Heatmap: Cluster_241 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.4 0.12 0.06 0.34 0.31 0.38 0.68 0.68 0.39 0.01 0.07 0.02 0.19 0.14 0.25 0.18 0.14 0.29 0.07 0.05 0.37
0.03 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.32 0.09 0.06 0.0 0.03 0.35 0.14 0.12 0.26 0.24 0.49 0.0 0.0 0.0 0.03 0.23 0.27 1.0 0.48 0.39 0.71 0.99 0.89
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.76 0.0 0.0 0.12 0.12 0.83 0.11 1.0 0.49 0.39 0.29 0.02 0.01 0.07 0.01 0.03 0.03 0.57 0.79 0.55 0.45 0.28 0.87
0.12 0.14 0.05 0.05 0.04 0.07 0.36 0.04 0.04 0.04 0.8 0.05 0.2 0.1 0.23 0.46 0.19 0.92 0.91 0.61 0.88 0.06 0.04 0.04 0.3 0.11 0.2 0.78 0.38 0.38 1.0 0.98 0.26
0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.04 0.0 0.02 0.01 1.0 0.15 0.24 0.01 0.04 0.2 0.2 0.34 0.5 0.47 0.28 0.04 0.1 0.01 0.17 0.08 0.11 0.2 0.29 0.25 0.2 0.23 0.34
0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.0 0.05 0.48 0.12 0.02 0.04 0.05 0.19 0.08 0.52 0.51 0.43 0.57 0.02 0.01 0.02 0.06 0.03 0.04 0.28 0.22 0.41 0.47 0.46 1.0
0.01 0.04 0.01 0.05 0.08 0.01 0.34 0.0 0.01 0.0 0.25 0.15 0.04 0.03 0.19 0.36 0.09 0.16 0.3 0.3 0.41 0.06 0.01 0.0 0.04 0.16 0.2 0.65 0.51 0.55 0.63 0.64 1.0
0.06 0.01 0.07 0.04 0.05 0.06 0.1 0.0 0.0 0.01 0.72 0.05 0.29 0.07 0.61 1.0 0.45 0.31 0.76 0.64 0.77 0.17 0.02 0.0 0.21 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01
0.24 0.27 0.23 0.23 0.25 0.34 0.57 0.29 0.28 0.3 0.78 0.94 0.32 0.52 0.9 0.39 0.43 0.62 0.68 0.48 0.75 0.35 0.26 0.26 0.39 0.55 0.55 0.59 0.68 0.82 0.54 0.59 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.03 0.08 0.74 0.3 0.02 0.26 0.27 1.0 0.14 0.93 0.87 0.79 0.9 0.01 0.02 0.0 0.05 0.57 0.44 0.29 0.44 0.77 0.42 0.34 0.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.72 0.13 0.12 0.08 0.09 1.0 0.29 0.58 0.52 0.23 0.55 0.1 0.26 0.09 0.3 0.08 0.08 0.15 0.35 0.45 0.09 0.09 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.05 0.17 0.03 0.0 0.15 0.14 0.14 0.11 0.26 0.13 0.16 0.33 0.05 0.25 0.04 0.03 0.19 0.28 0.56 0.21 0.28 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.05 0.02 0.05 0.27 1.0 0.22 0.27 0.41 0.5 0.41 0.02 0.47 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.98 0.05 0.11 0.02 0.19 0.29 0.15 0.8 0.7 0.85 0.71 0.03 0.17 0.1 0.07 0.04 0.02 0.48 0.37 0.27 0.91 1.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.19 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.44 0.13 0.07 0.23 0.78 0.26 0.57 0.38 1.0 0.94
0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.15 0.0 0.04 0.01 0.09 0.24 0.12 0.08 0.02 0.08 0.17 0.06 0.08 0.08 0.08 0.11 0.02 0.55 0.23 0.15 0.27 0.66 0.23 0.49 0.36 0.76 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.08 0.09 0.04 0.74 0.42 0.56 0.59 0.55 0.5 0.05 0.24 0.1 0.36 0.11 0.11 0.11 0.4 0.55 0.09 0.08 0.79
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.76 0.0 0.0 0.01 0.42 0.43 0.16 0.7 0.63 0.63 0.43 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.1 0.55 0.14 0.12 0.71 1.0 0.1
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.59 0.08 0.08 0.08 0.33 0.19 0.07 1.0 0.47 0.51 0.55 0.02 0.02 0.0 0.09 0.05 0.05 0.47 0.18 0.08 0.41 0.67 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.3 0.12 0.0 0.0 0.1 0.15 0.0 0.0 0.0 0.27 0.01 0.0 0.53 0.65 0.57 0.36 0.5 0.64
0.06 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.83 0.02 0.08 0.0 0.1 0.24 0.12 1.0 0.66 0.52 0.61 0.01 0.03 0.09 0.03 0.03 0.02 0.19 0.15 0.11 0.38 0.4 0.13
0.69 0.59 0.72 0.54 0.43 0.15 0.24 0.04 0.06 0.24 0.2 0.2 0.38 0.13 0.17 0.18 0.05 0.24 0.21 0.08 0.19 0.11 0.21 0.05 0.45 0.05 0.07 0.17 0.61 0.87 0.24 0.18 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.22 0.49 0.54 0.59 0.62 0.55 0.6 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.25 0.55 0.11 0.18 0.57 0.53 0.07
0.35 0.23 0.23 0.46 0.39 0.81 1.0 0.23 0.29 0.47 0.42 0.9 0.34 0.69 0.74 0.22 0.52 0.22 0.27 0.43 0.37 0.33 0.25 0.46 0.85 0.47 0.62 0.52 0.62 0.74 0.42 0.62 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.05 0.0 0.3 1.0 0.05 0.43 0.27 0.14 0.65 0.04 0.02 0.0 0.26 0.05 0.12 0.55 0.4 0.4 0.73 0.99 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.16 0.0 0.19 0.45 0.05 0.12 0.46 0.14 0.28 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.04 0.43 0.36 0.49 0.73 1.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.11 0.1 0.27 0.32 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.66 0.34 0.62 0.61 1.0 0.81
0.69 0.49 1.0 0.76 0.98 0.75 0.75 0.49 0.29 0.28 0.82 0.52 0.9 0.34 0.79 0.87 0.57 0.77 0.77 0.71 0.74 0.58 0.7 0.9 0.8 0.44 0.45 0.84 0.77 0.68 0.82 0.65 0.65
0.18 0.11 0.2 0.25 0.29 0.44 0.18 0.15 0.2 0.22 1.0 0.14 0.28 0.09 0.32 0.47 0.57 0.93 0.86 0.64 0.84 0.1 0.18 0.29 0.26 0.23 0.29 0.39 0.51 0.55 0.4 0.35 0.56
0.07 0.04 0.17 0.13 0.32 0.13 0.2 0.12 0.1 0.13 0.31 0.06 0.08 0.0 0.18 0.31 0.22 0.32 0.25 0.29 0.29 0.15 0.09 0.28 0.08 0.22 0.16 0.73 0.46 0.49 0.42 0.55 1.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.23 0.08 0.09 0.01 0.31 0.28 0.16 0.03 0.13 0.31 0.24 0.11 0.11 0.23 0.01 0.23 0.14 0.67 0.29 0.37 0.41 0.56 1.0
0.27 0.38 0.24 0.4 0.42 0.69 0.92 0.17 0.35 0.26 0.75 0.9 0.41 1.0 0.22 0.82 0.37 0.7 0.76 0.71 0.74 0.56 0.48 0.5 0.64 0.47 0.36 0.26 0.43 0.82 0.3 0.27 0.77
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.1 0.0 0.05 0.2 0.23 0.24 0.61 0.38 0.47 0.03 0.0 0.0 0.37 0.04 0.11 0.28 0.16 0.19 0.13 0.14 0.23
0.43 0.24 0.72 0.42 0.26 0.26 0.24 0.09 0.07 0.22 0.09 0.03 0.11 0.03 0.31 0.08 0.09 0.08 0.09 0.07 0.1 0.06 0.06 0.09 0.05 0.09 0.09 0.42 0.47 1.0 0.49 0.35 0.67
0.6 0.35 1.0 0.84 0.58 0.3 0.6 0.14 0.07 0.08 0.5 0.32 0.61 0.45 0.46 0.65 0.08 0.51 0.6 0.68 0.49 0.51 0.33 0.65 0.4 0.0 0.0 0.64 0.66 0.39 0.46 0.42 0.51
0.24 0.11 0.53 0.49 0.45 0.24 0.35 0.04 0.03 0.07 0.59 0.11 0.34 0.13 0.41 0.41 0.28 0.42 0.58 0.41 0.63 0.34 0.02 0.0 0.2 0.07 0.09 0.62 0.98 1.0 0.63 0.54 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.02 0.74 0.03 0.01 0.09 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.02 0.0 0.33 0.19 0.55 0.88 0.43 0.31 0.12 1.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.04 0.1 0.11 0.01 0.03 0.03 0.06 0.11 0.08 0.0 0.02 0.07 0.11 0.14 0.06 0.03 0.03 0.06 0.03 0.16 0.12 0.17 0.25 0.53 0.22 0.5 0.46 0.77 1.0
0.19 0.24 0.08 0.11 0.09 0.04 0.45 0.0 0.06 0.01 0.67 0.15 0.07 0.09 0.31 0.66 0.19 0.81 0.6 1.0 0.95 0.04 0.02 0.01 0.02 0.24 0.28 0.55 0.37 0.53 0.52 0.6 0.8
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.26 0.0 0.0 0.0 0.67 0.01 0.35 0.01 0.2 0.5 0.27 0.39 0.86 0.98 0.97 0.02 0.01 0.02 0.25 0.09 0.14 0.58 0.3 0.26 1.0 0.98 0.29
0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.2 0.03 0.01 0.05 0.44 0.03 0.21 0.0 0.13 0.17 0.18 0.29 0.44 0.39 0.36 0.01 0.02 0.01 0.19 0.09 0.2 0.67 0.24 0.21 1.0 0.9 0.2
0.3 0.22 0.92 0.64 0.48 0.34 0.4 0.02 0.04 0.02 0.34 0.06 0.14 0.02 0.13 0.21 0.16 0.38 0.31 0.18 0.29 0.19 0.0 0.0 0.15 0.06 0.1 0.59 0.68 0.9 0.68 0.51 1.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.02 0.03 0.98 0.03 0.04 0.0 0.03 0.24 0.07 0.41 0.77 0.12 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.36 0.36 0.49 0.31 0.24 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.01 0.06 0.0 0.21 0.7 0.01 0.61 1.0 0.24 0.75 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.51 0.5 0.11 0.22 0.19 0.3
0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.02 0.31 0.55 0.08 0.23 0.07 0.32 0.54 0.18 0.72 0.42 0.65 0.12 0.0 0.09 0.33 0.14 0.19 0.67 0.66 0.77 0.64 0.5 1.0
0.02 0.01 0.0 0.03 0.04 0.03 0.25 0.0 0.0 0.0 0.95 0.03 0.21 0.02 0.34 0.63 0.18 0.91 1.0 0.85 0.9 0.02 0.01 0.03 0.2 0.03 0.04 0.37 0.12 0.11 0.53 0.54 0.11
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.04 0.19 0.08 0.37 0.47 0.07 1.0 0.79 0.39 0.73 0.05 0.02 0.03 0.02 0.03 0.07 0.51 0.41 0.21 0.42 0.29 0.18
0.07 0.13 0.02 0.03 0.03 0.05 0.58 0.06 0.07 0.11 0.4 0.42 0.36 0.12 0.6 0.24 0.14 0.27 0.2 0.2 0.24 0.21 0.07 0.51 0.26 0.51 0.47 0.18 0.89 1.0 0.2 0.14 1.0
0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.18 0.03 0.03 0.09 0.31 0.26 0.07 0.13 0.13 0.17 0.21 0.18 0.19 0.19 0.16 0.17 0.15 0.19 0.13 0.36 0.42 0.6 0.72 0.73 0.49 0.43 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.16 0.15 0.51 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.53 0.77 0.66 0.38 0.44 1.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.35 0.15 0.16 0.22 0.21 0.4 0.13 0.44 0.27 0.22 0.47 0.2 0.36 0.0 0.01 0.01 0.01 0.11 0.42 0.34 0.06 0.1 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.14 0.01 0.08 0.01 0.49 0.36 0.43 0.43 0.32 0.54 0.07 0.11 0.04 0.21 0.11 0.13 0.1 0.47 0.43 0.07 0.07 0.72
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.12 0.03 0.66 0.59 0.16 1.0 0.89 0.89 0.91 0.03 0.11 0.01 0.18 0.11 0.1 0.43 0.18 0.06 0.45 0.6 0.26
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.14 0.0 0.74 0.58 0.37 0.6 0.68 0.56 0.6 0.01 0.03 0.0 0.06 0.0 0.03 0.14 0.25 0.4 0.23 0.15 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.03 0.0 0.39 0.26 0.07 1.0 0.47 0.32 0.46 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.09 0.05 0.16 0.04 0.33 0.43 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.83 0.06 0.14 0.1 0.5 0.29 0.13 1.0 0.75 0.59 0.78 0.02 0.02 0.0 0.12 0.04 0.04 0.46 0.11 0.09 0.33 0.57 0.23
0.27 0.23 0.39 0.53 0.47 0.45 1.0 0.11 0.32 0.05 0.77 0.32 0.54 0.23 0.52 0.81 0.44 0.63 0.61 0.66 0.56 0.05 0.29 0.14 0.52 0.15 0.18 0.39 0.85 0.95 0.47 0.4 0.8
0.15 0.24 0.12 0.23 0.12 0.21 0.28 0.28 0.26 0.18 1.0 0.16 0.62 0.27 0.26 0.75 0.58 0.86 0.87 0.57 0.87 0.22 0.28 0.12 0.67 0.31 0.48 0.88 0.77 0.76 0.98 0.78 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.02 0.06 0.02 0.21 0.34 0.13 0.44 0.45 1.0 0.49 0.0 0.05 0.0 0.02 0.34 0.25 0.42 0.51 0.65 0.43 0.59 0.93
0.02 0.04 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.6 0.04 0.01 0.07 0.06 0.42 0.01 0.47 0.37 0.28 0.21 0.02 0.0 0.0 0.03 0.03 0.04 0.4 0.5 0.4 0.11 0.09 1.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.13 0.21 0.55 0.92 0.3 0.18 0.14 0.47 0.29 0.08 0.0 0.01 0.47 0.13 0.13 1.0 0.82 0.73 0.51 0.47 1.0
0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.51 0.19 0.06 0.06 0.16 0.46 0.14 0.69 0.4 0.38 0.47 0.08 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.16 0.53 0.47 0.07 0.16 1.0
0.01 0.02 0.04 0.01 0.06 0.0 0.35 0.01 0.05 0.0 0.15 0.14 0.01 0.01 0.18 0.3 0.07 0.25 0.29 0.23 0.22 0.02 0.04 0.0 0.01 0.09 0.12 0.69 0.55 0.45 0.57 0.68 1.0
0.28 0.23 0.41 0.52 0.5 0.58 0.66 0.23 0.37 0.44 0.8 0.51 0.62 0.5 0.48 0.73 0.6 0.68 0.39 0.54 0.62 0.44 0.41 0.23 0.59 0.46 0.51 0.4 0.58 0.9 0.39 0.35 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.19 0.19 0.18 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.18 0.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.19 0.05 0.09 0.3 0.19 0.5 0.39 1.0 0.72
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.54 0.01 0.15 0.01 0.32 0.36 0.94 0.39 0.9 0.74 1.0 0.02 0.01 0.01 0.18 0.28 0.37 0.41 0.58 0.6 0.42 0.36 0.78
0.09 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.12 0.0 0.02 0.0 0.28 0.12 0.09 0.06 0.44 0.06 0.08 0.26 0.43 0.53 0.18 0.1 0.11 0.0 0.06 0.03 0.02 0.32 0.28 0.5 0.35 0.57 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.02 0.07 0.59 0.01 0.01 0.19 0.0 0.0 0.0 0.13 0.01 0.01 0.0 0.27 0.14 0.56 0.88 0.37 0.29 0.12 1.0
0.09 0.16 0.0 0.12 0.11 0.0 0.93 0.0 0.14 0.0 0.67 0.38 0.04 0.1 0.1 0.36 0.18 0.3 0.0 0.36 1.0 0.0 0.09 0.0 0.58 0.0 0.01 0.04 0.14 0.47 0.1 0.04 0.3
0.05 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.07 0.02 0.03 0.02 0.87 0.01 0.03 0.01 0.39 0.64 0.17 1.0 0.89 0.73 0.79 0.02 0.01 0.01 0.08 0.04 0.07 0.23 0.12 0.12 0.31 0.32 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)