Heatmap: Cluster_382 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.66 0.62 0.47 0.36 0.4 0.36 0.9 0.54 0.39 0.47 0.56 0.55 0.8 0.76 0.45 0.55 0.56 0.48 0.62 0.52 0.57 0.74 0.74 0.71 0.87 0.5 0.5 0.67 0.98 1.0 0.67 0.51 0.9
0.52 0.38 0.42 0.4 0.28 0.13 1.0 0.16 0.1 0.19 0.2 0.51 0.44 0.26 0.17 0.15 0.33 0.16 0.17 0.17 0.18 0.47 0.51 0.3 0.35 0.34 0.41 0.19 0.48 0.5 0.23 0.19 0.51
0.5 0.45 0.6 0.49 0.42 0.5 0.98 0.22 0.21 0.2 0.58 0.56 0.55 0.82 0.6 0.72 0.49 0.61 0.54 0.36 0.58 0.64 0.65 0.85 0.66 0.61 0.66 0.75 0.94 1.0 0.87 0.6 0.74
0.33 0.42 0.21 0.12 0.19 0.24 0.28 0.18 0.17 0.12 0.18 0.2 0.51 0.27 0.11 0.17 0.21 0.18 0.16 0.14 0.14 0.31 0.52 1.0 0.2 0.41 0.38 0.32 0.53 0.47 0.38 0.26 0.44
0.86 0.78 0.63 0.62 0.59 0.42 0.92 0.4 0.33 0.59 0.74 0.84 0.98 0.82 0.42 0.79 0.8 0.98 0.71 0.72 0.68 0.86 0.87 0.73 0.96 0.73 0.77 0.79 0.96 1.0 0.78 0.73 1.0
0.79 0.7 0.52 0.37 0.39 0.38 1.0 0.27 0.3 0.23 0.27 0.61 0.6 0.5 0.42 0.28 0.38 0.24 0.2 0.23 0.22 0.76 0.94 0.65 0.42 0.63 0.59 0.64 0.79 0.74 0.68 0.55 0.84
0.58 0.44 0.33 0.26 0.22 0.27 1.0 0.2 0.16 0.2 0.15 0.69 0.35 0.61 0.71 0.17 0.34 0.18 0.26 0.11 0.13 0.78 0.81 0.49 0.29 0.49 0.44 0.75 0.7 0.68 0.73 0.6 0.76
0.3 0.4 0.23 0.26 0.26 0.41 0.46 0.15 0.13 0.11 0.15 0.5 0.4 0.33 0.31 0.25 0.27 0.12 0.14 0.13 0.15 0.58 0.36 1.0 0.32 0.37 0.39 0.36 0.52 0.56 0.4 0.35 0.45
0.52 0.32 0.32 0.25 0.27 0.14 1.0 0.09 0.07 0.09 0.19 0.39 0.3 0.23 0.16 0.21 0.36 0.18 0.14 0.11 0.16 0.5 0.59 0.41 0.36 0.39 0.36 0.43 0.6 0.61 0.46 0.38 0.6
0.75 0.61 0.53 0.37 0.38 0.32 0.67 0.18 0.18 0.15 0.51 0.5 0.62 0.67 0.45 0.4 0.42 0.45 0.34 0.21 0.32 0.64 1.0 0.12 0.55 0.54 0.54 0.76 0.66 0.59 0.59 0.66 0.66
0.62 0.47 0.54 0.37 0.37 0.31 0.59 0.27 0.24 0.24 0.58 0.63 0.84 0.67 0.33 0.49 0.43 0.49 0.49 0.5 0.54 0.86 1.0 0.69 0.56 0.62 0.59 0.55 0.67 0.63 0.63 0.47 0.59
0.67 0.71 0.55 0.53 0.47 0.48 0.85 0.59 0.46 0.45 0.42 0.73 0.88 0.79 0.41 0.55 0.49 0.43 0.42 0.43 0.46 0.97 1.0 0.81 0.76 0.65 0.69 0.66 0.88 0.94 0.69 0.64 0.81
0.66 0.66 0.61 0.56 0.57 0.43 0.72 0.42 0.43 0.49 0.54 0.62 0.5 0.62 0.63 0.57 0.8 0.66 0.57 0.7 0.53 0.58 0.67 0.47 0.48 0.7 0.73 0.7 1.0 0.91 0.69 0.64 0.88
0.37 0.59 0.11 0.11 0.1 0.16 0.72 0.09 0.17 0.12 0.03 0.48 0.57 0.39 0.02 0.03 0.36 0.01 0.02 0.01 0.01 0.75 1.0 0.38 0.34 0.44 0.46 0.19 0.61 0.77 0.29 0.19 0.52
0.76 0.68 0.68 0.51 0.52 0.44 1.0 0.43 0.34 0.37 0.66 0.64 0.69 0.71 0.67 0.62 0.65 0.89 0.64 0.55 0.61 0.61 0.58 0.56 0.58 0.73 0.83 0.76 0.95 0.92 0.83 0.71 0.91
0.69 0.58 0.46 0.4 0.44 0.45 0.72 0.32 0.25 0.24 0.3 0.69 0.49 0.76 0.47 0.31 0.47 0.45 0.41 0.39 0.31 0.88 0.68 0.3 0.56 0.57 0.55 0.88 0.74 1.0 0.78 0.59 0.9
0.4 0.51 0.25 0.21 0.21 0.22 0.58 0.26 0.29 0.24 0.35 0.5 0.74 0.76 0.38 0.38 0.39 0.27 0.28 0.27 0.3 0.8 1.0 0.87 0.47 0.66 0.61 0.49 0.74 0.76 0.52 0.4 0.78
0.61 0.6 0.33 0.22 0.32 0.44 0.48 0.3 0.41 0.48 0.39 0.51 0.27 0.73 0.53 0.44 0.35 0.24 0.37 0.4 0.39 0.52 0.64 0.27 0.35 0.54 0.53 0.98 0.85 0.78 1.0 0.86 0.78
0.47 0.52 0.2 0.09 0.05 0.05 1.0 0.08 0.04 0.18 0.01 0.94 0.2 0.42 0.0 0.01 0.09 0.01 0.01 0.02 0.01 0.46 0.53 0.1 0.12 0.54 0.28 0.22 0.51 0.26 0.33 0.16 0.25
0.1 0.14 0.05 0.04 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.08 0.01 0.87 0.22 0.3 0.02 0.01 0.09 0.01 0.01 0.02 0.01 0.34 0.3 0.14 0.13 0.41 0.22 0.23 0.58 0.3 0.36 0.22 0.28
0.45 0.5 0.21 0.13 0.25 0.24 0.37 0.31 0.36 0.19 0.37 0.38 0.84 0.44 0.37 0.29 0.41 0.34 0.32 0.3 0.33 0.68 0.97 1.0 0.44 0.56 0.56 0.53 0.79 0.82 0.6 0.42 0.67
0.54 0.41 0.57 0.4 0.45 0.34 1.0 0.32 0.24 0.34 0.42 0.66 0.6 0.77 0.43 0.59 0.48 0.49 0.54 0.49 0.49 0.74 0.8 0.71 0.63 0.57 0.55 0.61 0.83 0.75 0.62 0.53 0.73
0.43 0.37 0.27 0.14 0.23 0.22 1.0 0.11 0.12 0.1 0.06 0.49 0.64 0.73 0.21 0.08 0.31 0.08 0.07 0.08 0.05 0.68 0.7 0.69 0.2 0.38 0.45 0.2 0.59 0.47 0.24 0.14 0.6
0.79 0.97 0.47 0.44 0.39 0.58 0.83 0.38 0.38 0.39 0.57 0.71 0.86 0.76 0.58 0.54 0.52 0.54 0.51 0.5 0.53 0.87 0.98 0.77 0.53 0.79 0.79 0.75 0.97 1.0 0.79 0.62 0.94
0.61 0.68 0.35 0.29 0.18 0.14 0.82 0.22 0.13 0.21 0.37 0.7 0.94 0.67 0.92 0.47 0.57 0.39 0.42 0.41 0.44 0.87 1.0 0.82 0.58 0.66 0.69 0.78 0.92 0.99 0.84 0.74 0.83
0.74 0.8 0.43 0.33 0.33 0.33 0.81 0.31 0.29 0.33 0.44 0.79 0.77 0.95 0.17 0.53 0.33 0.57 0.49 0.48 0.51 1.0 0.99 0.87 0.52 0.6 0.64 0.45 0.68 0.69 0.46 0.38 0.62
0.42 0.34 0.49 0.27 0.36 0.29 1.0 0.19 0.19 0.1 0.31 0.65 0.53 0.77 0.56 0.5 0.44 0.47 0.37 0.32 0.35 0.75 0.97 0.77 0.41 0.54 0.57 0.52 0.63 0.57 0.51 0.42 0.63
0.36 0.48 0.14 0.08 0.07 0.15 1.0 0.22 0.19 0.16 0.09 0.65 0.79 0.43 0.08 0.08 0.35 0.06 0.07 0.06 0.07 0.46 0.52 0.12 0.33 0.41 0.49 0.08 0.79 0.81 0.18 0.03 0.6
0.41 0.45 0.14 0.08 0.08 0.13 1.0 0.09 0.09 0.08 0.04 0.4 0.91 0.66 0.02 0.0 0.34 0.02 0.02 0.02 0.06 0.93 0.65 0.86 0.24 0.45 0.46 0.15 0.87 0.75 0.24 0.03 0.58
0.34 0.47 0.19 0.15 0.2 0.14 0.73 0.13 0.1 0.1 0.49 0.83 1.0 0.92 0.54 0.48 0.26 0.24 0.31 0.36 0.33 0.98 0.79 0.97 0.33 0.79 0.7 0.62 0.95 0.88 0.57 0.53 0.75
0.5 0.45 0.34 0.22 0.29 0.21 0.52 0.33 0.29 0.37 0.55 0.66 0.96 0.6 0.41 0.51 0.48 0.55 0.37 0.33 0.36 0.89 0.91 1.0 0.64 0.71 0.76 0.65 0.8 0.85 0.7 0.58 0.8
0.53 0.51 0.49 0.53 0.47 0.58 0.47 0.47 0.47 0.76 0.42 0.62 0.58 0.79 0.48 0.39 0.5 0.37 0.42 0.45 0.34 0.71 0.55 0.75 0.39 0.55 0.62 0.74 0.89 0.98 0.9 0.67 1.0
0.41 0.31 0.18 0.1 0.11 0.14 0.54 0.05 0.05 0.03 0.09 0.6 0.11 1.0 0.06 0.15 0.09 0.1 0.1 0.08 0.09 0.68 0.26 0.25 0.16 0.53 0.37 0.25 0.13 0.15 0.12 0.29 0.34
0.53 0.6 0.41 0.42 0.34 0.54 0.66 0.35 0.29 0.34 0.45 0.55 0.9 0.62 0.57 0.46 0.52 0.44 0.48 0.49 0.53 0.8 1.0 0.9 0.55 0.66 0.63 0.62 0.88 0.82 0.69 0.59 0.86
0.7 0.67 0.43 0.45 0.32 0.45 0.58 0.43 0.41 0.46 0.55 0.65 0.76 0.72 0.48 0.61 0.54 0.77 0.33 0.52 0.56 0.76 0.72 0.32 0.6 0.65 0.74 0.79 0.94 0.93 0.82 0.69 1.0
0.59 0.57 0.45 0.35 0.44 0.45 0.8 0.49 0.38 0.31 0.53 0.89 1.0 0.78 0.59 0.51 0.48 0.49 0.46 0.5 0.48 0.85 0.8 0.86 0.77 0.49 0.52 0.67 0.96 0.86 0.7 0.6 0.78
0.32 0.6 0.11 0.12 0.1 0.22 1.0 0.11 0.14 0.12 0.19 0.57 0.32 0.52 0.81 0.4 0.29 0.28 0.21 0.2 0.28 0.58 0.71 0.78 0.39 0.51 0.49 0.72 0.85 0.68 0.82 0.71 0.72
0.57 0.74 0.31 0.19 0.2 0.17 0.7 0.25 0.12 0.16 0.27 0.53 0.66 0.65 0.15 0.3 0.3 0.24 0.25 0.25 0.29 0.92 0.87 0.75 0.43 0.57 0.59 0.53 1.0 0.88 0.64 0.44 0.76
0.47 0.59 0.22 0.2 0.16 0.2 0.81 0.13 0.17 0.24 0.4 0.62 0.75 0.75 0.5 0.4 0.42 0.43 0.37 0.45 0.5 0.67 1.0 0.92 0.52 0.74 0.66 0.64 0.82 0.7 0.69 0.53 0.86
0.44 0.47 0.26 0.24 0.36 0.35 0.54 0.31 0.31 0.3 0.36 0.51 0.76 0.57 0.26 0.41 0.38 0.5 0.3 0.37 0.32 0.61 0.71 0.62 0.39 0.51 0.49 0.54 1.0 0.87 0.55 0.45 0.77
0.36 0.37 0.23 0.14 0.13 0.17 0.63 0.14 0.09 0.22 0.32 0.43 0.6 0.62 0.73 0.51 0.33 0.38 0.39 0.45 0.44 0.53 0.7 1.0 0.42 0.54 0.52 0.5 0.62 0.61 0.52 0.4 0.66
0.41 0.31 0.4 0.3 0.22 0.16 0.77 0.16 0.13 0.14 0.19 0.43 0.46 0.54 0.4 0.36 0.26 0.33 0.24 0.32 0.34 0.61 0.54 1.0 0.29 0.42 0.45 0.44 0.69 0.63 0.48 0.36 0.55
0.47 0.42 0.42 0.31 0.52 0.28 0.88 0.38 0.27 0.24 0.33 0.58 0.55 0.36 0.59 0.41 0.59 0.32 0.26 0.27 0.28 0.84 1.0 0.77 0.51 0.56 0.57 0.64 0.89 0.77 0.64 0.53 0.96
0.32 0.4 0.36 0.36 0.29 0.34 0.8 0.22 0.19 0.29 0.39 0.65 0.82 0.64 0.44 0.34 0.57 0.33 0.34 0.41 0.36 0.91 1.0 0.65 0.53 0.58 0.58 0.57 0.9 0.93 0.57 0.58 1.0
0.41 0.42 0.17 0.1 0.13 0.18 0.71 0.1 0.21 0.09 0.13 0.39 0.58 0.45 0.13 0.19 0.31 0.18 0.1 0.14 0.11 0.74 1.0 0.46 0.52 0.35 0.37 0.27 0.48 0.45 0.36 0.26 0.45
0.46 0.61 0.17 0.12 0.12 0.24 0.63 0.19 0.29 0.11 0.36 0.42 0.53 0.44 0.28 0.32 0.26 0.32 0.16 0.21 0.2 0.44 0.18 0.28 0.63 0.56 0.5 0.86 0.61 0.69 0.94 0.85 1.0
0.58 0.65 0.52 0.54 0.51 0.57 0.79 0.36 0.3 0.31 0.44 0.7 0.58 0.73 0.42 0.46 0.54 0.41 0.44 0.39 0.45 0.81 0.69 0.41 0.61 0.65 0.68 0.67 0.79 0.85 0.66 0.67 1.0
0.49 0.64 0.45 0.49 0.45 0.53 0.65 0.5 0.42 0.59 0.39 0.62 0.61 0.61 0.3 0.32 0.44 0.39 0.42 0.39 0.46 0.71 0.7 0.64 0.36 0.56 0.6 0.64 1.0 1.0 0.76 0.55 1.0
0.47 0.58 0.3 0.35 0.41 0.54 0.7 0.48 0.59 0.35 0.55 0.64 0.69 0.65 0.3 0.54 0.38 0.7 0.58 0.62 0.67 0.7 0.99 0.51 0.51 0.58 0.62 0.67 0.96 1.0 0.71 0.57 0.93
0.57 0.62 0.46 0.47 0.47 0.61 0.74 0.58 0.51 0.56 0.33 0.71 0.59 1.0 0.25 0.28 0.46 0.33 0.34 0.46 0.37 0.71 0.79 0.69 0.4 0.55 0.6 0.71 0.98 0.92 0.64 0.52 0.99
0.28 0.24 0.25 0.21 0.19 0.16 0.41 0.16 0.12 0.07 0.05 0.22 0.32 0.18 0.19 0.06 0.22 0.07 0.05 0.07 0.06 0.45 0.41 1.0 0.28 0.31 0.32 0.38 0.31 0.29 0.39 0.42 0.35
0.48 0.35 0.34 0.23 0.35 0.28 0.72 0.29 0.28 0.21 0.23 0.49 1.0 0.37 0.44 0.24 0.56 0.12 0.26 0.27 0.2 0.69 0.65 0.69 0.8 0.69 0.59 0.6 0.61 0.58 0.55 0.62 0.55
0.49 0.39 0.53 0.44 0.45 0.3 1.0 0.2 0.15 0.14 0.29 0.45 0.91 0.46 0.34 0.29 0.44 0.29 0.33 0.28 0.32 0.66 0.75 0.92 0.5 0.55 0.52 0.71 0.73 0.67 0.68 0.59 0.61
0.79 0.57 0.4 0.27 0.29 0.27 0.61 0.31 0.32 0.19 0.36 0.5 0.81 0.52 0.4 0.32 0.52 0.42 0.38 0.32 0.38 0.65 1.0 0.92 0.63 0.58 0.56 0.47 0.51 0.47 0.46 0.4 0.51
0.39 0.54 0.2 0.18 0.14 0.3 0.92 0.1 0.08 0.1 0.07 0.37 0.41 0.21 0.3 0.11 0.23 0.08 0.04 0.05 0.04 0.84 0.62 0.26 0.3 0.31 0.39 1.0 0.61 0.66 0.79 0.63 0.83
0.41 0.52 0.33 0.37 0.4 0.53 0.41 0.47 0.35 0.38 0.3 0.56 0.61 0.58 0.4 0.34 0.45 0.34 0.39 0.27 0.32 0.48 0.66 0.8 0.37 0.5 0.47 0.72 0.83 1.0 0.91 0.69 0.87
0.19 0.23 0.07 0.05 0.07 0.03 0.22 0.03 0.05 0.08 0.2 0.3 0.42 0.33 0.39 0.21 0.22 0.16 0.27 0.26 0.18 0.68 0.6 1.0 0.19 0.49 0.46 0.55 0.62 0.5 0.42 0.43 0.46
0.47 0.62 0.22 0.17 0.19 0.22 0.57 0.18 0.23 0.18 0.4 0.43 0.83 0.54 0.28 0.36 0.33 0.33 0.25 0.29 0.31 0.57 0.86 1.0 0.34 0.61 0.55 0.57 0.7 0.69 0.52 0.42 0.75
0.38 0.48 0.25 0.2 0.22 0.28 0.39 0.26 0.29 0.23 0.51 0.4 0.64 0.49 0.31 0.54 0.26 0.52 0.47 0.47 0.48 0.5 0.71 1.0 0.32 0.48 0.46 0.57 0.73 0.66 0.59 0.41 0.59
0.37 0.31 0.28 0.28 0.27 0.16 0.46 0.23 0.13 0.1 0.17 0.28 0.48 0.18 0.23 0.25 0.25 0.27 0.16 0.16 0.31 0.31 0.38 1.0 0.33 0.27 0.31 0.46 0.41 0.43 0.41 0.34 0.45
0.58 0.55 0.24 0.15 0.12 0.11 1.0 0.16 0.1 0.12 0.03 0.47 0.24 0.58 0.06 0.03 0.06 0.03 0.03 0.05 0.03 0.86 0.9 0.61 0.13 0.53 0.5 0.42 0.67 0.47 0.32 0.32 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)