Heatmap: Cluster_63 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.24 0.6 -0.5 -0.71 -0.84 -0.66 0.17 -0.71 -0.89 -0.52 -0.82 0.03 0.56 0.1 0.11 -0.53 -0.81 -0.66 -0.58 -0.75 -0.56 0.66 0.62 0.94 0.15 -0.19 -0.27 0.38 0.58 0.52 0.4 0.31 0.16
-0.24 0.29 -0.38 0.07 -0.55 -0.58 -0.85 -0.06 -0.52 1.11 0.27 -0.41 0.12 -1.29 -0.34 -1.34 -0.0 -0.38 -0.03 0.02 -0.2 -0.08 -0.28 -0.76 -0.45 -0.18 -0.21 0.08 0.84 0.85 0.41 0.16 1.14
0.36 0.66 -0.45 -0.36 -0.25 0.14 0.25 -0.15 0.06 0.04 -0.27 -0.34 0.4 0.01 0.1 -0.23 -0.88 -0.28 -0.36 -0.4 -0.4 0.18 -0.14 0.52 -0.64 -0.1 -0.34 0.39 0.3 0.14 0.41 0.03 0.2
0.61 0.3 0.25 -0.11 0.13 -0.27 0.7 0.54 0.38 -0.17 -0.35 0.2 -0.37 0.11 0.25 -0.45 -1.03 -0.48 -0.53 -0.26 -0.5 0.23 -0.05 -0.75 -0.2 0.09 -0.05 0.5 0.08 -0.33 -0.01 0.11 -0.32
0.3 0.36 -0.62 -0.93 -0.66 -0.37 0.31 -0.58 -0.55 -0.25 -0.72 0.02 0.59 0.28 -0.91 -0.88 -1.06 -0.98 -1.05 -0.9 -0.89 0.41 1.08 1.57 -0.85 -0.15 -0.18 0.22 0.72 0.57 0.28 -0.41 0.59
0.81 0.39 -0.26 -0.61 -1.86 -1.18 0.33 -0.96 -1.1 -1.75 0.0 -0.5 0.19 -0.84 -0.1 -0.88 0.03 0.04 -0.26 -0.09 -0.3 0.6 0.04 0.94 -0.41 -0.1 -0.03 0.43 0.7 0.8 0.43 0.13 0.48
0.34 0.2 -0.09 -0.56 -0.51 -0.77 0.68 -0.61 -0.81 -0.76 -0.57 -0.3 0.21 0.46 0.82 0.12 -0.27 -0.51 -0.4 -0.59 -0.37 0.19 0.24 0.61 0.42 0.15 0.2 0.02 0.15 0.1 -0.03 -0.05 0.08
0.73 0.16 0.17 -0.48 -0.36 -0.66 0.27 0.25 -0.18 -0.47 -0.73 -0.21 -0.05 -0.93 -0.21 -0.59 -0.52 -0.77 -0.57 -0.49 -0.66 -0.02 0.33 -0.26 -0.24 -0.14 -0.14 0.5 0.84 0.85 0.45 0.29 0.88
0.28 -0.27 -0.44 -1.04 -0.59 -2.05 0.87 -0.92 -1.17 -1.56 -0.52 -0.03 0.63 -0.37 0.29 0.48 -0.21 -0.5 0.31 0.1 0.25 0.58 0.79 1.03 0.12 -0.34 -0.35 0.03 0.22 0.09 0.02 -0.32 0.0
0.38 0.3 -0.03 -0.27 -0.44 -0.74 0.4 -0.15 -0.54 -0.56 -0.93 0.03 0.22 -0.2 0.56 -0.72 -0.1 -0.69 -0.79 -1.06 -0.74 0.39 0.1 0.47 0.12 0.14 0.19 0.18 0.47 0.55 0.28 0.15 0.55
0.46 0.06 -0.17 -0.64 -0.93 -0.97 0.41 -0.26 -0.78 -0.46 -0.56 0.2 0.13 -0.18 0.65 -0.54 -0.29 -0.76 -0.99 -0.57 -0.83 0.2 0.2 -0.13 -0.0 0.06 0.06 0.55 0.82 0.72 0.53 0.24 0.63
0.15 0.11 -0.03 -0.59 -0.45 -0.61 0.09 -0.7 -0.74 -0.31 -0.04 0.15 0.59 -0.09 -0.17 -0.19 -0.51 -0.47 -0.4 -0.11 -0.35 0.47 0.94 0.85 0.06 -0.23 -0.35 0.09 0.36 0.21 0.04 -0.17 0.37
-0.05 0.22 -0.39 -0.73 -0.57 -0.35 0.03 -0.05 -0.08 0.09 -0.48 0.02 0.94 0.27 -0.41 -0.42 -1.01 -0.67 -0.73 -0.75 -0.73 0.46 1.04 0.93 -0.3 -0.34 -0.37 0.05 0.51 0.51 0.13 -0.4 0.38
0.29 0.39 -0.12 -0.6 -0.89 -1.24 0.05 -0.22 -0.64 -0.36 -0.29 -0.08 0.58 0.18 0.13 0.18 -0.69 -0.14 -0.36 -0.2 -0.44 0.53 0.76 0.24 0.11 -0.33 -0.39 0.21 0.56 0.36 0.22 0.02 0.02
0.07 0.44 -0.74 -0.99 -0.77 -0.92 0.55 -0.34 -0.14 -0.99 -0.83 0.07 0.9 0.11 -0.25 -0.52 -1.23 -0.98 -0.91 -0.36 -0.77 0.85 1.18 0.85 -0.31 0.17 0.06 0.11 0.54 0.5 0.03 -0.29 0.21
0.12 0.23 -0.51 -0.9 -0.69 -0.31 0.69 -0.43 -0.99 -1.74 -0.24 0.01 0.67 0.1 -0.04 0.23 -1.23 -0.79 -0.43 -0.37 -0.89 0.85 1.5 0.33 0.36 -0.19 -0.49 0.02 0.28 0.18 0.06 0.06 0.0
-0.18 -0.18 -0.72 -0.84 -0.86 -0.43 0.77 -1.16 -1.24 -0.82 -0.01 0.49 0.29 0.77 -0.33 -0.38 -0.71 -0.12 -0.37 -0.37 -0.28 0.48 0.6 0.93 -0.73 0.04 -0.03 -0.03 0.71 0.61 -0.14 -0.47 0.72
-0.65 -0.07 -0.54 -0.5 -0.36 -0.02 0.12 -0.11 -0.13 -0.09 -0.37 -0.19 0.44 -0.02 -0.34 -0.67 -0.46 -0.32 -0.61 -0.91 -0.4 0.36 0.28 0.58 -0.23 -0.47 -0.38 0.29 0.76 0.83 0.53 0.29 0.86
1.16 -0.11 0.54 -0.28 -0.87 -2.2 1.0 -0.27 -0.5 -1.46 -0.66 0.26 0.21 0.35 -0.05 0.07 -1.1 -0.67 -0.5 -0.44 -0.67 0.68 0.69 0.48 -0.09 -0.24 -0.39 -0.05 0.26 0.33 0.04 -0.48 0.16
0.13 -0.19 -0.74 -0.16 0.11 0.69 -0.88 -0.52 -0.77 -0.35 0.45 -0.39 -0.04 0.1 -0.17 -0.28 0.93 0.76 0.44 0.36 0.36 -0.21 -0.04 -1.59 0.53 -0.56 -0.26 -0.2 -0.06 -0.03 -0.02 -0.22 0.04
-0.0 0.28 -0.13 -0.35 -0.27 -0.73 0.29 -0.55 -0.66 -0.06 -0.51 0.19 0.51 0.18 -0.66 -0.32 -0.7 -0.67 -0.59 -0.56 -0.48 0.58 0.68 0.84 -0.37 0.2 0.15 0.04 0.32 0.38 0.21 0.03 0.41
0.35 0.64 -0.41 -0.48 -1.47 -1.03 0.08 -0.95 -0.71 -0.23 -0.83 0.35 0.14 0.28 -0.84 -0.61 0.37 -0.66 -0.28 -1.41 -0.61 0.81 0.76 0.08 0.09 -0.62 -0.39 0.51 0.68 0.55 0.51 0.45 0.49
0.2 0.39 -0.44 -0.74 -0.72 -0.4 0.1 -0.23 -0.3 -0.4 -0.15 0.22 0.62 0.37 -0.56 -0.29 -0.78 -0.42 -0.37 -0.25 -0.31 0.56 0.9 0.69 -0.34 0.06 -0.04 -0.03 0.28 0.3 -0.03 -0.39 0.34
0.08 0.49 -0.42 -0.48 -0.61 -0.09 0.75 -0.38 -0.27 -0.44 -1.12 0.46 1.27 0.75 -1.28 -1.23 -0.45 -0.82 -1.08 -1.02 -1.26 1.17 0.4 0.79 -0.06 -0.45 -0.27 -0.6 0.39 0.48 0.0 -0.56 0.22
-0.3 -0.04 -1.12 -1.12 -1.0 -0.37 -0.15 -0.81 -0.57 -0.12 -0.03 0.12 0.65 0.48 -1.03 -0.67 -1.11 -0.58 -0.71 -0.68 -0.49 0.34 1.14 1.69 -0.72 -0.1 -0.31 -0.14 0.87 0.77 -0.11 -0.52 0.71
-0.22 0.42 -0.48 -0.39 -0.68 0.19 0.29 -0.3 -0.16 0.07 -1.03 0.02 0.59 0.52 -0.94 -0.91 -0.44 -1.1 -1.33 -1.11 -1.21 0.58 1.16 0.92 -0.3 0.1 0.1 -0.02 0.49 0.59 -0.02 -0.39 0.44
0.42 0.73 -0.3 -0.45 -0.55 -0.29 0.02 0.12 0.02 -0.2 -0.48 0.03 0.53 0.14 -0.46 -0.39 -0.6 -0.63 -0.73 -0.68 -0.67 0.42 1.09 0.96 -0.38 -0.1 -0.12 -0.13 0.25 0.2 -0.14 -0.61 0.23
0.37 0.1 0.02 -0.85 -0.95 -1.25 1.03 -0.74 -1.37 -1.14 -0.32 0.41 1.11 0.12 0.07 0.66 -0.21 -0.27 -0.26 -0.47 -0.34 0.71 0.75 0.84 0.22 -0.48 -0.43 -0.44 -0.2 -0.2 -0.34 -0.47 -0.22
0.65 0.49 0.02 -0.66 -0.63 -0.68 0.51 -0.52 -0.54 -0.87 -1.01 0.24 0.47 -0.32 0.4 -0.49 -0.7 -1.1 -0.71 -1.17 -0.42 0.42 0.48 0.78 0.17 -0.04 -0.18 0.5 0.42 0.36 0.24 0.1 0.32
-0.24 0.27 -1.16 -1.16 -1.64 -1.55 0.35 -1.61 -1.31 -0.41 -0.74 0.77 0.87 0.71 0.01 -0.11 -0.16 -0.79 -1.1 -0.82 -0.95 0.98 0.57 1.32 0.8 -0.41 -0.46 0.08 0.5 0.39 -0.17 -0.32 0.34
-0.65 0.12 -0.43 -0.96 -0.06 0.35 0.58 -0.1 -0.3 -0.49 -1.14 0.58 1.32 0.55 -1.9 -2.86 -0.68 -2.2 -2.17 -1.97 -2.18 1.06 0.25 1.71 -0.62 -0.28 0.06 -0.43 0.82 0.55 -0.15 -0.94 0.59
0.02 0.5 -0.49 -1.0 -0.94 -0.57 0.14 -0.81 -0.61 -0.58 -0.32 -0.19 0.77 0.64 -0.75 0.11 -0.31 -0.27 -0.32 -0.59 -0.31 0.36 0.87 0.9 -0.13 0.29 0.35 -0.21 0.34 0.39 -0.43 -0.46 0.41
-0.25 -0.6 0.06 -0.56 -0.93 -2.36 1.16 -1.32 -0.78 -2.14 -0.06 0.22 0.71 0.72 -0.25 0.53 -0.52 0.21 0.22 0.22 0.12 0.74 0.63 0.98 0.55 -0.23 -0.39 -0.67 -0.22 -0.25 -0.72 -0.63 -0.36
-0.03 1.55 -0.08 -3.31 -0.81 -1.15 0.49 - - -1.0 - -0.99 1.66 0.01 - - -0.32 - - -2.67 - 2.19 2.26 1.35 -0.53 -4.86 -2.31 -1.18 1.22 1.41 -0.69 - -0.71
-0.12 0.43 -1.36 -1.23 -1.73 -1.09 0.71 -1.11 -0.7 -0.13 -0.64 0.03 0.44 0.42 -0.99 -0.84 -1.1 -1.16 -0.96 -0.84 -0.92 0.28 0.53 2.33 -1.16 -0.13 -0.13 0.01 0.81 0.61 -0.26 -0.6 0.86
0.65 0.67 0.19 -0.05 -0.84 -1.31 0.17 -1.17 -1.26 -0.63 -1.43 -0.26 1.23 -0.68 -1.25 -1.53 0.5 -1.26 -1.57 -1.87 -1.56 0.44 0.64 1.47 0.49 -0.45 -0.18 -0.27 0.84 0.81 0.06 -0.28 0.55
0.37 0.6 -0.26 -0.32 -0.68 -0.74 -0.33 -0.03 0.11 -0.43 -0.39 0.02 -0.88 0.44 -0.57 -0.09 -0.66 -0.46 -0.13 -0.19 -0.24 0.26 1.62 -0.46 -0.18 -0.41 -0.61 0.19 0.33 0.16 0.14 0.2 0.47
-0.33 0.27 -1.52 -1.86 -1.56 -0.73 0.59 -1.18 -1.06 -0.51 0.47 0.56 0.79 1.02 -1.18 -0.25 -0.92 0.32 -0.08 -0.14 -0.23 0.64 0.47 0.67 -0.73 -0.26 -0.12 -0.14 0.56 0.57 -0.27 -0.68 0.79
-0.32 -0.04 -0.76 -0.76 -1.19 -1.6 0.8 -1.88 -1.5 -1.41 -0.41 0.36 1.53 0.43 0.42 -0.51 -0.75 -0.44 -0.72 -0.55 -0.69 0.93 0.54 1.3 0.45 -0.25 -0.32 -0.22 0.43 0.22 -0.12 -0.41 0.17
0.09 0.39 -0.53 -0.91 -0.84 -0.79 0.27 -0.45 -0.27 -0.71 -0.12 0.19 0.53 0.44 -0.7 -0.2 -0.98 -0.65 -0.43 -0.28 -0.7 0.56 1.11 0.78 -0.26 -0.08 -0.42 -0.1 0.78 0.65 0.11 -0.4 0.35
1.03 1.12 -0.29 -0.98 -1.04 -0.88 0.32 -0.31 -0.2 0.12 -1.12 -0.28 0.13 0.06 -0.77 -1.29 -0.99 -0.55 -0.91 -1.17 -0.61 0.84 0.63 -0.35 -0.7 -0.01 -0.04 0.32 0.47 0.74 0.38 0.36 0.68
-0.18 -0.13 -1.08 -1.2 -1.57 -1.35 0.05 -1.39 -1.11 -0.58 0.03 0.34 0.92 0.29 -0.87 -0.42 -0.59 -0.47 -0.17 -0.31 -0.15 0.31 1.26 0.65 -0.54 0.04 0.01 0.22 0.68 0.74 0.16 0.02 0.88
0.5 0.45 0.11 -0.36 -0.5 -0.76 0.79 0.27 0.05 -0.27 -0.65 0.32 0.3 -0.19 -0.05 -0.53 -0.89 -0.47 -0.37 -0.36 -0.44 0.31 0.34 -0.03 -0.24 -0.05 -0.15 0.75 0.16 -0.27 0.2 0.39 -0.38
-0.37 0.29 -0.6 -1.17 -0.86 -1.26 0.38 -1.16 -0.99 -0.69 -0.8 0.21 1.11 0.68 0.12 -0.17 -0.53 -0.54 -0.83 -1.0 -0.86 0.98 1.06 1.51 -0.21 -0.36 -0.38 -0.29 0.26 0.31 -0.07 -0.19 0.26
0.48 0.6 -0.41 -0.73 -0.68 -0.28 -0.02 0.02 -0.11 -0.43 -0.37 -0.06 0.57 0.29 -0.28 -0.65 -0.45 -0.62 -0.45 -0.66 -0.51 0.37 0.62 0.54 -0.36 0.46 0.44 0.03 0.32 0.3 -0.0 -0.48 0.32
0.32 0.89 -0.75 -0.94 -1.75 -1.12 0.85 -1.73 -1.29 -1.94 -0.74 0.38 0.95 -0.36 -0.33 -0.04 -0.52 -0.83 -0.0 -0.42 -0.25 0.82 0.69 1.26 -0.17 -0.64 -0.69 0.38 0.49 0.24 0.29 -0.2 0.17
0.82 0.44 0.43 -0.35 -0.29 -1.0 0.88 -0.08 -0.48 -0.69 -0.74 0.34 0.49 -0.14 -0.4 -0.26 -0.3 -0.96 -0.79 -0.79 -0.62 0.47 0.52 -0.14 0.32 -0.22 -0.32 -0.12 0.37 0.38 -0.05 -0.04 0.39
0.14 0.5 -0.64 -0.92 -0.97 -0.79 0.2 -0.57 -0.39 -0.74 -0.51 0.29 0.79 0.46 -0.44 -0.75 -0.49 -0.62 -0.55 -0.85 -0.47 0.5 1.03 1.22 -0.1 0.0 -0.02 0.01 0.46 0.41 -0.14 -0.6 0.46
-0.55 -1.36 -0.25 -0.29 -0.34 -4.31 0.95 -0.96 -0.21 -2.52 -1.04 0.09 0.48 -0.57 -0.01 0.43 0.38 -0.35 0.21 0.25 0.11 1.03 0.46 0.1 1.04 0.29 0.01 -0.06 -0.16 -0.33 -0.12 0.22 -0.05
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0.12 -0.28 -0.2 -0.87 -0.76 -1.33 1.06 -1.05 -1.05 -1.2 -1.17 0.45 1.03 -0.06 -0.14 0.18 0.25 -0.24 -0.25 -0.36 -0.46 0.36 0.8 1.03 -0.23 -0.23 -0.27 -0.18 0.15 0.19 0.03 -0.19 0.43
0.69 0.52 -0.11 -1.14 -1.3 -0.97 0.75 -0.74 -0.65 -1.12 -0.61 -0.06 1.15 0.13 -0.3 -0.77 -0.95 -0.83 -1.26 -0.77 -0.84 0.78 0.92 1.5 -0.57 -1.44 -0.92 0.06 0.39 0.5 0.37 -0.25 0.47
-0.4 -0.25 -0.75 -0.9 -0.6 -3.0 1.29 -1.51 -1.27 -1.15 -0.31 0.65 1.23 -0.82 -0.13 -1.19 -1.2 -1.21 -0.5 -0.76 -1.16 0.84 0.75 1.24 0.04 -0.45 -0.81 -0.15 1.06 0.69 0.17 0.14 0.68
-0.52 0.05 -0.48 -0.57 -0.75 -0.26 -0.23 -0.19 -0.12 -0.11 0.08 -0.06 0.18 0.22 0.03 -0.14 -0.38 0.69 0.17 0.17 -0.12 0.14 0.21 0.13 0.08 -0.38 -0.32 0.13 0.22 0.47 0.21 -0.03 0.43
-0.11 -0.04 -0.22 -0.32 -0.53 -0.17 0.55 -0.13 -0.16 0.08 -0.66 0.17 0.76 0.1 -0.58 -0.37 -0.59 -0.88 -0.66 -0.85 -0.74 0.29 0.77 0.8 -0.44 -0.41 -0.41 0.1 0.48 0.61 0.21 -0.01 0.6
0.01 0.05 -0.51 -0.51 -0.38 -0.39 0.17 -0.43 -0.18 -0.33 -0.55 0.56 0.6 0.28 -0.21 -0.74 -0.55 -0.21 -0.68 -0.86 -0.57 0.56 0.26 0.78 0.08 0.06 0.06 0.15 0.27 0.47 0.28 0.08 0.29
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-0.28 0.26 -0.74 -0.73 -1.39 -0.87 0.12 -0.67 -0.63 -0.29 -0.02 -0.16 0.2 0.24 -0.83 -0.25 -0.8 0.08 -0.02 -0.28 -0.08 0.17 0.58 0.9 -0.71 0.13 0.08 0.07 1.01 0.81 0.01 -0.21 0.79
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-0.1 0.55 0.24 0.07 -0.44 -1.08 0.48 0.28 -0.57 0.06 -1.24 -0.42 1.05 -0.09 -0.66 -0.39 0.38 -0.3 -1.49 -1.39 -1.51 0.61 0.78 0.13 0.18 -0.03 0.12 -0.04 0.53 0.21 -0.21 -0.39 0.41
-0.35 -0.56 -1.02 -1.13 -0.89 -2.14 0.79 -0.63 -0.54 -1.89 -0.39 0.02 1.07 0.16 -0.28 0.19 -0.3 -0.94 -0.7 -0.61 -0.57 0.5 1.16 1.28 0.31 -0.27 -0.51 0.28 0.5 0.34 0.26 0.11 0.31
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0.8 0.52 -0.45 -1.01 -1.01 0.21 -0.82 -0.88 -0.59 -1.18 -0.02 -0.48 -0.24 -1.09 -1.29 -0.77 0.93 1.04 -0.04 -0.36 0.58 -0.1 0.19 -2.0 0.1 -0.73 -0.15 0.1 0.52 0.83 0.57 0.38 0.63
0.62 0.47 0.23 0.26 0.07 -0.03 1.43 1.22 0.6 0.22 -1.37 0.07 -1.4 -0.79 -0.71 -0.53 -2.07 -0.97 -1.0 -1.94 -0.87 -1.35 -1.48 0.17 -0.66 0.41 0.07 0.29 0.52 -0.12 0.3 0.5 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.