Heatmap: Cluster_476 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.06 0.02 0.03 0.01 0.04 0.01 0.08 0.02 0.05 0.05 0.81 0.18 0.57 0.05 0.66 0.69 0.54 1.0 0.88 0.89 0.79 0.16 0.26 0.14 0.43 0.25 0.28 0.27 0.25 0.33 0.31 0.26 0.31
0.09 0.07 0.12 0.09 0.11 0.07 0.17 0.08 0.06 0.05 0.66 0.12 0.43 0.11 0.37 0.53 0.67 0.65 0.88 0.74 1.0 0.16 0.18 0.1 0.45 0.31 0.36 0.3 0.29 0.32 0.35 0.27 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.83 0.05 0.4 0.04 0.06 0.49 0.67 0.67 1.0 0.62 0.84 0.05 0.1 0.12 0.24 0.19 0.26 0.17 0.2 0.18 0.16 0.17 0.23
0.11 0.1 0.08 0.09 0.13 0.19 0.11 0.18 0.21 0.18 0.83 0.18 0.41 0.16 0.46 0.85 0.47 0.83 1.0 0.87 0.96 0.1 0.38 0.17 0.34 0.27 0.34 0.19 0.24 0.26 0.21 0.2 0.26
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.57 0.25 0.12 0.13 0.12 0.1 0.18 0.59 0.76 0.6 1.0 0.02 0.25 0.07 0.3 0.1 0.09 0.03 0.02 0.04 0.01 0.02 0.04
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.13 0.01 0.01 0.01 0.69 0.17 0.44 0.11 0.34 0.92 0.42 0.53 1.0 0.74 0.93 0.1 0.21 0.08 0.26 0.22 0.24 0.08 0.06 0.1 0.09 0.14 0.08
0.1 0.07 0.07 0.04 0.08 0.07 0.05 0.11 0.1 0.09 0.78 0.08 0.61 0.06 0.36 0.64 0.67 0.75 1.0 0.94 0.85 0.07 0.13 0.11 0.55 0.22 0.29 0.15 0.24 0.3 0.23 0.24 0.27
0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.03 0.71 0.11 0.27 0.07 0.13 0.4 0.78 0.85 1.0 0.69 0.96 0.04 0.07 0.12 0.35 0.18 0.21 0.17 0.18 0.27 0.2 0.24 0.24
0.04 0.05 0.03 0.05 0.05 0.07 0.06 0.05 0.05 0.06 0.79 0.1 0.38 0.12 0.49 0.58 0.84 1.0 0.89 0.79 0.95 0.15 0.14 0.08 0.3 0.3 0.4 0.17 0.25 0.34 0.27 0.21 0.32
0.11 0.15 0.08 0.1 0.09 0.1 0.05 0.14 0.11 0.14 0.75 0.09 0.38 0.14 0.6 0.78 0.69 0.91 0.96 1.0 0.95 0.14 0.19 0.1 0.24 0.34 0.4 0.24 0.3 0.45 0.33 0.44 0.37
0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.66 0.13 0.06 0.61 0.98 0.64 0.71 0.8 0.67 0.14 0.1 0.02 0.89 0.16 0.24 0.19 0.21 0.24 0.16 0.19 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.02 0.47 0.03 0.04 0.29 0.55 0.83 1.0 0.72 0.94 0.01 0.04 0.02 0.37 0.18 0.22 0.13 0.16 0.23 0.14 0.15 0.26
0.1 0.07 0.12 0.09 0.1 0.1 0.08 0.14 0.1 0.12 0.83 0.15 0.73 0.13 0.44 0.83 0.43 0.9 0.99 0.88 1.0 0.15 0.39 0.2 0.35 0.24 0.27 0.11 0.13 0.17 0.15 0.16 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.13 0.51 0.19 0.1 0.72 0.48 0.72 0.91 0.75 0.73 0.34 0.39 0.31 0.53 0.32 0.42 0.06 0.11 0.17 0.06 0.11 0.21
0.1 0.13 0.08 0.07 0.09 0.12 0.08 0.1 0.1 0.13 0.87 0.14 0.78 0.14 0.45 0.93 0.64 0.83 1.0 0.92 0.91 0.14 0.21 0.12 0.42 0.3 0.37 0.17 0.2 0.28 0.19 0.19 0.27
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.76 0.13 0.52 0.09 0.52 0.8 0.72 0.88 1.0 0.91 0.92 0.11 0.14 0.08 0.4 0.25 0.3 0.25 0.31 0.39 0.3 0.29 0.4
0.06 0.08 0.04 0.04 0.04 0.06 0.02 0.03 0.03 0.1 0.84 0.06 0.48 0.06 0.09 0.52 1.0 0.86 0.95 0.82 0.97 0.04 0.14 0.03 0.48 0.3 0.41 0.19 0.21 0.31 0.21 0.27 0.26
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.97 0.13 0.71 0.08 0.36 0.89 0.56 1.0 0.98 0.87 0.88 0.07 0.11 0.08 0.72 0.25 0.33 0.32 0.3 0.4 0.31 0.31 0.27
0.05 0.05 0.02 0.03 0.02 0.02 0.13 0.01 0.01 0.02 0.69 0.13 0.68 0.11 0.44 0.74 0.88 0.86 1.0 0.84 0.9 0.15 0.27 0.17 0.54 0.33 0.42 0.33 0.37 0.46 0.37 0.39 0.43
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.82 0.13 0.09 0.11 0.2 0.67 0.32 0.9 1.0 0.93 0.98 0.06 0.07 0.04 0.08 0.13 0.15 0.05 0.08 0.14 0.06 0.09 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.07 0.54 0.24 0.06 0.34 0.08 0.33 0.21 1.0 0.76 0.78 0.77 0.11 0.09 0.19 0.06 0.11 0.13 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.44 0.25 0.06 0.31 0.09 0.33 0.24 0.56 0.82 1.0 0.82 0.14 0.13 0.24 0.05 0.08 0.09 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.06
0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.05 0.04 0.02 0.03 0.69 0.13 0.43 0.08 0.15 0.56 0.66 0.77 1.0 0.73 0.96 0.12 0.2 0.08 0.5 0.22 0.3 0.19 0.23 0.26 0.23 0.22 0.27
0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.05 0.05 0.14 0.88 0.17 0.4 0.12 0.3 0.59 0.45 0.95 1.0 0.7 0.92 0.12 0.1 0.12 0.51 0.23 0.23 0.3 0.25 0.28 0.27 0.27 0.31
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.43 0.06 0.24 0.03 0.35 0.48 0.45 0.71 1.0 0.84 0.89 0.06 0.08 0.05 0.25 0.15 0.17 0.1 0.14 0.15 0.13 0.14 0.13
0.15 0.14 0.17 0.1 0.11 0.14 0.15 0.12 0.11 0.15 0.82 0.16 0.64 0.2 0.28 0.85 0.6 1.0 0.86 0.67 0.82 0.19 0.23 0.28 0.41 0.27 0.27 0.25 0.32 0.34 0.31 0.28 0.33
0.06 0.07 0.02 0.02 0.02 0.04 0.06 0.03 0.02 0.03 0.88 0.16 0.75 0.15 0.16 0.77 0.81 0.91 1.0 0.73 0.94 0.18 0.22 0.17 0.42 0.2 0.29 0.19 0.24 0.3 0.2 0.24 0.28
0.04 0.04 0.04 0.04 0.05 0.04 0.07 0.06 0.09 0.07 0.9 0.2 0.7 0.23 0.5 0.89 0.45 0.8 1.0 0.86 0.98 0.21 0.28 0.15 0.5 0.27 0.28 0.12 0.14 0.17 0.13 0.13 0.17
0.11 0.14 0.09 0.08 0.09 0.1 0.07 0.08 0.08 0.12 0.83 0.15 0.49 0.16 0.21 0.61 0.71 0.89 1.0 0.81 0.99 0.13 0.18 0.11 0.44 0.32 0.41 0.22 0.23 0.33 0.25 0.29 0.37
0.18 0.15 0.15 0.11 0.16 0.14 0.21 0.15 0.12 0.16 0.86 0.29 0.56 0.3 0.43 0.9 0.52 0.83 1.0 0.9 0.95 0.27 0.35 0.32 0.53 0.34 0.33 0.26 0.24 0.26 0.28 0.26 0.3
0.09 0.07 0.04 0.04 0.05 0.09 0.22 0.08 0.07 0.09 0.87 0.21 0.58 0.29 0.62 1.0 0.39 0.79 0.82 0.66 0.77 0.16 0.26 0.34 0.31 0.24 0.27 0.1 0.11 0.13 0.14 0.16 0.13
0.03 0.02 0.04 0.05 0.07 0.07 0.04 0.17 0.12 0.15 0.69 0.14 0.2 0.15 0.29 0.46 0.26 1.0 0.85 0.64 0.92 0.08 0.06 0.09 0.19 0.2 0.24 0.07 0.09 0.08 0.07 0.08 0.1
0.03 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.8 0.07 0.36 0.09 0.08 0.38 0.57 0.89 0.93 0.73 1.0 0.08 0.12 0.09 0.39 0.14 0.18 0.2 0.22 0.23 0.2 0.27 0.23
0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.02 0.02 0.67 0.09 0.28 0.1 0.22 0.71 0.44 0.87 1.0 0.72 0.9 0.06 0.08 0.06 0.27 0.15 0.18 0.11 0.11 0.13 0.12 0.13 0.14
0.18 0.19 0.11 0.12 0.14 0.14 0.1 0.07 0.09 0.05 0.7 0.14 0.69 0.11 0.4 0.65 0.95 0.96 0.99 0.78 1.0 0.16 0.25 0.19 0.68 0.26 0.38 0.29 0.3 0.46 0.32 0.36 0.38
0.08 0.07 0.07 0.05 0.09 0.03 0.11 0.11 0.1 0.08 0.6 0.19 0.34 0.14 0.52 0.69 0.75 0.66 1.0 0.88 0.86 0.23 0.28 0.16 0.35 0.32 0.34 0.11 0.13 0.16 0.11 0.13 0.18
0.03 0.05 0.03 0.04 0.05 0.08 0.04 0.06 0.07 0.08 0.82 0.14 0.34 0.15 0.48 0.76 0.47 1.0 0.98 0.81 0.94 0.08 0.09 0.07 0.25 0.25 0.28 0.13 0.15 0.21 0.15 0.14 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.58 0.25 0.05 0.31 0.09 0.29 0.27 0.85 0.88 0.92 1.0 0.12 0.11 0.17 0.04 0.18 0.16 0.03 0.03 0.04 0.01 0.01 0.07
0.06 0.06 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.06 0.06 0.05 0.71 0.07 0.94 0.1 0.27 0.71 0.49 0.75 1.0 0.82 0.96 0.15 0.32 0.24 0.41 0.24 0.29 0.19 0.2 0.23 0.2 0.23 0.23
0.03 0.05 0.03 0.02 0.05 0.04 0.08 0.04 0.06 0.11 0.73 0.15 0.31 0.09 0.45 0.57 0.67 0.57 1.0 0.65 0.87 0.15 0.25 0.04 0.3 0.27 0.31 0.18 0.19 0.24 0.18 0.14 0.22
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.05 0.72 0.11 0.68 0.08 0.34 0.9 0.74 0.69 0.92 1.0 0.92 0.16 0.23 0.29 0.38 0.24 0.3 0.13 0.16 0.17 0.1 0.1 0.17
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.94 0.07 0.42 0.04 0.15 0.52 0.35 0.8 0.95 0.75 1.0 0.04 0.04 0.04 0.36 0.17 0.22 0.03 0.03 0.05 0.05 0.04 0.04
0.02 0.03 0.02 0.06 0.05 0.05 0.02 0.01 0.01 0.0 0.78 0.1 0.33 0.04 0.17 0.62 0.78 0.75 1.0 0.61 0.91 0.08 0.05 0.1 0.43 0.23 0.34 0.14 0.18 0.24 0.18 0.21 0.19
0.05 0.05 0.03 0.03 0.03 0.03 0.08 0.03 0.03 0.05 0.51 0.12 0.51 0.12 0.45 0.67 0.67 0.71 1.0 0.89 0.94 0.13 0.21 0.07 0.39 0.25 0.28 0.23 0.27 0.33 0.26 0.28 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.75 0.07 0.36 0.04 0.15 0.65 0.69 0.66 1.0 0.69 0.85 0.04 0.08 0.04 0.2 0.28 0.32 0.22 0.24 0.32 0.25 0.31 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.49 0.11 0.07 0.06 0.14 0.53 0.24 0.49 1.0 0.81 0.89 0.06 0.11 0.03 0.07 0.09 0.11 0.04 0.05 0.1 0.04 0.05 0.13
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.72 0.06 0.26 0.08 0.09 0.29 0.35 1.0 0.56 0.46 0.72 0.03 0.04 0.06 0.35 0.12 0.17 0.1 0.12 0.12 0.09 0.09 0.16
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.81 0.06 0.09 0.1 0.09 0.34 0.23 0.74 0.94 0.6 1.0 0.04 0.03 0.02 0.13 0.14 0.16 0.05 0.05 0.06 0.05 0.06 0.08
0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 1.0 0.08 0.5 0.1 0.08 0.43 0.83 0.75 0.86 0.52 0.78 0.05 0.1 0.06 0.4 0.35 0.44 0.18 0.19 0.24 0.18 0.16 0.23
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.56 0.0 0.12 0.62 0.47 0.89 0.97 0.77 0.97 0.03 0.1 0.08 0.5 0.28 0.34 0.12 0.17 0.24 0.2 0.16 0.17
0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.12 0.01 0.01 0.01 0.92 0.25 0.4 0.18 0.74 0.95 0.51 0.78 0.95 1.0 1.0 0.13 0.27 0.11 0.46 0.26 0.29 0.16 0.22 0.27 0.25 0.25 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.09 0.48 0.07 0.17 0.61 0.6 0.72 1.0 0.74 0.89 0.04 0.06 0.05 0.62 0.1 0.12 0.12 0.13 0.27 0.15 0.23 0.17
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.99 0.03 0.41 0.03 0.1 0.49 0.99 1.0 0.87 0.61 0.86 0.04 0.1 0.14 0.31 0.22 0.32 0.2 0.23 0.22 0.22 0.2 0.3
0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.85 0.18 0.16 0.06 0.43 0.69 0.5 0.74 1.0 0.77 0.82 0.09 0.17 0.08 0.29 0.26 0.25 0.3 0.26 0.33 0.32 0.33 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.01 0.1 0.01 0.41 0.61 0.31 0.9 0.96 0.79 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.04 0.05 0.93 0.12 0.25 0.12 0.22 0.73 0.39 0.94 1.0 0.81 0.97 0.1 0.12 0.03 0.26 0.16 0.2 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.04
0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.15 0.01 0.0 0.0 0.65 0.06 0.57 0.03 0.36 0.77 0.76 0.71 1.0 0.87 0.97 0.08 0.22 0.13 0.44 0.21 0.26 0.16 0.17 0.23 0.21 0.22 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.83 0.11 0.31 0.27 0.48 0.86 0.7 0.8 0.94 0.91 1.0 0.1 0.14 0.05 0.29 0.26 0.35 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01
0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.09 0.0 0.0 0.03 0.78 0.23 0.51 0.24 0.14 0.54 0.86 0.56 1.0 0.79 0.86 0.2 0.17 0.09 0.52 0.28 0.35 0.34 0.38 0.45 0.31 0.33 0.37
0.22 0.23 0.16 0.19 0.18 0.24 0.18 0.18 0.18 0.27 0.82 0.24 0.58 0.28 0.47 0.79 0.44 0.9 1.0 0.77 0.97 0.21 0.32 0.3 0.38 0.28 0.3 0.2 0.22 0.23 0.19 0.18 0.24
0.08 0.07 0.1 0.06 0.09 0.05 0.09 0.14 0.08 0.07 0.66 0.13 0.75 0.14 0.26 0.81 0.41 0.67 1.0 0.61 0.8 0.15 0.19 0.18 0.36 0.2 0.22 0.15 0.16 0.21 0.19 0.17 0.18
0.08 0.13 0.04 0.03 0.05 0.09 0.08 0.03 0.05 0.1 0.77 0.18 0.42 0.14 0.14 0.59 0.66 0.91 1.0 0.7 0.98 0.16 0.16 0.06 0.49 0.36 0.42 0.25 0.28 0.3 0.29 0.27 0.25
0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.95 0.06 0.12 0.04 0.15 0.42 0.34 0.84 1.0 0.74 0.98 0.03 0.03 0.02 0.11 0.16 0.19 0.07 0.08 0.11 0.06 0.09 0.13
0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.06 0.01 0.0 0.01 0.93 0.14 0.6 0.12 0.31 0.93 0.5 0.82 1.0 0.9 0.85 0.11 0.14 0.06 0.4 0.17 0.21 0.15 0.14 0.19 0.15 0.17 0.23
0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.06 0.02 0.02 0.01 0.82 0.1 0.36 0.1 0.44 0.78 0.83 0.68 0.99 1.0 1.0 0.08 0.22 0.11 0.31 0.41 0.48 0.41 0.55 0.52 0.41 0.49 0.43
0.03 0.04 0.03 0.06 0.03 0.05 0.11 0.07 0.01 0.02 1.0 0.12 0.58 0.12 0.23 0.7 0.67 0.99 0.98 0.84 0.86 0.1 0.12 0.17 0.64 0.23 0.31 0.27 0.25 0.31 0.28 0.25 0.39
0.07 0.07 0.09 0.05 0.07 0.03 0.13 0.05 0.08 0.02 0.72 0.15 0.51 0.22 0.39 0.77 0.64 0.81 0.82 0.69 1.0 0.2 0.2 0.25 0.38 0.25 0.23 0.25 0.35 0.27 0.26 0.22 0.32
0.06 0.07 0.04 0.03 0.05 0.05 0.25 0.03 0.05 0.07 0.68 0.32 0.47 0.26 0.61 0.81 0.46 0.66 1.0 0.87 0.87 0.22 0.4 0.21 0.36 0.3 0.29 0.11 0.09 0.12 0.15 0.14 0.15
0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.02 0.01 0.98 0.11 0.39 0.08 0.24 0.58 0.47 0.68 0.86 1.0 0.97 0.08 0.19 0.13 0.36 0.17 0.19 0.18 0.2 0.23 0.15 0.14 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.76 0.07 0.24 0.07 0.14 0.56 0.41 0.71 0.82 1.0 0.89 0.05 0.12 0.05 0.38 0.19 0.25 0.19 0.17 0.22 0.2 0.22 0.23
0.09 0.08 0.07 0.07 0.06 0.08 0.13 0.09 0.07 0.11 0.82 0.2 0.55 0.22 0.36 0.77 0.69 0.88 1.0 0.83 0.95 0.18 0.24 0.09 0.38 0.42 0.46 0.27 0.32 0.37 0.34 0.35 0.36
0.09 0.1 0.03 0.03 0.03 0.02 0.08 0.01 0.02 0.04 1.0 0.14 0.43 0.16 0.13 0.58 0.43 0.95 0.9 0.62 0.87 0.11 0.12 0.11 0.41 0.24 0.28 0.21 0.19 0.32 0.24 0.24 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)