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Heatmap: Cluster_262 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.56 0.09 0.42 0.38 -0.22 -2.62 -0.45 -0.52 0.17 0.11 0.73 -0.98 -1.11 -1.13 0.77 0.43 0.24 -0.84 0.1 0.3
0.3 0.8 0.2 -0.24 -0.09 -0.86 -0.01 -0.34 -0.22 -0.23 1.07 -0.83 -0.41 -0.64 0.94 0.11 0.19 -1.02 -0.49 -0.68
-0.08 0.36 -0.2 -0.67 0.26 0.16 -0.54 0.18 -0.03 -0.16 0.09 -0.63 0.22 0.03 0.05 -0.07 -0.48 0.64 0.32 -0.23
1.09 -0.95 -1.19 1.6 0.67 -1.68 1.42 -1.13 -1.05 -0.78 -0.93 -2.97 -0.73 -1.64 -1.12 -1.76 -3.27 -0.87 2.04 -0.54
1.03 0.21 -0.07 0.65 1.14 -1.33 -0.08 -0.1 -0.05 -0.06 0.03 -0.88 -0.11 -0.51 0.09 -0.01 -0.41 -0.46 -0.18 -2.04
0.39 0.8 0.16 0.02 0.3 -0.9 -0.05 -0.09 -0.12 -0.05 0.34 -0.98 -0.62 -1.04 0.33 -0.56 -0.82 0.15 0.87 -0.15
0.44 -0.25 0.09 -0.34 -0.11 0.42 0.47 0.07 -0.49 -0.19 0.53 -2.36 0.34 -0.96 0.3 0.13 -1.03 -0.32 0.32 0.47
0.66 0.3 -0.13 -0.3 0.12 -0.42 0.64 -0.67 -0.35 -0.48 0.28 -1.21 -0.11 -0.16 0.6 0.55 -0.52 0.32 -0.19 -0.6
0.89 -0.39 0.13 0.05 0.57 -2.1 -0.43 -0.23 0.02 0.26 0.61 -0.85 -0.56 -0.69 0.75 0.21 -0.31 -0.37 -0.19 0.07
1.16 -0.27 0.11 0.42 0.9 -2.66 -0.76 -0.36 -0.35 -0.07 0.78 -1.28 -1.19 -0.96 0.38 0.34 -0.35 0.36 -0.1 -0.43
0.9 0.74 0.09 1.18 0.66 -1.54 -1.04 -0.4 -0.36 -0.42 0.29 -1.85 -1.18 -2.13 0.35 -0.4 -0.98 0.02 1.21 -1.27
1.91 0.82 0.53 1.73 0.62 -1.4 -0.31 -1.33 -1.88 -2.06 -2.32 -3.05 -2.36 -2.6 -2.12 -2.4 -4.05 -0.52 1.74 -0.18
0.0 0.33 -0.13 -0.35 0.27 0.32 0.03 -0.11 -0.0 0.17 0.23 -0.93 0.32 -0.1 0.34 -0.84 -1.13 -0.27 0.6 -0.01
0.09 0.38 -0.64 0.14 0.59 -0.81 0.05 -0.06 0.04 -0.08 0.55 -1.09 -0.71 -0.92 0.7 -0.42 -0.84 0.21 0.96 -0.43
0.2 -0.08 -0.29 -0.57 0.26 0.15 0.16 -0.39 -0.26 -0.27 0.62 -1.06 -0.33 -0.53 0.82 0.39 -0.01 0.33 0.14 -0.66
0.04 0.46 0.0 -0.4 0.29 0.18 -0.11 0.05 -0.11 -0.06 0.44 -1.14 0.3 -0.05 0.43 -0.7 -1.3 -0.17 0.59 -0.24
0.24 1.64 0.29 -0.71 0.52 0.19 0.44 -0.25 -0.45 -0.48 -0.19 -1.33 -0.89 -1.35 0.11 -1.16 -1.96 0.33 0.58 -0.13
1.03 0.42 1.34 0.14 0.18 -0.47 -0.3 -0.64 -1.11 -1.73 -0.57 -2.37 -0.02 -1.07 -1.07 -1.55 -2.23 0.18 1.44 0.77
0.56 0.54 0.32 -0.01 0.9 -2.26 -1.04 -0.25 -0.25 -0.3 -0.04 -1.04 -0.63 -0.71 0.15 -0.21 -0.93 0.39 1.06 0.21
0.52 0.53 0.1 0.57 0.29 -1.74 -0.42 -0.36 -0.13 -0.35 0.1 -0.79 -0.15 -0.43 -0.16 -0.09 -0.21 0.06 1.08 -0.6
-0.33 0.67 0.27 -0.12 0.12 0.65 0.23 -0.09 0.12 -0.02 -0.33 -0.66 0.01 -0.07 -0.1 -0.38 -0.78 -0.2 0.38 -0.34
1.18 0.03 0.81 0.61 1.09 -2.63 -0.61 -0.33 -0.11 0.06 0.22 -1.7 -1.28 -1.02 0.27 -0.11 -0.13 -0.58 0.09 -0.81
0.9 -0.61 0.32 0.13 0.05 -3.62 -0.41 0.13 -0.01 0.32 0.82 -1.26 -1.07 -1.41 0.89 0.92 0.41 -0.9 -0.25 -1.18
0.44 0.42 -0.03 0.41 0.5 -1.63 0.23 -0.24 0.13 -0.05 0.47 -0.71 -0.61 -0.66 0.48 -1.55 -3.16 0.27 1.04 -0.36
0.56 1.16 0.54 0.13 0.67 0.09 -0.42 -0.43 -0.58 -0.6 -1.29 -0.71 -1.16 -1.92 -0.76 -1.02 -1.22 0.49 1.46 -0.18
0.66 0.4 0.29 0.27 0.51 -0.11 -0.62 -0.12 -0.26 -0.44 0.06 -0.94 -0.02 -0.47 0.17 -0.87 -0.93 -0.09 0.74 0.13
0.98 -0.43 0.25 0.41 0.02 -3.8 -0.37 -0.03 0.28 0.06 0.57 -1.1 0.07 -0.25 0.59 0.06 -0.65 -0.76 -0.09 0.15
-0.17 0.33 -0.27 0.2 0.31 -0.06 0.2 -0.22 -0.56 -0.4 0.37 -0.3 -1.84 -1.96 0.51 -0.55 0.01 0.58 1.04 -0.12
0.76 -1.18 0.02 0.27 -0.39 -3.58 0.02 -0.94 -0.1 0.18 1.21 -1.4 -2.13 -2.45 1.24 0.69 0.6 -0.96 -0.18 0.27
0.66 0.28 -0.17 0.3 0.44 -0.78 -0.28 -0.19 -0.42 -0.3 0.81 -1.33 -0.89 -1.34 0.78 -0.59 -0.38 -0.43 1.17 -0.63
0.59 1.06 0.39 -0.59 0.79 -1.09 0.09 -0.33 -0.59 -0.4 0.39 -1.01 -0.97 -0.86 0.47 -0.45 -1.56 0.03 0.87 -0.37
0.74 0.53 -0.24 0.4 0.55 -1.25 0.14 -0.47 -0.24 -0.23 0.86 -0.84 -0.23 -0.59 0.8 -0.29 -1.45 -0.91 0.41 -0.67
1.3 1.25 1.21 -0.12 0.91 -1.01 -0.05 -0.79 -1.46 -1.56 -1.0 -2.9 -0.92 -1.54 -1.3 -2.33 -2.99 0.34 0.77 1.06
-0.97 -0.9 -0.7 0.54 0.32 -0.54 0.58 0.03 -0.01 0.12 1.0 -0.52 -1.23 -1.38 0.98 -1.28 -1.03 0.5 0.86 -0.44
1.18 0.74 1.32 1.15 1.33 -1.33 -0.29 -1.12 -2.58 -1.96 -0.86 -2.83 -3.01 -2.85 -1.07 -1.33 -3.21 0.64 1.1 0.14
0.59 0.59 0.45 0.07 0.31 -0.06 -0.0 -0.21 -0.1 -0.2 0.17 -1.43 -1.15 -1.49 0.26 -0.99 -1.1 0.39 0.84 0.19
1.05 0.11 0.14 -0.02 0.62 -1.8 -0.08 -0.24 0.11 -0.04 0.48 -1.13 -0.81 -0.7 0.32 0.3 -0.04 0.01 0.08 -0.87
0.17 -0.63 -1.31 0.04 -0.64 -0.33 0.55 -0.03 -0.6 -0.27 1.07 -1.95 0.03 -0.58 1.08 0.16 -0.27 -0.17 0.22 0.33
0.15 -0.06 -0.12 -0.71 -0.06 -2.81 0.19 -0.37 0.3 0.26 1.14 -1.47 -1.11 -1.19 0.81 0.91 0.25 -0.45 0.61 -1.33
0.26 -0.44 -0.45 0.33 0.34 -0.65 0.25 -0.42 -0.0 -0.32 0.36 -0.8 -1.07 -1.03 0.26 0.62 -0.09 0.08 1.05 -0.31
1.61 0.17 0.33 0.84 0.98 -1.53 0.03 -0.55 -0.22 -0.73 -0.54 -1.57 -0.72 -1.08 -0.78 -0.1 -1.25 -0.29 0.69 -0.3
0.83 0.39 0.65 0.57 0.84 -1.79 0.16 -0.35 -0.14 -0.29 -0.33 -0.98 -0.81 -0.81 -0.24 -0.01 -0.14 0.61 -0.13 -0.95
0.57 0.78 0.12 -0.01 0.02 -1.35 -0.02 -0.19 0.05 -0.03 0.51 -0.85 -0.11 -0.23 0.44 0.38 -0.3 -0.12 0.08 -2.1
0.74 1.7 1.56 1.17 0.54 -3.65 -0.82 -1.82 -4.05 -1.8 -3.01 -3.56 -2.85 -2.83 -3.19 -3.29 - 0.13 2.07 0.23
0.1 -0.5 0.37 0.19 0.0 -3.34 0.45 -0.54 -0.09 0.19 1.04 -1.49 -2.16 -2.46 0.94 1.02 0.56 -0.65 0.41 -1.46
0.2 0.19 0.17 -0.31 -0.16 -1.48 0.11 -0.55 0.08 0.21 0.49 -0.93 -0.71 -0.92 0.6 0.38 0.44 -0.09 0.41 0.07
0.69 0.95 0.68 0.15 0.83 -1.39 0.09 -0.53 -0.27 -0.46 -0.1 -1.16 -0.11 -0.33 -0.03 -0.56 -0.72 -0.33 0.03 0.11
1.48 1.52 1.57 0.34 1.01 -2.14 -0.47 -1.47 -2.76 -3.08 -4.27 -3.84 -3.23 -4.27 -3.35 -4.51 -5.09 0.26 1.58 0.92
0.47 0.08 0.22 0.86 0.49 -0.67 0.1 -0.2 -0.23 -0.42 0.32 -0.98 -1.16 -1.54 0.35 -0.33 -0.06 0.37 0.6 -0.7
-0.02 0.91 0.28 0.04 0.17 0.58 0.42 -0.15 -0.12 -0.22 -0.3 -0.72 -0.16 -0.4 -0.27 -0.38 -0.97 -0.18 0.38 -0.18
0.67 1.07 0.46 0.22 0.42 -2.51 -0.37 -0.16 0.33 -0.0 -0.52 -1.49 0.37 -0.12 -0.37 -0.07 -0.61 -0.32 0.46 -1.01
0.0 -0.26 -0.64 -0.21 0.46 -0.31 0.4 -0.24 -0.51 -0.27 0.97 -0.87 -1.61 -1.84 0.87 0.08 -0.45 0.51 1.01 -0.72
0.96 -0.92 -0.27 0.39 -0.22 -3.32 -0.64 -0.1 0.07 0.22 1.11 -1.5 -0.68 -0.53 0.78 0.2 -0.56 -0.87 -0.58 1.04
0.31 0.75 0.59 0.09 0.19 -0.23 -0.32 -0.06 -0.16 -0.25 0.16 -0.53 -0.7 -1.09 0.18 -0.54 -0.33 -0.12 0.91 -0.52
0.49 1.14 0.01 -0.14 0.56 -1.16 -0.05 -0.44 -0.04 -0.01 -0.04 -1.71 0.22 -0.19 0.03 -0.53 -1.83 0.0 0.82 -0.29
0.81 -0.71 0.16 -0.28 0.03 -1.7 -0.21 0.06 0.57 0.29 0.49 -1.18 -0.21 -0.65 0.51 0.27 -0.17 -0.25 -0.27 0.28
0.71 -0.54 -0.15 -0.02 -0.3 -2.8 0.19 -0.18 0.21 0.0 0.96 -0.47 -0.05 -0.32 0.95 0.61 0.05 -1.0 -0.24 -1.37
1.25 0.48 0.36 1.22 0.66 -0.41 0.27 -0.58 -1.13 -1.87 -0.77 -3.05 -0.73 -1.69 -1.17 -1.34 -1.98 0.22 1.61 -0.43
1.45 -0.04 0.18 0.98 1.05 -1.23 0.1 -0.52 -0.77 -1.08 -0.83 -2.57 -0.4 -0.69 -0.71 -1.48 -2.26 -0.24 1.44 -0.01
0.97 0.96 1.0 1.49 0.8 -0.85 -0.19 -1.31 -1.85 -1.54 -2.39 -2.64 -3.37 -3.65 -2.46 -1.72 -2.02 -0.09 1.97 -0.03
0.84 0.55 0.03 -0.4 0.08 -0.04 -0.1 -0.22 -0.17 -0.41 0.02 -1.03 0.04 -0.23 0.05 -0.72 -1.03 0.08 0.9 0.08
2.0 0.86 0.77 1.07 1.05 -1.82 -0.14 -1.28 -1.81 -2.29 -2.59 -3.28 -1.5 -1.79 -1.83 -2.79 -3.2 -0.09 0.91 0.96
0.87 0.43 0.03 0.32 0.47 -0.3 -0.56 0.05 -0.26 -0.3 -0.19 -0.71 -0.36 -0.72 -0.23 -0.47 -0.41 0.04 0.99 -0.34
-0.09 0.73 0.16 0.26 0.4 -1.65 0.59 -0.28 0.1 0.09 0.41 -0.72 -0.97 -1.52 0.62 0.03 -0.28 -0.17 0.04 -0.16
1.74 -1.62 -0.28 0.93 0.92 -2.04 0.78 -0.52 -0.83 -0.82 -0.63 -2.24 -4.02 -1.81 -0.17 -1.01 -1.9 -0.24 1.5 0.49
1.6 0.73 0.73 0.73 1.09 -0.67 -0.1 -0.71 -1.06 -1.03 -1.27 -2.36 -1.53 -1.61 -1.3 -1.23 -1.77 0.16 0.95 0.34
0.47 -0.16 0.23 0.12 0.44 -0.83 0.29 -0.06 -0.55 -0.47 0.38 -0.54 -0.76 -1.12 0.51 -0.48 -0.41 0.63 0.71 -0.27
0.76 1.06 0.45 0.26 0.08 -1.32 -0.29 -0.38 -0.18 0.03 0.44 -0.92 -0.96 -1.11 0.3 0.12 -0.55 -0.52 0.57 -0.55
0.79 0.49 0.24 0.37 0.09 -1.59 -0.41 -0.21 -0.1 -0.18 0.72 -0.85 -0.07 -0.32 0.57 0.12 -0.32 -0.4 -0.1 -0.85
0.35 0.47 0.16 0.3 -0.16 -0.84 -0.3 -0.15 -0.02 -0.24 0.53 -0.5 0.3 -0.06 0.59 0.32 -0.48 -0.52 -0.04 -0.99
0.68 -0.01 0.1 0.08 0.4 -0.17 -0.19 -0.1 -0.11 -0.19 0.65 -1.04 -0.08 -0.66 0.51 -0.13 -0.51 -0.05 -0.06 -0.22
2.59 1.38 0.92 0.74 0.67 -4.24 -2.3 -1.8 -4.3 -4.82 -3.54 -3.65 -3.77 -3.53 -2.43 -3.71 -2.69 -0.18 1.82 -1.29
-0.4 -0.25 -0.27 0.31 0.16 0.45 -0.52 0.03 -0.45 -0.55 -0.08 -0.53 0.49 0.33 0.04 -0.43 -0.28 0.49 0.5 -0.0
0.39 0.24 0.18 -0.46 0.36 0.01 -0.38 -0.03 -0.06 -0.06 0.24 -0.95 0.34 -0.02 0.25 -0.73 -0.96 0.23 0.59 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.