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Heatmap: Cluster_350 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.34 -0.08 -0.02 -0.08 0.04 -0.63 -0.47 0.13 0.14 0.08 0.48 -0.52 0.07 -0.19 0.44 -0.04 -0.29 -0.2 0.39 -0.22
0.11 0.73 0.04 -0.61 0.38 -0.71 -0.3 -0.33 0.14 0.12 0.39 -0.71 0.27 -0.14 0.46 -0.41 -0.79 -0.04 0.34 -0.18
-0.17 0.04 -0.45 -0.83 0.42 -0.9 -0.09 -0.23 0.23 0.28 0.28 -1.36 0.43 0.21 0.35 -0.01 -0.67 0.29 -0.03 0.62
-0.28 0.01 -1.31 -1.42 0.66 -0.2 0.07 -0.27 0.26 0.44 0.44 -1.48 -0.59 -0.63 0.72 -0.06 -0.75 0.54 1.03 -0.37
-0.86 -0.24 -1.29 0.21 1.04 -0.69 -0.64 0.05 0.08 0.16 -0.16 -0.01 0.34 0.39 -0.22 -0.19 -0.69 0.22 1.01 -0.99
0.69 -0.1 0.63 0.23 0.22 -1.3 0.19 0.02 0.07 0.02 0.61 -0.72 -1.47 -1.54 0.63 0.01 -0.27 -0.33 0.54 -1.06
0.46 -0.04 0.04 0.36 0.2 -1.64 -1.31 0.15 0.34 -0.09 0.62 -0.7 -0.27 -0.25 0.49 0.01 -0.35 0.29 0.29 -0.54
0.63 -0.4 0.33 0.06 0.34 -0.49 -0.62 -0.02 0.13 -0.05 0.41 -0.33 -0.58 -0.52 0.35 0.13 0.18 -0.18 -0.45 0.16
-1.0 -0.41 -1.32 -1.01 1.11 -1.36 -0.31 0.16 0.6 0.54 0.2 -2.19 0.24 0.23 0.2 -0.87 -1.32 0.58 0.97 0.19
-0.31 0.25 -0.41 -0.57 0.09 0.26 -0.25 -0.29 -0.16 0.05 0.39 -1.07 -0.17 -0.38 0.51 -0.31 -0.0 0.59 0.31 0.39
-0.56 -0.76 -1.23 -0.69 -0.09 -0.01 -0.37 -0.35 -0.22 0.02 0.9 -1.36 0.46 0.38 0.95 -0.51 -0.2 0.46 0.25 0.39
0.34 -0.15 0.49 0.04 0.01 -0.56 -1.33 0.13 0.04 -0.13 0.47 -0.0 -0.01 -0.07 0.54 0.17 -0.18 -0.13 0.19 -1.14
0.82 -0.42 0.2 0.46 -0.83 -0.99 -1.36 -0.19 0.0 0.33 1.14 -1.02 0.15 -0.13 1.05 0.04 -0.24 -0.26 -1.38 -1.01
0.04 0.19 -0.09 -0.12 0.29 0.08 0.19 -0.25 -0.24 -0.24 0.66 -0.57 -0.27 -0.39 0.49 -0.26 -0.48 0.04 0.04 0.21
-0.25 -0.05 -0.39 -0.78 0.16 -0.15 -0.25 -0.1 -0.06 0.04 0.52 -0.99 0.35 -0.02 0.46 0.05 -0.4 0.23 0.36 0.33
0.03 -0.44 -0.69 -0.25 0.46 -0.83 0.31 0.27 -0.13 -0.04 0.76 -0.63 -0.51 -0.67 0.88 -0.41 -0.24 0.4 0.52 -0.65
0.87 -0.55 0.34 0.56 0.04 -0.5 -1.17 0.15 -0.01 0.02 0.63 -0.68 0.04 -0.11 0.56 -0.39 -0.28 -0.13 -0.37 -0.76
0.55 0.43 -1.57 0.45 0.62 -0.61 0.7 -0.31 0.64 0.28 -0.72 -1.41 -2.28 -2.05 -0.79 0.64 -0.46 0.4 0.76 -0.34
0.75 -0.04 -0.21 0.62 0.32 -1.22 -0.89 -0.34 0.18 -0.45 0.51 -0.93 -0.33 0.1 0.12 0.42 0.28 0.1 -0.61 -0.16
0.8 0.0 0.42 0.06 0.58 -1.65 -0.78 -0.21 0.06 -0.12 0.05 -1.52 -0.14 -0.09 -0.13 0.7 -0.07 0.27 -0.22 -0.21
0.93 0.35 0.29 0.05 0.0 -1.39 -1.3 0.27 0.23 0.26 0.3 -0.75 0.57 0.32 0.16 0.16 -0.24 -0.53 -0.59 -2.28
1.59 -1.1 0.15 0.81 -0.6 -1.32 -0.93 0.1 -0.08 -0.2 0.78 -0.88 -0.27 -0.9 0.48 0.66 0.29 -1.25 -0.87 -1.35
-0.46 0.59 -1.75 -1.04 0.62 -0.48 -0.15 -0.21 -0.31 0.2 0.79 -1.31 -1.1 -1.1 1.24 0.48 -1.14 0.46 0.81 -0.7
0.64 0.23 -0.37 0.23 -0.07 -2.5 -0.03 -0.2 0.16 0.41 0.68 -1.08 -0.7 -0.91 0.52 -0.29 -0.55 -0.28 0.32 0.75
0.5 -0.04 -0.34 -0.11 0.29 -1.27 -0.31 -0.33 -0.3 -0.16 1.17 -1.44 0.1 -0.38 1.17 -0.33 -0.25 -0.38 0.3 -0.72
0.24 0.16 -0.13 0.1 0.42 -0.09 -0.69 -0.13 -0.39 -0.38 0.29 -1.05 0.31 0.17 0.24 -0.21 -0.88 0.33 0.53 0.02
0.28 0.78 0.46 0.03 0.22 -0.01 -0.86 -0.2 -0.42 -0.4 -0.28 -0.74 -0.01 -0.21 -0.2 -0.13 -0.97 0.39 0.94 -0.34
0.6 -0.64 -0.01 0.47 -0.23 -0.53 -1.77 0.0 -0.02 -0.05 0.9 -0.81 0.15 -0.2 0.74 0.63 0.43 -0.71 -1.23 -0.62
1.05 -0.04 0.41 0.87 0.12 -1.37 -0.78 -0.06 0.1 0.16 -0.05 -1.02 0.23 -0.05 0.05 -0.08 -0.56 -0.12 -0.04 -1.17
0.97 0.11 0.14 0.3 0.31 -1.07 0.31 -0.13 0.45 0.0 0.4 -0.89 -0.69 -0.66 0.31 0.66 -0.46 -0.12 -1.92 -0.87
0.96 0.46 0.3 0.57 0.37 -0.8 0.02 -0.08 0.26 -0.19 0.17 -0.96 -0.48 -0.7 0.18 0.44 -0.77 -0.01 -0.87 -1.06
-0.31 -0.72 -0.43 -0.89 0.15 -1.56 -0.81 -0.1 0.33 0.3 0.82 -0.47 0.26 0.36 0.59 0.31 -0.12 -0.02 -0.35 0.55
0.77 0.31 0.37 0.35 -0.14 -1.61 -0.65 -0.12 -0.08 -0.09 0.69 -0.49 0.12 -0.08 0.7 -0.05 -0.53 -0.42 0.1 -1.43
0.08 0.46 0.44 0.87 0.64 -1.1 -0.58 -0.25 -0.1 -0.44 -0.47 -0.45 -1.02 -0.76 -0.84 0.21 0.22 0.48 0.58 -0.2
0.34 0.62 0.44 -0.29 0.1 -0.62 -1.48 -0.09 0.01 -0.06 0.72 -0.63 -0.12 -0.44 0.57 -0.0 -0.01 0.08 -0.02 -0.82
-0.23 -0.6 -0.96 0.31 0.16 -1.64 -1.8 -0.05 -0.26 0.07 1.15 -0.42 0.01 -0.09 1.17 -0.38 -0.65 -0.31 -0.24 0.96
-0.42 0.41 -0.29 -0.12 0.0 -1.04 0.41 -0.03 0.56 0.32 0.73 -1.95 -0.25 -0.58 0.61 -0.12 -0.24 -0.1 0.59 -0.98
-1.66 -0.38 -0.75 -1.88 -0.68 -0.48 0.64 -0.62 -0.21 0.01 1.14 -1.72 -2.85 -3.45 1.39 -0.24 -0.45 0.22 0.73 1.51
0.16 -0.51 -0.06 -0.12 -0.35 -1.07 -0.9 0.18 0.36 -0.02 0.64 -0.41 0.51 0.71 0.46 0.28 0.26 -0.52 -1.01 -0.41
0.4 0.71 -0.06 0.21 0.07 -0.22 -0.62 0.06 -0.27 -0.45 0.71 -0.82 -0.34 -0.61 0.75 -0.44 -1.04 -0.24 0.47 -0.04
0.45 -0.62 -0.27 -0.22 0.39 -1.96 1.14 -0.03 -0.02 0.28 0.73 -2.34 -0.87 -1.15 0.93 -1.42 -1.92 0.59 0.68 -0.26
-0.45 0.07 -0.18 -0.98 -0.04 -0.13 0.22 0.01 0.45 0.52 0.05 -0.11 -0.26 -0.3 0.06 -0.08 -0.01 0.05 0.31 0.14
0.08 -0.38 -0.16 -0.18 -0.0 0.19 -0.77 0.14 0.16 -0.16 0.28 -0.25 -0.06 -0.17 0.16 0.27 0.04 0.17 0.45 -0.3
0.4 0.1 -0.04 0.11 0.27 -0.36 -0.66 -0.1 -0.1 -0.15 0.99 -0.69 -0.26 -0.47 0.89 -0.22 -0.44 -0.34 0.46 -1.32
0.35 -0.75 -0.16 0.25 0.03 -1.35 -1.03 0.04 0.44 0.16 0.66 -0.71 0.23 -0.02 0.5 0.05 -0.24 0.01 0.25 -0.31
0.34 0.72 0.75 0.8 0.4 -1.15 -1.38 -0.12 -0.06 -0.32 -0.02 -0.84 -1.17 -0.98 0.12 0.18 0.21 0.33 0.07 -0.64
0.37 0.36 0.22 -0.24 0.19 -1.16 -0.89 -0.08 0.49 0.4 0.66 -1.09 0.28 -0.13 0.55 -0.5 -0.9 0.24 -0.2 -0.59
0.43 -0.35 -0.05 -0.06 0.17 0.04 -0.57 0.15 -0.33 -0.61 0.41 -0.32 0.02 -0.49 0.33 -0.16 -0.01 0.29 0.63 -0.39
0.35 0.01 -0.21 0.69 0.25 -1.11 -1.07 -0.07 -0.11 -0.12 0.72 -0.74 0.13 0.13 0.61 -0.3 -0.54 -0.21 0.28 -0.41
0.29 0.18 -0.18 0.32 0.11 -0.91 -0.95 0.16 0.18 -0.03 0.56 -0.58 0.07 -0.09 0.53 0.25 -0.57 0.15 0.04 -0.8
0.02 -0.86 0.03 0.5 -0.13 -0.84 -0.82 0.13 0.24 0.06 0.77 -0.5 0.13 0.04 0.67 0.14 -0.02 -0.43 -0.37 -0.13
0.58 -0.05 0.32 -0.07 0.15 -0.38 -0.11 0.01 0.08 0.01 0.41 -0.57 -0.9 -1.01 0.47 -0.15 0.05 -0.06 0.34 -0.18
0.49 -0.02 0.17 1.07 0.23 -0.63 -1.25 0.19 0.38 -0.34 0.27 -0.3 -0.8 -0.65 0.31 -0.03 -0.58 0.04 0.05 -0.42
0.65 -0.65 -0.68 0.15 0.05 -0.67 -0.83 0.17 -0.19 -0.14 0.97 -0.39 -0.57 -1.15 1.06 -0.1 -0.14 -0.3 0.66 -0.42
-0.61 -0.51 -0.07 -0.87 -0.01 0.32 0.4 -0.03 -0.32 -0.03 0.8 -0.41 -0.75 -1.07 0.7 -0.19 0.45 -0.37 0.18 0.57
0.56 0.65 0.85 0.89 -0.09 -1.62 -1.52 -0.2 0.37 -0.08 -0.35 -1.33 -0.32 -0.25 -0.51 1.28 -0.01 -0.14 -1.04 -2.19
0.47 -1.13 -0.46 0.45 0.67 -0.15 -1.11 0.33 0.2 -0.13 0.26 -0.85 -0.7 -0.9 0.13 0.08 -0.34 0.45 1.01 -0.85
0.11 -0.15 -0.23 -1.08 -0.36 -0.36 -0.56 -0.21 -0.0 0.07 0.67 -1.36 -0.09 -0.44 0.81 0.11 -0.57 0.42 0.25 0.88
0.03 -0.8 -1.09 -0.34 0.17 -0.77 0.67 -0.21 0.43 0.42 0.47 -1.67 -0.04 0.11 0.59 -0.38 -0.83 0.16 0.16 0.56
0.2 -0.68 -0.18 -0.07 -0.23 -0.36 -0.22 0.12 0.15 -0.09 0.96 -0.37 -0.65 -0.65 0.77 0.31 0.15 0.08 -0.36 -0.17
0.84 0.11 0.61 0.21 0.29 -1.48 -1.28 -0.15 0.32 0.04 -0.51 -0.61 -0.82 -1.14 -0.21 1.4 0.67 -0.02 -1.07 -1.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.