Heatmap: Cluster_415 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
1.38 0.54 0.71 0.73 1.54 1.96 0.68 0.66 1.55 1.09 -3.5 -0.17 -4.56 -0.21 -2.69 -1.78 0.24 -1.27 -1.52 -3.79 -2.5 -1.04 -0.45 -1.29 -1.9 1.02 0.74 -5.62 -3.63 -3.39 -4.61 -3.46 -2.57
-0.29 -0.12 -0.04 0.29 0.29 0.19 0.49 -0.43 -0.91 -0.79 0.05 -0.64 0.98 0.05 -0.86 0.23 -0.66 -0.36 -0.47 -0.44 -0.57 0.05 0.05 1.11 -0.18 -0.51 -0.56 0.02 0.48 0.51 0.12 -0.2 0.27
-0.66 -0.96 -0.33 -0.07 -0.23 0.48 -1.15 0.17 -0.24 0.37 0.27 -0.81 -0.93 -0.96 0.49 0.16 -0.35 0.38 0.31 0.28 0.57 -0.88 -1.79 -1.49 -0.86 0.23 0.29 0.25 0.4 0.7 0.19 0.46 0.98
-0.05 0.08 -0.2 0.13 -0.04 0.71 -0.86 0.07 -0.03 1.5 -0.85 -0.52 -1.79 -0.74 -0.14 -0.97 -0.35 -0.71 -1.23 -1.05 -0.95 -0.77 -1.45 -1.87 -0.5 0.41 0.49 0.35 0.6 1.0 0.74 0.52 1.03
0.07 -0.28 0.11 0.28 0.95 0.68 -0.46 0.73 0.73 -0.55 -0.54 -0.47 0.52 -0.55 -0.5 -1.18 -1.24 -0.78 -1.24 -1.51 -0.71 0.03 0.64 -0.34 -0.79 0.07 0.26 -0.38 0.93 0.51 -0.09 -0.67 0.7
-0.15 -0.58 -0.07 -0.22 -0.03 0.4 -0.45 0.08 0.32 0.42 -0.18 -0.32 -0.86 0.07 0.16 -0.08 -0.37 0.18 0.12 -0.35 0.01 -0.33 0.01 0.75 -0.46 0.15 0.19 -0.0 0.11 0.24 0.02 -0.08 0.19
0.13 -0.56 -0.44 -0.38 0.39 -0.11 0.15 -1.08 -1.05 -1.2 0.45 -0.7 -0.18 0.31 0.12 0.22 -0.54 0.08 -0.91 0.02 -1.3 0.7 1.29 0.18 0.3 -1.06 -1.12 0.45 0.61 0.28 0.27 0.09 0.24
-0.19 -0.25 -0.55 -0.67 -0.42 -0.03 0.78 -0.06 -0.67 -0.59 -0.24 0.23 -0.3 0.13 1.14 0.22 -0.71 0.26 -0.16 -0.16 0.01 0.21 0.11 1.0 -0.07 -0.48 -0.54 -0.25 0.03 -0.02 0.12 0.0 -0.25
-0.36 -0.3 -0.24 -0.19 -0.04 0.36 0.34 -0.11 -0.44 0.06 0.09 0.49 -0.06 0.59 -0.23 0.39 -0.08 0.3 0.05 0.06 -0.05 0.19 0.03 0.25 -0.78 -0.18 -0.01 -0.38 0.19 -0.0 -0.35 -0.52 -0.07
0.31 0.06 0.01 -0.29 0.31 0.89 0.21 0.77 0.7 0.65 -0.06 0.4 -0.97 0.12 -0.44 -0.16 -0.35 -0.09 -0.43 -0.51 -0.46 -0.14 -0.23 -1.27 -0.49 -0.05 -0.02 -0.41 0.08 0.04 -0.42 -0.53 0.29
0.16 -0.3 -0.33 -0.14 -0.31 0.63 -0.71 -0.38 -0.45 0.45 0.3 -1.21 -2.35 -1.7 1.2 -1.02 -1.1 0.07 -0.17 0.19 0.21 -1.97 -1.44 -0.95 -1.46 0.28 0.67 0.51 0.55 0.76 0.76 0.77 0.67
-0.5 -0.42 -0.3 -0.18 0.1 0.55 -0.42 0.47 0.34 0.44 0.44 -0.64 -1.26 -0.33 0.35 0.17 -0.25 0.73 -0.05 -0.0 0.08 -0.33 -0.75 -1.93 -0.51 0.13 0.42 -0.24 0.07 0.44 0.06 -0.04 0.45
0.48 0.05 0.05 -0.16 0.25 0.33 -0.0 0.86 1.18 0.68 -1.16 -0.12 -0.78 -0.46 -0.8 -1.13 -0.45 -0.99 -0.9 -1.21 -1.12 -0.19 -0.17 -1.61 -0.23 0.17 0.39 -0.01 0.69 0.64 0.35 0.13 0.31
0.12 0.16 -0.06 -0.0 -0.03 0.67 -0.11 0.69 1.23 0.35 -1.12 0.26 -0.83 -0.34 -0.83 -1.46 0.07 -1.01 -1.66 -1.0 -1.12 0.28 0.08 -0.84 -0.26 -0.19 0.1 0.04 0.34 0.56 0.59 0.45 0.13
0.59 0.22 0.12 -0.05 0.35 0.3 0.03 0.75 0.49 0.43 -0.42 -0.06 -0.59 -0.03 -0.46 -0.49 -0.45 -0.34 -0.68 -0.37 -0.7 0.07 -0.21 -0.5 -0.28 -0.08 -0.13 0.12 0.17 0.22 0.19 0.1 0.15
-0.04 -0.39 -0.18 0.16 0.18 0.94 -0.53 0.75 0.23 1.17 -1.08 -0.31 -1.33 -0.17 -0.17 -1.03 -0.68 -0.84 -0.54 -1.0 -0.55 -0.26 0.06 1.03 -0.38 0.08 0.31 -0.41 0.38 0.82 -0.09 -0.53 -0.02
-0.03 -0.12 -0.13 -0.03 -0.14 0.43 0.15 -0.29 -0.26 -0.8 -0.81 -0.57 -0.4 -0.31 2.36 -0.08 -1.8 -0.35 -0.54 -0.83 -0.58 -0.28 0.2 -0.45 -0.29 -1.68 -1.58 0.11 0.96 0.7 0.3 -0.41 -0.1
-0.38 -1.09 -0.1 -0.36 0.46 0.76 0.87 0.76 0.49 1.05 0.03 0.9 -0.43 0.26 -0.26 -0.09 -0.27 -0.37 -0.4 -0.25 -0.19 0.13 -0.36 -0.7 -0.54 -0.7 -0.31 -0.94 -0.25 0.03 -0.69 -0.92 0.21
-2.19 -1.03 -1.25 -0.01 -0.77 -1.47 -2.35 1.88 -0.43 0.29 - -1.32 -3.37 1.27 1.28 -1.4 -2.02 -1.24 - -2.41 -0.79 1.2 3.29 -0.98 -2.27 -1.21 0.05 -2.31 -0.64 -0.77 -1.34 -3.34 -0.46
-1.6 -1.8 -1.95 -0.57 0.56 -1.21 -1.79 2.55 0.95 1.18 -2.74 -0.79 -2.4 1.06 -0.82 -1.12 -2.79 -2.49 -6.06 -2.12 -1.18 1.02 2.83 -0.73 -1.47 -1.41 -1.21 -2.43 -0.17 -0.7 -1.35 -3.03 0.08
-0.39 -0.34 -0.49 -0.49 -0.24 0.19 0.26 -0.54 -0.82 -0.36 0.03 0.05 0.44 0.24 0.33 0.75 0.01 0.09 -0.04 -0.03 -0.05 0.1 0.12 0.44 -0.25 -0.21 -0.17 0.05 0.12 0.15 -0.02 -0.22 0.12
0.12 -0.23 0.03 -0.23 0.33 0.98 -0.71 0.9 0.79 0.74 -0.59 -0.48 -0.47 -0.18 -0.65 -0.61 -0.38 -0.47 -0.41 -0.18 -0.25 -0.18 -0.68 -1.59 -0.13 0.27 0.16 -0.14 0.15 0.36 0.15 0.13 0.32
-0.35 -0.29 -0.17 0.13 0.05 0.58 0.54 0.04 -0.48 0.37 0.1 0.72 -0.52 0.82 -0.08 0.19 -0.2 0.12 -0.27 -0.07 -0.3 0.41 -0.29 -1.34 -0.11 0.31 0.4 -0.45 -0.22 -0.38 -0.48 -0.36 -0.55
0.13 -0.23 -0.54 -0.63 -0.31 0.02 -0.26 -0.3 -0.28 -0.63 0.14 0.23 -0.1 0.8 0.73 0.45 -0.69 -0.18 -0.16 -0.23 -0.23 0.02 -0.22 0.4 0.07 -0.99 -0.86 0.27 0.74 0.22 0.26 0.04 0.21
-0.06 -0.43 0.09 -0.21 0.28 0.58 0.41 0.77 0.49 0.83 -0.44 0.26 -0.7 0.12 -0.24 -0.34 -0.58 -0.34 -0.52 -0.34 -0.52 0.12 -0.18 -0.59 -0.55 0.06 0.11 -0.02 0.02 0.09 0.09 -0.07 0.03
0.07 -0.41 0.1 0.47 0.64 1.47 0.0 1.03 0.95 1.03 -0.64 -0.1 -1.04 0.04 -0.2 -0.57 -0.58 -0.36 -0.81 -0.47 -0.39 -0.27 -0.58 -0.89 -1.01 0.13 0.39 -0.64 -0.41 -0.22 -0.42 -0.92 -0.37
0.45 0.45 -0.04 -0.35 -0.13 -0.01 0.26 0.05 0.05 0.12 -0.81 0.33 0.19 0.7 -1.31 -0.8 -1.37 -0.71 -0.44 -0.68 -0.65 0.75 0.7 -0.58 -0.27 0.38 0.44 0.07 0.27 0.33 -0.21 -0.42 0.14
0.96 1.05 0.18 0.37 0.55 0.92 -0.23 0.9 1.36 0.83 -1.44 -1.05 -1.25 -0.52 -1.48 -2.37 0.16 -2.1 -1.12 -2.38 -2.24 -0.68 -1.21 -1.18 -0.26 0.05 0.02 0.49 0.01 0.6 0.04 -0.06 0.15
0.06 -0.35 -0.02 -0.19 0.21 0.76 0.2 0.83 0.57 0.76 -0.62 -0.02 -0.43 0.06 0.11 -0.61 -1.14 -0.51 -0.56 -0.63 -0.54 0.01 -0.08 -0.23 -0.66 -0.1 -0.0 -0.13 0.26 0.4 0.14 -0.05 0.2
0.48 0.04 0.22 -0.14 0.25 0.46 0.24 0.3 0.35 -0.14 -0.63 0.0 -0.51 -0.08 -0.27 -0.64 -0.28 -0.88 -0.55 -0.53 -0.29 0.12 -0.04 -0.53 0.15 0.32 0.34 0.05 0.49 0.36 -0.09 -0.33 0.26
-1.1 -0.89 -0.52 -0.78 -0.59 -0.28 0.8 -0.28 -0.66 -0.59 -0.61 0.32 -0.09 0.11 0.27 -0.02 -0.49 0.63 0.21 0.35 0.48 0.12 -0.04 1.05 -0.03 -0.38 -0.35 -0.08 0.32 0.36 -0.01 -0.22 0.24
0.36 0.09 -0.09 -0.27 -0.03 0.22 -0.47 0.35 0.0 0.6 0.11 -0.07 -1.1 -0.03 0.13 -0.4 -1.23 0.22 0.2 0.32 0.39 -0.08 -0.02 -1.03 -1.15 0.37 0.39 -0.18 0.39 0.24 -0.18 -0.47 0.21
-0.32 -0.32 -0.47 0.07 -0.07 0.81 0.21 0.18 0.34 1.06 -0.13 0.19 0.13 0.22 0.33 -0.3 -0.93 0.02 -0.41 -0.26 0.22 0.33 -0.87 0.1 -0.43 0.28 0.41 -0.48 -0.3 -0.19 -0.53 -0.73 -0.43
0.46 0.3 -0.26 -0.59 -0.22 -0.1 0.22 0.26 -0.01 0.46 -0.23 0.23 -0.21 0.2 0.01 0.01 -1.29 -0.21 -0.56 -0.28 -0.39 0.56 0.43 -0.21 -0.31 0.23 0.23 -0.36 0.34 0.19 -0.13 -0.6 0.23
-0.27 -0.32 -0.38 -0.65 -0.12 0.53 0.09 0.1 0.01 -0.3 0.28 0.48 -0.77 0.98 0.52 0.36 -0.38 0.78 0.26 0.41 0.3 0.36 -0.14 -1.2 -0.49 0.18 0.19 -0.78 -0.4 -0.5 -0.55 -0.89 -0.66
0.03 -0.13 -0.09 0.16 -0.06 0.63 -0.16 -0.26 -0.33 0.74 -0.96 -0.26 -0.45 -0.94 -0.26 -1.04 0.15 -0.56 -0.23 -0.56 -0.72 -0.69 -0.06 -0.53 -0.74 -0.07 0.14 0.47 0.76 0.78 0.64 0.44 0.86
-0.19 0.29 -0.27 0.26 -0.09 0.27 0.46 0.09 -0.01 0.39 0.43 0.38 -0.3 0.47 -0.63 -0.23 -0.03 0.29 -0.32 -0.2 -0.28 0.28 -0.09 -1.31 -0.5 0.52 0.7 -0.4 -0.21 -0.26 -0.59 -0.82 -0.11
0.24 -1.12 0.61 0.6 1.12 0.98 -0.38 1.51 0.88 1.81 -3.35 -0.48 -2.21 -0.36 -2.66 -5.19 -1.95 -3.54 -3.54 -4.43 -3.2 1.31 -0.58 -1.39 -1.18 0.25 0.43 -0.05 -1.54 -1.52 0.01 1.21 0.21
0.28 0.23 0.51 0.33 0.45 0.92 0.64 0.43 0.31 0.37 -0.57 0.34 -0.28 -0.38 -0.55 -0.7 -0.07 -0.51 -0.82 -0.59 -0.55 0.21 -0.34 -0.16 -0.12 0.28 0.61 -0.71 -0.48 -0.23 -0.74 -0.93 0.06
-0.18 0.06 -0.24 -0.24 -0.11 0.16 -0.21 0.42 0.25 1.11 -0.31 0.27 -0.18 -0.12 0.26 -0.28 -0.58 -0.52 -0.54 -0.8 -0.75 -0.23 -1.66 -0.36 -0.3 -0.14 -0.02 -0.05 0.64 0.68 0.36 0.13 0.61
-0.18 0.04 -0.67 -0.59 -0.16 0.54 0.53 -0.08 0.08 0.07 0.4 0.1 -0.03 0.15 0.05 0.99 0.04 0.62 0.05 0.09 0.12 0.1 0.05 0.47 0.21 -0.46 -0.24 -1.3 -0.87 -0.55 -0.84 -0.99 -0.36
-0.46 -0.54 -0.2 -0.82 -0.22 0.16 0.57 -0.32 -0.69 -0.13 0.66 0.38 -0.01 0.88 0.6 0.32 -0.01 0.27 -0.25 0.36 0.3 0.17 -0.12 0.08 0.26 -0.3 -0.24 -0.89 -0.38 -0.36 -0.39 -0.88 -0.07
0.25 0.46 -0.18 -0.1 0.17 0.48 0.1 0.1 0.1 -0.62 -0.42 0.42 0.15 -0.2 -0.58 0.24 -1.15 -0.47 -0.51 -0.51 -0.68 0.63 0.73 0.38 -0.43 -0.12 -0.09 -0.5 0.39 0.4 -0.32 -0.49 0.21
-0.03 0.16 -0.12 -0.29 0.21 0.91 0.65 0.22 0.55 0.12 -0.97 0.81 0.55 0.21 -0.26 -0.72 -0.73 -0.83 -1.0 -0.77 -0.75 0.51 0.25 0.85 -0.31 0.25 0.23 -1.02 -0.31 -0.27 -0.76 -1.04 -0.19
0.2 0.08 0.02 0.09 -0.08 0.61 -0.39 0.33 0.17 0.64 -0.69 -0.29 -0.27 -0.77 -0.24 -0.91 0.08 -0.9 -0.86 -0.83 -0.81 -0.29 0.13 0.33 -0.24 0.27 0.38 0.27 0.42 0.3 0.2 0.22 0.5
0.12 -0.6 -0.05 -0.21 0.28 0.44 -0.7 1.5 1.35 0.69 -1.43 -0.47 -1.95 -0.96 -0.25 0.05 -0.92 -0.44 -0.81 -1.1 -0.48 -0.8 -1.54 -0.63 -0.66 0.15 0.29 0.28 0.46 0.42 0.35 0.42 0.52
-0.42 0.68 0.62 1.21 1.69 -0.84 - 2.58 3.29 1.04 -1.43 - - -2.65 - - 0.14 - - - - -3.75 - - -2.61 -3.19 -2.01 -2.38 -1.26 -1.68 -0.35 -1.71 -0.0
-0.05 0.08 -0.21 0.09 0.26 0.66 0.23 0.43 0.15 0.31 -0.45 -0.21 0.49 0.81 -0.9 0.0 -0.46 -0.08 -0.99 -0.69 -0.64 0.04 0.24 0.49 -0.73 -0.05 -0.04 -0.31 0.19 0.24 -0.34 -0.65 -0.06
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-0.65 -0.59 -1.71 -1.77 -0.62 -0.31 0.13 0.07 -0.95 -0.99 0.13 0.2 0.65 -0.3 1.42 0.9 -1.95 -0.06 0.24 -0.13 0.62 0.64 0.69 0.57 0.2 -7.62 -6.38 0.34 0.38 -0.13 0.58 -0.17 -0.36
0.96 1.1 0.52 0.28 0.1 0.59 -0.42 1.07 0.72 0.58 -1.84 -0.8 -1.44 -1.43 -1.53 -1.38 -0.58 -0.63 -1.41 -1.39 -1.17 -0.44 -0.92 -0.83 -0.89 0.2 0.17 0.51 0.41 0.49 0.01 0.0 1.02
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-0.62 -0.77 -0.49 0.14 0.28 0.86 0.29 -0.6 -0.37 0.02 -0.13 -0.27 0.41 0.39 -0.69 0.36 0.04 -0.28 -0.36 -0.63 -1.37 0.19 0.47 1.16 -0.54 -0.21 -0.18 -0.1 -0.13 0.23 -0.07 -0.44 0.47
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.