Heatmap: Cluster_263 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.49 0.77 1.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.15 0.07 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.57 0.23 0.22 0.15 0.07 0.27 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.39 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.94 1.0 0.13 0.13 0.09 0.12 0.1 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.34 1.0 0.0 0.0 0.0 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 1.0 0.28 0.07 0.07 0.09 0.3 0.0
0.0 0.08 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.26 0.13 0.0 0.11 0.24 0.0 0.0 0.0 0.22 0.1 0.0 0.23 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.0 0.74 0.48 0.0 0.0 0.12 0.0 0.25 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.31 0.0 0.0 1.0 0.34 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.48 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.03 0.0 0.0 0.66 0.22 0.16 0.01 0.07 0.17 0.33 0.17
0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.93 0.17 0.0 0.0 0.14 0.55 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.03 0.0 0.04 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.04 0.0 0.64 0.47 0.25 0.71 0.04 0.46 1.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.16 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.05 0.05 0.03 0.04 0.19 0.01 0.01 0.03 0.13 0.28 0.11 0.16 0.21 0.13 0.53 0.17 0.14 0.17 0.14 0.41 0.2 1.0 0.09 0.63 0.78 0.42 0.42 0.41 0.45 0.36 0.29
0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.11 0.0 0.39 0.0 0.17 0.22 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.15 0.19 0.06 0.6 0.0 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.72 0.69 0.14 0.12 0.34 0.0 0.9 0.07 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.11 0.62 0.8 0.76 0.0 0.5 0.62 0.0 0.0 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.08 0.75 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.14 0.0 0.0 0.18 0.0 0.16 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.0 0.0 0.0 1.0 0.52 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.23 0.27 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.27 0.0 0.0 0.38 0.0 0.38 0.28 0.65 0.27 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.14 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.33 0.1 0.0 1.0 0.5 0.47 0.0 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.2 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.24 0.47 0.54 0.34 1.0 0.28 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.28 1.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.62 0.0 0.16 0.88 1.0 0.0 0.47 0.42 0.36 0.16 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.6 0.0 0.4 0.32 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.98 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0
0.0 0.38 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.54 0.0 0.53 0.0 0.0 0.93 0.0 0.56 0.21 1.0 0.55 0.28 0.76 0.59 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.18 0.15 0.15 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.19 0.05 0.23 0.62 1.0 0.09 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 1.0 0.44 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.12 0.12 0.26 0.04 0.79 0.0 0.12 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 1.0 0.86 0.0 0.0 0.32 0.09 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.91 0.54 0.0 0.0 0.0 0.42 0.28 0.25
0.0 0.01 0.04 0.09 0.02 0.0 0.0 0.2 0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.47 0.25 0.27 0.51 0.28 0.27 0.1 0.12 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.59 0.43 0.0 0.18 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.68 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.36 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.01 0.0 0.83 0.95 0.61 0.77 1.0 0.53 0.58 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.91 0.02 0.0 0.02 0.03 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.54 0.06 0.83 0.96 0.36 0.0 0.35 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.02 0.03 0.0 0.06 0.0 0.07 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.09 0.63 0.29 0.14 0.0 1.0 0.14 0.0 0.15 0.64 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.93 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.07 0.0 1.0 0.41 0.27 0.02 0.0 0.06 0.08 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.03 0.02 0.21 0.17 0.07 0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0 0.24 1.0 0.13 0.0 0.35 0.11 0.11 0.12 0.22 0.59 0.24 0.38 0.35 0.06 0.16 0.18 0.22 0.28 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.04 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.23 0.61 0.11 0.2 0.0 0.0 0.23 0.18 1.0 0.59 0.63 0.0 0.15 0.0 0.15 0.11 0.22 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)