Heatmap: Cluster_241 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 1.65 0.12 0.66 0.19 0.1 0.56 0.52 0.63 1.13 1.12 0.64 0.02 0.11 0.04 0.32 0.23 0.41 0.29 0.23 0.48 0.11 0.08 0.6
0.08 0.12 0.02 0.02 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.8 0.21 0.14 0.0 0.07 0.86 0.34 0.3 0.63 0.61 1.22 0.0 0.0 0.0 0.07 0.56 0.67 2.48 1.2 0.96 1.76 2.46 2.2
0.08 0.0 0.27 0.02 0.03 0.06 0.04 0.04 0.09 0.0 6.64 0.0 0.0 1.06 1.06 7.33 1.0 8.79 4.3 3.44 2.57 0.21 0.07 0.58 0.07 0.28 0.24 5.03 6.92 4.85 3.94 2.43 7.68
2.46 2.85 1.02 0.97 0.9 1.42 7.44 0.82 0.87 0.84 16.55 1.05 4.23 2.16 4.69 9.61 3.95 18.99 18.87 12.69 18.16 1.32 0.75 0.87 6.3 2.29 4.08 16.24 7.79 7.9 20.69 20.31 5.35
0.21 0.16 0.23 0.15 0.06 0.56 0.42 0.03 0.25 0.07 11.93 1.74 2.87 0.1 0.53 2.37 2.38 4.04 6.01 5.66 3.35 0.47 1.21 0.08 2.02 0.94 1.37 2.34 3.5 2.97 2.33 2.75 4.08
0.18 0.67 0.21 0.11 0.0 0.0 5.86 0.27 0.02 1.29 13.31 3.39 0.51 1.01 1.3 5.32 2.21 14.37 14.05 11.86 15.73 0.62 0.29 0.44 1.7 0.91 1.04 7.83 6.11 11.26 12.87 12.57 27.6
0.05 0.13 0.03 0.17 0.28 0.02 1.17 0.01 0.05 0.0 0.88 0.53 0.14 0.12 0.65 1.24 0.31 0.56 1.06 1.06 1.45 0.21 0.04 0.0 0.12 0.56 0.69 2.26 1.79 1.91 2.19 2.22 3.49
1.92 0.23 2.29 1.31 1.63 2.01 3.37 0.17 0.0 0.41 24.54 1.69 10.01 2.38 20.62 33.93 15.31 10.61 25.63 21.84 26.01 5.9 0.64 0.16 7.24 0.12 2.27 0.24 0.07 0.14 0.23 0.91 0.32
11.15 12.59 10.81 11.01 11.89 16.08 26.83 13.92 13.05 13.97 36.65 44.43 14.96 24.72 42.72 18.46 20.38 29.52 32.16 22.51 35.63 16.53 12.25 12.5 18.41 26.18 25.92 27.86 31.9 38.85 25.6 27.74 47.25
0.0 0.0 0.05 0.3 0.32 0.52 0.46 1.63 0.89 2.44 22.42 9.1 0.52 7.82 8.27 30.28 4.35 28.24 26.43 23.88 27.23 0.35 0.53 0.0 1.55 17.12 13.35 8.85 13.45 23.23 12.69 10.23 29.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.01 0.0 0.0 10.25 1.86 1.74 1.18 1.25 14.17 4.05 8.16 7.38 3.33 7.76 1.36 3.68 1.23 4.23 1.12 1.15 2.13 5.03 6.43 1.32 1.29 6.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.05 0.15 0.02 0.0 0.14 0.12 0.13 0.09 0.22 0.11 0.15 0.29 0.04 0.22 0.03 0.03 0.16 0.24 0.49 0.18 0.25 0.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.17 0.06 0.17 0.84 3.11 0.68 0.83 1.29 1.55 1.29 0.08 1.45 0.0 0.05 0.01 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
4.75 6.74 0.71 0.62 0.28 0.57 16.45 0.1 0.02 0.39 154.41 8.38 17.02 2.62 29.7 46.34 24.28 126.46 110.49 134.28 112.21 4.1 26.75 16.21 11.76 6.62 3.13 74.71 57.5 42.72 142.48 157.25 57.87
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.01 0.04 0.14 0.05 0.1 0.07 0.18 0.17
0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.18 0.0 0.04 0.01 0.1 0.29 0.14 0.1 0.02 0.09 0.2 0.08 0.09 0.09 0.09 0.13 0.02 0.64 0.27 0.18 0.31 0.78 0.27 0.58 0.42 0.89 1.18
0.01 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 10.71 1.29 0.91 0.96 0.41 7.96 4.47 5.99 6.32 5.84 5.4 0.58 2.6 1.03 3.84 1.2 1.21 1.15 4.3 5.85 0.93 0.82 8.46
0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.14 0.03 0.25 0.39 9.05 0.0 0.0 0.1 5.0 5.1 1.92 8.28 7.52 7.48 5.1 0.0 0.29 0.0 0.0 1.16 1.14 6.54 1.63 1.47 8.41 11.91 1.18
0.29 0.93 0.04 0.03 0.02 0.0 0.54 0.0 0.3 0.03 21.32 2.84 2.95 2.86 12.11 6.77 2.56 36.19 17.1 18.6 19.77 0.83 0.84 0.0 3.15 1.7 1.87 16.99 6.38 3.06 14.7 24.3 11.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.17 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.24 0.29 0.26 0.16 0.22 0.29
16.8 19.43 2.92 2.29 1.67 2.67 6.51 2.44 2.68 2.21 239.33 5.16 21.77 1.39 29.46 68.55 34.0 287.06 189.59 149.92 175.71 1.92 8.93 24.68 9.01 8.21 5.08 55.24 42.18 30.47 108.04 113.57 36.76
2.74 2.36 2.84 2.14 1.72 0.6 0.94 0.16 0.23 0.93 0.78 0.81 1.51 0.5 0.67 0.72 0.21 0.93 0.85 0.34 0.73 0.43 0.82 0.2 1.8 0.21 0.27 0.68 2.43 3.44 0.96 0.72 3.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.75 0.0 0.1 0.0 0.38 0.86 0.94 1.04 1.08 0.97 1.06 0.0 0.0 0.0 0.2 0.33 0.43 0.96 0.19 0.32 1.0 0.93 0.12
0.88 0.57 0.59 1.18 0.99 2.06 2.53 0.59 0.74 1.18 1.07 2.29 0.87 1.75 1.87 0.56 1.32 0.56 0.68 1.08 0.94 0.85 0.64 1.17 2.17 1.19 1.57 1.32 1.58 1.87 1.06 1.56 2.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.14 0.0 0.82 2.71 0.15 1.16 0.73 0.38 1.77 0.11 0.07 0.0 0.71 0.12 0.33 1.5 1.09 1.07 1.98 2.68 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.76 0.0 0.91 2.17 0.23 0.56 2.18 0.65 1.33 0.0 0.0 0.0 0.76 0.01 0.19 2.08 1.72 2.36 3.47 4.79 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.48 0.4 1.13 1.35 1.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 2.77 1.43 2.6 2.56 4.2 3.41
6.88 4.87 9.91 7.54 9.74 7.44 7.47 4.89 2.91 2.8 8.12 5.11 8.88 3.36 7.83 8.57 5.69 7.6 7.66 7.05 7.37 5.78 6.92 8.92 7.92 4.39 4.48 8.33 7.66 6.78 8.16 6.48 6.45
168.02 101.87 188.26 235.35 273.07 412.58 171.95 140.67 189.18 206.21 945.29 128.48 267.65 88.57 300.43 447.01 540.03 875.69 812.96 605.37 790.47 97.23 170.35 271.81 244.17 212.87 277.67 366.52 484.62 522.97 377.43 327.07 533.55
0.52 0.31 1.18 0.96 2.27 0.92 1.44 0.88 0.7 0.9 2.23 0.41 0.57 0.0 1.25 2.19 1.54 2.27 1.79 2.09 2.04 1.07 0.64 1.95 0.57 1.53 1.14 5.2 3.26 3.51 2.95 3.92 7.09
0.04 0.02 0.04 0.01 0.03 0.0 0.78 0.01 0.04 0.0 1.5 0.5 0.59 0.07 1.99 1.83 1.03 0.23 0.87 2.0 1.56 0.7 0.73 1.49 0.07 1.51 0.93 4.36 1.89 2.39 2.71 3.67 6.53
11.19 15.44 9.76 16.3 17.3 28.21 37.97 7.17 14.44 10.65 30.67 36.93 16.68 41.08 8.91 33.82 15.39 28.84 31.13 29.25 30.4 22.95 19.66 20.45 26.36 19.23 14.6 10.62 17.85 33.82 12.31 11.01 31.67
0.0 0.02 0.0 0.05 0.03 0.15 0.33 0.0 0.0 0.0 6.46 0.6 0.67 0.0 0.34 1.31 1.48 1.57 3.95 2.45 3.01 0.18 0.0 0.0 2.41 0.28 0.68 1.78 1.04 1.24 0.86 0.89 1.48
42.18 23.59 70.06 40.89 25.31 25.92 23.39 8.82 7.2 21.59 8.48 2.55 10.81 2.69 30.8 8.12 8.45 7.8 8.5 6.94 9.8 6.24 6.21 8.92 4.68 9.02 9.13 41.6 45.58 97.97 47.59 34.7 65.29
4.26 2.47 7.12 5.97 4.1 2.11 4.28 1.0 0.49 0.6 3.53 2.29 4.35 3.19 3.24 4.63 0.57 3.66 4.28 4.81 3.51 3.61 2.38 4.61 2.83 0.03 0.02 4.56 4.66 2.8 3.25 2.98 3.66
1.43 0.65 3.19 2.92 2.71 1.44 2.12 0.26 0.2 0.39 3.55 0.64 2.06 0.77 2.43 2.46 1.66 2.5 3.48 2.47 3.79 2.01 0.13 0.02 1.18 0.43 0.53 3.69 5.84 5.98 3.76 3.26 5.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.6 0.15 0.19 8.84 0.36 0.15 1.06 0.0 0.0 0.07 0.98 0.04 0.18 0.02 4.01 2.24 6.53 10.5 5.11 3.72 1.47 11.98
0.02 0.01 0.15 0.09 0.2 0.49 0.51 0.07 0.14 0.13 0.29 0.53 0.37 0.02 0.12 0.32 0.55 0.66 0.31 0.13 0.16 0.31 0.13 0.79 0.57 0.84 1.19 2.57 1.06 2.4 2.21 3.7 4.84
0.53 0.64 0.23 0.3 0.26 0.1 1.23 0.01 0.17 0.02 1.81 0.41 0.18 0.24 0.84 1.78 0.52 2.2 1.64 2.72 2.59 0.11 0.04 0.02 0.05 0.64 0.76 1.48 1.01 1.45 1.43 1.63 2.17
0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.19 2.79 0.0 0.0 0.0 7.12 0.1 3.77 0.1 2.16 5.28 2.92 4.09 9.09 10.4 10.33 0.26 0.09 0.18 2.66 0.96 1.49 6.19 3.19 2.81 10.63 10.37 3.05
0.53 0.31 0.17 0.07 0.1 0.17 2.87 0.4 0.16 0.73 6.51 0.48 3.01 0.0 1.97 2.41 2.65 4.22 6.39 5.73 5.28 0.2 0.29 0.16 2.81 1.25 2.93 9.86 3.46 3.04 14.63 13.12 2.86
0.92 0.7 2.87 1.99 1.49 1.07 1.24 0.07 0.13 0.05 1.06 0.19 0.44 0.07 0.41 0.65 0.5 1.19 0.96 0.56 0.9 0.59 0.0 0.0 0.47 0.18 0.32 1.85 2.11 2.83 2.11 1.61 3.13
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.04 0.04 1.49 0.05 0.06 0.0 0.05 0.36 0.1 0.63 1.17 0.18 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.56 0.54 0.74 0.47 0.37 1.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.02 0.1 0.0 0.34 1.13 0.02 0.98 1.62 0.38 1.22 0.0 0.0 0.0 0.15 0.01 0.1 0.83 0.81 0.18 0.35 0.31 0.48
0.01 0.11 0.06 0.02 0.08 0.19 0.03 0.03 0.01 0.06 1.18 2.08 0.3 0.89 0.26 1.22 2.04 0.68 2.73 1.57 2.46 0.47 0.0 0.32 1.23 0.52 0.71 2.55 2.49 2.9 2.4 1.88 3.79
1.19 0.87 0.24 2.23 2.39 1.97 15.66 0.13 0.04 0.16 60.95 2.1 13.41 1.22 21.84 40.3 11.35 58.39 63.93 54.46 57.81 1.47 0.37 2.15 12.97 1.9 2.85 23.76 7.66 7.12 33.75 34.69 6.75
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.97 0.24 1.18 0.48 2.23 2.82 0.39 6.04 4.77 2.34 4.41 0.31 0.11 0.2 0.12 0.18 0.43 3.11 2.48 1.26 2.54 1.74 1.08
8.65 16.19 3.18 4.26 4.08 6.72 73.51 7.47 9.4 14.63 51.22 53.0 45.89 15.55 76.51 30.28 18.4 33.89 25.7 25.7 30.49 26.23 9.32 64.83 33.03 64.73 60.15 22.44 113.8 127.63 25.18 18.45 127.24
1.37 0.82 1.51 1.88 3.46 6.1 21.89 4.18 3.67 11.5 38.47 32.39 8.47 15.93 15.79 21.75 25.99 22.35 23.16 23.52 20.32 21.19 18.23 23.47 16.27 44.52 51.63 74.72 90.14 91.05 61.08 53.2 124.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.19 0.18 0.6 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.63 0.91 0.78 0.44 0.51 1.18
0.02 0.07 0.0 0.06 0.01 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 2.23 0.95 1.0 1.42 1.32 2.57 0.84 2.83 1.72 1.42 3.03 1.28 2.34 0.0 0.05 0.06 0.07 0.74 2.67 2.19 0.38 0.66 6.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.25 1.12 0.1 0.67 0.1 4.06 3.01 3.59 3.55 2.65 4.45 0.6 0.93 0.36 1.75 0.94 1.08 0.81 3.87 3.52 0.59 0.6 5.93
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 10.68 0.74 1.3 0.36 7.09 6.32 1.68 10.71 9.49 9.53 9.74 0.29 1.19 0.06 1.89 1.22 1.1 4.64 1.92 0.62 4.8 6.46 2.76
0.35 0.24 0.22 0.14 0.47 0.4 0.17 0.03 0.56 0.0 63.51 0.76 8.68 0.26 46.86 36.75 23.35 38.31 43.02 35.34 38.18 0.58 1.81 0.02 3.74 0.08 2.03 8.87 16.16 25.22 14.31 9.74 21.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37 0.0 0.1 0.0 1.54 1.02 0.26 3.91 1.86 1.24 1.81 0.0 0.0 0.0 0.3 0.47 0.35 0.21 0.63 0.14 1.3 1.67 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 38.71 2.82 6.54 4.73 23.36 13.63 5.91 46.62 35.03 27.32 36.23 0.75 1.06 0.02 5.56 1.74 1.95 21.52 5.2 4.24 15.55 26.35 10.87
10.12 8.64 14.98 19.98 17.65 16.95 37.93 3.99 12.2 1.74 29.27 12.13 20.51 8.59 19.8 30.87 16.55 23.72 23.0 24.96 21.38 1.8 10.93 5.27 19.79 5.58 6.65 14.67 32.22 36.22 17.66 15.14 30.48
1.17 1.93 0.93 1.82 0.94 1.65 2.23 2.2 2.03 1.39 7.94 1.27 4.94 2.14 2.09 5.98 4.57 6.84 6.93 4.56 6.93 1.76 2.2 0.99 5.34 2.48 3.79 6.96 6.12 6.07 7.76 6.23 4.94
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17.88 0.72 2.02 0.62 7.35 11.96 4.47 15.38 15.88 35.32 17.31 0.13 1.9 0.1 0.54 12.06 8.68 14.99 18.17 22.89 15.31 20.78 32.96
0.09 0.16 0.01 0.04 0.09 0.02 0.01 0.07 0.01 0.02 2.14 0.14 0.03 0.26 0.22 1.49 0.05 1.67 1.34 1.01 0.76 0.08 0.0 0.0 0.1 0.11 0.13 1.45 1.8 1.44 0.41 0.32 3.58
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0 0.25 0.38 1.03 1.71 0.55 0.33 0.26 0.88 0.55 0.14 0.0 0.02 0.89 0.25 0.24 1.86 1.54 1.36 0.94 0.89 1.87
0.25 0.59 0.05 0.11 0.05 0.19 0.58 0.0 0.1 0.18 8.86 3.37 1.08 1.13 2.86 8.01 2.4 12.1 7.02 6.65 8.22 1.43 0.95 0.2 0.17 0.09 0.09 2.8 9.29 8.3 1.23 2.83 17.53
0.01 0.05 0.09 0.03 0.14 0.0 0.8 0.02 0.1 0.0 0.33 0.31 0.02 0.02 0.41 0.68 0.17 0.56 0.66 0.52 0.51 0.05 0.09 0.0 0.02 0.21 0.28 1.56 1.24 1.02 1.28 1.55 2.26
12.72 10.53 18.35 23.16 22.65 26.14 29.73 10.43 16.46 19.7 35.71 22.7 27.71 22.63 21.63 32.78 27.03 30.64 17.41 24.38 27.94 19.57 18.34 10.53 26.38 20.71 23.04 17.76 26.19 40.42 17.3 15.78 44.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.05 0.01 0.02 0.08 0.05 0.13 0.1 0.26 0.18
0.21 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.03 0.0 0.19 19.82 0.36 5.33 0.46 11.85 13.31 34.32 14.32 33.01 27.23 36.62 0.76 0.4 0.36 6.74 10.08 13.66 14.97 21.12 21.97 15.48 13.32 28.54
0.1 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.32 0.14 0.1 0.07 0.5 0.07 0.09 0.3 0.49 0.61 0.21 0.11 0.13 0.0 0.07 0.04 0.03 0.37 0.32 0.57 0.41 0.66 1.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.74 0.35 1.39 12.59 0.2 0.13 3.99 0.0 0.0 0.09 2.76 0.29 0.18 0.0 5.81 2.99 11.91 18.89 7.87 6.12 2.49 21.4
0.02 0.04 0.0 0.03 0.03 0.0 0.23 0.0 0.04 0.0 0.17 0.1 0.01 0.02 0.02 0.09 0.05 0.08 0.0 0.09 0.25 0.0 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.04 0.12 0.02 0.01 0.07
3.24 2.35 1.45 1.2 1.98 1.76 4.17 1.14 1.72 1.0 53.36 0.74 2.14 0.6 24.1 39.28 10.66 61.22 54.5 44.48 48.58 0.95 0.73 0.46 4.85 2.43 4.35 13.81 7.3 7.43 18.81 19.7 6.28

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)