Heatmap: Cluster_207 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
-0.14 -0.02 0.33 -0.24
0.33 -0.48 0.38 -0.48
Pnu_g00581 (HIP1)
0.02 -0.03 0.14 -0.15
0.05 -0.05 0.25 -0.3
0.11 -0.02 0.14 -0.27
-0.07 0.01 0.17 -0.13
Pnu_g01173 (FIE)
0.0 -0.1 0.15 -0.06
Pnu_g01343 (RFR1)
0.14 -0.1 0.16 -0.25
0.2 -0.1 0.13 -0.28
Pnu_g01595 (LEJ1)
0.1 -0.02 0.14 -0.24
0.01 0.01 0.28 -0.38
Pnu_g01890 (ISU1)
0.07 0.01 0.09 -0.19
0.17 0.28 0.14 -0.86
-0.11 -0.06 0.32 -0.2
0.14 0.09 0.12 -0.42
0.02 0.15 0.24 -0.54
-0.01 -0.14 0.27 -0.16
0.33 0.02 0.32 -1.05
0.13 0.07 0.11 -0.35
0.08 -0.18 0.19 -0.12
0.02 -0.14 0.1 0.02
-0.24 0.04 0.61 -0.76
0.02 -0.18 0.42 -0.38
Pnu_g03323 (CRR2)
0.09 -0.33 0.39 -0.28
0.01 -0.12 0.15 -0.06
0.06 -0.19 0.21 -0.11
-0.04 0.0 0.17 -0.15
0.13 -0.13 0.06 -0.08
0.09 -0.11 0.26 -0.29
0.43 -0.01 0.23 -1.02
0.21 -0.19 0.22 -0.32
Pnu_g04290 (CUL3)
0.19 -0.54 0.38 -0.2
0.31 -0.11 0.16 -0.48
0.27 -0.47 0.44 -0.48
0.11 -0.01 0.2 -0.35
Pnu_g04424 (PECT1)
0.11 -0.21 0.15 -0.08
-0.19 -0.23 0.46 -0.16
0.13 -0.02 0.36 -0.64
0.01 -0.17 0.21 -0.07
0.1 -0.07 0.17 -0.23
0.12 -0.04 0.04 -0.13
0.03 -0.02 0.21 -0.26
0.03 -0.01 0.25 -0.34
Pnu_g06522 (LIP1)
0.04 -0.06 0.1 -0.09
0.31 -0.18 0.31 -0.66
0.18 0.07 0.09 -0.41
0.02 -0.02 0.16 -0.18
-0.04 -0.04 0.19 -0.12
0.06 -0.1 0.29 -0.33
-0.07 -0.06 0.46 -0.47
Pnu_g08129 (MRP6)
0.03 -0.23 0.32 -0.19
0.04 -0.0 0.22 -0.31
0.1 0.06 0.06 -0.23
Pnu_g08525 (ACS)
0.12 -0.23 0.24 -0.18
Pnu_g08624 (EDA9)
0.0 -0.11 0.31 -0.27
Pnu_g08713 (MGT2)
0.11 0.04 0.19 -0.43
Pnu_g08757 (GAS41)
0.07 -0.12 0.25 -0.25
0.08 -0.01 0.1 -0.19
0.0 0.03 0.06 -0.09
Pnu_g09071 (ARD4)
0.01 0.01 0.04 -0.06
0.01 -0.02 0.22 -0.26
Pnu_g09187 (ANL2)
0.06 -0.48 0.41 -0.13
0.1 -0.02 0.11 -0.21
Pnu_g09566 (PUB17)
-0.02 0.03 0.22 -0.26
Pnu_g09670 (ckl12)
0.02 -0.1 0.25 -0.2
0.07 -0.1 0.11 -0.09
Pnu_g09935 (DGK4)
0.17 -0.04 0.15 -0.34
0.07 -0.19 0.25 -0.18
0.04 0.04 0.35 -0.6
Pnu_g10413 (DegP9)
0.13 -0.02 0.05 -0.18
0.24 -0.05 0.15 -0.43
Pnu_g10992 (NUDT20)
0.06 -0.09 0.06 -0.04
-0.06 0.07 0.14 -0.17
Pnu_g11783 (CSTF64)
0.11 0.02 0.16 -0.35
0.2 -0.07 0.29 -0.55
0.19 -0.17 0.13 -0.18
Pnu_g12985 (TRS120)
0.18 -0.02 0.17 -0.4
0.08 -0.09 0.12 -0.13
0.05 0.08 0.02 -0.16
0.45 -0.05 -0.06 -0.5
Pnu_g15089 (TLP3)
0.21 -0.14 0.64 -1.41
0.09 -0.12 0.26 -0.29
Pnu_g15244 (OTP82)
0.28 -0.06 0.14 -0.46
0.04 -0.26 0.24 -0.06
0.11 -0.27 0.24 -0.13
0.27 -0.09 0.41 -0.93
0.27 -0.42 0.29 -0.28
Pnu_g16062 (OTP82)
0.23 -0.04 0.15 -0.42
Pnu_g16067 (SPY)
0.24 -0.18 0.16 -0.29
0.16 -0.21 0.42 -0.56
0.13 -0.13 0.1 -0.12
-0.09 0.02 0.66 -1.1
0.08 0.04 0.12 -0.28
0.0 0.02 0.26 -0.33
0.24 -0.02 0.04 -0.31
0.03 0.16 0.2 -0.48
0.09 -0.01 0.1 -0.2
0.09 0.0 0.52 -1.01
0.03 -0.01 0.35 -0.48
Pnu_g20599 (ATG18D)
0.02 0.05 0.19 -0.29
-0.12 -0.12 0.34 -0.17
0.22 -0.41 0.39 -0.38
0.11 0.04 0.18 -0.4
0.21 0.0 0.19 -0.51
0.13 -0.49 0.26 -0.0
0.08 -0.24 0.39 -0.35
Pnu_g23584 (CRR22)
0.3 -0.14 0.25 -0.56
Pnu_g23594 (OTP84)
0.0 0.0 0.19 -0.22
0.06 -0.22 0.69 -1.03
Pnu_g24191 (FBP7)
0.08 0.06 0.11 -0.27
0.68 -0.56 0.78 -
Pnu_g24674 (emb1644)
-0.12 0.01 0.35 -0.33
0.08 -0.01 -0.02 -0.05
Pnu_g25209 (PLDDELTA)
0.03 -0.09 0.25 -0.24
Pnu_g25239 (OTP84)
0.01 -0.15 0.29 -0.21
0.05 -0.32 0.47 -0.36
0.03 0.12 0.24 -0.49
0.11 -0.02 0.16 -0.28
0.04 -0.29 0.4 -0.26
Pnu_g26689 (DBP1)
0.2 -0.04 0.31 -0.66
0.09 -0.04 0.07 -0.13
Pnu_g26859 (MOS7)
0.08 -0.02 0.14 -0.22
-0.05 -0.05 0.09 0.0
0.02 -0.05 0.22 -0.22
0.12 -0.06 0.13 -0.22
0.05 -0.02 0.17 -0.22
0.05 -0.11 0.23 -0.22
-0.14 0.05 0.63 -0.97
0.32 -0.04 0.16 -0.6
0.21 -0.27 0.38 -0.49
0.08 -0.22 0.25 -0.16
0.57 -0.54 0.29 -0.72
0.14 -0.43 0.47 -0.38
Pnu_g30084 (CRR22)
0.05 0.14 0.28 -0.64
Pnu_g30086 (SPY)
0.04 0.06 0.1 -0.23
0.21 -0.27 0.09 -0.07
0.3 -0.55 0.51 -0.59
Pnu_g30607 (CRR2)
-0.01 -0.13 0.45 -0.46
0.11 0.01 0.15 -0.32
Pnu_g30639 (OTP84)
0.19 -0.06 0.05 -0.22
0.12 -0.05 0.19 -0.3
0.03 -0.06 0.16 -0.15
-0.04 -0.02 0.14 -0.1
0.79 -0.65 0.67 -4.29
0.12 -0.22 0.4 -0.43
0.67 -0.9 0.09 -0.3
-0.02 0.0 0.07 -0.06
0.17 -0.14 0.33 -0.49
0.08 -0.0 0.19 -0.31
0.13 0.15 0.46 -1.23
-0.12 -0.36 0.55 -0.25
Pnu_g33723 (BPM2)
0.22 0.02 0.07 -0.38
Pnu_g33917 (B80)
0.3 -0.14 0.22 -0.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.