Heatmap: Cluster_263 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.17 0.22 0.0 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.08 0.03 0.03 0.02 0.01 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.37 0.16 0.57 0.68 0.74 0.36 2.45 0.04 0.37 0.15 0.23 0.5 0.28 0.29 0.0 0.11 12.17 0.28 0.05 0.07 0.02 0.19 1.28 0.58 0.3 29.34 31.05 4.03 3.98 2.72 3.67 3.07 2.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.7 0.2 0.05 0.05 0.07 0.21 0.0
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.03 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.2 0.0 0.15 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.29 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.21 0.58 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.02 0.0 0.0 0.53 0.17 0.13 0.01 0.06 0.14 0.27 0.13
0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.32 0.06 0.0 0.0 0.05 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.0 0.06 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.06 0.0 0.84 0.61 0.33 0.93 0.05 0.61 1.31 0.0 0.0 0.0 0.12 0.21 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.28 3.26 3.02 2.81 1.82 2.37 10.62 0.44 0.34 1.45 7.28 15.52 6.31 9.0 11.65 7.17 29.29 9.29 7.85 9.62 7.58 22.68 10.97 55.28 5.09 34.95 43.3 23.22 23.47 22.5 24.76 20.04 16.28
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.18 0.06 0.08 0.03 0.24 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.54 0.52 0.11 0.09 0.25 0.0 0.67 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.75 0.08 0.47 0.6 0.57 0.0 0.38 0.46 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.1 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.07 0.0 0.26 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.1 0.07 0.17 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.14
0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 10.95 7.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.07 0.03 0.03 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.14 0.28 0.31 0.2 0.58 0.16 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.29 0.0 0.07 0.41 0.46 0.0 0.22 0.19 0.17 0.07 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.07 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.57 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12 0.0 0.07 0.03 0.13 0.07 0.04 0.1 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 8.19 12.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.01 0.03 0.09 0.15 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 1.01 0.45 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.06 0.06 0.12 0.02 0.38 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.48 0.41 0.0 0.0 0.16 0.04 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.53 0.52 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.05
0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.05 0.06 0.11 0.06 0.06 0.02 0.02 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.03 0.0 0.01 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.34 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.8 0.0 0.03 0.17 0.09 0.0 0.12 0.16 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 18.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 21.4 0.56 0.22 38.65 44.26 28.38 36.07 46.6 24.71 26.8 37.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 1.15 0.0 0.07 0.26 0.0 1.92 0.23 0.0 0.0 0.21 0.18 0.0 0.0 0.0 14.4 13.04 0.25 0.01 0.26 0.37 0.57 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.01 0.11 0.13 0.05 0.0 0.05 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.05 0.02 0.0 0.16 0.02 0.0 0.02 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 3.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.26 0.0 0.0 1.43 9.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.12 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.08 0.0 1.1 0.45 0.29 0.02 0.0 0.07 0.09 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.2 0.03 0.0 0.07 0.02 0.02 0.02 0.04 0.12 0.05 0.08 0.07 0.01 0.03 0.04 0.04 0.06 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.03 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.41 0.07 0.14 0.0 0.0 0.16 0.12 0.68 0.4 0.43 0.0 0.1 0.0 0.1 0.07 0.15 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)