Heatmap: Cluster_450 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.67 0.01 0.0 0.01 0.34 0.87 0.62 0.98 0.4 0.55 0.92 0.63 0.63 0.6 0.65 0.8 0.68 0.45 0.46 0.73 0.95 0.65 0.77 0.83 0.67 0.69 1.0
0.23 0.16 0.13 0.09 0.15 0.16 0.71 0.14 0.15 0.14 0.85 0.8 1.0 0.6 0.74 1.0 0.9 0.84 0.78 0.76 0.75 0.88 0.87 0.4 0.84 0.7 0.74 0.77 0.93 1.0 0.79 0.75 0.99
0.1 0.09 0.07 0.05 0.05 0.1 0.39 0.02 0.02 0.04 0.43 0.38 0.42 0.31 0.59 0.43 0.79 0.43 0.58 0.7 0.57 0.18 0.53 0.26 0.47 1.0 0.95 0.72 0.78 0.76 0.67 0.66 0.75
0.33 0.31 0.31 0.23 0.25 0.24 0.57 0.15 0.15 0.18 0.54 0.53 0.72 0.6 0.91 0.82 1.0 0.92 0.8 0.89 0.8 0.3 0.73 0.55 0.78 0.95 0.88 0.84 0.95 0.97 0.88 0.87 0.92
0.05 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 0.49 0.01 0.01 0.02 0.6 0.58 0.58 0.41 0.54 0.79 0.95 0.74 0.79 0.87 0.82 0.29 0.48 0.43 0.48 1.0 0.98 0.77 0.89 0.98 0.75 0.85 0.98
0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 1.0 0.0 0.0 0.03 0.58 0.8 0.88 0.97 0.58 0.88 0.97 0.53 0.68 0.79 0.72 0.78 0.92 0.35 0.72 0.72 0.88 0.56 0.65 0.82 0.67 0.64 0.86
0.09 0.08 0.08 0.05 0.1 0.11 0.56 0.02 0.03 0.04 0.54 0.66 0.55 0.63 0.65 0.78 1.0 0.71 0.63 0.58 0.45 0.67 0.49 0.41 0.54 0.6 0.67 0.52 0.5 0.76 0.67 0.71 0.62
0.18 0.18 0.13 0.1 0.13 0.13 0.4 0.14 0.11 0.13 0.73 0.7 0.54 0.48 0.45 0.5 0.78 0.58 0.66 0.71 0.62 0.81 0.71 0.43 0.77 0.67 0.67 0.73 0.95 0.96 0.73 0.76 1.0
0.1 0.13 0.04 0.07 0.03 0.05 0.53 0.01 0.03 0.05 0.6 0.76 0.54 0.79 0.38 0.83 0.62 0.75 0.74 0.75 0.68 0.84 0.58 0.39 0.4 0.6 0.67 0.62 0.86 1.0 0.62 0.8 0.88
0.09 0.05 0.05 0.04 0.03 0.02 0.75 0.02 0.01 0.02 0.42 0.63 0.38 0.39 1.0 0.45 0.71 0.55 0.47 0.56 0.61 0.63 0.66 0.42 0.5 0.5 0.64 0.49 0.49 0.59 0.5 0.41 0.67
0.16 0.16 0.14 0.13 0.13 0.18 0.5 0.13 0.13 0.15 0.73 0.59 0.49 0.68 0.36 0.74 0.59 0.82 0.67 0.93 0.63 0.68 0.42 0.26 0.51 0.57 0.62 0.54 0.8 1.0 0.56 0.59 0.89
0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.66 0.0 0.0 0.01 0.45 0.92 0.75 0.64 0.9 0.64 0.88 0.48 0.59 0.65 0.49 0.93 0.86 0.75 0.74 0.72 0.73 0.67 0.91 1.0 0.83 0.81 0.86
0.07 0.07 0.06 0.11 0.1 0.12 0.38 0.05 0.05 0.14 0.71 0.65 0.49 0.48 0.84 0.86 0.76 0.71 0.91 1.0 0.94 0.47 0.38 0.23 0.57 0.6 0.74 0.56 0.7 0.87 0.63 0.76 0.91
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.25 0.02 0.01 0.02 0.73 0.7 0.31 0.61 0.68 0.64 0.65 0.79 0.92 0.98 1.0 0.65 0.52 0.18 0.47 0.56 0.68 0.61 0.74 0.83 0.6 0.57 0.93
0.05 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.33 0.0 0.0 0.01 0.88 0.6 0.45 0.59 0.86 0.87 0.79 0.92 0.81 0.96 0.74 0.63 0.82 0.32 0.46 0.97 0.97 0.91 0.83 0.98 1.0 0.99 1.0
0.07 0.06 0.1 0.04 0.04 0.05 0.63 0.1 0.04 0.1 0.52 0.89 0.44 0.98 0.48 0.66 0.72 0.72 0.7 0.8 0.58 0.96 0.43 0.44 0.38 0.8 0.8 0.89 0.88 1.0 0.69 0.69 0.94
0.03 0.05 0.03 0.04 0.04 0.06 0.83 0.02 0.02 0.03 0.58 0.81 0.87 0.74 0.98 0.88 0.89 0.62 0.7 0.64 0.75 0.88 0.71 0.48 1.0 0.7 0.72 0.49 0.62 0.72 0.58 0.44 0.8
0.12 0.1 0.07 0.06 0.04 0.06 0.99 0.04 0.03 0.05 0.38 0.71 0.74 0.69 0.77 0.54 0.8 0.45 0.48 0.46 0.43 0.73 0.6 0.54 1.0 0.66 0.67 0.55 0.75 0.93 0.51 0.5 0.76
0.17 0.18 0.14 0.18 0.18 0.24 0.78 0.15 0.14 0.16 0.56 0.95 0.73 1.0 0.5 0.59 0.91 0.63 0.62 0.68 0.6 0.94 0.83 0.51 0.61 0.65 0.77 0.47 0.69 0.74 0.5 0.4 0.61
0.16 0.15 0.11 0.05 0.1 0.19 0.42 0.07 0.09 0.17 0.78 0.65 0.71 0.61 0.42 0.46 0.69 0.64 0.9 0.46 0.87 0.6 0.71 0.79 0.91 0.6 0.63 0.63 0.67 1.0 0.68 0.62 0.9
0.07 0.12 0.04 0.04 0.02 0.02 0.38 0.04 0.02 0.03 0.6 0.5 0.63 0.54 0.4 0.62 0.81 0.49 0.45 0.51 0.52 0.67 0.87 0.27 0.68 0.44 0.56 0.73 0.93 0.94 0.61 0.6 1.0
0.14 0.1 0.06 0.06 0.05 0.04 0.7 0.03 0.04 0.04 0.5 0.87 0.67 0.6 0.78 0.67 0.88 0.57 0.49 0.46 0.5 0.91 1.0 0.42 0.84 0.6 0.66 0.49 0.8 0.94 0.59 0.5 0.77
0.12 0.06 0.08 0.04 0.06 0.04 0.84 0.02 0.04 0.02 0.6 0.78 0.73 0.77 1.0 0.85 0.96 0.68 0.61 0.63 0.78 0.98 0.94 0.64 0.87 0.71 0.81 0.41 0.69 0.84 0.53 0.48 0.81
0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.24 0.44 0.46 1.0 0.35 0.33 0.53 0.26 0.32 0.41 0.29 0.61 0.63 0.25 0.25 0.46 0.6 0.37 0.54 0.59 0.47 0.39 0.49
0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.72 0.01 0.01 0.02 0.52 0.75 0.85 0.95 0.33 0.62 0.85 0.53 0.61 0.68 0.68 0.83 1.0 0.84 0.51 0.56 0.68 0.47 0.56 0.52 0.44 0.38 0.6
0.05 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.66 0.01 0.01 0.01 0.55 0.71 0.67 0.95 0.62 1.0 0.88 0.67 0.73 0.95 0.76 0.79 0.87 0.35 0.78 0.58 0.72 0.48 0.55 0.61 0.5 0.47 0.59
0.08 0.06 0.04 0.05 0.05 0.04 0.4 0.05 0.05 0.05 0.76 0.7 0.42 0.52 1.0 0.73 0.61 0.68 0.63 0.8 0.71 0.5 0.59 0.53 0.37 0.63 0.7 0.85 0.78 0.7 0.73 0.66 0.82
0.17 0.16 0.11 0.13 0.11 0.14 0.38 0.07 0.07 0.15 0.8 0.48 0.37 0.53 0.75 0.71 0.63 0.91 0.9 1.0 0.95 0.4 0.36 0.2 0.5 0.6 0.68 0.78 0.76 0.84 0.86 0.75 1.0
0.17 0.16 0.13 0.15 0.17 0.2 0.43 0.12 0.1 0.18 0.57 0.56 0.32 0.39 0.68 0.53 0.59 0.69 0.54 0.62 0.65 0.35 0.8 0.18 0.3 0.51 0.65 0.83 0.77 0.87 0.77 0.73 1.0
0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.55 0.0 0.01 0.03 0.44 0.77 0.67 0.95 0.54 0.94 0.87 0.56 0.59 1.0 0.51 0.76 0.57 0.4 0.69 0.57 0.69 0.53 0.75 0.81 0.59 0.55 0.78
0.11 0.1 0.07 0.07 0.09 0.08 0.73 0.06 0.06 0.09 0.76 0.78 0.62 0.97 0.57 0.6 0.74 0.52 0.66 0.68 0.66 0.72 0.7 0.7 0.75 0.92 0.85 0.54 0.92 0.97 0.56 0.53 1.0
0.05 0.09 0.04 0.01 0.04 0.02 0.3 0.01 0.03 0.28 0.56 0.43 0.42 0.4 0.13 0.33 0.81 0.42 0.36 0.35 0.4 0.58 0.54 0.18 0.5 0.52 0.56 0.64 0.84 0.97 0.63 0.62 1.0
0.15 0.13 0.13 0.13 0.16 0.13 0.5 0.1 0.1 0.09 0.68 0.48 0.66 0.58 0.39 0.47 0.74 0.59 0.53 0.54 0.45 0.69 0.73 0.43 0.6 0.53 0.58 0.56 0.83 0.9 0.62 0.59 1.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.57 0.01 0.0 0.01 0.28 0.62 0.35 0.44 0.44 0.29 0.83 0.24 0.44 0.59 0.3 1.0 0.64 0.36 0.47 0.77 0.74 0.72 0.99 0.9 0.77 0.69 0.96
0.17 0.15 0.13 0.16 0.15 0.22 0.83 0.11 0.12 0.14 0.66 0.78 0.66 0.95 0.66 0.69 0.97 0.74 0.75 0.89 0.73 0.89 0.72 0.33 1.0 0.74 0.77 0.71 0.85 0.94 0.74 0.77 0.95
0.14 0.13 0.09 0.09 0.08 0.11 0.39 0.06 0.08 0.16 0.94 0.47 0.46 0.53 0.66 0.88 0.58 0.87 0.77 0.76 0.71 0.63 0.39 0.2 0.51 0.65 0.69 0.57 0.76 1.0 0.74 0.69 0.81
0.13 0.17 0.05 0.07 0.08 0.12 0.37 0.07 0.07 0.07 0.58 0.64 0.35 0.88 0.62 0.87 0.73 0.74 0.51 0.87 0.58 0.83 0.54 0.32 0.42 0.74 0.79 1.0 0.74 0.82 0.86 0.94 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.28 0.63 0.24 0.5 0.33 0.25 0.44 0.16 0.21 0.21 0.34 0.51 0.39 0.34 0.2 0.5 0.47 0.51 0.67 0.73 0.5 0.46 1.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.11 0.03 0.02 0.04 0.3 0.33 0.2 0.29 0.16 0.23 0.46 0.18 0.37 0.22 0.18 0.23 0.56 0.09 0.22 0.49 0.5 0.48 0.6 0.82 0.46 0.38 1.0
0.12 0.08 0.09 0.1 0.11 0.1 0.54 0.06 0.07 0.04 0.85 0.63 0.61 0.54 0.67 0.78 1.0 0.82 0.88 0.59 0.85 0.69 0.47 0.57 0.65 0.64 0.75 0.56 0.62 0.67 0.55 0.57 0.61
0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.46 0.01 0.01 0.01 0.61 0.49 0.57 0.54 0.61 0.66 0.86 0.63 0.62 0.71 0.7 0.58 0.38 0.42 0.45 0.84 0.83 0.79 1.0 0.8 0.65 0.55 0.98
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.87 0.03 0.0 0.0 0.27 0.39 0.58 0.68 0.61 0.33 0.76 0.6 0.3 0.53 0.45 0.53 1.0 0.62 0.45 0.63 0.7 0.62 0.64 0.63 0.6 0.6 0.78
0.13 0.13 0.13 0.13 0.16 0.2 0.63 0.18 0.16 0.12 0.49 0.82 0.78 0.7 0.92 0.82 1.0 0.76 0.76 0.73 0.79 0.91 0.73 0.72 0.84 0.6 0.72 0.57 0.78 0.93 0.74 0.67 0.79
0.06 0.07 0.05 0.05 0.05 0.06 0.48 0.03 0.05 0.04 0.82 0.58 0.51 0.58 0.44 0.71 0.84 0.78 1.0 0.71 0.87 0.45 0.44 0.27 0.73 0.6 0.64 0.52 0.66 0.71 0.54 0.48 0.67
0.05 0.06 0.06 0.03 0.03 0.04 0.7 0.04 0.02 0.06 0.38 0.73 0.56 0.58 0.46 1.0 0.57 0.43 0.61 0.43 0.64 0.61 0.96 0.82 0.49 0.74 0.79 0.68 1.0 0.91 0.67 0.58 0.98
0.18 0.21 0.13 0.14 0.16 0.29 0.54 0.14 0.15 0.32 0.58 0.9 0.58 1.0 0.55 0.74 0.81 0.69 0.69 0.88 0.65 0.84 0.73 0.34 0.75 0.52 0.66 0.46 0.63 0.75 0.59 0.5 0.66
0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.58 0.02 0.01 0.01 0.53 1.0 0.37 0.52 0.85 0.58 0.59 0.57 0.58 0.53 0.54 0.81 0.79 0.32 0.5 0.56 0.69 0.53 0.76 0.7 0.58 0.42 0.71
0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.25 0.01 0.01 0.01 0.58 0.39 0.42 0.3 0.36 0.51 0.76 0.48 0.69 0.56 0.71 0.3 0.28 0.14 0.34 0.53 0.7 0.52 0.62 0.83 0.61 0.6 1.0
0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.44 0.02 0.03 0.0 0.32 0.7 0.72 1.0 0.4 0.89 0.73 0.66 0.7 0.58 0.69 0.75 0.85 0.58 0.42 0.63 0.73 0.44 0.58 0.66 0.48 0.41 0.64
0.27 0.34 0.26 0.34 0.35 0.34 0.39 0.29 0.28 0.32 0.83 0.64 0.58 0.59 0.65 0.61 0.83 0.84 0.74 0.65 0.65 0.62 0.64 0.51 0.64 0.85 0.93 0.76 1.0 0.94 0.81 0.71 0.9
0.09 0.09 0.07 0.08 0.11 0.15 0.29 0.14 0.12 0.12 0.82 0.64 0.23 0.72 0.73 0.69 0.7 1.0 0.83 0.73 0.77 0.52 0.34 0.2 0.41 0.54 0.67 0.46 0.59 0.64 0.45 0.44 0.72
0.11 0.09 0.08 0.1 0.09 0.06 0.49 0.05 0.03 0.07 0.89 0.64 0.43 0.72 0.79 0.99 0.71 1.0 0.9 0.88 0.89 0.63 0.48 0.27 0.62 0.73 0.77 0.84 0.95 0.9 0.82 0.83 0.91
0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.56 0.01 0.0 0.03 0.54 0.95 0.65 0.62 0.7 0.66 1.0 0.72 0.43 0.36 0.8 0.69 0.46 0.7 0.53 0.54 0.77 0.68 0.67 0.6 0.67 0.75 0.9
0.11 0.11 0.07 0.06 0.09 0.07 0.71 0.04 0.02 0.06 0.52 0.59 0.63 0.7 0.52 1.0 0.87 0.65 0.66 0.62 0.5 0.77 0.59 0.39 0.77 0.73 0.74 0.75 0.95 0.85 0.72 0.72 1.0
0.13 0.13 0.08 0.09 0.09 0.08 0.67 0.05 0.04 0.07 0.68 0.7 0.64 0.98 0.8 0.78 1.0 0.6 0.69 0.71 0.83 0.77 0.78 0.59 0.95 0.61 0.68 0.79 0.92 0.99 0.74 0.72 0.87
0.07 0.09 0.05 0.1 0.07 0.05 1.0 0.02 0.01 0.04 0.24 0.83 0.62 0.9 0.59 0.56 0.87 0.67 0.51 0.57 0.48 0.82 0.73 0.32 0.83 0.78 0.85 0.54 0.86 0.94 0.65 0.65 0.89
0.12 0.14 0.09 0.09 0.11 0.12 0.53 0.11 0.11 0.09 0.97 0.75 0.66 0.84 0.57 1.0 0.6 0.99 0.93 0.9 0.83 0.7 0.74 0.33 0.55 0.6 0.67 0.54 0.75 0.78 0.61 0.59 0.9
0.16 0.17 0.18 0.16 0.2 0.14 0.54 0.13 0.14 0.14 0.82 0.73 0.56 0.7 0.93 0.73 0.72 1.0 0.75 0.8 0.59 0.76 0.63 0.37 0.52 0.78 0.73 0.65 0.87 0.89 0.75 0.75 0.91
0.14 0.13 0.08 0.08 0.08 0.06 1.0 0.06 0.07 0.08 0.79 0.7 0.73 0.6 0.98 0.81 0.93 0.78 0.77 0.83 0.89 0.83 0.79 0.49 0.88 0.67 0.8 0.76 0.87 0.84 0.81 0.66 0.81
0.07 0.08 0.06 0.06 0.04 0.06 0.89 0.02 0.01 0.04 0.61 0.91 0.79 0.78 0.65 0.77 1.0 0.57 0.69 0.81 0.65 0.88 0.77 0.51 0.89 0.63 0.67 0.66 0.86 0.82 0.59 0.51 0.91
0.22 0.15 0.13 0.1 0.12 0.19 0.24 0.12 0.14 0.38 0.41 0.33 0.2 0.38 0.42 0.28 0.58 0.34 0.33 0.42 0.36 0.41 0.36 0.15 0.24 0.58 0.59 0.62 0.82 0.86 0.73 0.67 1.0
0.17 0.14 0.16 0.14 0.19 0.18 0.21 0.15 0.12 0.31 0.65 0.62 0.36 0.3 0.45 0.33 0.64 0.37 0.38 0.32 0.32 0.42 0.46 0.18 0.61 0.68 0.7 0.67 0.85 0.9 0.7 0.64 1.0
0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.4 0.01 0.02 0.01 0.8 0.6 0.61 0.45 0.28 0.66 0.87 0.66 0.86 0.67 0.97 0.63 0.67 0.26 0.67 0.67 0.82 0.56 0.79 1.0 0.57 0.55 0.86

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)