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Heatmap: Cluster_142 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
0.55 -0.55 -0.26 0.03
0.24 0.03 -0.2 -0.1
0.4 -0.04 -0.58 0.06
0.18 -0.07 0.06 -0.19
Pnu_g00698 (UNE2)
 0.31 0.0 -0.57 0.12
0.1 -0.11 0.06 -0.05
0.57 -0.06 -0.48 -0.26
Pnu_g01162 (GSNAP)
 0.18 0.15 -0.38 -0.02
0.07 0.27 -0.34 -0.06
Pnu_g01184 (BRH1)
 0.48 -0.42 -0.08 -0.13
0.17 0.05 -0.13 -0.11
0.19 0.04 -0.09 -0.16
Pnu_g01755 (GRL)
 0.11 -0.11 0.12 -0.13
0.34 -0.05 -0.04 -0.33
Pnu_g02041 (ATP3)
 0.14 -0.04 -0.04 -0.07
0.21 -0.14 -0.28 0.15
0.45 -0.29 -0.34 0.04
0.77 -0.16 -0.59 -0.45
0.34 -0.35 -0.26 0.15
0.29 -0.18 -0.08 -0.07
0.3 0.07 -0.09 -0.37
0.46 -0.14 -0.28 -0.17
0.01 0.18 -0.35 0.1
Pnu_g03099 (GCP2)
 0.06 0.06 -0.17 0.04
0.13 -0.35 -0.24 0.36
0.1 0.02 -0.11 -0.02
0.39 -0.31 -0.22 0.04
0.22 0.06 -0.06 -0.26
0.13 -0.06 -0.52 0.32
Pnu_g03761 (UPL2)
 -0.0 0.01 -0.12 0.1
0.27 0.37 -0.74 -0.15
0.16 -0.12 -0.03 -0.02
0.43 -0.05 -0.04 -0.5
-0.0 0.08 -0.17 0.07
0.14 0.01 -0.52 0.25
0.55 -0.06 -0.58 -0.14
0.33 0.09 -0.59 0.01
Pnu_g04369 (PP2A-2)
 -0.02 0.02 -0.05 0.05
0.49 -0.68 0.11 -0.18
0.17 0.02 -0.28 0.06
0.89 -1.72 -0.49 0.17
-0.45 -0.21 0.56 -0.11
0.54 -0.08 -0.35 -0.3
-0.08 -0.04 -0.02 0.13
Pnu_g05911 (RAB11c)
 0.36 -0.09 -0.11 -0.24
Pnu_g05918 (CAD5)
 0.59 -0.27 -0.3 -0.23
Pnu_g05933 (CBL2)
 0.28 -0.04 -0.62 0.22
0.12 0.01 -0.08 -0.07
Pnu_g06102 (XT1)
 0.2 0.04 -0.08 -0.19
Pnu_g06648 (UCH3)
 0.32 -0.21 0.03 -0.21
Pnu_g06686 (ARI8)
 0.11 0.01 -0.02 -0.11
Pnu_g06859 (UGT85A1)
 0.46 -0.25 0.12 -0.53
0.12 0.06 -0.04 -0.15
0.31 0.06 -0.54 0.04
Pnu_g07155 (UBQ11)
 0.47 0.12 -0.7 -0.13
Pnu_g07219 (NIP6)
 0.05 -0.16 -0.27 0.31
0.18 0.26 -0.46 -0.08
Pnu_g07304 (DDE1)
 0.05 -0.06 -0.33 0.27
Pnu_g07340 (SFH3)
 -0.18 -0.09 -0.02 0.25
Pnu_g07481 (EMB2423)
 0.18 -0.07 -0.04 -0.1
0.11 -0.02 -0.03 -0.07
0.67 -0.21 -0.35 -0.4
0.07 -0.05 -0.07 0.05
Pnu_g07684 (ABIL1)
 0.15 -0.06 0.02 -0.13
Pnu_g07954 (COV1)
 0.21 -0.05 -0.15 -0.03
0.58 -0.21 -0.19 -0.4
Pnu_g08053 (NQR)
 0.29 -0.15 -0.34 0.12
0.58 -0.02 -0.27 -0.53
0.61 0.0 -0.42 -0.47
0.11 -0.05 0.0 -0.07
0.27 -0.29 -0.01 -0.02
0.19 0.03 -0.11 -0.14
0.12 -0.04 -0.11 0.02
0.16 -0.06 -0.09 -0.02
0.43 0.02 -0.65 0.01
0.34 -0.0 -0.18 -0.23
0.6 -0.01 -0.26 -0.62
0.55 -0.91 0.14 -0.15
Pnu_g09108 (HCT)
 0.37 0.13 -0.43 -0.2
Pnu_g09146 (PAT1)
 0.36 -0.38 -0.04 -0.03
0.3 -0.01 -0.49 0.08
-0.07 -0.24 0.05 0.21
0.27 -0.35 0.12 -0.12
0.2 -0.02 -0.49 0.2
0.16 0.11 -0.52 0.14
0.55 -0.2 -0.13 -0.42
Pnu_g09570 (OPT7)
 0.52 -0.01 -0.76 -0.02
Pnu_g09831 (ROPGEF1)
 0.31 -0.08 -0.24 -0.05
0.33 0.07 -0.37 -0.12
Pnu_g09909 (TGA2)
 0.28 0.01 -0.09 -0.25
0.21 -0.2 -0.58 0.38
Pnu_g09983 (FIO1)
 0.27 -0.09 -0.12 -0.09
Pnu_g10051 (ATP5)
 0.07 -0.03 -0.09 0.04
0.19 -0.26 0.12 -0.1
Pnu_g10191 (URH1)
 0.02 -0.04 0.0 0.03
0.41 -0.0 -0.41 -0.12
0.5 -0.34 0.23 -0.68
0.49 -0.0 -0.38 -0.27
0.23 0.06 -0.48 0.1
0.24 -0.0 -0.26 -0.02
0.52 -0.6 -0.14 0.0
0.21 0.11 -0.43 0.03
0.37 -0.08 -0.28 -0.09
Pnu_g10490 (PUB44)
 0.19 -0.11 -0.09 -0.02
0.64 0.04 -0.51 -0.48
Pnu_g10560 (G6PD6)
 0.34 -0.06 -0.52 0.1
Pnu_g10590 (YSL6)
 0.1 -0.02 -0.04 -0.05
Pnu_g10596 (ORF02)
 0.38 0.07 -0.39 -0.18
Pnu_g10893 (STP7)
 0.12 -0.07 -0.19 0.12
Pnu_g10919 (PAB1)
 0.2 -0.01 -0.02 -0.2
0.22 0.23 -0.52 -0.05
Pnu_g11204 (EIN3)
 -0.0 0.08 -0.14 0.05
Pnu_g11280 (SUS3)
 0.17 -0.02 -0.45 0.21
Pnu_g11487 (PDF2)
 0.5 -0.17 -0.27 -0.2
0.22 0.09 -0.28 -0.08
0.13 0.0 -0.33 0.15
0.23 0.01 -0.07 -0.21
Pnu_g11992 (MAR1)
 0.45 -0.05 -0.57 -0.02
0.27 -0.24 -0.04 -0.03
Pnu_g12176 (CHO)
 0.17 0.0 -0.24 0.04
Pnu_g12296 (HCT)
 0.24 -0.22 -0.16 0.09
0.31 0.01 -0.07 -0.33
Pnu_g12368 (CAT2)
 0.21 -0.03 -0.19 -0.02
0.53 -0.18 -0.48 -0.06
Pnu_g12525 (GLP5)
 0.79 -0.78 0.32 -1.17
-0.47 0.5 -0.68 0.31
Pnu_g12588 (ECI2)
 0.21 -0.03 -0.01 -0.21
Pnu_g12625 (PMM)
 0.42 -0.32 -0.16 -0.05
0.26 -0.12 0.3 -0.63
0.35 -0.08 -0.0 -0.36
0.61 -0.25 0.04 -0.73
Pnu_g12873 (JR3)
 0.29 -0.03 -0.11 -0.19
Pnu_g13013 (MRP5)
 0.41 -0.08 -0.22 -0.21
0.3 0.03 -0.43 0.01
0.21 0.06 -0.59 0.18
0.16 0.1 -0.27 -0.03
0.14 0.01 -0.13 -0.03
Pnu_g13921 (TLP3)
 0.37 -0.06 -0.06 -0.35
0.24 0.2 -0.54 -0.02
Pnu_g14059 (WLIM1)
 0.21 0.04 -0.37 0.07
0.61 -0.72 0.18 -0.43
0.09 -0.37 -0.0 0.23
0.35 -0.26 0.03 -0.2
0.23 -0.15 -0.23 0.1
0.59 0.22 -1.07 -0.24
0.13 -0.07 -0.18 0.1
Pnu_g15024 (AGB1)
 0.06 0.04 -0.09 -0.02
0.74 -0.72 -0.06 -0.39
0.01 -0.07 0.04 0.01
0.32 -0.39 0.24 -0.31
0.14 -0.04 -0.08 -0.02
0.14 -0.03 -0.82 0.43
Pnu_g16111 (SHD)
 0.48 -0.01 -0.54 -0.11
0.29 -0.05 -0.18 -0.1
0.55 0.13 -1.02 -0.08
0.21 -0.04 -0.32 0.1
0.36 -0.11 -0.37 0.03
Pnu_g17000 (ORF240B)
 0.56 -0.55 0.05 -0.31
Pnu_g17265 (DGD1)
 0.33 -0.14 -0.2 -0.05
0.34 0.09 -0.3 -0.22
Pnu_g17495 (DGL1)
 -0.01 -0.01 -0.04 0.06
0.53 -0.11 0.05 -0.77
Pnu_g17686 (SDG37)
 0.23 0.05 -0.28 -0.05
0.28 -0.03 -0.16 -0.13
Pnu_g17899 (AFH14)
 0.12 -0.02 -0.06 -0.05
0.29 -0.19 -0.23 0.07
0.5 -0.34 -0.39 0.03
0.39 -0.14 -0.15 -0.19
0.4 0.02 -0.3 -0.22
0.32 0.04 -0.34 -0.09
-0.29 0.27 -0.13 0.08
Pnu_g18811 (EST3)
 0.2 -0.09 -0.33 0.16
0.44 -0.06 -0.9 0.2
Pnu_g19507 (CYP98A3)
 0.08 -0.05 -0.02 -0.02
Pnu_g19783 (SPPL2)
 0.1 0.03 -0.15 0.01
0.36 0.16 -0.81 0.04
Pnu_g20334 (WRKY21)
 0.42 0.01 -0.81 0.12
0.37 -0.46 -0.06 0.03
0.48 -0.16 -0.11 -0.35
0.21 -0.09 0.06 -0.21
0.04 0.01 -0.04 -0.01
0.43 -0.12 -0.09 -0.33
0.27 -0.02 -0.38 0.05
0.18 -0.01 -0.06 -0.13
0.36 0.02 -0.46 -0.04
0.18 -0.04 -0.05 -0.11
0.4 0.01 -0.25 -0.27
0.64 0.14 -0.46 -0.71
0.08 -0.38 0.53 -0.45
0.57 -0.13 -0.39 -0.25
0.49 0.11 -0.23 -0.6
0.42 -0.24 0.05 -0.35
0.37 -0.3 0.44 -0.91
Pnu_g23557 (SET22)
 0.11 -0.15 0.04 -0.02
Pnu_g23562 (EMB2758)
 0.43 -0.36 0.11 -0.33
Pnu_g23865 (PUB44)
 0.48 0.07 -0.62 -0.14
0.33 -0.38 0.08 -0.12
0.79 -0.52 -0.54 -0.18
0.47 -0.27 0.0 -0.35
0.38 -0.28 -0.21 0.02
0.36 -0.04 -0.7 0.17
Pnu_g24479 (SHD)
 0.29 -0.12 -0.19 -0.03
0.45 0.2 -0.4 -0.46
Pnu_g24918 (MCA1)
 0.35 -0.03 0.03 -0.47
0.78 -0.52 -0.87 0.05
Pnu_g25196 (IQD3)
 0.42 -0.12 -0.23 -0.18
0.0 -0.01 -0.14 0.14
Pnu_g25257 (ZFN3)
 0.26 -0.24 -0.02 -0.05
0.12 0.01 -0.28 0.11
0.09 0.07 -0.1 -0.08
0.44 -0.12 -0.29 -0.14
0.28 -0.04 -0.12 -0.18
Pnu_g26314 (APG6)
 0.23 -0.12 -0.03 -0.11
Pnu_g26457 (RING1B)
 0.2 -0.01 0.08 -0.31
0.16 -0.11 -0.14 0.07
Pnu_g26809 (UBQ14)
 0.27 0.08 -0.2 -0.2
0.67 -0.35 0.05 -0.76
0.16 -0.09 0.01 -0.1
0.5 -0.28 0.19 -0.69
Pnu_g27468 (EXO70D1)
 0.2 -0.05 -0.29 0.1
0.41 -0.41 -0.15 0.02
Pnu_g27512 (PRMT3)
 0.14 -0.06 -0.04 -0.05
0.18 0.11 -0.26 -0.07
0.27 0.1 -0.38 -0.06
0.02 -0.02 -0.15 0.14
0.58 -0.01 -0.58 -0.24
0.09 -0.12 -0.11 0.12
1.09 -0.36 -0.36 -1.71
0.45 0.03 -0.3 -0.32
0.32 0.0 -0.11 -0.28
0.39 -0.45 0.45 -0.76
0.18 -0.49 -0.0 0.21
0.52 -0.11 -0.27 -0.31
1.02 0.14 -1.01 -1.41
-0.26 -0.41 0.44 0.07
0.32 0.17 -0.73 0.03
0.15 0.09 -0.35 0.06
0.63 -0.28 -0.25 -0.33
0.3 -0.16 -0.07 -0.13
0.16 -0.01 -0.35 0.15
0.26 -0.34 -0.01 0.02
0.67 -0.28 -0.01 -0.76
0.26 -0.01 -0.11 -0.18
Pnu_g31237 (NOP10)
 0.17 0.02 -0.26 0.03
0.11 -0.46 0.1 0.16
Pnu_g31493 (SINAT2)
 0.54 -0.38 -0.01 -0.34
0.34 -0.02 -0.17 -0.22
0.77 0.49 -3.96 -0.29
0.17 0.11 -0.17 -0.15
0.77 -0.65 -0.15 -0.39
-0.06 0.17 -0.16 0.03
Pnu_g32478 (CPL1)
 0.16 -0.03 0.06 -0.21
0.35 -0.1 -0.24 -0.08
Pnu_g32679 (HMG1)
 0.4 -0.06 -0.06 -0.4
0.04 0.07 -0.14 0.02
0.27 0.08 -0.44 0.0
0.21 0.01 -0.1 -0.15
0.4 0.03 -0.37 -0.18
0.28 -0.09 -0.17 -0.07
0.66 -0.44 -0.3 -0.2
-0.16 0.05 -0.19 0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.