Heatmap: Cluster_268 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.05 0.04 0.06 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.0 0.05 0.29 0.09 0.0 0.0 0.2 0.19 0.05 0.35 0.02 0.31 0.22 0.21 0.27 0.27 0.0 0.23 0.15
0.52 0.0 0.0 0.35 0.16 0.0 0.1 0.12 0.11 0.06 0.0 0.03 0.07 0.1 0.18 0.37 0.12 0.05 0.32 0.0
1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.58 4.9 0.88 7.75 2.44 3.14 2.22 6.05 6.12 7.37 2.67 1.88 15.65 11.03 2.85 5.99 1.94 1.99 6.37 1.71
1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.11 0.05 0.16 0.0 0.0 0.07 0.12 0.13 0.05 0.14 0.01 0.04 0.07 0.14 0.61 0.18 0.04 0.26 0.06
0.63 0.16 0.29 0.69 0.15 0.0 0.22 0.28 0.02 0.04 0.0 0.04 0.5 0.43 0.0 0.11 0.4 0.0 0.43 0.13
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.33 0.24 0.18 0.22 0.12 0.07 0.13 0.21 0.24 0.16 0.25 0.05 0.15 0.15 0.11 0.64 0.19 0.02 0.24 0.03
0.39 0.0 0.05 0.88 0.07 0.0 0.0 0.08 0.18 0.02 0.03 0.0 0.03 0.25 0.19 0.8 0.0 0.0 0.17 0.12
0.94 0.37 0.0 0.54 0.06 0.0 0.13 0.18 0.2 0.19 0.21 0.06 0.18 0.04 0.35 0.16 0.18 0.1 0.47 0.24
0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.25 0.66 0.13 0.0 0.38 0.38 0.58 0.73 0.73 0.0 0.18 0.35
0.62 0.0 0.0 0.65 0.1 0.0 0.0 0.06 0.13 0.06 0.1 0.0 0.04 0.07 0.0 0.48 0.21 0.09 0.04 0.28
0.09 0.0 0.02 0.11 0.02 0.0 0.0 0.05 0.04 0.07 0.02 0.01 0.01 0.0 0.04 0.1 0.02 0.06 0.15 0.05
3.8 0.0 0.39 2.27 0.17 1.42 0.0 0.42 0.4 0.15 0.2 0.08 1.85 0.6 1.54 0.43 1.52 1.35 0.19 1.47
0.66 0.47 0.2 1.52 0.12 0.0 0.23 0.28 0.13 0.0 0.11 0.01 0.73 0.43 0.07 0.01 0.09 0.03 0.67 0.04
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07
0.23 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.05 0.06 0.07 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01 0.07 0.13 0.0 0.0 0.11 0.0
1.68 0.0 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0
0.48 0.26 0.0 0.75 0.0 0.0 0.21 0.31 0.17 0.26 0.0 0.0 0.15 0.04 0.63 0.56 0.49 0.22 0.48 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.11 0.14 0.03 0.04 0.02 0.05 0.1 0.16 0.06 0.06 0.12 0.25 0.02
0.34 0.0 0.0 0.27 0.09 0.14 0.07 0.24 0.23 0.21 0.24 0.01 0.53 0.47 0.22 0.54 0.17 0.04 0.35 0.0
0.05 0.0 0.0 0.1 0.06 0.01 0.0 0.03 0.04 0.05 0.04 0.0 0.08 0.03 0.1 0.09 0.02 0.01 0.05 0.0
0.49 0.66 0.08 0.68 0.13 0.05 0.05 0.22 0.07 0.26 0.2 0.06 0.19 0.0 0.22 0.23 0.1 0.07 0.33 0.0
1.69 0.93 0.86 2.36 1.83 0.13 0.36 0.78 1.31 1.65 0.79 0.35 0.33 0.53 1.46 2.43 1.37 0.37 0.74 0.83
0.18 0.0 0.1 0.33 0.32 0.0 0.2 0.12 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.09 0.12 0.0 0.05 0.24 0.04
0.75 0.0 0.28 2.89 0.0 0.0 0.28 0.13 0.38 0.15 0.22 0.04 0.0 0.24 0.52 0.19 0.71 0.8 0.31 0.0
0.11 0.0 0.17 0.55 0.12 0.21 0.07 0.51 0.46 0.52 0.27 0.0 1.06 0.52 0.15 0.41 0.38 0.1 0.49 0.45
0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.44 0.08 0.25 0.04 0.09 0.11 0.08 0.01 0.0 0.0 0.02 0.06 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.26 0.07
0.32 0.0 0.03 0.35 0.09 0.06 0.06 0.13 0.09 0.12 0.05 0.03 0.17 0.19 0.03 0.48 0.12 0.03 0.15 0.1
0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.11 0.04 0.02 0.02 0.09 0.0 0.01 0.05 0.05 0.18 0.0 0.03 0.17 0.03
11.91 0.0 0.0 0.0 2.84 0.0 3.31 2.11 1.7 4.35 4.97 0.65 1.98 1.94 6.75 17.57 0.0 0.0 0.0 4.47
0.25 0.0 0.11 0.53 0.23 0.0 0.3 0.15 0.14 0.22 0.16 0.06 0.07 0.06 0.34 0.15 0.0 0.05 0.4 0.18
0.11 0.0 0.34 1.1 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.55 0.0 0.11 0.23 0.0
27.25 20.34 6.54 20.72 8.47 0.0 12.62 10.61 2.59 4.12 4.4 0.7 12.01 7.64 7.32 25.83 20.76 4.09 10.15 10.03
1.96 0.0 0.37 0.57 0.19 0.0 0.0 0.81 0.57 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.06 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0
0.21 0.0 0.0 0.11 0.04 0.0 0.04 0.01 0.02 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.08 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.04 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.09 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 0.0 0.07 0.0 0.1 0.04 0.0 0.2 0.1 0.0 0.07 0.0
0.71 0.0 0.0 1.1 0.11 0.0 0.0 0.18 0.25 0.32 0.0 0.0 0.26 0.29 0.29 0.37 0.0 0.11 0.25 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.41 0.76 0.35 0.0 0.11 0.0 0.21 0.05 0.07 0.0 0.22 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.03
0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.84 0.23 0.05 0.33 0.53 0.0 0.19 0.25 0.21 0.35 0.68 0.04 0.15 0.11 0.33 0.25 0.14 0.0 0.55 0.14
0.19 0.04 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.0 0.07 0.09 0.12 0.08 0.08 0.02 0.14 0.02
0.31 0.09 0.33 1.18 0.25 0.2 0.12 0.23 0.22 0.14 0.19 0.0 0.26 0.18 0.25 0.18 0.33 0.04 0.07 0.25
0.49 0.0 0.14 0.0 0.07 0.08 0.24 0.28 0.11 0.04 0.07 0.03 0.13 0.23 0.06 0.68 0.17 0.12 0.31 0.34

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)