Heatmap: Cluster_278 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.75 0.69 1.0 0.69 0.64 0.87 0.32 0.8 0.51 0.49 0.73 0.6 0.83 0.75 0.85 0.69 0.92 0.52 0.56 0.56
0.5 1.0 0.61 0.36 0.77 0.39 0.56 0.48 0.53 0.47 0.57 0.42 0.55 0.49 0.54 0.48 0.35 0.53 0.53 0.63
0.39 1.0 0.51 0.41 0.78 0.2 0.33 0.33 0.33 0.36 0.5 0.26 0.35 0.27 0.59 0.46 0.42 0.52 0.66 0.36
0.68 0.9 1.0 0.71 0.86 0.7 0.38 0.81 0.71 0.56 0.88 0.75 0.48 0.49 0.75 0.75 0.82 0.65 0.54 0.43
0.78 0.53 1.0 0.55 0.69 0.4 0.2 0.51 0.41 0.38 0.39 0.5 0.56 0.52 0.37 0.54 0.71 0.42 0.2 0.25
0.77 0.45 0.42 0.68 0.99 1.0 0.83 0.69 0.15 0.12 0.07 0.34 0.66 0.54 0.05 0.01 0.03 0.27 0.0 0.03
0.41 1.0 0.64 0.44 0.74 0.37 0.44 0.54 0.56 0.56 0.49 0.39 0.44 0.39 0.52 0.38 0.46 0.62 0.65 0.45
0.53 0.89 1.0 0.59 0.47 0.31 0.08 0.38 0.22 0.28 0.43 0.09 0.29 0.25 0.55 0.37 0.38 0.45 0.09 0.13
0.61 0.96 0.83 0.0 0.68 1.0 0.32 0.19 0.27 0.45 0.1 0.16 0.04 0.03 0.18 0.3 0.06 0.27 0.0 0.12
0.67 0.71 1.0 0.44 0.26 0.31 0.01 0.44 0.38 0.41 0.48 0.17 0.46 0.29 0.66 0.23 0.15 0.32 0.1 0.09
0.6 0.81 0.79 0.87 1.0 0.7 0.28 0.92 0.55 0.51 0.77 0.73 0.38 0.28 0.76 0.88 0.92 0.7 0.49 0.31
0.71 0.87 0.87 0.54 1.0 0.46 0.7 0.61 0.57 0.48 0.62 0.59 0.31 0.29 0.67 0.62 0.56 0.74 0.81 0.61
0.56 0.67 0.36 0.36 0.74 0.64 0.42 0.46 0.48 0.36 0.56 0.5 0.41 0.16 0.66 0.26 0.25 1.0 0.07 0.76
0.39 0.76 0.93 0.5 0.78 0.74 0.51 0.76 0.7 0.76 0.62 1.0 0.56 0.33 0.47 0.79 0.74 0.85 0.34 0.34
0.78 0.72 0.94 0.54 0.84 0.62 0.17 0.56 0.67 0.66 0.49 0.84 0.5 0.51 0.43 0.76 1.0 0.57 0.24 0.34
0.67 0.84 1.0 0.79 0.72 0.54 0.16 0.48 0.53 0.55 0.24 0.47 0.58 0.54 0.3 0.51 0.66 0.47 0.3 0.29
0.56 1.0 0.94 0.53 0.48 0.76 0.38 0.54 0.5 0.41 0.61 0.3 0.4 0.31 0.61 0.44 0.26 0.37 0.26 0.57
0.72 0.35 0.69 0.88 0.61 0.81 0.41 1.0 0.43 0.43 0.69 0.49 0.7 0.48 0.63 0.25 0.5 0.5 0.69 0.33
0.23 1.0 0.24 0.32 0.72 0.43 0.14 0.5 0.43 0.41 0.49 0.27 0.52 0.4 0.51 0.26 0.26 0.6 0.63 0.54
0.86 0.74 1.0 0.24 0.39 0.91 0.08 0.52 0.39 0.23 0.63 0.41 0.21 0.16 0.36 0.76 0.39 0.37 0.28 0.04
0.31 0.25 1.0 0.36 0.34 0.53 0.6 0.33 0.35 0.33 0.26 0.19 0.16 0.16 0.36 0.23 0.41 0.3 0.37 0.39
0.62 0.64 0.43 0.39 0.48 0.22 0.16 0.37 0.23 0.18 0.4 0.64 0.19 0.19 0.27 1.0 0.49 0.57 0.08 0.17
0.88 0.43 0.9 0.61 0.67 0.95 0.46 0.9 0.62 0.67 0.99 1.0 0.88 0.76 0.97 0.48 0.86 0.69 0.56 0.76
0.65 0.83 1.0 0.63 0.7 0.74 0.39 0.53 0.53 0.54 0.57 0.49 0.42 0.37 0.64 0.44 0.56 0.57 0.48 0.7
0.17 1.0 0.37 0.1 0.18 0.05 0.07 0.12 0.1 0.12 0.24 0.05 0.1 0.07 0.3 0.12 0.12 0.23 0.21 0.13
0.72 0.53 0.82 0.7 0.7 1.0 0.71 0.73 0.49 0.53 0.51 0.41 0.72 0.63 0.5 0.47 0.5 0.72 0.55 0.68
0.36 0.57 0.36 0.4 0.44 0.71 0.28 1.0 0.8 0.69 0.48 0.68 0.43 0.41 0.39 0.53 0.41 0.4 0.13 0.16
0.91 0.67 0.61 0.74 0.71 1.0 0.22 0.63 0.56 0.53 0.76 0.52 0.34 0.34 0.79 0.48 0.42 0.89 0.42 0.42
0.58 0.72 1.0 0.58 0.47 0.56 0.29 0.61 0.6 0.62 0.96 0.4 0.64 0.55 0.99 0.47 0.39 0.38 0.48 0.43
0.56 1.0 0.69 0.56 0.67 0.38 0.27 0.5 0.46 0.38 0.46 0.34 0.49 0.44 0.49 0.36 0.33 0.56 0.65 0.51
0.88 0.41 0.52 0.87 0.65 0.91 0.07 0.8 0.53 0.45 0.57 0.44 0.5 0.49 0.56 0.56 0.56 1.0 0.58 0.23
0.07 0.05 0.05 0.25 0.42 1.0 0.0 0.49 0.12 0.16 0.21 0.24 0.05 0.08 0.24 0.27 0.32 0.48 0.02 0.02
0.58 0.43 0.36 0.44 0.28 1.0 0.03 0.72 0.53 0.38 0.2 0.47 0.54 0.61 0.23 0.22 0.11 0.27 0.01 0.03
0.73 1.0 0.96 0.91 0.88 0.61 0.33 0.65 0.52 0.46 0.88 0.55 0.5 0.42 0.86 0.58 0.43 0.71 0.4 0.67
0.62 1.0 0.83 0.49 0.73 0.4 0.32 0.48 0.4 0.36 0.57 0.36 0.44 0.31 0.52 0.54 0.38 0.52 0.56 0.52
0.84 0.51 0.73 0.56 0.84 1.0 0.31 0.92 0.72 0.63 0.99 0.6 0.52 0.58 0.95 0.72 0.95 0.96 0.62 0.63
0.59 0.37 0.65 0.6 0.39 0.68 0.38 0.96 0.2 0.24 0.64 0.81 1.0 0.95 0.58 0.18 0.66 0.49 0.22 0.58
0.95 0.78 0.99 0.89 0.78 0.68 0.44 1.0 0.71 0.75 0.97 0.66 0.59 0.61 0.96 0.58 0.66 0.71 0.69 0.47
0.81 1.0 0.79 0.6 0.63 0.87 0.43 0.66 0.48 0.39 0.29 0.37 0.35 0.3 0.37 0.46 0.43 0.77 0.08 0.11
0.86 0.78 0.87 0.59 0.63 0.6 0.61 0.75 0.48 0.48 0.78 0.67 0.69 0.81 0.73 0.57 1.0 0.55 0.4 0.6
0.77 0.83 0.78 0.0 0.56 1.0 0.61 0.4 0.21 0.28 0.36 0.53 0.18 0.16 0.24 0.19 0.21 0.29 0.0 0.38
0.74 0.93 0.91 0.42 0.81 0.72 0.84 0.72 0.65 0.74 1.0 0.6 0.6 0.48 0.94 0.67 0.89 0.8 0.54 0.89
0.7 0.6 1.0 0.41 0.33 0.33 0.18 0.3 0.38 0.48 0.16 0.29 0.25 0.18 0.35 0.49 0.44 0.33 0.19 0.24
0.35 0.52 0.49 0.3 0.93 1.0 0.49 0.82 0.65 0.45 0.91 0.86 0.52 0.38 0.69 0.77 0.59 0.86 0.79 0.57
0.52 0.64 0.56 0.57 0.69 0.91 0.28 0.71 0.53 0.44 1.0 0.74 0.27 0.26 0.76 0.47 0.54 0.78 0.3 0.6
0.4 1.0 0.56 0.0 0.49 0.39 0.23 0.36 0.14 0.16 0.34 0.16 0.08 0.12 0.36 0.24 0.15 0.34 0.0 0.08
0.97 0.74 1.0 0.54 0.7 0.48 0.38 0.58 0.51 0.49 0.56 0.54 0.58 0.53 0.58 0.4 0.45 0.49 0.49 0.68
0.9 0.46 0.76 0.6 0.65 0.45 0.68 0.56 0.46 0.46 0.27 0.58 0.55 0.55 0.27 0.25 0.39 0.83 0.26 1.0
1.0 0.37 0.68 0.7 0.43 0.3 0.19 0.62 0.48 0.36 0.55 0.46 0.3 0.23 0.55 0.53 0.54 0.47 0.28 0.21
1.0 0.33 0.79 0.54 0.42 0.55 0.67 0.59 0.29 0.35 0.29 0.26 0.46 0.4 0.18 0.14 0.27 0.54 0.24 0.26
0.76 0.68 1.0 0.7 0.36 0.17 0.07 0.24 0.16 0.21 0.26 0.11 0.32 0.27 0.33 0.2 0.15 0.23 0.04 0.09
0.32 0.82 1.0 0.12 0.25 0.32 0.04 0.32 0.24 0.17 0.64 0.29 0.17 0.13 0.55 0.19 0.23 0.35 0.17 0.13
0.14 1.0 0.35 0.29 0.19 0.0 0.0 0.1 0.06 0.07 0.03 0.1 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.05 0.23 0.12
0.84 1.0 0.76 0.79 0.63 1.0 0.6 0.7 0.63 0.61 0.7 0.61 0.99 0.83 0.85 0.38 0.52 0.74 0.44 0.81
0.55 1.0 0.91 0.18 0.48 0.28 0.33 0.22 0.11 0.05 0.08 0.24 0.17 0.09 0.19 0.1 0.17 0.12 0.09 0.1
0.43 0.49 0.77 0.56 1.0 0.26 0.61 0.53 0.54 0.56 0.47 0.5 0.55 0.52 0.52 0.31 0.55 0.71 0.81 0.99
0.7 0.86 0.7 1.0 0.56 0.41 0.11 0.36 0.14 0.17 0.36 0.08 0.4 0.35 0.48 0.17 0.17 0.53 0.21 0.1
0.08 0.4 0.16 0.21 0.29 0.8 0.24 0.76 0.39 0.37 0.24 0.57 0.78 1.0 0.2 0.2 0.21 0.66 0.01 0.05
0.53 1.0 0.67 0.04 0.59 0.85 0.36 0.57 0.56 0.46 0.53 0.33 0.55 0.54 0.49 0.74 0.43 0.36 0.08 0.35
0.5 0.67 0.42 0.08 0.81 0.84 0.02 0.28 0.54 0.47 0.17 0.16 0.25 0.23 0.0 0.19 0.41 0.45 0.0 1.0
0.52 0.34 1.0 0.14 0.3 0.53 0.01 0.16 0.06 0.17 0.48 0.14 0.03 0.05 0.29 0.0 0.07 0.48 0.01 0.04
0.44 0.91 1.0 0.5 0.38 0.29 0.21 0.35 0.31 0.33 0.7 0.21 0.48 0.34 0.69 0.29 0.27 0.44 0.28 0.33
0.06 0.05 0.08 0.09 0.18 1.0 0.01 0.55 0.15 0.13 0.39 0.21 0.09 0.08 0.27 0.08 0.12 0.06 0.01 0.0
0.72 0.8 0.52 0.5 0.7 1.0 0.3 0.77 0.61 0.55 0.55 0.6 0.67 0.56 0.53 0.5 0.59 0.77 0.41 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)