Heatmap: Cluster_317 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.1 0.28 0.18 0.06 0.14 0.21 0.04 0.14 0.04 0.06 0.01 0.19 0.06 0.08 0.03 0.22 0.14 1.0 0.37 0.37
Gb_01048 (EXP15)
0.13 0.05 0.17 0.15 0.14 0.11 0.02 0.08 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.06 0.04 1.0 0.22 0.15
0.39 0.02 0.12 0.23 0.14 0.07 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 1.0 0.24 0.26
Gb_02470 (ATSBT5.2)
0.0 0.0 0.01 0.13 0.26 0.22 0.0 0.24 0.13 0.1 0.23 0.26 0.6 0.64 0.26 0.08 0.16 1.0 0.06 0.1
Gb_02472 (ATSBT5.2)
0.0 0.0 0.0 0.1 0.25 0.18 0.0 0.22 0.14 0.13 0.21 0.34 0.11 0.12 0.2 0.09 0.15 1.0 0.11 0.13
Gb_04986 (CCD4)
0.01 0.14 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02
0.47 0.79 0.39 0.52 0.6 0.42 0.49 0.36 0.37 0.29 0.47 0.31 0.28 0.33 0.6 0.51 0.44 1.0 0.62 0.82
0.05 0.06 0.07 0.05 0.12 0.08 0.01 0.14 0.05 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 1.0 0.55 0.14
0.05 0.05 0.06 0.05 0.14 0.05 0.02 0.16 0.13 0.13 0.03 0.03 0.04 0.02 0.07 0.04 0.03 1.0 0.22 0.2
0.31 0.4 0.37 0.38 0.49 1.0 0.37 0.44 0.31 0.29 0.32 0.42 0.35 0.35 0.38 0.28 0.28 0.58 0.37 0.38
Gb_07209 (HB-3)
0.07 0.03 0.02 0.28 0.26 0.4 0.33 0.31 0.12 0.18 0.04 0.11 0.04 0.05 0.09 0.34 0.24 1.0 0.01 0.66
Gb_07998 (AIR3)
0.03 0.0 0.0 0.37 0.67 0.51 0.0 0.25 0.1 0.06 0.08 0.19 0.15 0.19 0.05 0.22 0.31 1.0 0.3 0.1
0.26 1.0 0.27 0.42 0.62 0.62 0.09 0.4 0.29 0.3 0.17 0.25 0.44 0.35 0.25 0.26 0.24 0.81 0.33 0.09
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.13 0.01 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.13 0.03 1.0 0.0 0.0
Gb_08946 (RLK4)
0.0 0.01 0.0 0.02 0.16 0.15 0.0 0.16 0.05 0.06 0.07 0.03 0.02 0.04 0.1 0.17 0.18 1.0 0.68 0.16
0.03 0.0 0.01 0.11 0.08 0.04 0.01 0.06 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.17 0.08 1.0 0.39 0.15
0.37 0.33 0.32 0.38 0.59 0.52 0.3 0.5 0.47 0.41 0.66 0.31 0.43 0.42 0.7 0.81 0.68 1.0 0.72 0.24
Gb_10452 (AMT2)
0.26 0.05 0.1 0.33 0.13 1.0 0.03 0.43 0.15 0.13 0.19 0.24 0.16 0.1 0.19 0.12 0.42 0.32 0.13 0.18
Gb_10459 (AMT2)
0.26 0.04 0.19 0.17 0.01 1.0 0.1 0.39 0.28 0.26 0.26 0.3 0.03 0.04 0.05 0.14 0.51 0.31 0.25 0.31
0.61 0.37 0.59 0.4 0.73 0.46 0.08 0.47 0.59 0.46 0.39 0.46 0.41 0.36 0.48 0.24 0.2 1.0 0.49 0.46
0.26 0.2 0.16 0.25 0.36 0.05 0.05 0.15 0.03 0.02 0.07 0.19 0.01 0.01 0.11 0.53 0.26 1.0 0.23 0.02
Gb_13249 (CYP71A22)
0.04 0.01 0.02 0.08 0.08 0.05 0.0 0.21 0.02 0.07 0.06 0.1 0.03 0.05 0.1 0.34 0.79 1.0 0.01 0.35
Gb_13250 (CYP71A22)
0.04 0.01 0.02 0.08 0.08 0.05 0.0 0.21 0.02 0.07 0.06 0.1 0.03 0.05 0.1 0.34 0.79 1.0 0.01 0.35
0.01 0.04 0.01 0.02 0.2 0.17 0.0 0.13 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.58 0.3 1.0 0.06 0.31
Gb_14080 (NIP6)
0.11 0.12 0.07 0.25 0.51 0.25 0.24 0.25 0.23 0.26 0.24 0.55 0.33 0.27 0.39 0.22 0.35 1.0 0.05 0.71
Gb_15398 (PI)
0.05 0.06 0.05 0.05 0.22 1.0 0.02 0.1 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.53 0.05 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.03 0.12 0.09 1.0 0.0 0.12
0.35 0.29 0.22 0.24 0.4 0.36 0.3 0.24 0.15 0.14 0.17 0.18 0.07 0.07 0.22 0.26 0.19 1.0 0.33 0.14
0.09 0.0 0.0 0.25 1.0 0.15 0.0 0.19 0.16 0.11 0.1 0.1 0.06 0.09 0.05 0.11 0.05 0.89 0.33 0.02
0.07 0.02 0.05 0.1 0.17 0.16 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.15 0.06 1.0 0.31 0.33
Gb_20678 (EXP15)
0.12 0.03 0.1 0.2 0.14 0.12 0.01 0.08 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.07 0.04 1.0 0.07 0.16
Gb_21388 (PMEPCRF)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.07 0.0 0.1 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.41 0.57 1.0 0.13 0.05
0.06 0.01 0.02 0.1 0.09 0.12 0.0 0.06 0.01 0.09 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 1.0 0.56 1.0
0.43 0.18 0.35 0.22 0.2 0.03 0.07 0.13 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 0.04 0.0 0.03 0.03 1.0 0.3 0.07
0.34 0.25 0.45 0.11 0.16 0.04 0.05 0.11 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 1.0 0.25 0.08
0.08 0.0 0.01 0.16 0.21 0.8 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 1.0 0.37 0.03
Gb_26728 (GH9C3)
0.11 0.02 0.04 0.16 0.14 0.04 0.02 0.11 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.01 0.01 0.22 0.11 1.0 0.23 0.05
Gb_26825 (IP5PII)
0.62 0.22 0.3 0.31 0.59 1.0 0.13 0.39 0.22 0.19 0.15 0.23 0.22 0.18 0.2 0.27 0.34 0.89 0.37 0.35
Gb_27086 (SWEET17)
0.1 0.17 0.12 0.01 0.19 0.61 0.0 0.15 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.15 0.18
Gb_27223 (CYCP3;2)
0.06 0.07 0.05 0.07 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.03 0.08
0.04 0.05 0.05 0.1 0.38 0.36 0.07 0.28 0.2 0.27 0.23 0.34 0.06 0.11 0.3 0.5 0.42 1.0 0.14 0.24
Gb_28564 (sks4)
0.07 0.02 0.02 0.18 0.2 0.08 0.02 0.12 0.04 0.04 0.05 0.06 0.04 0.05 0.05 0.09 0.08 1.0 0.17 0.49
Gb_28575 (sks4)
0.07 0.01 0.03 0.12 0.2 0.06 0.02 0.12 0.06 0.04 0.03 0.05 0.02 0.03 0.05 0.1 0.08 1.0 0.28 0.43
Gb_28825 (NUDT2)
0.13 0.29 0.25 0.24 0.31 0.26 0.26 0.41 0.22 0.23 0.57 0.44 0.06 0.06 0.53 0.17 0.35 1.0 0.89 0.7
0.35 0.05 0.1 0.22 0.13 0.16 0.05 0.23 0.11 0.13 0.05 0.08 0.02 0.03 0.05 0.72 0.32 1.0 0.36 0.24
0.02 0.0 0.0 0.06 0.04 0.09 0.01 0.12 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.08 0.04 1.0 0.22 0.11
0.69 0.7 0.63 0.91 0.86 0.52 0.5 0.42 0.25 0.25 0.79 0.33 0.32 0.29 1.0 0.32 0.4 0.68 0.66 0.85
0.06 0.01 0.01 0.05 0.22 0.28 0.0 0.27 0.2 0.21 0.22 0.15 0.18 0.17 0.23 0.13 0.23 1.0 0.4 0.81
0.22 0.41 0.3 0.17 0.35 1.0 0.02 0.29 0.42 0.31 0.12 0.15 0.23 0.16 0.11 0.24 0.16 0.79 0.08 0.33
Gb_31174 (TBL22)
0.3 0.17 0.19 0.37 0.32 1.0 0.0 0.23 0.17 0.13 0.27 0.1 0.16 0.1 0.31 0.13 0.1 0.51 0.05 0.15
Gb_31179 (TBL22)
0.22 0.67 0.36 0.28 0.41 1.0 0.01 0.32 0.26 0.19 0.19 0.12 0.26 0.15 0.19 0.35 0.21 0.76 0.11 0.4
0.61 0.62 0.38 0.65 0.85 0.64 0.53 0.54 0.43 0.38 0.75 0.4 0.37 0.33 0.71 0.45 0.39 1.0 0.81 0.4
0.64 0.24 0.41 0.72 0.7 0.29 0.32 0.51 0.56 0.51 0.47 0.44 0.52 0.58 0.5 0.43 0.32 0.91 1.0 0.62
Gb_32033 (AIR3)
0.05 0.0 0.01 0.34 0.47 0.66 0.0 0.22 0.1 0.1 0.12 0.19 0.23 0.18 0.09 0.39 0.43 1.0 0.38 0.01
0.07 0.0 0.0 0.19 0.04 0.41 0.01 0.2 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 1.0 0.08 0.03
0.22 0.1 0.06 0.47 0.44 0.05 0.02 0.21 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.43
0.42 0.28 0.37 0.65 0.52 0.25 0.24 0.39 0.38 0.33 0.3 0.34 0.22 0.29 0.28 0.37 0.3 1.0 0.87 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.07 0.01 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 1.0 0.14 0.03
0.52 0.09 0.21 0.18 0.48 0.1 0.07 0.27 0.2 0.27 0.33 0.14 0.27 0.23 0.28 0.24 0.21 1.0 0.21 0.18
0.75 0.31 0.35 0.52 0.51 0.18 0.07 0.37 0.25 0.28 0.65 0.19 0.18 0.12 0.53 0.23 0.23 1.0 0.38 0.16
0.17 0.36 0.16 0.96 1.0 0.02 0.0 0.23 0.09 0.08 0.1 0.02 0.04 0.03 0.14 0.07 0.01 0.95 0.35 0.09
Gb_36091 (NAT12)
0.51 0.24 0.3 0.38 0.45 0.19 0.38 0.34 0.24 0.26 0.26 0.25 0.38 0.37 0.27 0.26 0.24 1.0 0.62 0.82
0.53 0.57 0.51 0.24 0.62 1.0 0.31 0.12 0.03 0.06 0.07 0.03 0.01 0.02 0.1 0.1 0.18 0.99 0.3 0.26
0.12 0.11 0.05 0.48 0.19 0.46 0.01 0.22 0.08 0.15 0.04 0.15 0.03 0.01 0.05 0.26 0.33 1.0 0.06 0.05
Gb_38353 (CRK)
0.5 0.3 0.32 0.61 0.55 0.43 0.11 0.49 0.5 0.51 0.4 0.25 0.56 0.39 0.46 0.36 0.31 1.0 0.61 0.2
0.06 0.09 0.13 0.1 0.35 0.4 0.11 0.16 0.24 0.17 0.21 0.09 0.13 0.12 0.22 0.25 0.24 1.0 0.32 0.61
0.08 0.42 0.31 0.08 0.29 0.41 0.56 0.17 0.13 0.09 0.14 0.11 0.03 0.07 0.19 0.14 0.32 1.0 0.57 0.37
0.02 0.12 0.04 0.04 0.08 0.18 0.21 0.18 0.08 0.08 0.02 0.15 0.01 0.02 0.03 0.36 0.17 1.0 0.06 0.11
0.48 0.21 0.28 0.48 0.51 0.38 0.04 0.45 0.37 0.34 0.41 0.2 0.4 0.32 0.46 0.62 0.44 1.0 0.48 0.14
Gb_41109 (GAD4)
0.23 0.21 0.25 0.24 0.56 0.51 0.1 0.4 0.33 0.42 0.28 0.24 0.4 0.34 0.3 0.29 0.49 1.0 0.21 0.33
Gb_41124 (GAD4)
0.47 0.27 0.47 0.37 0.64 1.0 0.31 0.37 0.26 0.28 0.21 0.21 0.33 0.32 0.2 0.12 0.29 0.82 0.3 0.32
Gb_41470 (HDR)
0.2 0.19 0.15 0.17 0.26 0.23 0.11 0.32 0.17 0.16 0.43 0.2 0.17 0.15 0.48 0.22 0.22 1.0 0.71 0.55
0.31 0.21 0.3 0.44 0.54 0.2 0.17 0.46 0.33 0.41 0.47 0.54 0.16 0.22 0.52 0.31 0.42 1.0 0.47 0.28
0.53 0.05 0.02 0.54 0.76 1.0 0.0 0.31 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.7

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)