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Heatmap: Cluster_321 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.25 0.61 1.08 0.37 0.67 -0.21 -0.91 -0.22 -0.95 -0.91 -0.89 -0.77 0.01 -0.04 -0.81 -0.6 -0.63 0.64 0.49 0.04
0.13 0.13 -0.16 0.01 1.33 0.36 -0.08 -0.44 -1.29 -1.13 -1.25 -0.92 -1.02 -1.19 -0.87 -1.45 -1.35 1.38 0.87 0.96
0.83 0.63 0.99 0.05 0.8 0.26 0.6 -0.27 -1.55 -1.46 -1.45 -0.65 -0.26 -0.34 -1.13 -1.77 -1.17 1.1 -0.25 -0.2
-0.57 -0.45 0.04 0.43 1.6 0.82 -1.95 -0.12 -1.31 -0.86 -0.12 0.62 -1.53 -1.44 -0.16 -0.89 -0.07 0.76 0.64 -1.06
0.58 -0.89 -0.52 -0.21 0.73 -0.35 -0.16 -0.2 -0.63 -0.78 0.75 -0.3 -1.49 -1.9 0.74 -0.27 -0.5 0.41 0.61 0.84
-0.64 -1.39 -1.12 0.15 2.14 1.32 -0.76 -1.79 -3.52 -4.31 -0.34 0.75 -2.33 -1.64 -0.07 -1.97 -1.85 0.53 0.98 0.66
0.47 -0.02 0.09 0.65 0.55 -0.76 0.24 -0.72 -0.48 -0.74 0.47 -0.44 -1.14 -1.72 0.54 0.13 -0.37 0.22 0.16 0.42
0.29 -0.24 -0.38 -0.39 1.23 0.87 -0.16 -0.04 -1.25 -1.18 0.01 -0.51 -1.23 -1.28 0.01 -0.52 -0.06 0.81 0.23 0.42
0.39 -0.15 0.23 0.33 0.67 0.2 -1.67 0.17 -0.91 -1.03 -0.75 0.15 -0.35 -0.28 -0.77 -0.81 -0.35 1.34 0.12 0.38
-0.88 -0.53 0.14 0.33 1.03 1.6 0.26 -0.25 -1.36 -1.13 -0.38 -0.34 -0.45 -0.51 -0.47 -1.81 -1.09 1.11 -0.43 0.08
0.98 -1.79 0.59 0.76 0.28 1.94 -0.26 -0.22 -2.83 -6.27 -0.95 0.31 -1.84 -0.77 -2.15 -2.37 -1.56 1.76 -2.19 -0.62
-0.15 -0.4 0.26 -0.11 0.72 0.12 -1.0 0.11 -0.64 -0.64 0.03 -0.11 -0.84 -0.91 0.15 -0.46 0.11 1.02 0.39 0.39
-0.83 -0.02 0.58 -0.89 1.45 -1.29 0.95 -1.21 -1.17 -0.15 0.43 -1.35 -1.39 -1.68 0.55 -2.06 -1.63 0.12 1.09 0.92
-0.12 -0.32 -0.05 0.41 0.68 -0.15 -0.95 0.2 -0.53 -0.67 0.28 0.2 -0.45 -0.47 0.33 -0.6 -0.25 0.69 0.4 -0.04
0.56 0.31 0.55 0.53 1.0 -0.37 0.4 -0.18 -1.1 -1.1 -0.29 -0.83 0.04 0.15 -0.31 -1.46 -1.36 0.77 -0.15 -0.38
-0.08 -0.42 -0.12 0.44 0.87 1.13 -1.15 -0.23 -1.1 -1.24 -0.49 -0.6 -1.29 -1.06 -0.68 -1.1 -0.74 1.15 0.9 0.84
-0.04 -0.35 -0.22 -0.44 0.5 0.35 -0.37 -0.14 -0.57 -0.91 -0.05 0.05 -0.12 -0.09 0.02 -0.09 -0.28 0.94 0.53 0.1
0.16 -0.09 -0.0 0.2 0.67 1.76 -0.58 -0.03 -1.11 -1.02 -0.88 -0.54 -0.75 -0.61 -1.38 -1.07 -0.57 1.4 -0.24 -0.52
0.08 0.04 0.29 0.7 0.56 0.57 -0.74 0.07 -1.21 -1.24 -0.77 -0.37 -0.39 -0.71 -0.54 -1.21 -1.07 1.19 0.77 0.36
0.16 0.1 0.05 -0.27 0.33 0.21 -0.22 -0.01 -0.85 -0.83 -0.37 -0.25 0.07 0.14 -0.2 -0.36 -0.18 1.06 0.2 0.05
-1.24 -1.22 -0.63 0.4 2.06 1.3 -0.66 -1.67 -3.99 -4.22 -0.33 0.55 -4.58 -3.98 0.02 -2.58 -2.27 0.78 1.47 0.3
-0.15 0.31 0.02 0.01 1.2 -2.12 -2.85 -0.37 -2.31 -2.26 -2.12 -1.29 -3.88 -3.47 -2.01 -1.21 -0.79 2.27 1.75 0.79
-0.1 0.94 0.44 0.15 1.31 -1.11 -1.7 -0.58 -3.79 -3.77 -5.58 -1.99 -6.39 -3.98 -4.47 -1.05 -1.48 2.23 1.97 -0.41
0.31 -0.04 -0.42 0.1 0.51 0.56 -0.64 -0.16 -0.75 -0.77 0.03 -1.01 0.03 -0.06 0.19 -0.4 -0.92 0.93 0.33 0.32
-0.2 -0.08 -0.19 -0.59 0.5 0.33 -1.48 0.15 -0.55 -0.65 -0.18 -0.22 -0.83 -0.88 -0.13 -0.09 -0.48 1.2 0.71 0.87
-0.25 -0.53 0.09 0.08 0.07 0.3 -0.35 0.03 -0.36 -0.3 0.45 -0.68 -0.01 -0.16 0.36 -0.33 -0.1 0.16 0.38 0.43
-0.25 -0.95 -0.31 0.4 0.51 -0.12 -0.98 0.07 -0.55 -0.5 0.42 -0.17 -1.25 -1.18 0.38 -0.29 -0.19 1.3 0.46 0.37
-0.72 -0.5 0.28 -0.44 0.03 0.55 -0.33 0.07 -0.11 -0.08 0.15 -0.53 0.11 0.19 0.08 -1.12 -0.58 0.56 0.33 0.67
-0.05 -0.42 0.09 -0.16 0.48 0.75 -0.16 0.14 -0.51 -0.57 -0.49 0.13 -0.47 -0.63 -0.43 -0.61 -0.02 0.5 0.5 0.57
-0.72 -0.69 -0.33 -0.08 0.72 1.17 -0.11 0.26 -0.77 -0.64 -0.79 0.19 -0.52 -0.43 -0.68 -0.89 0.01 1.28 -0.27 0.26
-0.36 0.43 -0.07 -0.06 0.88 0.56 -0.54 0.03 -0.18 -0.31 -0.8 -0.44 -0.32 -0.14 -0.81 -0.15 -0.3 0.93 0.1 -0.02
-0.93 -1.47 -0.6 -0.1 1.11 0.54 -4.83 0.5 -0.55 -0.57 -0.5 0.28 -0.43 -0.54 -0.37 -0.69 -0.48 1.63 0.92 -0.57
0.07 -0.55 -0.08 0.28 0.69 0.62 -0.87 0.16 -0.9 -0.88 -0.43 -0.47 -0.06 -0.12 -0.4 -0.87 -0.54 1.07 0.67 0.27
0.03 0.06 -0.98 -0.52 0.35 0.46 0.08 -0.39 -0.62 -0.32 0.67 -0.47 -0.59 -1.48 0.45 -0.13 -0.35 0.36 0.58 0.7
-0.04 -0.29 0.11 0.5 0.8 0.03 -1.58 0.05 -0.52 -0.56 -0.21 -0.17 -1.22 -1.28 -0.05 -0.3 -0.1 1.14 -0.33 0.93
0.55 -0.41 0.09 0.55 1.02 -0.85 -0.01 0.02 -0.25 -0.63 -0.2 -0.63 -0.66 -1.13 0.26 -1.18 -0.98 0.88 0.24 0.47
0.11 -0.2 0.42 0.22 0.98 -0.34 -1.41 -0.35 -1.01 -0.95 -0.68 -0.31 -3.87 -3.25 -0.88 -0.21 -0.07 1.67 0.94 0.63
-0.03 0.02 0.11 0.3 0.87 -0.55 -0.71 -0.14 -0.87 -0.87 -0.99 -0.54 -0.04 0.37 -0.81 -0.89 -0.31 1.32 0.75 0.04
0.26 -0.48 -0.13 0.16 0.66 0.29 -0.39 0.19 -0.36 -0.48 0.22 -0.67 -1.06 -1.33 0.23 -0.26 -0.08 0.42 0.67 0.35
0.14 0.91 -0.12 -0.62 0.72 0.58 -0.51 -0.32 -1.5 -1.38 -0.76 -0.21 0.03 -0.01 -0.48 -1.44 -1.41 1.14 0.59 0.51
0.68 -4.7 -2.48 -0.46 1.34 0.65 0.2 -0.32 -0.98 -1.47 0.51 0.02 -2.72 -1.73 0.11 -0.82 -1.16 1.6 0.12 0.52
0.39 -0.35 -0.08 -0.38 1.17 0.56 -0.02 -0.07 -0.92 -0.96 -0.47 -0.38 -0.43 -0.27 -0.39 -0.74 -0.79 1.16 -0.23 0.47
0.22 0.17 0.24 -0.06 0.62 0.42 -0.62 0.18 -0.6 -0.65 -0.04 -0.44 -0.07 -0.22 -0.11 -0.72 -0.36 0.68 0.2 0.06
-0.31 0.52 0.64 0.05 0.55 -0.21 -0.79 -0.14 -0.39 -0.47 -0.08 -0.45 -0.45 -0.49 -0.09 -0.4 -0.05 1.0 0.01 0.11
0.05 -0.69 -0.21 -0.03 0.56 -0.29 -0.97 0.12 -0.48 -0.47 0.46 -0.29 -0.22 -0.63 0.51 -0.65 -0.34 0.67 0.59 0.6
0.27 0.56 1.31 1.18 1.37 -2.76 -3.57 -0.8 -7.3 -7.91 -8.57 -5.48 -7.06 -7.95 -8.98 -6.28 -5.62 1.63 2.05 0.9
-0.12 0.4 0.27 0.23 0.29 0.38 0.02 -0.21 -0.4 -0.45 -0.45 -0.52 -0.11 -0.11 -0.2 -0.22 -0.35 0.72 -0.22 0.23
-0.35 0.18 -0.06 -0.17 0.14 0.41 -0.42 -0.1 0.08 0.0 0.64 -0.3 -1.61 -1.07 0.31 -0.2 -0.47 0.62 0.61 0.01
0.01 -0.35 0.32 0.61 0.78 1.4 -0.78 -0.09 -1.81 -1.77 -1.09 -0.07 -0.4 0.13 -1.08 -1.26 -0.67 1.11 0.22 -0.22
-0.56 -0.38 -0.08 -0.33 0.61 1.63 -0.18 0.17 -0.81 -0.74 -0.38 -0.1 -0.81 -1.14 -0.42 -1.13 -0.52 1.22 -0.5 0.45
-0.31 -0.36 -0.08 -0.28 0.45 0.86 -0.36 0.07 -0.72 -0.58 -0.25 -0.16 0.15 0.11 -0.22 -0.73 -0.08 0.73 0.17 0.32
-0.01 -0.49 -0.45 0.02 0.44 0.91 0.36 0.0 -0.84 -0.87 -0.93 -0.41 -0.01 0.23 -0.72 -0.36 0.53 0.55 -0.34 0.5
-1.19 -3.55 -3.03 0.58 1.93 0.75 -3.64 -0.5 -1.75 -1.83 -2.25 -1.33 -2.03 -1.26 -1.44 -1.17 -0.47 2.02 1.49 0.41
-0.0 -0.06 -0.47 0.1 0.08 -0.34 -0.02 -0.31 -0.34 -0.2 0.82 -0.33 -1.49 -1.55 0.95 -0.44 -0.22 0.18 0.67 0.54
-0.11 -0.4 0.24 -0.56 0.81 0.18 -0.26 0.01 -0.65 -0.72 -0.36 -0.12 -0.19 0.09 -0.5 -0.96 0.07 0.87 0.32 0.58
0.6 -0.05 0.49 -0.07 0.68 0.58 0.28 -0.08 -1.25 -1.22 -0.11 -0.59 -1.12 -1.36 0.06 -1.1 -0.43 0.75 0.31 0.51
0.48 -0.42 -0.33 0.12 1.49 -1.81 0.12 -0.42 -1.18 -0.73 0.47 -0.41 -1.8 -1.66 0.26 -0.2 -1.12 0.77 0.5 0.69
1.29 -1.27 -1.89 0.95 0.69 -1.03 0.26 -0.83 -0.69 -0.8 0.47 -0.44 -2.6 -2.3 0.74 0.07 -1.0 0.83 0.38 0.15
0.51 -0.09 0.24 0.05 0.94 0.04 0.32 -0.24 -0.92 -0.92 -0.61 -0.33 -0.0 -0.1 -0.89 -0.61 -0.37 0.92 0.17 -0.08
-0.15 0.2 0.32 0.09 0.58 1.11 -0.37 0.04 -0.49 -0.67 -0.59 -0.31 -0.35 -0.29 -0.57 -0.18 0.09 0.65 -0.46 -0.24
1.14 -1.26 -0.28 0.5 0.78 1.02 -0.94 0.06 -1.2 -1.13 -1.03 -0.89 -0.58 -0.57 -1.1 -1.28 -0.42 1.35 0.8 -0.6
-0.02 -0.07 0.27 0.18 0.62 -0.08 -0.74 0.07 -0.5 -0.63 0.5 -0.26 -1.53 -1.73 0.46 -0.26 0.29 0.53 -0.2 0.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.