Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00163560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.151)
- - - - 0.34 - 2.56 - 1.61 2.55 -0.02 - - -0.25 -2.92 - - -0.4 -1.38 -0.88 0.44 -0.11
AMTR_s00002p00100490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.58)
- - - - - - 3.02 - 1.72 2.33 - - 0.94 -0.75 1.61 - - - - - - -
AMTR_s00002p00127350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.84)
- - - - 3.58 - - - 3.32 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00002p00238510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.287)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00003p00044650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.26)
- - - - - - - - 3.51 2.97 - - - - - - - - - 1.48 - -
AMTR_s00003p00270330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.431)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00004p00244560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.238)
- - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00005p00110340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.29)
- - - - - - 2.46 - 3.09 3.0 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00005p00244730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.140)
- - - - 2.4 - - - 3.74 1.75 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00006p00234700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.105)
- - - - 2.13 - 2.82 - 3.0 1.35 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00006p00237030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.108)
- - - - 2.18 - - - 3.41 2.78 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00007p00073270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.39)
- - - - 1.84 - 2.94 - 3.19 0.68 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00010p00069010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.37)
- - - - 1.82 - -0.34 - 1.56 2.73 - - 1.8 - - - - - - - - 2.2
AMTR_s00010p00126170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.83)
- - - 0.49 -0.7 - 2.89 - 1.46 1.79 -0.14 0.09 -0.19 -0.22 -0.91 - -0.61 - -2.85 -1.89 - 0.05
AMTR_s00010p00238860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.296)
- - - - 0.92 - 2.89 - 3.05 2.03 - - -2.81 -3.42 -3.52 - - - - - - -
AMTR_s00011p00266070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.227)
- - - - - - 2.89 - - 3.87 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00012p00055520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.16)
- - - - 3.56 - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00012p00214500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.155)
- - - - 0.97 - 3.33 - 1.17 1.94 - - - -0.28 1.6 - - - - - - -
AMTR_s00013p00259990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.267)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00016p00183360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.145)
- - - - 0.78 - 2.03 - 0.43 2.18 - - 0.91 0.66 - - - - - - - 2.78
AMTR_s00016p00256640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.343)
- - - - - - - - 0.55 3.62 - - - 0.79 2.71 - - - - - - -
AMTR_s00018p00159390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.89)
- - - - 2.21 - - - 3.93 1.06 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00019p00146540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.133)
- - - - - - - - 3.61 2.93 - - - 1.11 - - - - - - - -
AMTR_s00019p00190310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.210)
- - - - 2.21 - - - 3.38 2.8 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00022p00078940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.61)
- - - - -0.99 - 3.17 - 2.02 2.71 -1.91 - - 0.09 - - - - - - - -0.87
AMTR_s00022p00113590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.102)
- - - - -0.27 - 2.38 - 1.56 2.32 - - - - 0.3 - - - - - 2.77 -
AMTR_s00025p00043160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.22)
- - - - 3.62 - - - 2.52 - - - - - 2.0 - - - - - - -
AMTR_s00025p00143670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.156)
- - - - - - 1.88 - 1.13 1.87 - - - 2.47 2.79 - - - - - - -
AMTR_s00025p00227340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.324)
- - - - - - - - 0.47 - - - - 2.91 0.62 - 3.53 - - - - -
AMTR_s00030p00204560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.149)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00030p00223090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.172)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00032p00217210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.214)
- - - - - - 3.33 - - - - - - - 1.97 - - - - 3.0 - -
AMTR_s00036p00108740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.43)
- - - - - - - - 3.7 3.17 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00036p00145440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.68)
- - - - - - 2.75 - 2.51 2.96 - - - -0.06 -0.23 - - - - - - -
AMTR_s00037p00238350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.162)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00038p00061290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.24)
- - - - - - - - 4.3 1.2 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00039p00051030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.19)
- - - - 3.56 - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00040p00219580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.243)
- - - - 1.71 - -0.32 - 3.24 1.77 0.1 1.88 - - - - - - - - - -1.8
AMTR_s00041p00205370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.189)
- - - - - - - - 3.41 3.5 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00041p00213780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.225)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00041p00217310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.241)
- - - - 3.85 - - - 2.16 1.65 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00043p00200100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00043.60)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00044p00130430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.118)
- - - - - - - - 3.66 3.23 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00050p00041270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.10)
- - - - - - - - 3.7 - - - - - 3.16 - - - - - - -
AMTR_s00051p00169130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.64)
- - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00052p00099240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.28)
- - - - 0.83 - 2.58 - 2.38 2.16 - - -0.28 0.04 0.92 - - - - -0.31 - -
AMTR_s00055p00192650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.127)
- - - - - - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - -
AMTR_s00057p00191600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.213)
- - - - - - - - 4.01 2.57 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00061p00117680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.94)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00061p00139570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.119)
- - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00062p00174230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.168)
- - - - -1.59 - 1.99 - 1.99 0.53 0.07 - -0.02 0.19 0.78 - - 1.75 - -0.52 1.59 -1.71
AMTR_s00063p00185550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.67)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00067p00138260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.124)
- - - - 3.62 - - - 2.94 -0.34 - - 0.32 - - - - - - - - -
AMTR_s00069p00179380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.169)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00074p00199590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.129)
- - - - 2.3 - 3.42 - - - - - - 2.66 - - - - - - - -
AMTR_s00076p00152920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.50)
- - - - 3.57 - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00077p00066660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.43)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00080p00087650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.29)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00081p00135650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.51)
- - - - 3.81 - - - 3.0 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00083p00019540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.4)
- - - - - - 3.56 - 3.35 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00083p00105420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.29)
- - - - - - 2.26 - 3.45 1.33 - - 1.03 0.8 - - - - - - - -
AMTR_s00086p00105150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.54)
- - - - - - 3.08 - 3.44 - - - 1.42 - - - - - - - - -
AMTR_s00087p00171080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00087.54)
- - - - - - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - -
AMTR_s00088p00132500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.97)
- - - - 0.05 - 3.41 - 2.39 2.34 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00089p00115940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.63)
- - - - 2.67 - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00091p00084260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00091.31)
- - - - - - 3.34 - - 3.57 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00105p00127920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00105.62)
- -2.4 -1.37 - 0.11 - - - - - 0.27 0.45 1.43 2.24 0.4 - - - - -2.17 3.1 -2.33
- - - - - - 3.97 - - 2.66 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00108p00141880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00108.43)
- - - - - - 2.77 - - 2.53 - - - 3.23 - - - - - - - -
AMTR_s00114p00022200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.7)
- - - - - - 3.61 - 2.59 1.5 - - - -0.02 - - - - - - - -
AMTR_s00117p00111640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.46)
- - - - - - - - 3.74 3.12 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00118p00065230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00118.10)
- - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00122p00136570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.73)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00124p00045850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00124.5)
- - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00129p00117890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.92)
- - - - - - 3.89 - 1.88 0.68 - - - 0.88 - - - - - - - -
AMTR_s00130p00078370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.35)
- - - - 2.18 - 2.12 - 0.89 -0.36 - - -0.66 -1.89 -1.97 - 2.13 - 1.91 - - 0.3
AMTR_s00144p00041480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.16)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00149p00098020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.81)
- - - - - - 2.91 - 3.06 2.63 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00165p00052980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00165.34)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00167p00042130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00167.17)
- - - - - - - - - 3.74 - - - - 3.11 - - - - - - -
AMTR_s00174p00067570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00174.35)
- - - - 2.89 - - - 3.65 0.64 - - -2.48 - -1.89 - - - - - - -
AMTR_s00178p00026980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00178.2)
- - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00194p00015150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00194.3)
- - - - - - 3.91 - 1.89 1.69 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00194p00019170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00194.7)
- - - - 2.34 - 2.88 - 1.9 1.23 - - -2.45 -0.44 - - 0.96 - - -1.75 - -1.68
AMTR_s00213p00012540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00213.1)
- - - - 3.95 - - - 2.71 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00238p00020510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00238.3)
- - - - - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00240p00014450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00240.1)
- - - - 2.95 - - - 2.56 - - - - - 3.06 - - - - - - -
AMTR_s00374p00013480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00374.4)
- - - - - - 1.34 - 3.58 2.9 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s01152p00009680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01152.1)
- - - - - - - - 3.22 3.3 - - - 1.52 - - - - - - - -
AMTR_s01798p00005570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01798.2)
- - - - - - - - - - - - -0.63 3.28 -1.28 - - - - - 3.37 -0.16
- - - - - - - - - - - - - 4.46 - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.17 2.02 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s04521p00003460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04521.1)
- - - - 2.21 - 0.34 - 3.14 1.35 2.26 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.