Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.52 0.35 0.07 0.21 0.53 0.12 0.23 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.18 0.03
2.16 1.02 1.02 1.67 1.34 0.1 0.13 0.24 0.1 0.1 0.03 0.07 0.01 0.05 0.04 0.27 0.11 0.76 1.2 2.23
0.56 0.04 0.14 0.51 0.48 0.0 0.06 0.07 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.13 0.02 0.64 0.26 0.93
0.5 1.78 1.43 0.2 0.89 0.21 0.15 0.07 0.02 0.0 0.12 0.41 0.07 0.02 0.0 0.1 0.17 0.27 0.0 0.36
1.16 0.82 1.91 1.4 0.83 0.16 0.65 0.15 0.06 0.19 0.1 0.15 0.12 0.07 0.11 0.13 0.07 0.66 0.96 3.78
152.33 2.95 0.33 1.04 45.84 1.36 0.24 2.97 0.78 1.07 0.0 0.31 0.06 0.53 0.27 0.44 1.79 21.22 0.05 90.1
0.07 0.0 0.02 0.12 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0
1.24 2.22 0.72 1.8 1.46 0.02 1.17 0.03 0.04 0.07 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.74
0.37 0.57 0.31 0.35 0.27 0.72 0.43 0.14 0.09 0.06 0.07 0.03 0.01 0.03 0.08 0.2 0.04 0.69 0.59 1.04
0.08 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.07 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
4.86 2.13 2.68 3.01 2.25 0.63 2.29 0.73 0.47 0.48 0.53 0.31 0.21 0.14 0.64 0.28 0.2 2.02 2.24 2.24
10.53 27.25 16.77 10.92 14.0 0.51 7.27 0.24 0.23 0.2 0.0 0.26 0.08 0.08 0.02 0.24 1.13 0.78 0.5 12.31
4.34 8.51 10.17 4.61 4.74 0.56 2.32 0.16 0.15 0.32 0.16 0.0 0.03 0.11 0.28 0.73 0.05 0.4 0.18 8.65
13.88 14.37 14.19 16.44 24.55 0.61 14.44 1.18 1.78 1.67 0.63 1.21 1.13 0.6 0.75 2.74 5.54 0.0 0.01 2.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.37 0.59 0.72 0.26 0.27 0.06 0.01 0.04 0.05 0.03 0.08 0.01 0.02 0.07 0.01 0.0 0.03 0.04 0.0 0.41
0.66 0.16 0.37 0.13 0.68 0.17 0.11 0.07 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.51 0.4 0.62
2.4 0.63 2.05 1.68 1.75 1.1 0.35 0.24 0.01 0.0 0.02 0.09 0.02 0.01 0.02 0.02 0.11 1.7 2.09 1.62
7.12 2.24 5.74 11.86 3.67 0.1 2.91 0.1 0.01 0.01 0.05 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.19 0.0 13.95
138.58 5.67 0.31 0.47 48.44 1.4 0.13 2.87 0.12 0.71 0.0 0.01 0.04 0.3 0.08 0.52 1.72 21.08 0.05 72.72
0.35 0.35 0.06 0.17 0.17 0.0 0.03 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.43 1.16 0.74 0.34 0.68 0.0 0.72 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.37 0.17
0.53 0.83 0.19 0.54 0.58 0.18 0.18 0.06 0.05 0.08 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.1 0.0 0.16 0.06 0.07
22.77 13.95 22.25 16.65 37.98 0.06 19.86 0.62 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 10.18 13.29 5.21
0.23 0.13 0.03 0.46 0.06 0.13 0.06 0.1 0.02 0.03 0.14 0.01 0.06 0.12 0.17 0.41 0.1 0.0 0.21 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.28 8.32 5.52 5.27 7.62 3.56 3.8 1.98 1.39 1.31 1.73 2.45 0.85 1.24 1.79 3.5 2.77 4.17 2.04 7.39
2.97 2.85 1.76 1.16 1.72 0.01 0.14 0.03 0.01 0.08 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 6.39
0.24 0.52 0.98 0.09 0.44 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.04
0.98 0.21 0.82 0.71 0.47 0.03 0.21 0.19 0.25 0.2 0.64 0.09 0.26 0.17 0.65 0.15 0.16 0.01 0.02 0.18
0.31 0.38 0.31 0.27 0.93 0.02 0.07 0.08 0.04 0.06 0.01 0.01 0.08 0.09 0.02 0.0 0.01 0.73 0.23 0.74
0.09 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.08 0.05 0.1 0.08 0.0 0.11 0.29 0.22 0.28 0.09 0.08 0.25 0.0
3.49 3.22 3.52 4.29 4.63 0.2 1.56 1.04 0.46 0.49 0.4 1.05 0.99 0.92 0.34 0.05 0.32 2.66 2.39 10.35
4.58 3.21 2.83 4.93 1.1 0.4 0.05 0.22 0.14 0.09 0.08 0.08 0.05 0.01 0.06 0.09 0.09 0.24 0.12 1.25
3.1 2.23 1.96 3.07 0.84 0.09 0.04 0.14 0.03 0.03 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0 0.11 0.11 0.18 0.09 0.99
0.93 2.99 2.78 0.0 2.12 0.0 0.67 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.21 0.08
1.29 1.43 1.96 0.7 1.14 0.0 0.91 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.12 0.1
11.21 15.03 12.26 5.82 16.01 1.85 11.51 2.69 4.99 1.78 1.94 7.25 1.22 2.3 1.61 3.74 4.06 0.15 0.03 12.54
2.42 9.38 2.58 1.6 1.39 0.83 1.98 0.39 0.27 0.34 0.47 0.68 0.33 0.44 0.51 0.06 0.2 0.48 0.31 2.27
0.1 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.08 0.06 0.06 0.03 0.04 0.04 0.03 0.17 0.05 0.06 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.21 0.13 0.57 0.7 0.17 0.1 0.14 0.13 0.15 0.02 0.03 0.07 0.06 0.03 0.25 0.43 0.2 0.38 2.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0
2.58 1.53 2.36 1.95 1.89 0.11 0.25 0.36 0.45 0.66 0.61 0.53 0.22 0.12 0.54 1.19 1.8 0.73 1.22 1.13
8.2 2.62 5.06 3.83 4.16 0.29 2.59 1.86 1.91 1.88 3.47 1.48 1.98 1.38 3.47 1.38 2.33 3.66 2.46 3.14
8.37 13.56 8.33 3.78 7.15 7.24 0.32 0.87 1.96 1.78 1.77 0.43 0.2 0.59 2.81 0.05 0.23 2.78 0.89 9.96
2.61 4.6 3.41 2.14 5.96 0.65 0.09 0.16 0.01 0.0 0.02 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 1.05 0.32 2.35

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)