Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.75 0.55 0.53 0.78 1.0 0.13 0.37 0.31 0.38 0.48 0.47 0.29 0.15 0.14 0.52 0.38 0.4 0.71 0.84 0.46
0.76 0.53 0.73 1.0 0.6 0.17 0.31 0.47 0.42 0.43 0.91 0.39 0.57 0.53 0.85 0.71 0.52 0.5 0.6 0.4
1.0 0.91 0.85 0.51 0.86 0.23 0.5 0.53 0.6 0.52 0.73 0.44 0.31 0.28 0.84 0.92 0.6 0.76 0.77 0.61
0.78 0.41 0.7 0.55 0.67 0.34 0.41 0.54 0.39 0.4 0.66 0.35 0.32 0.32 0.63 0.34 0.41 0.75 1.0 0.48
0.65 0.48 0.61 0.43 0.72 0.27 0.39 0.44 0.55 0.57 1.0 0.34 0.23 0.22 0.82 0.69 0.77 0.34 0.98 0.4
0.7 0.48 0.53 0.8 0.78 0.42 0.48 0.55 0.31 0.34 0.68 0.31 0.23 0.25 0.73 0.42 0.41 1.0 0.9 0.28
0.74 0.83 0.63 1.0 0.68 0.15 0.27 0.41 0.48 0.42 0.63 0.22 0.14 0.12 0.48 0.36 0.29 0.5 0.81 0.22
1.0 0.57 0.62 0.61 0.72 0.34 0.44 0.51 0.41 0.39 0.67 0.29 0.41 0.33 0.63 0.39 0.27 0.61 0.57 0.74
0.89 0.57 0.81 0.68 0.74 0.09 0.36 0.45 0.36 0.43 0.97 0.27 0.26 0.25 1.0 0.48 0.46 0.67 0.87 0.35
1.0 0.6 0.69 0.83 0.82 0.29 0.37 0.48 0.36 0.36 0.4 0.46 0.28 0.34 0.36 0.28 0.36 0.6 0.66 0.44
1.0 0.91 0.62 0.71 0.9 0.47 0.39 0.61 0.5 0.42 0.56 0.29 0.41 0.33 0.53 0.53 0.28 0.71 0.53 0.73
0.63 0.49 0.35 0.55 0.93 0.45 0.36 0.62 0.61 0.57 0.83 0.34 0.53 0.49 0.82 0.48 0.41 1.0 0.91 0.55
0.7 0.5 0.38 0.78 0.58 0.12 0.2 0.34 0.46 0.42 1.0 0.27 0.11 0.12 0.77 0.59 0.37 0.3 0.6 0.23
0.66 0.49 0.51 0.71 0.9 0.67 0.53 0.64 0.56 0.56 0.74 0.51 0.48 0.4 0.78 0.42 0.46 0.98 1.0 0.79
1.0 0.43 0.72 0.9 0.98 0.37 0.36 0.59 0.41 0.39 0.34 0.33 0.64 0.44 0.35 0.27 0.27 0.96 0.68 0.44
1.0 0.81 0.75 0.73 0.95 0.22 0.41 0.54 0.54 0.52 0.74 0.42 0.39 0.35 0.72 0.38 0.37 0.74 0.89 0.76
0.86 0.59 1.0 0.69 0.6 0.15 0.33 0.42 0.41 0.45 0.78 0.31 0.37 0.32 0.77 0.3 0.27 0.44 0.7 0.47
0.78 0.69 0.67 0.7 0.76 0.47 0.29 0.6 0.5 0.5 0.73 0.49 0.38 0.3 0.79 0.59 0.66 0.78 1.0 0.43
0.96 0.75 0.85 0.88 0.88 0.12 0.28 0.41 0.5 0.55 0.85 0.35 0.11 0.11 0.82 0.89 0.75 0.88 1.0 0.43
0.67 0.92 0.46 0.53 0.58 0.04 0.07 0.32 0.28 0.24 0.62 0.13 0.14 0.15 0.65 0.25 0.19 0.49 0.97 1.0
0.75 0.54 0.33 0.73 0.86 0.37 0.54 0.38 0.42 0.51 0.86 0.22 0.34 0.3 0.75 0.44 0.34 0.69 0.75 1.0
0.65 0.86 0.82 0.52 0.77 0.46 0.42 0.59 0.62 0.62 1.0 0.43 0.4 0.4 0.96 0.64 0.66 0.63 0.78 0.48
1.0 0.68 0.66 0.66 0.81 0.27 0.57 0.48 0.45 0.44 0.75 0.33 0.37 0.31 0.69 0.52 0.39 0.76 0.92 0.79
0.71 0.56 0.5 0.61 0.53 0.07 0.16 0.4 0.41 0.45 0.82 0.29 0.35 0.35 1.0 0.75 0.5 0.73 0.67 0.23
0.87 0.22 0.37 0.83 0.65 0.32 0.37 0.44 0.48 0.47 0.46 0.28 0.31 0.34 0.49 0.84 0.57 0.63 1.0 0.65
1.0 0.56 0.71 0.96 0.97 0.58 0.42 0.64 0.47 0.47 0.75 0.4 0.53 0.4 0.76 0.4 0.39 0.94 0.75 0.48
1.0 0.76 0.87 0.67 0.99 0.33 0.51 0.6 0.5 0.54 0.79 0.38 0.49 0.42 0.76 0.57 0.52 0.93 0.84 0.63
1.0 0.47 0.59 0.61 0.59 0.12 0.25 0.37 0.34 0.3 0.47 0.27 0.27 0.26 0.42 0.5 0.35 0.34 0.57 0.46
1.0 0.63 0.44 0.5 0.71 0.29 0.57 0.37 0.31 0.29 0.38 0.08 0.23 0.17 0.4 0.19 0.08 0.4 0.31 0.39
1.0 0.65 0.65 0.8 0.84 0.48 0.44 0.56 0.44 0.5 0.76 0.39 0.28 0.29 0.77 0.63 0.44 0.81 0.87 0.43
0.58 0.35 0.45 0.48 0.56 0.32 0.19 0.33 0.47 0.33 0.69 0.23 0.31 0.34 0.89 0.17 0.2 0.54 1.0 0.53
0.89 0.6 0.57 0.6 0.81 0.3 0.54 0.42 0.43 0.4 0.81 0.33 0.42 0.39 0.77 0.4 0.26 0.58 0.56 1.0
1.0 0.45 0.67 0.7 0.62 0.11 0.27 0.31 0.38 0.39 0.6 0.23 0.35 0.28 0.53 0.63 0.51 0.29 0.5 0.41
0.61 0.57 0.61 0.65 0.7 0.11 0.2 0.37 0.58 0.53 1.0 0.27 0.14 0.12 0.89 0.6 0.58 0.44 0.81 0.18
0.58 0.56 0.67 0.7 0.67 0.31 0.49 0.51 0.58 0.52 0.81 0.41 0.49 0.44 0.66 0.5 0.45 0.61 1.0 0.75
1.0 0.51 0.72 0.47 0.75 0.13 0.39 0.48 0.56 0.54 0.96 0.38 0.18 0.19 0.9 0.62 0.55 0.49 0.83 0.33
0.73 0.79 0.58 0.53 0.61 0.16 0.22 0.35 0.35 0.3 0.64 0.28 0.22 0.18 0.69 0.44 0.49 0.62 1.0 0.36
0.18 0.48 0.0 0.12 0.15 0.0 0.02 0.03 0.23 0.06 0.34 0.0 0.07 0.09 0.32 0.06 0.04 0.26 1.0 0.09
0.47 0.34 0.49 0.56 0.53 0.2 0.22 0.32 0.32 0.34 0.28 0.15 0.36 0.31 0.32 0.17 0.18 0.45 1.0 0.33
1.0 0.71 0.57 0.68 0.74 0.52 0.55 0.64 0.49 0.52 0.56 0.28 0.46 0.35 0.54 0.48 0.34 0.79 0.58 0.57
0.77 0.52 0.63 1.0 0.96 0.45 0.38 0.59 0.43 0.41 0.61 0.48 0.36 0.25 0.66 0.44 0.36 0.77 0.79 0.32
1.0 0.51 0.72 0.84 0.89 0.22 0.34 0.49 0.56 0.6 1.0 0.31 0.29 0.27 0.99 0.44 0.28 0.59 0.8 0.26
0.65 0.65 0.69 0.97 1.0 0.53 0.25 0.58 0.38 0.37 0.4 0.5 0.46 0.47 0.4 0.36 0.45 0.79 0.88 0.36
1.0 0.42 0.41 0.97 0.77 0.11 0.27 0.45 0.4 0.35 0.62 0.22 0.38 0.33 0.63 0.47 0.31 0.51 0.82 0.36
0.53 0.33 0.51 0.37 0.42 0.31 0.31 0.36 0.39 0.41 0.65 0.24 0.14 0.12 0.59 0.46 0.47 0.72 1.0 0.73
0.47 0.46 0.31 0.23 0.48 0.16 0.26 0.32 0.36 0.37 0.4 0.16 0.28 0.18 0.45 0.24 0.21 0.41 1.0 0.4
0.86 1.0 0.54 0.45 0.78 0.35 0.59 0.35 0.33 0.32 0.15 0.14 0.14 0.12 0.29 0.31 0.12 0.38 0.36 0.32
0.79 0.56 0.31 0.33 0.69 0.21 0.5 0.47 0.48 0.44 0.59 0.09 1.0 0.64 0.64 0.25 0.15 0.31 0.16 0.63
1.0 0.65 0.68 0.73 0.84 0.47 0.45 0.54 0.51 0.43 0.76 0.34 0.72 0.5 0.71 0.39 0.33 0.69 0.71 0.46
0.94 0.22 0.64 0.82 0.79 0.06 0.31 0.29 0.28 0.31 1.0 0.24 0.05 0.07 0.89 0.58 0.43 0.32 0.67 0.23
1.0 0.78 0.62 0.53 0.57 0.35 0.47 0.3 0.46 0.4 0.4 0.24 0.16 0.18 0.38 0.44 0.28 0.47 0.58 0.47
0.83 0.8 0.88 0.85 0.7 0.25 0.52 0.48 0.54 0.55 1.0 0.32 0.24 0.22 0.78 0.86 0.53 0.42 0.73 0.22
0.64 0.39 0.6 0.62 0.65 0.21 0.28 0.42 0.42 0.47 0.81 0.33 0.29 0.23 0.66 0.44 0.67 0.41 1.0 0.23
1.0 0.67 0.57 0.73 0.63 0.41 0.35 0.44 0.3 0.33 0.67 0.21 0.31 0.25 0.66 0.42 0.33 0.41 0.56 0.48
1.0 0.41 0.46 0.74 0.79 0.31 0.46 0.48 0.45 0.45 0.56 0.37 0.21 0.17 0.56 0.35 0.32 0.61 0.67 0.39
1.0 0.78 0.8 0.69 0.91 0.55 0.49 0.75 0.55 0.55 0.63 0.38 0.54 0.37 0.64 0.43 0.32 0.81 0.62 0.53
0.79 0.84 0.73 0.7 0.7 0.4 0.58 0.49 0.58 0.54 0.98 0.4 0.39 0.29 1.0 0.57 0.4 0.6 0.93 0.5
0.48 0.38 0.55 0.57 0.47 0.23 0.35 0.38 0.44 0.38 0.6 0.38 0.43 0.37 0.56 0.43 0.34 0.66 1.0 0.58
0.75 0.71 0.59 0.7 0.81 0.41 0.53 0.54 0.56 0.47 0.95 0.29 0.38 0.33 0.88 0.42 0.5 0.85 1.0 0.97
0.71 0.46 0.63 0.81 0.67 0.13 0.25 0.52 0.54 0.52 0.85 0.35 0.3 0.27 0.9 0.7 0.58 0.8 1.0 0.31
0.65 0.39 0.39 0.49 0.59 0.23 0.24 0.27 0.41 0.33 0.69 0.13 0.26 0.18 0.84 0.21 0.16 0.44 1.0 0.43
0.56 0.44 0.41 0.68 0.91 0.47 0.38 0.66 0.53 0.45 0.9 0.42 0.28 0.24 0.92 0.45 0.42 0.78 1.0 0.5
1.0 0.87 0.97 0.57 0.68 0.34 0.5 0.47 0.52 0.49 0.79 0.33 0.31 0.35 0.85 0.83 0.75 0.95 0.85 0.46
0.81 1.0 0.56 0.53 0.66 0.28 0.44 0.31 0.35 0.36 0.72 0.3 0.28 0.27 0.6 0.35 0.2 0.48 0.64 0.25
1.0 0.48 0.47 0.88 0.87 0.8 0.54 0.5 0.39 0.43 0.84 0.31 0.52 0.59 0.84 0.54 0.44 0.68 0.67 0.55
0.49 0.31 0.42 0.57 0.75 0.43 0.62 0.51 0.32 0.43 0.45 0.37 0.21 0.15 0.51 0.27 0.31 1.0 0.85 0.6
0.54 0.55 0.47 0.58 0.67 0.46 0.62 0.59 0.49 0.48 0.74 0.45 0.48 0.4 0.72 0.4 0.33 0.91 1.0 0.9
1.0 0.47 0.54 0.63 0.88 0.37 0.3 0.52 0.44 0.43 0.45 0.27 0.62 0.48 0.48 0.31 0.3 0.78 0.63 0.34
0.44 0.59 0.28 0.4 0.51 0.12 0.26 0.32 0.29 0.29 0.62 0.19 0.31 0.25 0.5 0.38 0.3 0.4 1.0 0.12
0.61 0.62 0.53 0.68 0.89 0.41 0.69 0.68 0.47 0.45 1.0 0.56 0.4 0.41 0.88 0.46 0.43 0.75 0.93 0.65
0.93 0.7 0.62 0.84 0.87 0.52 0.5 0.62 0.52 0.57 1.0 0.37 0.66 0.51 0.95 0.44 0.48 0.75 0.79 0.46
0.52 0.09 0.21 0.18 0.48 0.1 0.07 0.27 0.2 0.27 0.33 0.14 0.27 0.23 0.28 0.24 0.21 1.0 0.21 0.18
0.75 0.31 0.35 0.52 0.51 0.18 0.07 0.37 0.25 0.28 0.65 0.19 0.18 0.12 0.53 0.23 0.23 1.0 0.38 0.16
1.0 0.19 0.53 0.8 0.53 0.07 0.25 0.26 0.26 0.3 0.67 0.16 0.18 0.17 0.65 0.41 0.42 0.24 0.52 0.26
0.96 0.7 0.74 0.78 1.0 0.24 0.51 0.41 0.45 0.35 0.8 0.31 0.12 0.12 0.53 0.6 0.3 0.62 0.96 0.55
0.59 0.77 0.53 0.47 0.76 0.34 0.35 0.46 0.43 0.37 0.67 0.33 0.22 0.17 0.72 0.3 0.25 0.81 1.0 0.42
0.99 0.64 0.84 0.69 1.0 0.21 0.41 0.44 0.36 0.35 0.57 0.31 0.34 0.27 0.44 0.28 0.27 0.46 0.64 0.26
0.85 0.72 0.66 0.67 0.88 0.54 0.42 0.58 0.49 0.51 0.71 0.38 0.37 0.3 0.68 0.62 0.45 0.78 1.0 0.8
0.72 1.0 0.65 0.84 0.83 0.14 0.31 0.37 0.35 0.32 0.57 0.28 0.36 0.25 0.52 0.35 0.27 0.47 0.74 0.51
0.72 0.7 0.51 0.56 1.0 0.08 0.3 0.27 0.25 0.32 0.42 0.26 0.12 0.1 0.36 0.25 0.33 0.46 0.43 0.5
1.0 0.34 0.56 0.86 0.83 0.03 0.37 0.27 0.39 0.45 0.58 0.16 0.09 0.09 0.62 0.64 0.29 0.32 0.93 0.13
0.97 0.98 0.8 0.64 0.66 0.15 0.47 0.48 0.52 0.5 0.89 0.4 0.15 0.21 0.92 0.94 0.99 0.71 1.0 0.27
0.71 0.5 0.69 0.49 0.54 0.34 0.52 0.5 0.65 0.6 1.0 0.41 0.17 0.23 0.84 0.63 0.68 0.6 0.59 0.39
0.83 0.58 0.62 0.52 0.44 0.08 0.11 0.19 0.17 0.24 0.39 0.2 0.09 0.11 0.33 0.03 0.11 0.56 1.0 0.86
0.91 0.58 0.84 0.87 0.73 0.15 0.48 0.47 0.49 0.56 1.0 0.3 0.16 0.18 0.96 0.68 0.73 0.65 0.84 0.78
0.97 0.62 0.65 0.77 0.79 0.52 0.44 0.53 0.39 0.42 0.77 0.34 0.32 0.23 0.9 0.43 0.38 0.83 1.0 0.85
0.87 0.56 0.4 0.53 0.73 0.21 0.4 0.42 0.52 0.56 1.0 0.36 0.11 0.06 0.76 0.59 0.44 0.5 0.71 0.18
0.96 0.59 0.77 1.0 0.77 0.39 0.41 0.5 0.42 0.4 0.7 0.31 0.52 0.51 0.66 0.42 0.44 0.53 0.82 0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)