Heatmap: Cluster_23 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Cambium and expanding xylem
Cambium
Expanding xylem
Expanding and mature xylem
Maturing xylem
Maturing xylem and dead early wood
Wood
Dead early and late wood
Dead early wood
Dead late wood
Vegetative shoots - needles
Vegetative shoots - stem
Vegetative shoots
Girdled twig - stem
Dried twig - needles
Girdled twig - needles
Needles
Needles - dawn
Needles - later afternoon
Needles - midday
Needles - night
Buds
Female flower
Male flower
Pineapple galls
Somatic germinants - abnormal type
Somatic germinants - normal type
Cell culture - H20 - 5 days
Cell culture - KI added - 5 days
Cell culture - KI added - 20 days
Cell culture - KI removed - 4 days
Cell culture - KI removed - 12 days
Cell culture - solid medium
-0.59 -1.2 0.03 -0.1 0.02 -0.61 -1.84 -0.98 -1.32 -1.36 -1.09 -1.76 -2.21 -0.56 1.38 -0.92 -1.61 -0.65 -0.88 -0.59 -0.76 -0.85 -2.59 -0.24 -1.83 -0.12 -0.52 2.28 1.55 0.39 1.48 1.44 0.1
0.03 0.23 -0.2 0.25 0.26 0.78 -0.4 0.99 0.54 0.57 -0.66 0.31 -0.67 0.09 -0.59 -0.99 -1.23 -0.68 -0.85 -0.72 -0.8 0.08 -0.38 -1.06 -0.89 -0.94 -0.97 0.57 0.68 0.58 0.6 0.41 0.42
-0.39 0.05 -0.04 -0.23 0.25 1.03 -0.24 -0.02 0.46 -0.14 -0.46 -0.34 -1.9 -1.02 -0.26 -0.15 -0.7 -0.58 -0.76 -0.45 -0.65 -0.82 -0.96 -1.99 -2.08 -0.99 -0.76 0.97 1.09 1.02 1.1 0.74 1.14
0.23 -0.42 0.07 -0.33 0.41 0.71 1.13 0.3 0.54 1.37 -1.9 0.36 -3.31 0.36 -1.17 -1.7 -4.4 -2.16 -2.08 -2.46 -2.14 -0.78 -2.15 -2.36 -0.96 0.12 0.0 0.39 1.03 1.21 0.6 0.33 1.11
-0.06 -0.47 0.01 -0.23 0.23 0.41 -0.29 0.18 0.35 0.56 -0.26 -0.05 -0.73 -0.43 0.17 -0.5 -0.98 -0.14 -0.64 -0.25 -0.48 -0.17 -0.63 -0.43 -0.66 -0.2 -0.3 0.59 0.71 0.64 0.51 0.4 0.71
0.46 0.11 -0.24 0.18 0.44 1.58 1.33 0.81 1.47 1.12 -3.43 -0.54 -3.84 -1.24 -3.54 -3.46 -2.93 -3.96 -4.15 -4.41 -4.49 -2.58 -1.8 -5.38 -2.44 -1.35 -1.14 -0.24 1.78 1.41 0.5 -0.99 1.51
-0.19 -0.79 0.17 0.03 -0.02 -0.23 0.17 0.0 -0.3 -1.04 -1.65 -0.55 -0.46 -0.63 0.62 -0.65 -0.29 -1.26 -1.18 -1.0 -1.05 -0.1 0.25 0.48 -0.75 -0.03 -0.05 1.16 0.67 0.57 0.93 0.91 0.83
-1.11 -1.48 -0.76 -0.25 -0.01 1.01 -2.21 0.5 0.42 1.3 0.48 -0.75 -1.33 -1.4 -0.78 -0.49 -0.93 0.02 -0.16 -0.11 -0.1 -1.68 -2.71 -2.51 -0.57 -0.63 -0.45 0.81 0.99 1.17 0.59 0.75 1.05
-0.13 -0.21 -0.15 0.25 0.49 0.97 -0.42 0.06 0.01 -0.61 -0.21 -0.58 -0.62 0.2 -0.57 -0.91 -1.1 -0.11 -0.91 -0.55 -0.18 -0.34 -0.21 -0.87 -0.43 -0.66 -0.46 0.59 1.05 0.81 0.78 0.38 0.72
-1.4 -0.06 -0.99 -0.47 0.08 0.96 -0.39 -2.01 -1.49 0.16 0.73 -0.86 -1.44 0.01 -0.58 0.94 -1.35 0.74 -0.48 0.65 -0.55 -0.1 -2.07 -4.2 -1.17 -0.72 -1.07 0.65 1.07 0.96 0.73 0.53 1.19
-0.16 -0.53 0.47 0.91 0.68 1.45 -0.06 -0.7 0.99 -0.01 -1.04 -0.65 -0.91 -0.46 -0.35 -2.48 -0.57 -2.43 -1.49 -2.33 -2.13 -1.9 -2.04 -1.07 -0.74 0.28 0.47 -1.0 1.45 2.0 -0.4 -1.31 0.75
-0.59 -0.79 -1.17 -0.96 -0.59 0.09 -0.33 0.04 -0.05 0.24 0.17 0.45 -0.99 0.3 0.28 -0.16 -1.81 -0.02 -0.29 -0.02 -0.27 0.13 -0.37 -1.93 -0.73 -1.01 -0.89 0.73 0.95 1.06 0.85 0.62 1.07
-0.89 -1.03 -0.7 -0.84 -0.67 -0.04 -0.43 -0.12 -0.24 0.25 0.61 -0.27 -0.74 -0.65 0.13 0.41 -0.31 0.62 0.65 0.47 0.56 -0.55 -0.6 -1.12 -1.33 -0.2 -0.3 0.41 0.66 0.65 0.57 0.39 0.61
0.59 0.75 -0.06 -0.23 0.24 0.51 -0.05 0.8 1.13 0.93 -0.96 -0.19 -0.48 -1.04 -0.92 -1.37 -0.46 -0.52 -1.07 -0.67 -0.66 -0.58 0.34 -0.58 -0.19 -0.66 -0.64 0.1 0.41 0.24 0.41 -0.02 0.35
-0.79 -1.23 -1.1 -1.24 -0.93 -1.98 -0.12 0.2 1.09 -0.15 -2.09 -2.51 -1.96 -6.01 -2.38 -2.4 -0.38 -1.35 -2.77 -3.1 -2.37 -1.85 -1.06 -2.68 -0.86 0.35 0.17 1.96 1.35 0.9 1.96 2.24 0.8
0.08 -0.45 0.12 0.08 0.2 0.96 0.12 0.82 0.52 0.89 -0.97 -0.39 -0.64 -0.46 -0.41 -1.16 -1.59 -1.26 -0.74 -0.9 -0.81 -0.49 -0.47 -0.3 -1.12 -0.77 -1.02 0.4 0.77 1.0 0.69 0.43 0.82
-7.97 -10.28 -8.43 -3.57 -2.84 -2.23 -6.2 1.92 1.08 2.06 -4.06 0.2 -2.67 -0.76 -1.47 -3.44 -5.29 -3.76 -4.7 - -5.54 -0.32 -5.01 -2.71 -2.49 0.28 0.19 2.16 -0.16 -0.26 2.13 2.43 -1.21
0.37 0.23 0.2 0.11 0.28 0.69 -0.61 0.47 0.26 0.55 -0.61 -0.62 -0.93 -0.88 0.38 -0.48 -1.07 -0.43 -0.68 -0.72 -0.38 -0.6 -0.39 -1.5 -0.5 0.2 0.2 0.8 0.36 0.23 0.85 0.29 0.2
-5.74 -3.78 -3.95 -2.73 -3.43 -3.62 -2.26 -0.99 -1.96 1.71 -0.2 -0.13 1.13 -0.61 -0.89 -1.09 0.77 -0.09 -0.45 -0.32 -0.2 -0.65 0.55 -0.64 0.69 -4.55 -4.59 0.96 1.37 1.19 1.15 1.02 1.06
0.42 0.05 0.33 -0.08 0.15 -0.14 -0.36 0.23 0.07 -0.04 -0.99 -0.64 -1.66 -0.72 -0.54 -1.31 -0.8 -1.24 -1.13 -0.89 -1.19 -0.67 -0.48 -1.41 -1.19 -0.29 -0.42 0.92 1.35 1.36 0.88 0.71 1.4
-0.21 -0.36 0.4 0.27 0.52 0.39 -0.66 -0.03 0.02 0.55 -0.58 -0.44 -0.39 -0.44 -1.25 -0.45 -0.23 0.13 -0.95 -0.65 -0.32 -0.19 0.05 -0.27 -0.43 -0.75 -0.6 0.6 0.55 0.66 -0.03 -0.31 1.56
-0.17 -0.24 0.19 0.13 0.0 0.39 0.04 0.35 0.49 0.57 -0.58 -0.01 -0.09 -0.13 0.02 -0.61 -1.06 -0.8 -0.6 -0.46 -0.45 0.22 -0.21 -0.07 -0.13 -0.57 -0.63 -0.14 0.5 0.87 0.04 0.1 0.77
-0.44 -0.69 -0.41 -0.75 -0.79 -0.87 0.18 -0.34 -1.05 -0.62 -0.56 -0.14 0.25 0.13 -1.19 -0.45 -0.8 -0.34 -0.9 -0.79 -0.44 -0.02 -0.21 0.06 -0.09 -0.75 -0.89 1.04 1.37 1.31 0.8 0.64 1.31
-0.01 0.3 0.5 0.18 0.17 0.04 0.16 0.27 -0.02 0.33 -0.66 -0.02 -0.48 -0.36 -0.36 -0.72 -0.89 -0.66 -0.68 -1.05 -0.83 -0.22 -0.24 -0.17 -0.54 -0.21 -0.32 0.51 0.74 0.81 0.46 0.09 0.95
0.16 -0.02 -0.09 -0.95 0.23 -0.65 -0.5 0.88 0.75 -0.61 -4.24 0.25 -0.87 -2.1 0.62 -2.68 -2.11 -7.73 -3.93 -6.31 -7.87 0.8 0.13 -1.45 -0.36 -0.61 -0.86 1.67 1.68 0.48 1.54 1.0 -0.24
-0.82 -0.21 -0.91 -0.59 -0.58 -0.41 -0.97 -0.09 -0.0 0.81 0.12 -0.5 0.28 -0.8 -0.76 0.01 -0.29 0.21 0.17 0.06 0.22 -0.96 -0.39 -0.65 -0.37 -0.77 -0.81 0.52 0.8 0.98 0.66 0.72 1.04
-0.08 -0.23 -0.23 0.39 0.19 0.63 -0.73 0.16 -0.21 0.47 -0.58 -0.86 -1.11 -0.47 -0.82 -0.27 -1.42 -0.32 -0.32 -0.35 -0.49 -0.71 -1.25 -1.13 -1.08 -0.27 -0.38 0.79 1.05 1.07 0.9 0.71 1.12
-0.48 -0.88 0.15 0.07 -0.21 -0.18 -0.87 0.19 0.3 -0.58 -2.94 -1.5 -1.05 -2.1 0.48 -4.11 -0.62 -6.12 -2.46 -3.7 -3.55 -0.31 -2.22 -3.12 -0.42 -0.21 -0.02 0.88 2.19 2.07 0.91 0.29 1.65
-0.59 -0.33 -0.53 -0.81 -0.16 0.16 -1.2 1.4 1.14 2.34 -3.01 -0.17 -2.75 -1.68 -1.52 -2.52 -3.78 -3.36 -4.14 -2.53 -1.59 -0.5 - -0.83 -5.4 -6.06 -5.44 1.13 1.21 1.59 1.05 0.8 1.35
0.06 -0.07 -0.04 -0.02 0.05 0.13 -0.24 0.03 0.12 0.58 -0.28 0.04 -0.3 0.09 -0.65 -0.25 -0.48 -0.14 -0.26 -0.39 -0.36 -0.11 -0.28 -1.19 -0.06 -0.49 -0.22 0.36 0.75 0.77 0.42 0.13 0.52
-2.61 -0.78 -0.98 -0.28 -0.86 -1.33 0.21 -0.22 -0.47 0.93 -1.18 -0.47 -2.98 -1.39 -0.05 -1.15 -2.4 -1.27 -0.65 -0.7 -0.57 -2.05 -1.66 -3.15 -2.28 -1.08 -1.35 1.26 1.86 1.77 1.48 1.34 1.69
-0.56 -0.92 -0.56 -0.64 -0.76 -0.02 0.52 -0.18 -0.54 -0.31 -1.09 -0.08 -1.66 0.18 -1.09 -0.84 -1.08 -1.01 -1.03 -0.72 -0.86 -0.41 -1.23 -1.73 -1.55 0.13 0.09 1.42 0.92 0.8 1.17 1.79 1.37
-0.29 -0.18 -0.45 -0.39 -0.27 0.09 -0.7 -0.07 -0.1 0.27 -0.42 -0.66 -1.06 -0.82 -0.84 -0.54 -0.43 -0.24 -0.32 -0.38 -0.36 -0.4 -1.03 -1.43 -0.4 -0.51 -0.37 0.98 1.3 1.27 0.99 0.74 1.17
0.06 0.25 -0.09 -0.85 0.12 0.56 -0.03 -0.14 -0.18 0.13 -0.19 0.31 -0.77 -0.05 -0.97 -0.59 -1.01 -0.21 -0.63 -0.62 -0.88 -0.33 -0.17 -0.99 -0.4 -0.12 -0.03 0.5 0.9 0.91 0.65 0.3 1.01
0.41 -0.02 0.06 0.15 0.56 0.45 -0.37 1.24 0.71 0.52 -2.0 -0.44 -0.6 0.02 -0.63 -3.46 -1.43 -3.04 -3.27 -2.27 -2.24 0.03 -0.94 0.15 -1.27 -0.28 -0.08 0.66 1.19 1.02 0.67 0.03 0.77
0.27 0.32 0.03 -0.09 -0.02 0.02 0.17 0.09 0.08 0.21 -0.4 0.1 0.11 -0.04 -0.12 -0.71 -1.12 -0.53 -0.74 -0.84 -0.5 0.23 0.5 0.22 -0.54 -0.22 -0.27 0.3 0.55 0.52 0.18 -0.16 0.55
0.26 -0.58 0.19 -0.45 -0.4 -1.03 -0.17 -0.86 -0.9 -0.72 -0.41 -0.77 -0.18 0.02 -0.44 -0.09 -1.09 -1.26 -0.61 -0.73 -1.09 -0.41 -0.07 -0.11 -0.55 -0.67 -0.81 1.04 1.5 1.3 0.97 0.89 1.16
-1.77 0.02 -2.65 -1.72 -1.82 -0.17 -0.78 -1.51 0.25 1.16 -3.0 1.58 0.37 -1.86 - -5.03 -0.54 -3.87 -4.39 -5.04 -2.31 0.44 -0.23 -3.2 2.11 0.51 0.35 0.76 1.01 0.93 1.05 0.36 0.73
-0.59 -0.75 -1.48 -1.11 -1.14 -1.56 -1.0 -0.1 1.12 0.05 0.44 0.15 0.12 -0.35 -0.68 -0.46 -0.07 -0.1 0.54 0.8 0.77 -0.11 0.18 -0.63 -0.17 -0.53 -0.36 0.37 0.78 0.36 0.33 0.22 0.3
-0.11 -0.06 0.01 -0.26 -0.58 -0.21 0.24 -0.09 -0.36 -0.31 -0.75 -0.08 -0.93 -0.2 -0.3 -0.69 -1.02 -0.72 -1.08 -1.27 -1.02 -0.28 -0.42 -0.54 -0.11 -0.95 -0.83 1.16 1.38 1.23 0.95 0.8 1.06
0.61 0.15 0.38 -0.23 -0.03 -0.16 -0.7 0.33 0.02 -0.6 -0.68 -0.85 -0.81 -0.88 -0.73 -1.1 -0.5 -1.1 -0.75 -1.01 -0.92 -0.4 0.09 -1.25 0.01 -0.84 -0.85 0.89 1.13 1.25 0.95 0.83 1.11
0.01 -0.33 -0.4 -0.62 -0.3 0.28 -0.58 0.62 0.28 0.99 0.03 -0.05 -0.19 0.24 -0.58 0.16 -1.51 0.27 -0.0 0.09 0.12 -0.29 -0.4 -0.41 -0.78 -0.71 -0.68 0.08 0.5 0.6 0.17 0.17 0.52
0.21 -0.07 0.08 -0.22 0.06 -0.06 -0.57 -0.46 -0.3 -1.27 -0.68 -0.01 -1.31 -0.08 0.28 -1.13 -0.7 -0.02 -0.87 -0.71 -0.53 0.15 -1.69 -0.59 -0.82 -0.77 -0.69 1.0 1.43 1.09 0.68 0.6 1.29
-0.37 -0.65 -0.85 -0.58 -0.41 0.88 -0.77 -0.27 1.14 -0.14 -3.11 -0.56 -2.28 -2.09 -3.99 -3.03 -3.52 -4.22 -3.78 -4.22 -3.98 -1.7 0.01 -1.39 -0.27 0.46 0.35 0.51 1.59 2.09 0.59 0.77 2.15
-2.0 -2.01 -1.0 -0.43 0.07 0.55 -1.56 -0.41 0.64 -0.12 -1.52 -0.54 0.58 -0.5 0.32 -0.02 -0.48 -0.92 -1.11 -1.36 -1.05 0.12 0.33 1.14 0.25 0.21 0.14 1.11 0.26 -0.07 1.12 0.91 -0.37
0.48 -0.35 0.8 0.32 0.63 0.39 0.41 0.4 0.32 1.45 -0.54 -0.29 -1.11 -1.55 -1.59 -1.44 -1.24 -1.01 -1.41 -1.2 -1.1 -1.29 -0.69 -1.57 -0.37 -0.0 0.02 -0.03 0.58 0.97 0.09 -0.02 1.34
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-0.59 -0.96 -0.74 -0.63 -0.05 0.31 -0.18 -0.27 0.53 -0.4 -0.12 -0.46 -0.28 -0.68 0.05 0.04 -0.19 -0.03 0.02 0.18 -0.09 -0.37 0.62 0.42 -0.21 0.66 0.38 0.01 0.38 0.4 -0.2 -0.08 0.61
0.22 0.06 0.57 0.58 0.43 0.48 -1.06 0.18 -0.38 0.01 -1.76 -1.57 -1.34 -1.65 -1.25 -2.12 -0.85 -1.5 -2.07 -1.74 -1.72 -1.43 -0.74 -0.99 -1.14 -0.58 -0.64 1.28 1.36 1.32 1.29 1.2 1.31
0.32 0.22 -0.63 -0.71 -1.33 -0.12 0.05 -0.24 -1.12 0.54 -0.56 -0.84 0.33 -1.32 -0.22 0.28 0.26 -0.78 -0.56 -1.45 -0.97 -0.96 0.67 1.58 0.19 -0.01 0.17 0.45 0.41 0.21 0.53 0.24 0.08
-0.06 -0.04 0.28 0.54 0.43 0.32 -0.72 0.57 0.35 1.15 -0.86 -0.81 -1.5 -0.84 -0.84 -1.29 -0.51 -0.95 -1.0 -1.08 -1.0 -1.0 -0.11 -1.61 -1.35 0.22 0.1 0.69 0.91 0.78 0.51 0.61 0.98
-3.95 -4.63 -3.49 -2.22 -1.72 -3.67 -3.37 0.49 1.77 0.74 -2.23 0.89 0.27 0.59 -0.36 -3.23 -0.12 -2.2 -3.57 -3.15 -3.2 0.77 -1.69 -0.51 0.56 -0.77 -0.56 0.77 2.08 1.46 0.63 -1.59 1.31
-0.4 -0.35 -0.92 -1.09 -0.39 -0.23 -0.58 0.35 0.16 1.42 0.04 -0.41 -0.32 0.02 -0.14 -0.13 -0.08 -0.4 -0.16 -0.23 -0.27 -0.61 0.03 -0.82 0.68 -0.14 -0.19 0.07 0.39 0.74 0.13 0.13 0.63
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-3.78 -6.51 -2.75 -0.8 0.0 0.55 -5.32 -1.94 2.25 -4.12 -4.1 0.28 -1.88 -0.05 -4.05 -6.84 -2.25 - - -5.84 -5.81 -2.96 -0.77 -3.68 0.81 0.03 -0.28 -2.03 1.76 2.88 -1.32 -2.48 2.54
0.51 -1.33 1.19 0.78 0.64 2.23 -1.53 0.5 0.35 0.62 -2.37 -0.35 -3.53 -1.71 -0.42 -1.87 -5.43 -2.45 -2.83 -3.54 -2.58 -0.19 -4.22 -2.74 -2.16 -2.49 -2.91 1.24 -0.81 0.18 2.36 0.73 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.