - 0.5 -0.19 -2.17 -1.82 -2.12 -2.34 - - -0.22 -1.08 -0.09 0.78 1.26 0.69 0.16 0.27 1.89 -0.07 -0.19 -0.06 -1.03 1.1 1.04 -0.06 -3.11 0.13 -3.41 -0.29 -2.25 0.39 1.36 - -2.66 1.04 0.15 -0.64 1.72 -0.48 -0.28
-0.23 -0.21 -0.43 -0.44 - -1.01 0.01 -1.43 -0.11 -0.31 -0.31 -1.51 -6.54 0.64 0.19 0.16 0.54 1.08 0.63 0.19 0.78 0.11 0.68 -0.78 -1.03 -1.98 1.38 1.1 -1.01 - 0.46 -2.54 0.32 -0.76 -0.28 1.87 -4.99 -3.24 1.47 -0.18 -0.79 0.01 0.13 -0.64
-0.18 -1.34 -0.54 1.39 - 0.78 -1.7 -1.31 -0.42 -0.17 -0.37 -0.27 -0.36 -1.21 -0.62 -0.32 0.51 0.85 0.3 -0.29 0.41 0.49 -0.55 -0.61 -0.9 -0.2 1.29 1.03 0.42 - -0.4 -0.11 -0.96 -1.12 1.08 0.13 0.99 0.68 0.65 0.1 -1.05 -0.49 -0.85 -0.61
0.31 -1.25 -0.26 0.2 - 0.2 -0.79 -0.87 -0.33 -0.22 -0.3 -2.74 -4.98 -0.45 -0.17 0.28 0.65 1.04 0.81 0.41 0.09 0.24 0.2 0.48 0.43 -0.91 0.89 0.96 0.29 -6.27 0.15 -1.36 -0.1 -0.02 0.39 1.35 -1.4 -1.88 1.19 0.44 -1.27 -0.23 -0.72 -0.38
-0.39 -0.73 0.74 0.06 2.42 0.34 -0.88 -0.25 -0.1 0.01 -0.09 -4.5 -0.92 -0.47 -0.79 0.12 0.12 0.42 -0.53 -0.71 -0.04 0.37 -0.11 0.08 -0.42 -1.35 0.58 0.53 0.2 -8.21 0.04 -0.57 -0.28 -0.74 0.1 -0.73 0.32 -0.2 0.67 0.12 -0.46 -0.63 -0.02 -0.11
-0.65 -0.5 -0.66 0.61 - 0.09 -1.41 -0.66 0.32 0.2 0.16 -1.48 - -0.02 -0.51 -0.49 0.31 0.71 0.82 0.33 0.74 1.14 0.32 0.26 0.24 -1.04 1.11 1.15 0.37 - 0.11 -1.1 -0.18 1.43 -0.3 -0.84 -1.96 -1.89 0.87 -0.09 -0.96 -0.01 -0.64 -0.61
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AT2G02470 (AL6)
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AT2G02790 (IQD29)
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AT2G25710 (HCS1)
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AT2G35620 (FEI2)
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AT2G39090 (APC7)
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AT2G45880 (BMY4)
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AT3G18520 (HDA15)
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AT3G43700 (BPM6)
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AT3G44680 (HDA9)
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AT3G49920 (VDAC5)
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AT3G53760 (GCP4)
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AT3G55480 (PAT2)
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AT4G02460 (PMS1)
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AT4G27180 (KATB)
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AT4G27630 (GTG2)
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AT5G06310 (AtPOT1b)
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AT5G06910 (ATJ6)
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AT5G08470 (PEX1)
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-0.68 -1.47 -0.63 0.98 - 0.03 -1.04 -1.9 -1.21 -1.16 -0.94 -2.17 -4.27 -0.15 -0.06 0.18 0.74 1.22 0.75 0.2 0.61 0.83 -0.08 0.09 -1.27 -0.57 1.25 1.46 0.3 - 0.03 -1.12 -0.41 -0.66 0.86 0.86 -0.5 -0.66 1.34 0.06 -1.54 0.21 -0.09 -1.04
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AT5G49980 (AFB5)
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AT5G51230 (EMF2)
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0.04 0.1 -0.03 0.51 1.04 0.15 -1.33 -0.52 -0.49 -0.29 -0.37 -2.74 -3.09 -0.21 0.05 0.46 0.71 0.86 -0.05 -0.53 -0.46 -0.03 -0.25 0.04 -0.3 -0.64 0.55 0.77 0.06 -4.83 0.01 0.47 -0.55 -0.4 0.07 0.64 0.89 0.33 0.7 0.51 -0.46 -1.01 -1.0 -0.49
AT5G58970 (UCP2)
0.22 -0.79 0.91 0.21 1.42 0.23 -0.49 -1.45 -1.71 -2.29 -2.31 -2.89 -3.76 1.31 0.09 -0.4 0.07 0.0 0.32 0.21 0.47 -0.18 0.61 1.13 0.83 -1.75 0.3 0.19 1.22 -7.5 0.78 -1.5 0.71 -1.04 -0.68 1.16 -1.65 -1.54 0.54 -0.1 -1.88 -1.75 -0.87 -0.65
AT5G59160 (PPO)
0.52 0.7 0.77 -0.17 1.56 0.21 -0.69 -0.98 -0.57 -0.4 -0.41 -2.0 -1.25 0.04 0.05 0.3 0.3 0.29 -0.04 -0.5 0.1 -0.38 -0.7 -0.67 0.19 0.31 0.22 0.5 1.98 -0.4 -0.27 -2.08 -0.34 -0.22 -0.79 -0.33 -2.42 -2.37 0.38 0.02 -0.47 -1.09 -0.23 0.34
AT5G62390 (BAG7)
0.58 -1.26 -0.16 0.45 0.71 0.17 -1.55 -1.77 -2.07 -1.68 -1.65 -1.68 -2.69 -0.18 -0.68 0.88 1.17 1.39 0.97 -0.05 -0.07 0.35 -0.78 -0.19 -0.7 -1.58 1.29 1.51 -0.09 -7.48 -0.69 -2.93 -1.15 -1.89 0.76 1.77 -4.47 -3.5 1.13 0.2 -1.04 -0.2 -0.07 -0.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.