Heatmap: Cluster_397 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-6.34 -6.83 -5.63 - -4.32 - 0.1 -1.87 -4.18 - -1.93 0.05 -1.4 -0.06 -1.06 -0.85 1.32 -0.69 -0.14 0.16 0.12 -0.55 -0.73 -1.01 -0.8 -0.22 0.31 1.17 1.55 1.86 1.4 1.28 1.72
-2.19 -2.34 -2.78 -2.56 -2.34 -2.36 0.37 -2.85 -3.18 -3.64 -0.55 0.33 0.09 0.2 0.21 -0.09 0.58 -0.1 -0.33 -0.21 -0.3 0.38 -0.08 0.32 -0.46 0.04 0.36 0.96 1.28 1.27 0.98 0.64 1.19
-5.44 -5.5 -5.96 -8.22 -6.25 -5.68 -0.29 -6.32 -5.91 -8.14 -0.75 0.33 0.14 0.12 -0.52 -0.51 0.4 -0.73 -0.34 -0.16 -0.15 0.22 0.77 0.05 -0.66 0.23 0.4 1.24 1.53 1.48 1.18 1.02 1.45
-3.41 -3.92 -4.6 -4.85 -4.86 -4.6 -0.05 -5.07 -5.75 -4.72 -0.48 0.31 0.53 0.22 -0.4 -0.15 0.34 -0.71 -0.14 -0.14 -0.12 0.46 0.58 0.09 -0.14 0.36 0.58 0.79 1.54 1.38 0.88 0.64 1.36
-4.16 -4.95 -8.44 -7.08 -7.07 - 0.45 -6.09 - -7.31 -0.51 0.61 -0.03 0.36 0.04 -0.49 0.46 -0.62 0.02 0.09 -0.38 0.31 0.7 0.02 -0.49 0.35 0.5 0.99 1.43 1.3 0.91 0.52 1.41
-2.57 -3.02 -3.53 -3.38 -3.32 -5.34 -0.05 -3.67 -5.46 -4.51 -0.52 0.03 -0.62 0.32 -1.38 -0.61 0.38 0.2 -0.19 -0.26 -0.18 0.35 0.38 -0.64 -0.3 0.4 0.74 1.09 1.51 1.56 1.03 0.67 1.59
-4.11 -4.72 -5.58 -5.38 -5.63 -5.46 0.51 -5.6 -5.83 -6.06 -0.67 0.58 0.2 0.44 0.11 -0.27 0.42 -0.48 -0.3 0.02 -0.27 0.51 0.54 -0.35 -0.34 0.29 0.46 0.96 1.25 1.3 0.88 0.75 1.45
-1.72 -1.63 -1.59 -1.83 -1.91 -1.81 -0.09 -2.05 -2.36 -3.39 -0.79 -0.05 -0.11 -0.46 -0.57 -0.64 0.69 -0.67 -0.73 -0.54 -0.59 0.44 0.12 -0.14 -0.26 0.0 0.3 1.18 1.3 1.51 1.35 1.08 1.25
-5.82 -5.21 -4.43 -6.68 -5.43 -5.56 0.03 -5.75 -6.61 -4.38 -0.73 0.15 -0.14 0.14 -0.06 -0.46 0.53 -1.25 -0.05 0.0 0.1 -0.07 0.09 -0.1 -0.99 0.24 0.54 1.13 1.57 1.53 1.3 0.91 1.58
-2.64 -4.46 -4.12 -3.84 -4.65 -4.57 0.33 -4.26 -5.15 -3.69 -0.67 0.34 -0.07 0.07 -0.65 -0.45 0.56 -0.58 -0.15 -0.42 -0.25 0.12 0.15 0.54 0.19 0.41 0.56 1.19 1.46 1.21 0.95 0.88 1.36
-1.85 -2.08 -2.35 -2.4 -2.19 -2.17 0.44 -2.19 -2.93 -2.51 -0.46 0.23 0.07 0.3 -0.28 -0.55 0.51 -0.28 -0.32 -0.48 -0.16 0.35 0.14 0.8 0.2 0.11 0.25 1.07 1.26 1.12 0.78 0.53 1.05
-2.14 -2.28 -2.24 -2.32 -1.99 -2.0 0.16 -2.38 -2.74 -2.65 -0.39 0.03 0.13 0.15 -0.07 -0.03 0.41 -0.02 0.03 -0.1 -0.1 0.21 0.2 0.18 -0.12 0.06 0.24 1.15 1.05 0.97 1.1 0.89 1.06
-0.86 -1.32 -1.34 -1.82 -1.58 -1.99 0.23 -1.5 -1.67 -1.63 -0.63 0.31 -0.09 0.2 -0.46 -0.47 0.38 -0.25 -0.56 -0.08 -0.28 0.46 0.59 -0.07 -0.06 -0.0 0.14 0.86 1.15 1.17 0.87 0.71 0.98
-2.02 -2.34 -2.51 -2.44 -2.46 -2.28 -0.07 -2.69 -2.42 -2.3 -0.56 0.23 0.04 -0.0 -0.41 -1.01 0.64 -0.32 -0.43 -0.59 -0.41 0.29 0.28 0.19 -0.05 0.04 0.26 1.05 1.6 1.46 1.09 0.67 1.21
-3.94 -2.55 -3.65 -3.52 -3.9 -2.87 0.09 -5.08 -4.05 -2.94 -0.47 -0.04 -0.29 0.66 0.13 -0.49 0.69 -0.09 -0.43 -1.0 -0.34 0.29 0.32 -0.22 -0.41 0.01 0.34 1.12 1.33 1.55 1.04 0.87 1.46
-1.4 -1.29 -1.38 -1.06 -1.06 -0.97 -0.04 -1.43 -1.58 -1.31 -0.37 0.16 -0.03 0.32 -0.21 -0.06 0.29 0.06 -0.09 0.11 -0.01 0.3 0.17 0.13 0.08 0.22 0.38 0.63 0.89 0.96 0.72 0.42 0.81
-3.05 -3.29 -3.29 -5.35 -3.66 -3.14 -0.1 -3.86 -5.19 -2.45 -1.01 0.45 -0.34 0.24 -1.52 -0.02 0.51 -0.74 -0.43 -0.38 -0.56 0.31 0.64 -0.36 -0.59 0.11 0.4 1.03 1.58 1.77 1.07 0.83 1.54
-6.51 -6.43 -7.3 -5.76 -7.14 -7.54 -0.31 -6.34 - -9.95 -0.59 -0.04 -0.41 0.33 -0.41 -0.64 0.66 -0.42 0.19 -0.47 -0.23 0.03 -0.35 -0.81 -0.51 0.28 0.71 1.49 1.53 1.55 1.48 1.27 1.2
-5.25 -7.0 -9.57 - -8.9 - 0.02 -7.31 - -6.86 -0.57 0.31 0.22 0.08 0.12 -0.28 0.45 -0.06 0.12 0.05 0.13 0.38 0.3 -0.33 -0.47 -0.09 0.51 1.33 1.35 1.24 1.23 1.03 1.1
-3.47 -3.68 -4.86 -5.3 -4.42 -5.47 -0.11 -5.66 -6.16 -5.48 -0.35 -0.58 0.28 -0.14 -0.12 -0.23 0.58 -0.24 -0.5 -0.36 0.03 0.02 0.14 0.18 -0.21 0.34 0.6 1.13 1.33 1.35 1.19 1.36 1.34
-2.42 -2.3 -2.42 -2.53 -2.55 -2.68 -0.14 -3.07 -3.92 -2.64 -0.3 0.02 0.05 0.16 -0.32 0.16 0.96 -0.22 -0.15 -0.01 0.1 0.08 0.19 0.26 -0.02 0.11 0.27 0.88 1.19 1.23 0.86 0.79 1.21
-4.37 -5.49 -5.97 -6.76 -6.7 - -0.15 -5.83 -5.84 - -0.3 -0.23 -0.83 0.01 -0.24 -0.5 0.51 -0.73 0.4 -0.34 -0.25 -0.12 0.71 -1.25 -0.73 0.37 0.76 1.32 1.57 1.44 1.19 1.05 1.62
-3.97 -3.18 -5.22 -4.56 -4.96 -3.88 0.29 -6.6 -5.28 -5.57 -0.43 0.26 -0.15 0.27 -0.09 -0.18 0.49 0.27 -0.27 0.32 0.25 0.08 -0.65 0.06 -0.47 0.06 0.4 1.06 1.31 1.41 1.11 0.81 1.42
-2.95 -2.91 -3.95 -3.75 -3.62 -4.29 0.18 -3.16 -3.44 -4.01 -0.29 0.27 -0.58 0.49 -0.76 -0.44 0.42 0.47 -0.47 -0.13 0.08 0.3 0.24 -0.31 -0.42 0.29 0.53 0.71 1.37 1.54 1.07 0.56 1.54
-2.58 -3.59 -2.92 -4.29 -3.45 -2.82 -0.02 -3.63 -3.04 -3.57 -0.3 0.39 -0.63 0.06 -0.56 -0.34 0.51 0.52 -0.02 0.39 -0.05 0.05 0.08 -0.1 -0.58 0.11 0.36 0.92 1.48 1.49 0.73 0.6 1.55
-3.6 -3.92 -3.92 -4.04 -3.98 -4.63 0.09 -5.41 -5.45 -6.19 -0.64 -0.05 0.03 -0.12 0.49 -0.04 0.26 -0.04 -0.34 -0.01 -0.35 0.12 0.31 0.49 -0.3 0.07 0.16 1.51 1.33 1.02 1.35 1.09 1.03
-5.48 -5.15 -6.12 -6.63 -5.4 -3.86 0.42 -4.54 -4.8 -4.79 -0.39 0.01 0.12 0.27 -0.22 -0.56 0.67 -0.29 -0.3 0.09 -0.43 0.38 0.85 0.3 -0.23 0.07 0.26 1.07 1.26 1.29 0.99 0.92 1.33
-4.38 -3.25 -4.12 -3.57 -5.29 -5.0 -0.34 -7.05 -5.58 -5.26 -0.66 -0.18 -1.05 0.05 -0.87 -0.67 0.72 -1.17 -0.02 -0.45 -0.26 0.03 -0.1 -1.02 0.03 0.57 0.62 1.46 1.55 1.3 1.35 1.45 1.61
-5.64 -5.18 -5.37 -4.68 -5.82 -4.88 -0.55 -5.14 -8.24 -4.8 -0.19 -0.43 -0.24 -0.39 0.07 -0.55 0.89 -1.05 0.1 0.07 0.09 -0.35 -0.15 -0.94 0.12 0.56 0.66 1.22 1.34 1.53 1.4 1.18 1.39
-4.82 -6.0 -7.51 -5.29 -8.28 - -0.51 -5.96 - - -1.09 -0.17 -0.28 -0.31 -0.75 -0.28 0.63 0.43 -1.24 -0.01 0.04 -0.22 0.47 -0.32 -0.51 0.61 0.66 1.28 1.57 1.52 1.22 0.79 1.71
-3.52 -3.77 -4.41 -4.0 -4.07 -5.33 -0.04 -5.36 -5.08 -5.79 -0.18 -0.19 -0.91 0.18 0.06 -0.51 0.49 -0.02 0.24 0.09 -0.3 -0.4 -0.14 -1.13 -0.66 0.33 0.48 1.36 1.46 1.59 1.38 1.12 1.32
-3.97 -2.63 -3.27 -4.6 -5.27 -2.83 0.37 -5.31 -4.61 -5.16 -0.82 0.49 0.36 0.3 -1.55 -1.13 0.59 -1.32 -0.43 -0.76 -0.48 0.05 0.78 -0.38 -0.31 0.02 0.29 1.25 1.44 1.51 1.32 1.0 1.49
-3.88 -5.22 -4.32 -4.0 -3.84 -4.27 0.62 -4.28 -4.96 -5.09 -1.2 0.07 -0.37 -0.14 -0.63 -0.13 0.58 -0.34 -0.45 -0.33 -0.38 0.05 0.18 -0.56 0.15 0.66 0.82 1.04 1.2 1.45 1.11 1.16 1.55
-1.8 -1.74 -1.97 -2.07 -1.74 -2.01 0.01 -2.35 -1.95 -2.22 -0.17 0.24 0.13 0.01 -0.22 0.03 0.26 -0.49 -0.39 0.15 -0.21 -0.01 0.48 0.33 -0.79 0.23 0.29 0.92 1.23 1.06 0.95 0.91 1.15
-3.1 -3.17 -3.3 -2.75 -2.99 -2.34 -0.1 -4.02 -3.75 -2.52 -0.37 0.21 -0.86 0.17 -0.0 -0.51 0.61 0.07 -0.21 0.37 0.26 -0.06 -0.05 -0.7 -0.62 0.34 0.59 1.06 1.34 1.37 1.13 0.95 1.29
-4.66 -4.66 -4.49 -4.32 -5.11 -4.58 -0.05 -3.09 -5.12 -5.49 -0.14 0.17 0.1 -0.14 -0.23 -0.01 0.55 -0.32 0.18 0.08 0.11 0.01 -0.24 -0.11 -0.26 0.3 0.51 1.12 1.15 1.33 1.05 0.97 1.6
-3.99 -3.86 -4.84 -4.42 -4.84 -5.32 0.18 -5.09 -7.18 -5.61 -0.44 0.06 -0.86 0.52 -0.81 0.08 0.66 0.09 -0.39 -0.22 -0.29 0.34 0.5 -0.6 0.0 0.31 0.41 1.12 1.51 1.46 1.0 0.81 1.39
-2.44 -2.92 -2.96 -2.69 -3.81 -4.38 0.69 -3.99 -3.95 -3.98 -0.36 0.02 0.13 -0.19 0.12 -0.96 0.43 -0.16 -0.15 -0.57 -0.27 0.32 0.26 0.35 0.14 0.34 0.48 1.1 1.13 1.16 1.15 1.02 1.13
-3.74 -3.91 -3.97 -4.71 -4.25 -4.51 0.13 -5.34 -4.35 -5.39 -0.28 0.28 0.23 -0.16 -0.52 0.07 0.4 0.18 0.03 -0.05 0.11 0.35 0.2 0.15 -0.09 0.0 0.25 1.02 1.37 1.38 1.01 0.76 1.31
-5.13 -5.02 -4.57 -7.04 -5.47 -6.89 0.13 -5.54 -6.51 -5.14 -0.5 -0.45 -0.49 -0.31 -0.18 -0.38 0.59 -0.85 -0.14 0.16 0.14 0.3 0.35 -0.74 -0.14 0.47 0.63 1.29 1.51 1.3 1.16 1.26 1.37
-6.77 -6.2 -6.57 -6.66 - -8.27 0.22 -7.65 - - -0.8 -0.57 -0.3 -1.15 0.01 -0.12 0.84 -1.03 -0.28 -0.45 -0.35 -0.32 -0.04 0.5 -0.23 0.64 0.71 1.37 1.37 1.33 1.38 1.36 1.4
-4.04 -4.32 -5.25 -5.84 -3.4 -3.99 0.14 -5.03 -5.77 - -0.86 0.45 0.36 0.18 -0.12 0.54 0.43 -1.37 -0.09 -0.21 -0.01 0.3 0.64 0.28 -0.13 0.03 0.39 1.16 1.17 1.2 0.99 0.82 1.35
-4.11 -4.25 -5.45 -5.45 -4.81 -4.75 0.23 -8.78 -7.76 - 0.28 0.35 0.1 0.51 -0.91 0.57 0.18 0.0 0.08 -0.29 0.05 0.24 0.47 -0.56 -0.02 0.07 0.21 0.96 1.39 1.41 0.89 0.61 1.32
-3.0 -3.94 -3.32 -3.74 -3.24 -2.91 0.19 -3.45 -3.54 -3.36 -0.42 0.24 0.26 0.26 -0.38 0.26 0.28 -0.01 0.22 0.29 -0.06 0.05 0.43 0.6 -0.37 -0.24 0.03 1.07 1.22 1.21 1.07 0.76 1.07
-2.33 -2.05 -3.34 -2.66 -3.84 -4.09 -0.2 -6.93 -4.26 -3.56 -0.1 0.28 0.18 0.11 -0.07 -0.02 0.25 0.16 0.3 0.41 0.01 0.53 0.65 0.21 -0.24 0.15 0.25 0.81 1.12 1.16 0.82 0.7 1.09
-5.73 -6.46 -5.89 -7.41 -6.16 - -0.16 -5.79 -6.85 - -0.31 0.67 0.25 0.43 -0.73 -0.32 0.36 -0.6 -0.22 -0.58 0.16 0.34 0.6 0.57 -0.08 -0.11 0.18 1.06 1.46 1.53 0.83 0.75 1.4
-2.21 -2.17 -2.54 -2.63 -2.32 -1.73 -0.44 -2.08 -2.15 -2.26 -0.54 -0.05 0.06 0.08 -0.15 -0.46 0.41 -0.4 -0.23 -0.32 -0.21 0.27 0.29 -0.01 -0.38 0.46 0.61 0.91 1.21 1.4 1.08 0.91 1.28
- -7.61 -8.37 - -9.02 - -0.21 -7.66 -6.95 - -0.31 0.04 0.19 0.05 -0.1 -0.28 0.63 -0.27 0.21 0.31 0.02 0.53 0.58 0.05 -0.1 0.07 0.35 0.92 1.33 1.43 1.03 0.65 1.4
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-2.52 -2.42 -3.56 -3.62 -3.57 -3.81 -0.09 -4.48 -4.41 -3.87 -0.96 0.03 0.39 -0.05 -0.2 -0.6 0.48 -0.87 -0.67 -0.93 -0.76 0.53 0.87 0.02 -0.13 0.05 0.3 1.0 1.46 1.62 1.19 1.02 1.37
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-2.61 -2.98 -2.59 -3.3 -3.11 -3.59 -0.07 -3.59 -3.54 -4.9 -0.62 0.31 0.41 0.4 -0.99 -0.71 0.51 -0.65 -0.4 -0.33 -0.5 0.37 0.4 0.35 -0.31 0.19 0.38 1.32 1.23 1.21 1.16 0.88 1.46
-4.85 -7.15 -6.49 -6.47 -5.4 -4.91 0.42 -4.81 -6.91 -5.97 -0.85 0.22 -0.04 -0.07 -0.92 -0.11 0.42 -0.38 -0.37 -0.35 -0.19 0.36 0.43 0.27 0.3 0.39 0.57 0.99 1.01 1.32 1.14 1.23 1.56
-4.53 -4.55 -5.45 -4.08 -5.04 -4.67 0.3 -6.71 -6.86 -6.29 -0.85 -0.51 -0.43 -0.67 0.09 -0.88 0.83 -0.75 -0.55 -0.82 -0.89 -0.26 -0.21 0.73 -0.66 0.19 0.34 1.4 1.45 1.5 1.44 1.5 1.57
-3.74 -3.64 -5.0 -4.29 -4.53 -5.8 -0.08 -5.24 -5.28 -5.33 -0.59 -0.04 -0.49 0.06 -0.21 0.19 0.66 -0.15 0.17 0.08 0.37 0.3 0.77 0.13 0.07 0.29 0.33 0.87 1.17 1.33 0.99 0.72 1.36
-3.49 -5.65 -4.48 -5.05 -3.67 -3.46 0.23 -3.94 -4.15 -5.35 -0.08 0.55 0.07 0.17 -0.09 0.34 0.57 -0.2 -0.04 -0.14 -0.52 0.18 0.13 0.16 0.16 0.23 0.33 1.16 1.14 1.21 0.93 0.75 1.24
-4.78 -4.89 -5.85 -6.67 -6.31 -5.44 0.29 -5.8 -5.91 -6.05 -0.45 0.5 -0.17 0.77 -0.06 0.14 0.24 -0.28 0.27 -0.01 0.26 0.44 0.63 0.14 -0.24 0.17 0.29 0.91 1.26 1.23 0.75 0.71 1.17
-3.01 -3.15 -3.15 -3.19 -3.02 -4.19 -0.03 -5.04 -3.84 - 0.04 0.66 -1.12 -0.11 0.38 -0.84 0.3 -0.24 0.17 0.23 0.12 0.07 0.62 -1.23 -0.36 0.33 0.36 1.01 1.2 1.38 1.32 0.87 1.25
-3.34 -4.32 -4.06 -3.9 -3.99 -5.24 0.3 -5.1 -5.3 -4.41 -0.34 0.06 -0.38 0.14 0.72 -0.33 0.36 -0.24 -0.25 0.0 0.14 -0.12 0.13 -0.21 -0.08 0.43 0.61 1.14 1.37 1.18 1.12 1.02 1.09
-1.62 -1.46 -1.48 -1.58 -1.3 -1.48 -0.04 -1.76 -1.88 -1.9 -0.36 0.26 0.12 -0.24 0.28 -0.49 0.84 -0.49 -0.35 -0.29 -0.08 0.32 0.13 -0.17 0.18 0.21 0.47 0.67 1.1 1.17 0.69 0.52 1.16
-2.99 -2.89 -4.39 -4.7 -4.7 -3.37 -0.39 -5.05 -5.19 -6.33 -0.82 -0.12 -0.13 -0.31 -0.05 -0.13 0.52 -0.36 -0.43 -0.04 0.02 0.19 0.44 0.59 -0.24 0.62 0.71 1.55 1.08 0.98 1.27 0.93 1.22
-3.86 -3.1 -4.22 -4.58 -3.95 -4.0 -0.16 - -4.13 -5.12 -0.03 -0.87 -0.46 0.19 0.25 0.79 0.26 0.31 -0.24 -0.02 -0.44 0.04 -0.09 -0.44 -0.01 -0.24 0.13 1.13 1.53 1.35 1.32 1.06 1.29
-4.17 -5.0 -4.16 -4.39 -4.95 -4.51 0.17 -5.27 -6.21 -6.04 -1.18 -0.2 0.63 -0.03 -0.46 -0.57 1.03 -1.28 -0.73 -0.45 -0.59 0.24 0.63 0.2 0.3 0.19 0.41 1.27 1.29 1.36 1.12 1.08 1.37
-5.93 -4.48 -2.46 -4.6 -6.55 -4.38 -0.71 -3.35 -3.17 -5.66 -0.02 -0.19 0.05 0.48 -0.22 -1.73 0.91 -1.15 -0.3 0.49 0.64 0.36 0.65 -0.62 -0.73 -0.15 0.17 1.0 1.38 1.4 0.94 1.34 1.28
-5.34 -5.78 -5.48 -5.6 -7.62 -7.31 -0.44 -5.2 -8.58 - -1.06 0.04 -1.28 -0.21 -0.16 -0.17 0.62 -0.89 -0.24 -0.02 0.15 -0.04 0.18 -1.3 -0.84 0.34 0.54 1.43 1.59 1.57 1.38 1.05 1.77
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-3.59 -3.52 -3.71 -4.78 -3.94 -3.88 0.57 -6.41 -6.07 -6.82 -0.47 0.06 -0.09 0.3 -0.73 -0.24 0.88 0.11 0.05 -0.13 0.08 0.38 0.28 0.31 -0.29 0.02 0.16 0.9 1.35 1.4 0.92 0.6 1.36
-3.69 -2.64 -4.59 -2.42 -4.47 -4.49 -0.23 -6.72 -4.87 -4.6 -0.01 -0.12 0.25 0.05 -0.26 -0.1 0.59 0.06 0.02 0.02 0.25 0.22 0.04 0.02 0.22 0.28 0.27 1.17 1.13 1.18 0.88 0.96 1.35

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.