Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
-1.25 -0.9 -5.59 -5.71 1.24 0.3 0.4 0.27 1.58 1.15 0.81 1.44 -1.09 0.49 -0.39 -0.41 -0.6 -0.74 0.11 -1.2 -1.12 1.68 -0.19 -0.72 -0.41 -1.2 -0.38 -0.86 0.6 -0.76 -1.49 1.15 -1.29 0.67 -0.76 -0.21 -1.16 0.36 -1.05 -0.66 -0.12 -0.2 -0.36 -0.15 0.43 -0.02 -0.51 -0.02 -1.34 -1.39 -0.97 0.48 0.15 0.15
0.04 -0.09 -0.24 -5.66 1.06 0.54 0.4 -0.33 0.26 -0.07 0.04 0.14 -1.03 -1.2 0.38 0.37 0.33 0.35 0.01 0.06 0.07 -0.22 -0.22 -0.98 -0.08 0.16 -0.2 -0.24 -0.26 -0.07 -0.68 -0.9 -0.8 -0.97 -0.64 -0.21 0.37 0.34 0.28 -0.04 0.27 0.03 -0.33 0.19 -0.01 0.24 -0.15 -0.33 -0.24 0.11 0.11 0.59 0.83 0.55
0.04 -0.09 -0.24 -5.66 1.06 0.54 0.4 -0.33 0.26 -0.07 0.04 0.14 -1.03 -1.2 0.38 0.37 0.33 0.35 0.01 0.06 0.07 -0.22 -0.22 -0.98 -0.08 0.16 -0.2 -0.24 -0.26 -0.07 -0.68 -0.9 -0.8 -0.97 -0.64 -0.21 0.37 0.34 0.28 -0.04 0.27 0.03 -0.33 0.19 -0.01 0.24 -0.15 -0.33 -0.24 0.11 0.11 0.59 0.83 0.55
0.22 -0.28 0.77 -3.67 0.1 0.53 0.46 -0.44 0.13 -0.8 -0.44 0.06 -0.29 -0.22 -0.09 -0.44 -0.18 -0.29 -0.09 -0.47 -0.24 1.15 -0.11 -1.78 -0.54 0.41 0.2 -0.53 0.77 -0.4 0.66 0.65 -1.68 -0.06 -1.59 0.87 0.05 1.04 0.33 0.25 -0.21 -0.16 -0.26 -0.25 0.88 -0.32 -0.66 0.11 -0.41 -0.14 -0.41 -0.35 -0.19 -0.17
0.33 0.01 -0.31 -2.88 1.78 0.53 0.61 -0.26 0.53 -1.23 -0.28 0.31 -1.09 -0.04 -0.77 -0.56 -0.79 -0.7 -0.45 -0.06 -0.29 0.66 -0.78 -0.3 -0.01 0.57 -0.37 -0.85 -0.0 -0.98 -0.09 -0.42 -0.52 0.79 -0.51 1.66 -0.01 1.12 0.13 -0.54 0.75 -0.4 -0.6 0.39 -0.0 0.82 -0.8 -0.38 -1.1 -0.75 -0.68 -0.81 -0.64 -0.73
-0.36 -0.65 -1.12 -3.78 1.54 0.79 0.54 -0.04 0.57 -0.25 -0.06 0.58 -0.15 -0.15 -0.76 -0.41 -0.59 -0.73 -0.03 -0.24 0.1 0.56 -0.28 -1.11 0.14 -0.18 0.14 -0.54 0.21 -0.66 0.43 0.64 -1.03 -0.01 -1.11 1.03 -0.44 0.32 -0.19 -0.32 0.58 -0.23 -0.39 0.52 0.21 0.72 -0.64 -0.21 -1.02 -0.42 -0.42 0.22 0.1 -0.13
0.24 -0.11 2.58 -0.06 0.96 -0.25 -0.03 - - -0.31 0.91 - -2.41 -0.33 - - -0.14 - - 0.11 - -1.08 -1.67 - 1.77 -0.75 1.28 -0.08 -0.76 - 0.49 -0.31 -2.39 -0.9 - 1.53 -0.62 0.53 -0.4 -0.1 2.29 0.72 -2.62 1.51 -0.42 1.73 -2.49 - -3.34 -1.33 -2.33 -3.14 -0.34 0.81
-0.41 0.3 -0.04 -4.84 1.93 0.36 0.59 -0.02 0.47 0.44 0.56 0.31 -1.1 -0.01 -0.71 -0.74 -1.12 -0.84 -0.62 -1.13 -0.92 2.15 -0.62 -1.23 0.68 -0.7 -0.83 -1.21 -0.17 -0.89 0.38 0.35 -1.34 0.37 -1.0 1.35 -1.08 0.17 -0.92 -0.49 0.85 -0.74 -1.16 0.91 -0.27 0.81 -1.14 -0.79 -1.75 -1.39 -1.07 -0.13 0.02 -0.13
0.46 0.07 -0.79 -4.91 1.05 0.68 0.62 -0.64 0.45 -0.54 -0.19 0.38 -0.09 -0.48 0.3 0.25 0.18 0.23 0.71 0.14 0.0 -0.73 -0.12 -1.02 0.06 0.67 -0.45 -0.58 -0.75 -0.47 0.04 -1.33 -1.2 -1.06 -1.26 0.27 0.54 0.38 0.56 -0.26 0.29 -0.44 -0.54 0.44 -0.25 0.31 -0.57 -0.33 -0.2 -0.02 -0.09 0.1 0.56 0.56
-0.45 0.24 1.58 -1.8 1.27 0.69 -0.14 -0.58 0.05 -0.52 -0.56 0.02 -0.85 0.07 0.26 0.08 0.32 0.27 0.34 0.43 0.48 -0.52 -0.6 -0.9 -0.19 0.35 -0.62 -0.7 -1.06 -0.85 -0.3 -0.77 -0.61 -1.11 -0.73 0.63 0.27 0.33 0.33 -0.66 0.83 -0.44 -0.71 0.1 -0.55 0.81 -0.59 -0.74 -0.48 -0.69 -0.53 0.31 0.54 0.56
-0.03 -0.51 -0.99 -4.6 0.69 0.91 0.63 0.29 0.71 0.09 0.43 0.63 -0.27 -0.04 -0.37 -0.43 -0.24 -0.36 0.85 0.41 0.5 0.48 -0.42 -0.36 -0.31 -0.79 0.01 -0.33 -0.07 -0.18 0.32 -0.11 -0.22 0.67 -0.43 -0.44 -0.45 -0.48 -0.56 0.33 0.39 0.11 -0.39 0.09 0.11 -0.01 -0.3 -0.29 -0.72 -0.55 -0.23 -0.06 0.08 -0.1
0.6 0.8 1.24 -2.56 1.88 -0.95 -0.23 1.18 1.18 1.45 1.39 1.45 -2.28 0.59 -2.36 -2.32 -2.27 -2.38 -0.13 0.42 0.56 2.75 -2.28 -2.67 -1.77 -0.82 -0.58 -2.0 0.88 -1.9 -3.3 0.57 -1.14 -0.05 -1.13 -0.36 -1.12 0.31 -0.83 -0.9 -0.71 -0.1 -1.23 -1.26 0.41 -0.8 -1.15 -1.13 -2.66 -2.19 -2.24 -2.08 -2.7 -2.5
0.42 0.16 -3.49 -4.83 0.85 1.16 1.45 0.35 0.85 0.01 0.48 0.4 -0.02 -1.01 -0.43 -0.54 -0.59 -0.63 -1.34 -0.25 -0.33 1.6 -0.44 -0.39 -0.47 -0.94 0.18 0.02 0.88 -0.68 -0.36 0.28 -0.28 0.0 -0.74 1.16 -1.22 -0.36 -1.2 -0.72 0.21 -0.55 -0.03 0.9 0.51 0.17 -0.64 -0.01 -0.95 -1.3 -1.05 -0.97 -0.35 -0.41
0.84 0.89 -1.12 -4.24 0.99 0.51 0.88 1.15 0.35 0.8 1.38 -0.18 -1.42 -0.15 -0.42 -0.24 -0.23 -0.27 -0.26 -0.17 -0.17 0.05 0.1 -0.23 -0.95 0.08 -0.59 0.11 -0.33 -0.23 -0.75 -0.59 0.26 -0.31 0.0 -1.15 0.05 -0.19 -0.01 -0.06 -0.33 -0.18 -0.03 -0.8 -0.04 -0.98 -0.17 -0.17 -0.78 -0.21 0.19 0.19 0.13 -0.15
-0.35 0.15 0.1 -4.1 1.32 0.61 0.07 -0.16 0.58 -0.04 0.04 0.4 -0.36 -0.37 0.07 0.11 0.09 0.03 0.68 0.07 0.05 -0.24 -0.07 -0.69 -0.12 0.14 0.29 -0.23 -0.31 -0.22 -0.56 -0.51 -1.08 -0.63 -1.14 0.18 0.12 0.12 0.16 0.25 0.29 -0.02 -0.42 -0.1 0.24 0.55 -0.4 -0.3 -0.03 -0.07 -0.01 -0.08 0.09 -0.09
1.27 -0.2 -3.87 -6.25 1.7 0.6 1.4 -0.15 -0.84 -0.53 -0.0 -1.02 -0.87 -0.15 -0.22 -0.53 -0.24 -0.48 1.0 -1.23 -1.33 2.05 -0.69 0.87 -0.42 -0.51 -0.58 -0.63 0.52 -0.89 1.11 0.27 0.37 0.77 0.45 -1.4 -0.62 0.47 -0.55 -0.38 -0.47 -0.82 -0.73 -0.16 0.42 -0.78 -1.04 -0.24 0.48 -0.44 -1.52 -3.12 -1.8 -1.39
0.24 -0.14 -7.48 -4.61 1.74 0.76 -0.64 0.33 1.19 1.76 0.79 1.85 -1.36 0.36 0.03 -0.07 0.01 -0.41 -0.06 1.68 1.28 0.51 -1.09 -2.7 -1.89 -1.03 0.65 -1.06 -1.76 -0.78 -1.43 1.44 -1.25 -2.76 -1.52 -2.38 -0.73 -1.47 -0.63 -0.01 -0.71 0.56 -0.85 -1.32 -0.19 -0.77 -0.75 -1.12 -0.6 -0.39 -0.62 -0.63 -0.94 -0.82
0.17 0.23 0.74 -5.66 0.57 0.39 0.98 0.16 0.36 0.18 0.16 0.23 -0.68 -0.03 -0.19 -0.17 -0.17 -0.27 0.25 -0.46 -0.24 1.47 -0.17 -0.61 0.01 -0.19 -0.3 -0.53 0.29 -0.64 0.03 -0.68 -0.35 0.1 -0.35 0.13 -0.39 0.14 -0.2 -0.39 0.38 -0.43 -0.12 0.19 0.34 0.25 -0.51 0.01 -0.42 -0.22 -0.26 -0.48 -0.18 -0.28
0.33 0.83 -4.48 -4.57 0.92 0.5 0.16 0.59 1.23 0.98 1.37 0.84 -0.07 1.02 0.08 0.04 0.07 0.17 1.01 -0.03 -0.2 0.19 -0.59 -1.57 -0.88 0.16 -0.37 -0.44 -0.89 -0.88 -1.49 -0.83 -1.28 -1.61 -1.56 0.79 -0.07 0.5 -0.07 0.58 0.22 -0.04 -0.76 -0.15 -0.19 0.3 -0.41 -0.75 -1.5 -1.29 -0.99 -0.81 -0.57 -0.64
-0.22 0.04 0.79 -1.88 0.7 0.03 -0.49 0.07 -0.04 -0.13 -0.16 0.31 -1.18 0.14 -0.33 -0.23 -0.21 -0.24 0.53 -0.41 -0.5 0.43 -0.09 -0.58 -0.47 -0.2 0.53 0.4 0.43 0.25 -1.01 -0.93 -0.12 -0.5 -0.26 -0.64 0.22 0.34 0.04 0.64 -0.21 0.73 0.23 -0.36 0.56 -0.28 0.48 0.2 0.13 0.02 -0.06 -0.16 -0.16 -0.49
0.59 0.55 0.52 -4.65 1.18 1.0 0.64 0.37 0.59 0.03 0.24 0.6 -0.48 -0.3 -0.08 -0.14 0.03 -0.02 -0.16 0.22 0.27 0.33 -0.4 -1.65 -0.53 0.17 0.42 -0.4 -0.17 -0.1 -0.34 -0.45 -1.04 -1.07 -1.27 -0.55 0.09 0.32 0.18 0.4 -0.28 0.23 -0.29 -0.38 0.35 -0.35 -0.29 -0.22 -0.38 -0.26 -0.23 -0.2 -0.31 -0.51
0.09 -0.08 0.19 -5.04 0.97 0.46 0.44 -0.1 0.26 -0.22 -0.24 0.37 -1.22 0.03 -0.29 -0.3 -0.28 -0.31 0.25 -0.43 -0.27 1.36 -0.56 -0.02 -0.39 -0.18 -0.25 -0.54 0.07 -0.68 0.5 0.68 -0.03 0.6 0.06 0.99 -0.2 0.62 -0.11 -0.19 0.2 -0.13 -0.4 0.03 0.25 0.16 -0.47 -0.15 -0.67 -0.55 -0.41 -0.64 -0.66 -0.8
0.06 -0.2 0.45 -4.38 0.44 0.25 0.31 0.33 0.37 0.42 0.39 0.6 -0.32 -0.15 -0.79 -0.83 -0.62 -0.93 -0.16 -0.03 -0.04 1.17 -0.4 -0.77 -0.47 0.39 0.6 -0.18 0.11 -0.21 -0.24 -0.41 -0.43 -0.44 -0.45 -0.2 0.3 0.77 0.45 0.61 -0.15 0.59 -0.2 -0.47 0.73 -0.18 -0.22 -0.15 0.3 -0.1 -0.74 -1.18 -0.86 -0.35
0.17 0.46 0.31 -3.88 1.9 0.64 0.25 -0.13 0.57 0.16 0.12 0.61 -0.42 -0.4 -0.22 -0.3 -0.31 -0.31 -0.22 0.34 0.17 0.07 -0.5 -1.27 0.48 -0.14 -0.3 -0.58 -0.52 -0.52 -0.39 -1.0 -0.91 -1.07 -0.89 0.5 -0.25 0.04 -0.22 -0.44 0.87 -0.14 -0.54 0.67 -0.24 0.76 -0.48 -0.4 -0.93 -0.55 -0.52 0.31 0.25 0.2
0.43 0.32 0.16 -3.91 0.62 0.38 0.58 -0.15 0.05 -0.34 -0.27 -0.07 -0.92 -0.28 -0.14 -0.17 -0.13 -0.13 0.53 -0.16 -0.23 0.63 -0.3 -1.23 -0.77 0.72 0.33 -0.46 0.27 -0.57 -0.29 -0.01 -1.1 -0.53 -1.21 0.98 0.55 1.22 0.63 0.32 0.02 0.23 -0.22 -0.13 0.77 -0.25 -0.37 -0.12 -0.43 -0.3 -0.31 -0.69 -0.74 -0.77
-0.57 0.2 1.6 -0.82 1.07 0.12 -0.23 -0.35 -0.25 -0.38 -0.59 -0.17 -0.86 0.69 -0.62 -0.54 -0.5 -0.5 0.12 -0.35 -0.42 0.03 -0.67 -0.94 0.94 -0.23 -0.22 -0.68 -0.02 -0.6 0.73 -0.45 -0.69 -0.3 -0.6 1.25 -0.37 -0.32 -0.3 -0.65 1.07 -0.27 -0.42 0.89 -0.08 1.17 -0.23 -0.33 -0.64 -0.68 -0.66 -0.15 0.02 -0.11
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0.5 0.97 0.95 -4.01 0.7 0.21 -0.14 -0.01 0.13 -0.11 -0.08 0.24 -0.59 -0.74 0.34 0.24 0.18 0.14 0.93 0.19 0.14 0.13 -0.4 -0.53 0.35 0.06 -0.72 -0.25 -0.59 -0.47 0.03 -0.91 -0.21 -0.42 -0.52 -0.2 0.14 -0.18 0.07 -0.43 0.54 -0.07 -0.24 0.38 -0.53 0.5 -0.07 -0.25 -0.48 -0.5 -0.35 -0.28 0.04 0.01
-1.85 -1.34 0.18 -2.27 1.62 0.62 0.38 0.81 1.36 2.05 1.88 1.65 -2.93 -0.54 -0.94 -1.15 -1.18 -1.64 0.22 -0.43 -0.82 1.26 -1.54 -2.8 -0.68 -0.43 0.57 -1.99 -0.35 -1.52 -0.37 1.48 -2.16 0.88 -2.82 0.81 -1.41 -0.29 -1.11 0.67 -0.27 0.24 -1.99 0.38 0.06 0.04 -1.32 -1.63 -2.12 -2.15 -2.45 -2.36 -1.49 -1.56
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0.21 -0.18 -1.07 -4.17 0.96 0.59 0.24 0.28 -0.01 0.27 0.13 -0.02 -0.53 -0.23 -0.37 -0.22 -0.46 -0.37 -0.37 0.55 0.48 0.29 -0.14 -2.23 -0.83 -0.16 1.15 0.39 -0.17 0.44 -1.76 -1.07 -1.49 -2.36 -1.49 -1.22 0.32 -0.35 0.31 1.0 -0.99 1.21 0.24 -0.97 1.02 -0.76 0.46 0.05 -0.26 -0.3 -0.04 0.35 0.42 0.34
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.