Heatmap: Cluster_322 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.3 0.02 0.72 1.07 0.86 0.61 0.28 -0.76 -2.37 -2.41 -1.79 -1.38 -2.04 -1.88 -1.49 -1.26 -0.58 0.78 1.0 -0.15
1.15 0.03 0.8 0.62 0.42 0.04 0.03 0.09 -0.65 -0.81 -0.18 -0.66 -0.68 -0.67 -0.42 -0.61 -0.46 0.17 0.27 -0.72
1.38 -0.08 0.54 0.74 0.74 -0.34 -0.07 -0.65 -0.92 -1.37 -0.55 -1.79 -1.53 -1.46 -0.89 -0.31 -0.44 0.56 0.69 0.59
1.08 0.25 0.54 1.07 0.84 -0.84 -0.01 -0.52 -0.77 -0.89 -0.55 -1.44 -0.86 -0.9 -0.56 -0.57 -0.62 0.37 0.74 -0.18
0.81 -0.38 0.12 0.82 0.45 0.06 -0.19 -0.1 -0.51 -0.64 -0.06 -0.93 -0.47 -0.58 -0.13 -0.45 -0.22 0.43 0.4 0.02
0.4 -0.43 -0.21 0.94 0.59 -0.73 0.32 -0.23 -0.49 -0.71 0.42 -1.23 -1.64 -1.38 0.29 0.3 -0.33 0.7 0.52 -0.25
0.51 -0.34 0.1 0.27 0.88 0.08 -0.02 -0.61 -0.81 -0.87 -0.34 -1.28 -0.62 -0.58 -0.21 -0.75 -0.73 1.02 0.79 0.59
1.14 0.43 0.4 0.85 0.83 0.18 0.09 -0.43 -1.09 -1.18 -0.62 -1.13 -0.7 -0.97 -0.54 -0.94 -1.38 0.45 0.71 -0.2
1.37 0.02 0.41 1.07 0.84 -0.25 -0.13 -0.55 -1.19 -1.07 -0.23 -1.32 -1.55 -1.67 -0.09 -0.84 -0.96 0.59 0.69 -0.35
1.2 -0.2 0.56 0.97 0.47 -1.23 -0.16 -0.48 -0.47 -0.68 0.04 -0.93 -0.43 -0.64 0.02 -0.48 -0.74 -0.33 0.86 -0.42
1.15 -0.16 0.38 0.99 1.24 -1.01 -0.01 -0.46 -0.92 -0.98 -0.48 -1.27 -0.84 -0.95 -0.49 -0.68 -0.62 0.76 0.35 -0.3
1.32 0.21 0.55 1.03 0.85 0.12 -0.11 -0.46 -0.85 -0.93 -0.22 -1.0 -1.08 -1.56 -0.3 -0.98 -1.15 0.15 0.54 -0.5
0.91 0.8 0.69 0.99 0.88 -0.64 -0.19 -0.45 -1.11 -1.07 -0.82 -1.15 -1.22 -1.06 -0.68 -0.93 -1.18 0.36 0.7 0.4
0.85 0.33 0.58 0.77 0.88 0.27 0.0 -0.47 -1.02 -1.05 -0.45 -0.82 -0.96 -0.85 -0.53 -1.18 -0.99 0.36 0.71 0.1
0.82 -0.32 0.1 1.02 1.08 0.49 0.23 -0.48 -1.33 -1.43 -0.47 -0.78 -1.28 -1.17 -0.47 -1.02 -0.8 0.84 0.06 0.45
0.81 0.43 0.47 0.48 0.37 0.06 -0.11 -0.09 -0.33 -0.46 -0.3 -1.12 -0.36 -0.63 -0.37 -0.64 -1.23 0.21 0.94 -0.38
1.14 0.25 1.08 0.53 0.37 -0.42 -0.38 -0.0 -0.42 -0.85 -0.27 -1.4 -0.45 -0.85 -0.27 -1.52 -1.93 0.38 0.97 -0.44
0.99 0.73 0.51 0.98 0.53 -0.74 0.43 -0.69 -1.25 -1.39 -0.54 -1.88 -2.04 -2.14 -0.47 -0.19 -0.33 0.63 0.67 0.26
0.92 0.39 0.28 0.24 0.82 -0.08 -0.3 -0.48 -0.76 -0.65 -0.18 -0.66 -1.3 -1.3 -0.45 -0.76 -0.76 0.88 0.72 0.25
0.91 -0.02 0.2 0.79 0.71 0.57 -0.01 -0.32 -1.03 -1.2 -0.54 -1.13 -0.77 -0.97 -0.5 -0.67 -0.76 0.57 0.7 0.19
1.09 0.5 0.43 0.86 0.88 -0.75 -0.12 -0.59 -0.96 -0.84 -0.57 -1.52 -0.39 -0.55 -0.54 -0.17 -0.92 0.3 0.05 0.45
1.25 0.0 0.27 0.85 1.07 -0.67 -0.09 -0.64 -0.94 -1.16 -0.52 -1.31 -1.2 -1.38 -0.52 -0.38 -0.86 0.59 0.68 0.37
1.36 0.29 0.92 1.12 1.06 -0.85 -0.57 -0.55 -0.93 -1.12 -0.99 -1.2 -1.28 -1.34 -0.95 -1.32 -1.15 0.53 0.89 -0.4
1.44 0.34 0.52 0.67 1.07 -0.15 -0.36 -0.64 -1.38 -1.28 -0.3 -1.16 -1.48 -1.26 -0.41 -1.16 -1.3 0.67 0.66 -0.05
1.08 0.66 0.54 1.05 0.76 -0.61 -0.32 -0.55 -1.37 -1.43 -0.64 -1.12 -1.77 -1.8 -0.48 -1.19 -1.26 0.68 1.07 0.29
1.06 0.51 0.59 0.47 0.45 -0.48 0.3 -0.37 -0.67 -0.8 0.09 -1.47 -1.43 -1.69 0.23 -0.15 -0.93 0.26 0.83 -0.64
0.37 -0.33 -0.15 0.45 0.29 -0.1 0.27 -0.04 -0.85 -0.68 0.31 -0.93 -0.07 -0.2 0.07 -0.55 -0.31 0.62 0.08 0.51
1.18 -0.12 0.29 0.81 0.62 -0.23 0.05 -0.16 -0.4 -0.68 -0.35 -0.88 -1.34 -1.39 -0.17 -0.51 -0.75 0.6 0.51 -0.15
0.73 0.13 0.4 0.8 0.3 -0.12 -0.58 -0.29 -1.03 -0.86 -0.04 -1.01 -0.28 -0.5 -0.06 -0.61 -0.57 0.28 0.88 0.22
0.12 -0.05 -0.36 0.37 0.23 0.05 0.27 0.02 -0.47 -0.45 0.09 0.03 -0.1 0.17 0.07 -0.88 -0.43 0.25 0.69 -0.47
0.72 0.22 0.44 0.4 0.51 -0.5 0.1 -0.31 -0.31 -0.56 0.12 -0.52 -1.04 -1.36 -0.02 -0.25 -0.79 0.12 0.61 0.43
1.39 0.82 0.96 0.86 0.81 -0.75 0.17 -0.7 -1.49 -1.6 -0.97 -1.41 -0.82 -1.0 -0.85 -1.13 -1.31 0.27 0.69 -0.18
1.2 -0.09 0.74 0.85 0.55 0.14 -0.32 -0.2 -1.04 -1.35 -0.24 -1.25 -1.41 -1.31 -0.38 -0.61 -0.97 -0.07 1.03 0.24
1.03 0.62 0.57 0.35 0.68 -0.51 0.41 -0.4 -0.71 -0.72 -0.12 -0.83 -1.61 -1.72 -0.16 -0.86 -0.58 0.35 0.76 -0.24
0.79 0.03 0.32 0.6 0.46 0.32 -0.59 -0.28 -1.03 -1.11 -0.44 -1.1 -0.63 -0.74 -0.16 -0.42 -0.71 0.48 1.21 0.02
1.26 0.42 1.29 0.59 0.58 -0.12 0.03 -0.83 -1.51 -1.73 -0.45 -1.71 -1.21 -1.52 -0.7 -0.83 -1.75 0.25 1.18 -0.12
0.91 0.33 0.4 0.87 0.87 -0.37 0.04 -0.6 -1.27 -1.38 -1.13 -0.96 -1.01 -1.25 -0.82 -0.83 -0.71 0.68 1.19 0.17
0.78 0.28 0.27 0.41 0.84 -0.9 0.23 -0.22 -0.77 -0.84 -0.41 -0.8 -0.68 -0.61 -0.3 -0.55 -0.67 0.74 0.55 0.22
0.77 0.48 0.11 0.58 1.01 -0.13 -0.22 -0.37 -0.88 -0.88 -0.15 -0.6 -0.86 -0.98 -0.15 -0.78 -0.47 0.66 0.46 -0.17
0.64 0.85 0.96 0.28 0.7 0.18 0.25 -0.9 -1.77 -1.7 -0.81 -1.2 -0.88 -0.7 -0.65 -0.72 -1.05 0.54 0.64 0.57
0.8 0.36 0.59 0.54 0.68 -0.22 0.42 -0.47 -1.22 -0.81 -0.4 -0.86 -1.51 -1.81 -0.34 -0.71 -0.42 0.5 0.8 0.32
1.16 0.1 0.87 0.97 1.0 -0.89 0.68 -0.76 -1.12 -1.16 -1.02 -1.43 -1.3 -1.29 -0.85 -0.39 -0.34 0.29 0.52 -0.29
1.26 0.3 0.66 0.97 1.15 -0.76 0.09 -1.07 -1.38 -2.22 -1.79 -2.9 -3.15 -2.57 -2.52 -0.55 -1.02 1.13 1.09 0.59
0.95 0.43 0.85 0.88 1.02 -0.77 0.21 -0.8 -1.33 -1.67 -1.47 -2.62 -2.91 -2.91 -1.04 -1.13 -1.46 1.13 1.32 0.3
1.42 0.73 0.73 -0.48 1.51 -0.67 0.35 -1.02 -1.21 -1.49 -2.01 -3.11 -2.52 -1.89 -2.16 -1.06 -1.24 1.2 0.6 0.61
0.6 0.66 0.27 0.72 0.52 -0.12 -0.05 -0.47 -0.83 -0.95 -0.09 -1.01 -0.94 -1.0 -0.09 -0.38 -0.77 0.58 0.74 -0.0
1.21 0.29 0.44 0.78 0.9 -0.61 -0.04 -0.61 -0.96 -1.12 -0.31 -1.22 -1.07 -1.25 -0.3 -0.42 -1.01 0.47 0.67 0.16
0.76 0.44 0.47 0.85 1.15 -0.29 0.08 -0.73 -1.56 -1.59 -0.64 -1.36 -1.3 -1.1 -0.42 -0.96 -1.03 0.98 0.49 0.43
0.91 0.25 0.54 0.94 0.3 -0.09 0.48 -0.4 -0.51 -0.45 -0.63 -0.91 -0.66 -0.89 -0.6 -0.36 -0.81 0.1 0.7 -0.43
0.61 0.45 0.38 0.65 0.68 -0.18 0.03 -0.3 -0.75 -0.92 -0.27 -0.65 -0.25 -0.64 -0.17 -1.07 -0.76 0.36 0.66 0.04
0.81 0.1 0.1 0.64 0.8 0.02 -0.24 -0.45 -1.18 -1.15 -0.39 -1.27 -0.61 -0.77 -0.25 -0.31 -0.78 0.66 0.86 0.36
1.33 0.46 0.89 0.94 0.47 -0.14 0.3 -1.09 -1.93 -1.97 -0.34 -2.29 -2.84 -2.88 -0.68 -2.01 -1.88 0.51 1.47 0.29
0.89 -0.01 -0.11 0.56 0.65 0.71 0.59 -0.66 -1.18 -1.27 -1.0 -0.69 -1.39 -1.29 -0.96 -0.84 -0.61 0.74 1.06 0.2
0.38 -0.43 -0.12 1.02 0.62 0.26 1.08 -0.76 -1.12 -1.26 -0.91 -0.38 -3.74 -2.32 -0.12 0.03 -0.37 0.68 0.83 0.03
0.69 0.15 0.9 1.34 0.71 -0.18 -0.72 -0.31 -0.93 -0.87 -0.32 -0.65 -0.47 -0.75 -0.37 -1.27 -0.71 -0.04 0.58 -0.25
0.88 0.57 0.39 0.78 0.67 -0.01 -0.49 -0.3 -0.69 -0.79 -0.31 -1.18 -0.82 -1.04 -0.41 -0.45 -0.75 0.47 0.52 0.2
0.87 -0.21 -0.35 0.56 0.88 -0.62 0.09 -0.19 -0.47 -0.66 -0.2 -0.93 -0.1 0.09 -0.26 -0.28 -0.67 0.32 0.0 0.4
0.73 0.31 0.37 0.11 1.0 -0.28 0.02 -0.57 -0.6 -0.47 -0.43 -0.56 -1.68 -1.31 -0.61 -0.35 -0.63 0.82 0.43 0.59
1.1 -0.39 -0.63 0.54 0.9 -0.49 -0.05 -0.55 -0.48 -0.73 -0.19 -0.55 -0.37 -0.19 -0.58 -0.47 -0.16 0.68 -0.3 0.61
0.77 0.01 0.28 0.57 0.45 0.54 0.33 -0.4 -0.54 -0.77 -0.39 -0.58 -1.32 -1.11 -0.49 -0.19 -0.52 0.12 0.97 -0.23
1.05 0.3 0.22 1.28 0.74 -0.34 -0.25 -0.49 -1.02 -0.99 -0.5 -0.92 -0.75 -0.96 -0.31 -0.78 -0.7 0.55 0.42 -0.07
0.83 0.2 0.14 1.05 0.72 -0.37 -0.37 -0.3 -0.91 -0.94 -0.37 -1.25 -0.73 -0.82 -0.37 -0.65 -0.68 0.96 0.73 -0.25
0.68 0.57 0.08 0.44 0.76 -0.3 0.8 -0.56 -1.03 -1.03 -0.39 -1.07 -2.03 -2.28 -0.42 -0.41 -0.9 0.61 1.07 0.32
0.81 0.31 0.39 0.76 0.66 0.04 0.24 -0.37 -0.88 -0.96 -0.24 -0.93 -0.59 -0.95 -0.2 -0.91 -0.74 0.19 0.3 0.53
1.3 -0.05 0.5 0.93 0.7 -0.73 -0.22 -0.52 -0.67 -0.69 -0.65 -1.37 -1.19 -1.36 -0.51 -0.93 -0.77 0.55 1.15 -0.21
0.34 -0.29 -0.31 0.03 0.55 0.04 0.53 0.06 -0.6 -0.72 0.2 -0.7 -0.4 -0.42 0.11 -0.57 -0.49 0.5 0.55 0.3
1.05 -0.76 0.46 1.39 0.86 0.02 -0.58 -0.41 -1.7 -1.25 -0.78 -1.04 -1.41 -1.27 -0.77 -1.92 -0.64 0.57 1.11 0.45
1.26 0.28 0.49 0.57 0.24 -0.13 0.01 -0.76 -0.83 -0.89 -0.51 -1.62 -1.16 -1.18 -0.35 -0.66 -1.02 0.09 1.07 0.78
1.46 0.02 0.71 1.33 0.81 -1.04 -0.84 -0.76 -1.12 -1.34 -0.65 -1.61 -1.79 -1.93 -0.64 -0.58 -1.05 0.43 1.3 -0.45
1.49 -0.91 0.07 0.89 1.06 -0.72 -0.31 -0.9 -0.66 -0.98 -0.37 -2.16 -1.54 -1.37 -0.14 -0.48 -0.86 0.68 0.6 0.63
1.46 -0.24 0.44 1.07 0.79 -0.89 -0.67 -0.87 -1.03 -1.19 -0.46 -2.12 -1.78 -2.01 -0.79 -0.77 -1.3 0.59 1.48 0.27
0.68 -0.65 0.03 0.67 0.83 0.01 0.19 -0.21 -1.16 -0.85 -0.01 -1.47 -0.69 -0.75 0.14 -0.63 -0.68 0.78 0.42 0.44
0.96 1.08 0.74 0.61 0.5 -0.18 0.06 -0.99 -0.84 -1.2 -0.49 -1.61 -1.91 -2.12 -0.45 -0.07 -1.19 0.19 1.01 0.15
1.16 0.42 0.56 1.01 0.75 -1.75 0.49 -0.84 -0.94 -0.93 -0.0 -1.46 -0.82 -1.05 0.09 -0.9 -1.35 -0.22 0.57 0.27
0.92 0.1 0.6 0.89 0.43 0.04 0.07 -0.07 -0.57 -0.68 -0.18 -0.6 -0.13 -0.65 -0.24 -0.84 -1.01 0.02 0.34 -0.49
0.33 0.48 0.25 0.5 0.66 0.14 0.02 -0.47 -0.75 -0.86 -0.78 -0.69 -0.72 -0.58 -0.67 -0.42 -0.54 0.63 0.62 0.63
1.07 0.48 0.64 0.85 1.02 -0.69 -0.22 -0.69 -1.49 -1.79 -1.43 -1.5 -1.64 -1.45 -1.5 -0.83 -0.68 1.16 0.74 0.6
0.4 -0.2 -0.03 0.38 0.34 0.35 0.16 -0.33 -0.75 -0.69 -0.44 -0.98 -0.41 -0.43 -0.32 -0.6 -0.28 0.79 0.76 0.52
0.9 0.01 0.28 0.81 0.67 0.26 0.03 -0.44 -1.05 -0.99 -0.34 -1.21 -1.62 -1.53 -0.15 -0.94 -0.6 0.68 0.88 0.27
0.68 0.46 0.33 0.55 0.72 -0.5 -0.19 -0.32 -0.95 -0.96 -0.11 -0.78 -0.72 -0.79 0.05 -0.31 -0.45 0.52 0.47 0.2
0.73 0.14 0.45 0.65 0.74 -0.11 0.1 -0.29 -0.67 -0.78 -0.49 -0.79 -0.28 -0.51 -0.34 -0.6 -0.41 0.02 0.47 0.25
0.96 0.82 0.87 0.21 1.02 -0.57 0.22 -1.04 -1.06 -1.22 -0.54 -1.47 -1.63 -1.42 -0.82 -0.71 -1.21 0.28 0.93 0.65
1.34 0.42 0.75 0.91 1.1 -0.5 0.68 -1.34 -3.37 -3.28 -2.92 -2.13 -2.7 -2.57 -2.56 -2.13 -2.22 0.86 1.68 0.28
1.31 0.56 0.54 0.57 0.82 0.12 0.46 -0.9 -0.93 -1.54 -1.44 -1.79 -3.64 -3.37 -0.37 -1.11 -2.05 0.5 1.22 0.51
0.78 0.2 0.24 0.65 0.82 -0.15 0.27 -0.47 -1.04 -0.97 -0.3 -0.95 -0.92 -1.19 -0.09 -1.02 -0.81 0.2 1.24 -0.04
0.91 -0.28 0.21 0.7 0.79 0.64 -0.11 -0.4 -1.07 -1.17 -0.59 -0.99 -0.61 -0.67 -0.57 -0.84 -0.51 0.57 0.52 0.4
1.31 -0.23 0.96 1.28 0.76 -0.6 -0.01 -0.81 -1.61 -1.76 -1.88 -1.5 -1.83 -1.79 -1.79 -0.86 -0.98 0.9 1.24 -0.03
0.8 0.19 0.43 0.83 0.67 -1.12 0.77 -0.42 -1.15 -1.21 -0.53 -0.75 -1.25 -1.07 -0.46 -0.5 -0.5 0.92 0.59 -0.18
0.75 0.16 0.32 1.0 0.63 -0.13 -0.21 -0.24 -1.05 -1.08 -0.03 -0.99 -0.39 -0.71 0.02 -0.87 -0.76 0.39 0.73 -0.24
1.09 0.53 0.63 0.8 1.16 -1.66 -0.3 -0.64 -0.95 -1.2 -0.69 -1.42 -1.27 -1.62 -0.24 -1.01 -0.91 0.54 1.09 -0.01
0.99 0.3 0.44 0.91 0.68 0.64 -0.04 -0.62 -1.57 -1.55 -0.89 -1.29 -1.16 -1.22 -0.62 -1.18 -1.3 0.7 0.79 0.5
1.11 -0.12 0.93 1.01 0.78 0.18 0.03 -0.85 -1.51 -1.84 -0.77 -1.0 -2.51 -2.26 -0.87 -1.08 -0.66 0.63 1.17 0.06
1.04 0.13 0.41 0.46 0.64 -0.54 0.01 -0.16 -0.81 -0.77 -0.1 -0.96 -0.76 -0.97 -0.2 -0.38 -0.42 0.61 0.62 -0.25
1.11 -0.3 0.62 0.75 0.55 0.02 -0.14 -0.17 -0.75 -0.97 -0.45 -0.82 -0.53 -0.85 -0.38 -0.83 -0.5 0.24 0.68 0.09
0.67 -0.07 0.21 0.69 0.33 0.33 -0.11 -0.22 -0.81 -0.85 -0.22 -0.9 -1.13 -1.25 -0.19 -0.96 -1.04 0.31 1.2 0.66
0.74 0.2 0.49 0.61 0.8 -0.15 0.01 -0.25 -0.77 -0.77 -0.29 -0.79 -0.86 -1.0 -0.22 -0.39 -0.45 0.52 0.48 -0.07
0.92 -0.16 0.6 0.7 0.52 0.29 0.35 -0.37 -0.42 -0.48 -0.31 -1.04 -0.16 -0.75 -0.12 -1.01 -0.74 -0.12 0.52 -0.42
0.71 -0.1 0.37 0.8 1.24 -0.35 -0.82 -0.33 -1.17 -1.39 -0.78 -1.43 -0.9 -1.1 -0.75 -1.07 -0.82 1.21 0.96 0.28
0.98 0.35 0.84 0.8 1.29 -0.33 0.07 -0.56 -1.52 -1.6 -1.28 -1.27 -2.03 -2.24 -1.13 -1.38 -1.64 0.93 0.81 0.55
0.76 -0.34 0.28 1.29 1.2 -0.54 0.41 -0.49 -1.51 -1.37 -1.55 -1.29 -1.48 -1.43 -1.11 -1.35 -1.79 0.83 0.94 0.82
1.02 0.5 0.87 0.86 0.91 -0.35 -1.16 -0.19 -0.84 -0.81 -0.85 -0.56 -0.69 -0.91 -0.7 -0.85 -0.49 0.18 0.6 -0.17
1.11 1.14 0.8 0.82 0.87 -0.03 0.26 -0.89 -1.44 -1.5 -1.34 -1.48 -1.97 -1.81 -1.11 -0.98 -1.69 0.39 1.02 -0.05
0.78 0.06 0.72 0.73 0.35 0.17 -0.32 -0.1 -0.68 -0.72 -0.27 -0.86 -0.12 -0.4 -0.14 -0.63 -0.62 0.14 0.49 -0.32
0.83 -0.18 0.47 0.77 1.13 -2.04 -0.03 -0.43 -0.66 -0.68 -0.52 -1.08 -1.66 -1.54 -0.72 -0.02 -0.29 0.49 0.86 0.46
0.86 0.13 0.33 0.69 0.88 0.88 0.3 -0.17 -0.87 -0.86 -0.32 -1.17 -0.41 -0.4 -0.15 -1.23 -2.13 -0.3 0.82 -1.22
1.15 0.14 0.76 0.62 0.86 -0.0 -0.49 -0.31 -0.87 -0.99 -0.6 -0.84 -0.93 -1.02 -0.65 -0.95 -0.5 0.54 0.65 -0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.