Heatmap: Cluster_290 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.61 0.05 0.03 0.81 0.54 -2.4 -1.17 -0.63 -0.09 -1.04 0.74 -0.91 0.35 -0.65 0.27 1.03 -1.02 -0.43 0.29 -0.57
1.0 -1.04 -0.23 0.71 0.26 -2.99 -0.9 -0.54 -0.12 -0.3 0.55 -1.16 -0.2 -0.44 0.81 1.05 -0.06 -0.07 -0.63 -0.23
0.8 0.22 0.11 0.35 0.43 -1.47 -0.61 -0.23 0.06 -0.1 0.66 -0.91 -0.64 -1.13 0.72 -0.08 -0.65 -0.05 0.36 -0.22
0.2 -1.04 -0.51 -0.24 -0.24 -0.23 0.17 0.22 -0.29 -0.39 0.89 -0.87 -0.08 -0.02 0.75 0.26 0.24 -0.35 0.27 -0.22
1.18 -0.66 0.17 0.7 0.31 -2.59 -0.26 -0.29 0.01 -0.17 0.54 -0.91 -0.32 -0.67 0.4 0.41 -0.12 -0.67 0.17 -0.63
0.18 0.27 0.03 0.27 0.16 -0.98 -0.12 -0.13 -0.13 -0.24 0.3 -0.7 -0.04 -0.28 0.2 0.35 0.16 0.36 -0.1 -0.32
0.23 -0.2 -0.2 -0.01 0.41 -0.52 -0.18 0.05 -0.09 -0.13 0.35 -0.28 -0.12 -0.31 0.42 0.01 -0.26 0.17 0.23 -0.0
0.45 0.05 -0.68 0.26 0.28 -0.88 0.07 -0.24 -0.25 -0.34 0.81 -0.85 -0.06 -0.45 0.77 -0.13 -0.61 -0.36 0.4 0.14
0.04 -1.17 -0.65 -0.31 -0.39 -2.69 -0.53 0.18 0.02 0.28 1.18 -0.51 -0.2 -0.57 1.22 0.55 -0.1 -0.16 0.32 -0.49
0.37 -0.36 -0.51 -0.2 0.49 -0.15 -0.13 0.15 -0.05 -0.17 0.52 -0.66 0.12 -0.24 0.52 0.01 -0.3 0.27 0.06 -0.6
0.44 0.37 -0.13 0.06 0.31 -0.6 -0.56 -0.1 -0.31 -0.5 0.95 -0.71 -1.02 -1.46 0.85 -0.08 -0.29 -0.04 0.43 0.1
0.35 0.08 -0.18 -0.11 -0.03 -0.72 -0.56 -0.02 0.2 -0.05 0.8 -0.54 -0.01 -0.19 0.74 -0.07 -0.49 -0.31 0.18 -0.11
0.82 -0.23 -0.04 0.54 0.52 -0.85 -0.69 0.05 -0.02 -0.35 0.62 -0.69 -0.53 -0.85 0.55 0.05 -0.18 -0.03 -0.01 -0.37
0.46 0.29 -0.22 -0.1 0.31 -1.13 -0.32 -0.07 0.01 -0.07 0.45 -0.56 0.3 -0.03 0.44 0.1 -0.4 -0.19 0.21 -0.49
0.65 -0.88 0.65 0.45 0.5 -0.68 -0.58 0.01 -0.09 0.01 0.37 -0.99 0.12 -0.04 0.31 -0.75 -0.9 0.23 0.05 -0.21
0.18 -0.05 -0.46 0.01 0.15 -0.61 -0.15 -0.14 -0.08 -0.11 0.62 -0.69 -0.3 -0.55 0.6 0.26 0.04 0.23 0.36 -0.19
-0.59 -0.1 -0.06 -0.06 -0.35 -0.65 -0.59 0.42 0.19 0.05 0.58 -0.74 0.99 0.43 0.55 -0.42 -0.46 -0.13 0.09 -0.89
0.72 -0.06 0.14 0.14 0.3 -0.41 -0.32 -0.35 -0.15 -0.24 0.6 -0.76 -0.78 -0.86 0.52 -0.22 -0.41 -0.0 0.45 0.28
0.27 0.02 0.01 -0.14 0.17 -0.2 -0.47 -0.05 -0.18 -0.14 0.75 -0.52 -0.27 -0.52 0.7 -0.3 -0.35 -0.01 0.06 0.29
0.62 -0.51 -0.33 0.64 -0.17 -2.12 -1.25 0.22 -0.11 -0.01 1.03 -1.16 -0.2 -0.34 1.13 0.82 0.2 -0.42 -1.03 -1.78
0.65 0.12 -0.29 -0.05 0.34 -1.59 -0.75 -0.33 0.06 -0.09 0.51 -0.88 -0.14 -0.39 0.55 0.38 -0.02 0.19 0.34 -0.33
0.43 -0.15 0.28 0.35 0.26 -0.78 0.18 -0.25 -0.3 -0.27 0.52 -0.63 -0.45 -0.54 0.38 -0.07 0.09 -0.21 0.17 0.08
0.64 -0.08 0.01 0.38 0.42 -0.52 -1.06 0.02 -0.21 -0.3 0.28 -0.63 -0.43 -0.68 0.14 -0.38 -0.18 0.79 0.54 -0.28
0.42 -0.49 -0.42 0.29 0.3 -1.58 -0.41 0.08 0.28 0.17 1.21 -0.39 -1.09 -1.08 1.11 0.32 -0.14 -0.47 -0.3 -1.36
0.56 0.27 -0.26 0.33 0.33 -0.3 -0.29 -0.0 0.12 -0.01 0.18 -0.73 -0.22 -0.46 0.07 0.26 -0.65 -0.44 0.36 0.05
-0.3 -0.15 -0.24 -0.17 -0.07 -1.63 -0.34 0.23 0.09 0.07 0.53 -0.98 1.12 0.89 0.55 -0.61 -1.02 -0.68 0.72 -1.62
0.5 -0.48 -0.63 -0.11 0.44 -0.09 -0.74 0.1 -0.12 -0.19 0.25 -0.66 0.52 0.12 0.23 -0.16 -0.4 0.03 0.38 0.05
0.82 -0.03 -0.04 0.55 0.63 -1.01 -0.66 -0.27 -0.12 -0.18 0.24 -1.07 -0.29 -0.5 0.3 0.09 -0.04 0.41 0.06 -0.54
0.45 -0.23 -0.28 0.24 0.39 -0.37 -0.57 -0.13 -0.12 -0.15 0.98 -0.73 -0.35 -0.61 0.97 0.12 -0.41 -0.05 -0.64 -0.23
0.44 -0.02 -0.18 0.03 0.62 -0.24 -0.19 -0.05 -0.32 -0.23 0.48 -0.57 0.19 -0.19 0.56 -0.45 -0.56 0.05 -0.15 -0.05
0.6 0.03 -0.03 0.26 -0.02 -2.28 -0.54 0.01 0.4 0.37 0.43 -0.95 0.2 -0.24 0.34 -0.15 -0.6 -0.13 0.53 -0.44
-0.01 -0.27 -0.58 0.05 0.73 -0.56 -0.34 0.12 -0.07 -0.16 0.64 -0.37 -0.15 -0.27 0.57 -0.38 -0.5 0.09 0.07 0.37
-0.29 0.3 -0.64 -0.42 0.47 -1.19 0.58 -0.09 -0.07 0.0 0.72 -0.67 -0.14 -0.42 0.68 -0.53 -0.23 0.01 0.03 0.31
0.62 -0.5 -0.37 0.56 -0.11 -0.71 -0.63 0.34 0.38 0.01 0.84 -0.73 -0.32 -0.51 0.9 -0.29 -0.27 -0.13 -0.23 -0.83
0.52 -1.84 -0.8 -0.18 -1.03 -3.69 0.23 -0.23 0.75 0.36 0.85 -1.44 -0.76 -0.88 0.86 1.15 0.57 -1.74 0.36 -0.2
0.14 0.24 -0.02 0.1 -0.07 -0.4 -0.82 -0.01 -0.02 -0.12 0.67 -0.22 -0.34 -0.58 0.72 -0.07 0.16 -0.21 -0.1 0.08
0.94 0.21 -0.26 0.2 0.36 -0.48 -0.12 -0.43 -0.27 -0.31 0.6 -1.22 -0.45 -0.54 0.49 0.17 0.03 -0.1 0.24 -0.73
0.77 -0.04 0.02 0.78 0.22 -1.23 -0.66 -0.06 0.21 -0.11 0.51 -0.78 -0.07 -0.33 0.41 0.2 -0.35 -0.37 -0.11 -0.74
0.21 -2.39 -0.5 -1.01 -0.91 -2.69 -1.73 0.12 0.62 0.45 1.09 -1.09 -0.45 -0.57 0.84 1.39 1.18 -0.92 -0.46 -0.95
1.16 -0.04 0.2 0.72 0.8 -0.85 -0.29 -0.68 -0.38 -0.53 -0.13 -0.62 -0.92 -0.86 -0.18 0.25 -0.11 -0.36 0.65 -0.32
0.41 -0.73 -0.38 0.38 0.04 -2.15 0.04 -0.58 -0.02 -0.12 0.78 -1.03 -0.16 -0.06 0.76 0.94 0.09 -0.69 -1.25 0.44
0.29 -0.32 -0.05 -0.43 0.08 -0.46 -0.88 0.07 0.1 -0.24 0.33 -1.44 1.19 0.72 0.38 -0.23 -0.78 -0.17 0.33 -0.93
0.46 0.31 0.34 0.25 0.45 -0.37 -0.4 0.33 -0.07 -0.5 0.26 -0.46 -0.53 -0.8 0.22 -0.08 -0.77 -0.21 0.4 0.04
0.38 -0.1 0.29 0.48 0.48 -1.63 -0.21 -0.2 -0.38 -0.26 0.84 -0.84 -0.74 -0.73 0.78 0.19 -0.03 -0.07 0.4 -1.18
0.69 -0.07 0.11 0.51 0.49 -0.96 -0.05 0.02 -0.1 -0.26 0.45 -0.53 0.16 0.07 0.41 -0.46 -1.07 -0.32 -0.27 -0.18
-0.71 -1.04 -0.55 -0.29 -0.1 -0.9 0.8 -0.11 -0.42 -0.11 0.97 -0.05 -0.83 -0.33 1.04 0.1 -0.14 0.64 0.09 -0.65
0.85 0.17 -0.24 0.04 0.02 -0.72 -0.26 -0.28 -0.09 -0.31 0.69 -0.87 -0.12 -0.46 0.75 0.23 -0.33 -0.2 0.05 -0.32
0.17 -1.93 -0.68 -0.25 -0.58 -2.65 -0.66 -0.13 0.38 0.51 1.31 -1.32 0.09 -0.14 1.26 0.57 0.24 -0.88 -0.77 -0.02
0.76 -0.63 0.29 -0.09 -0.25 -2.95 -1.08 -0.01 0.39 0.3 0.58 -1.15 -0.31 -0.52 0.21 0.46 -0.07 -0.29 0.56 0.39
0.54 -0.49 -0.1 -0.1 0.41 -0.16 -0.28 -0.1 -0.18 -0.22 0.33 -0.51 -0.23 -0.29 0.32 -0.11 -0.07 0.48 0.23 -0.12
0.42 -0.23 -0.25 0.54 0.49 -1.08 0.02 -0.24 -0.14 -0.23 0.52 -1.01 0.24 -0.01 0.42 -0.56 -0.7 -0.06 0.5 -0.1
0.01 -0.02 -0.02 0.22 -0.12 -0.35 -0.22 0.06 0.18 -0.03 0.72 -0.62 -0.23 -0.26 0.46 -0.15 0.0 -0.49 0.71 -0.96
0.24 -1.61 -0.71 -0.14 0.03 -2.94 -1.0 0.08 0.28 0.34 1.22 -0.76 0.29 -0.57 1.22 0.48 0.01 -0.99 -0.44 -0.03
0.34 -0.16 -0.02 -0.83 0.02 -1.76 -0.26 0.11 0.21 0.41 1.07 -0.61 0.32 -0.31 1.04 0.05 -0.28 -0.57 -0.42 -1.21
0.35 0.1 0.13 0.04 0.04 -0.7 -0.55 0.02 -0.05 -0.24 0.67 -0.48 -0.41 -0.64 0.62 0.1 -0.07 -0.22 0.33 -0.0
-0.28 -0.19 -0.89 -0.45 -0.12 -4.5 -0.98 0.07 0.47 0.31 0.7 -0.7 0.63 0.05 0.45 0.0 -1.06 -0.72 1.02 0.65
0.66 0.41 -0.47 0.31 0.27 -1.57 -0.86 -0.3 0.06 -0.15 0.75 -0.7 -0.43 -0.85 0.77 0.56 -0.45 -0.41 0.28 -0.32
0.71 0.08 0.08 0.16 0.08 -1.27 0.19 -0.28 -0.02 -0.36 0.55 -0.83 -0.65 -0.83 0.39 -0.03 0.14 -0.42 0.18 0.52
0.66 0.16 0.19 0.53 0.22 -1.27 -0.16 -0.22 0.1 -0.09 0.38 -1.16 -0.23 -0.61 0.36 0.1 -0.4 -0.19 0.44 -0.35
0.76 0.41 0.4 0.65 -0.0 -1.45 0.11 -0.22 0.15 -0.01 0.47 -1.35 0.24 0.01 0.48 0.01 -0.51 -0.66 -0.67 -1.46
1.16 -0.36 0.25 0.64 0.04 -4.42 -0.31 -0.21 0.01 -0.21 0.87 -1.14 -0.84 -1.03 0.86 -0.92 -1.25 -0.08 0.54 0.18
0.28 -0.05 -0.37 0.11 0.23 -0.73 -0.08 0.24 -0.03 -0.35 0.8 -0.5 0.13 -0.04 0.64 -0.27 -0.27 -0.08 -0.08 -0.57
0.35 -0.8 -1.17 0.24 0.19 -1.34 -0.93 -0.11 0.06 -0.2 0.91 -0.88 -0.49 -0.79 0.95 0.78 -0.02 -0.11 0.4 0.03
0.48 -1.13 -0.27 0.24 0.95 -0.28 -0.16 0.03 -0.85 -0.78 0.11 -0.63 0.09 -0.12 0.1 -0.02 -0.17 0.53 0.07 0.23
0.5 -0.33 -0.43 0.28 -0.17 -0.87 0.03 0.33 0.51 0.35 0.23 -0.37 -0.64 -0.8 0.21 0.19 -0.48 0.04 0.49 -0.33
0.33 0.12 -0.2 -0.11 0.27 -0.48 0.68 0.02 0.03 -0.09 0.55 -0.85 0.08 0.05 0.55 -0.62 -1.11 -0.15 -0.17 -0.18
0.84 -1.59 0.05 -0.02 -0.52 -4.32 -0.51 -0.44 0.26 0.34 1.28 -1.43 -1.26 -1.44 1.14 0.8 0.72 -1.05 -0.54 -0.22
0.12 -0.08 -0.12 0.05 0.3 -0.66 -0.36 -0.02 0.08 -0.05 0.58 -0.39 -0.49 -0.37 0.62 -0.08 -0.35 -0.04 0.43 0.05
0.71 -0.73 -0.73 0.53 0.65 -0.94 0.09 -0.2 -0.34 -0.43 0.65 -0.87 -0.28 -0.46 0.49 -0.16 -0.43 -0.22 0.6 0.12
0.38 0.44 0.42 0.05 0.32 -1.19 -0.03 -0.12 -0.16 -0.26 0.61 -0.53 -0.62 -0.99 0.56 -0.03 -0.52 -0.16 0.24 0.08
-0.18 -2.26 -0.74 -0.45 -0.72 -3.37 -0.94 -0.19 0.6 0.52 1.14 -1.04 -0.5 -0.53 1.06 1.34 0.89 -0.31 -0.56 -1.04
-0.32 -0.53 -0.09 -0.55 -1.07 -3.4 -0.82 -0.23 1.0 0.62 0.81 -0.53 -1.44 -1.83 0.55 1.23 1.16 -0.6 0.08 -0.99
0.05 0.15 -0.26 0.25 -0.01 -0.97 -0.25 0.08 -0.24 -0.43 0.11 -0.09 -0.81 -0.42 0.22 0.27 0.38 -0.03 0.84 0.07
0.15 -0.41 -0.58 -0.2 0.2 -0.5 -0.23 -0.03 0.07 -0.31 0.76 -0.71 -0.04 -0.11 0.69 0.31 -0.39 0.08 0.17 0.07
0.13 -1.12 -0.77 0.05 -0.05 -0.94 0.25 -0.09 -0.11 -0.02 0.95 -0.76 0.16 -0.07 1.14 -0.3 -0.52 -0.06 0.1 -0.08
0.59 -0.21 -0.05 0.49 0.5 -0.31 -0.83 -0.15 -0.21 -0.41 0.18 -0.63 -0.13 -0.26 0.08 0.02 -0.2 -0.09 0.82 -0.35
0.57 0.04 -0.37 -0.16 0.4 -0.13 -0.0 0.15 -0.03 0.0 0.44 -0.68 0.36 0.01 0.19 -0.17 -0.67 -0.09 -0.12 -0.51
0.92 -0.89 -0.57 -0.33 0.68 -0.15 -0.47 0.13 -0.32 -0.34 0.44 -0.79 0.15 -0.18 0.47 -0.33 -0.51 0.33 0.23 -0.06
0.15 -0.34 -0.79 -0.33 0.2 -0.91 -0.52 0.44 0.11 0.01 0.58 -0.59 0.44 0.02 0.55 0.2 -0.36 -0.1 0.15 -0.08
0.94 -0.65 0.32 0.53 0.73 -1.54 -0.73 -0.15 0.08 -0.25 0.41 -0.99 -0.79 -1.2 0.34 -0.13 -0.4 0.33 0.39 -0.02
0.94 -0.68 0.08 0.25 0.68 -1.5 -0.77 -0.0 0.05 -0.21 0.44 -0.75 -0.17 -0.18 0.42 0.23 -0.25 -0.1 0.06 -0.48
0.69 0.1 -0.3 -0.41 0.74 0.13 -0.36 -0.09 -0.1 -0.17 0.36 -0.43 0.0 -0.09 0.16 -0.11 0.22 -0.49 -0.49 -0.21
0.74 0.01 -0.21 0.4 0.44 0.35 -0.55 -0.16 -0.21 -0.21 0.48 -0.48 -0.46 -0.6 0.35 -0.37 -0.04 -0.01 -0.01 -0.56
0.49 0.14 -0.29 0.32 0.24 -0.93 0.18 -0.2 -0.29 -0.34 0.81 -1.04 -0.37 -0.54 0.73 0.17 -0.39 -0.27 0.52 -0.77
0.85 -0.4 -0.1 0.48 0.34 -2.05 -1.01 -0.04 0.09 -0.01 0.47 -0.75 0.32 -0.1 0.48 -0.36 -0.91 0.12 0.2 -0.02
0.56 -0.6 -0.38 0.27 -0.1 -1.07 -0.63 -0.22 0.1 -0.11 0.94 -0.72 -0.29 -0.66 0.88 0.34 -0.15 -0.35 0.01 0.26
0.59 0.19 -0.47 0.08 0.35 -0.24 -0.58 0.11 -0.13 -0.19 0.52 -0.73 0.55 0.07 0.4 -0.15 -0.5 -0.12 0.01 -0.97
0.5 -0.59 -0.77 0.26 0.29 -0.81 -0.44 -0.1 -0.07 -0.05 0.62 -0.78 -0.57 -0.82 0.68 0.13 -0.39 0.35 0.77 -0.07
-0.16 -0.49 -0.71 -0.04 0.03 -0.84 -0.59 0.07 -0.25 -0.31 1.22 -0.86 -0.24 -0.61 1.19 -0.21 -0.41 -0.08 0.63 0.11
0.51 -0.3 -0.2 0.39 -0.12 -0.55 -0.46 -0.29 -0.32 -0.47 0.72 -1.02 -0.13 -0.4 0.75 -0.1 0.09 -0.01 0.12 0.41
-0.2 -0.35 -0.43 -0.15 -0.19 -0.44 0.12 0.0 -0.08 -0.17 1.04 -0.84 -0.04 -0.24 1.02 -0.36 -0.36 -0.03 0.48 -0.36
0.42 0.26 -0.08 0.34 0.35 -0.33 -0.43 0.08 0.04 -0.18 0.54 -0.41 -0.2 -0.44 0.53 -0.04 -0.5 -0.06 -0.43 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.