Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
-1.11 -1.79 -1.81 -1.35 -0.66 -0.27 0.26 -0.66 -0.83 -0.04 1.47 -1.32 -2.34 -2.34 1.59 -0.33 0.74 0.34 0.66 0.9
-0.41 -0.05 -0.39 -0.86 0.35 -0.25 -0.27 -0.24 0.15 -0.39 0.49 -0.27 -0.79 -0.59 0.41 0.4 -0.2 0.88 0.43 0.16
0.21 -0.58 0.11 0.14 0.2 -0.03 -0.31 -0.25 0.0 0.02 0.5 -0.51 -1.22 -1.31 0.33 0.2 0.24 -0.03 0.62 0.2
-0.04 -0.56 -0.22 -0.26 0.23 -0.42 -0.58 -0.16 -0.29 -0.45 0.94 -0.74 -0.59 -0.63 1.06 -0.95 -0.67 0.46 0.61 0.71
0.13 0.21 0.3 -0.12 0.46 -0.51 0.45 -0.18 -0.11 -0.19 0.01 -0.42 -0.15 -0.6 0.28 -0.18 0.02 -0.09 0.15 -0.02
0.4 -0.12 0.67 0.46 -0.27 -0.98 -1.35 -0.73 -0.63 -0.49 1.53 -1.47 -3.35 -3.32 1.84 -1.06 -0.57 -0.46 0.62 -0.57
0.36 1.09 -0.09 0.26 0.23 -0.98 -0.68 -0.32 -0.48 -0.44 0.7 -0.95 -0.97 -1.24 1.09 -0.34 -1.11 0.14 0.46 -0.05
0.09 -1.42 -0.91 -0.58 -0.38 -1.74 0.4 -0.06 0.44 0.43 0.56 -1.21 -1.12 -0.6 0.56 0.73 0.57 0.66 0.36 -0.31
-0.61 0.54 -0.01 0.88 0.63 -2.31 -0.32 0.23 0.08 0.02 1.03 -0.88 -0.74 -1.45 0.45 -0.28 -0.16 0.15 0.03 -1.01
1.14 1.05 1.38 - 1.19 -2.58 - -0.27 0.49 -0.83 -0.48 -1.76 -2.94 -2.85 -0.07 - -0.78 0.83 1.5 -1.19
0.39 0.55 0.1 0.53 0.52 -2.17 0.27 -0.21 -0.0 -0.1 0.03 -0.57 0.17 0.11 0.12 -0.62 -0.26 -0.39 0.26 -0.71
0.12 0.57 0.18 0.15 0.39 -0.19 -0.76 -0.43 -0.15 -0.2 0.24 -0.75 -0.62 -0.6 0.39 0.11 -0.32 0.07 0.44 0.29
0.33 0.01 -0.21 0.08 -0.01 -1.6 -0.17 -0.53 -0.0 0.02 1.47 -1.36 -2.98 -2.66 1.54 0.35 0.09 -1.37 0.21 -0.58
-0.23 -0.28 0.03 -0.46 -0.33 -0.09 -0.89 -0.62 -0.2 -0.02 1.15 -1.37 -1.11 -1.36 1.09 0.41 0.47 0.12 -0.37 0.69
-0.46 -0.79 -0.42 -0.69 -0.32 -2.28 -0.75 -0.56 0.11 0.01 1.17 -0.98 -1.05 -1.4 1.23 0.51 1.11 -0.48 -0.04 0.78
0.19 -0.59 -1.03 0.44 0.4 -0.93 -0.27 0.36 0.53 0.78 0.7 -0.82 -2.19 -1.48 0.95 -0.17 -0.26 -0.13 0.46 -0.9
-0.17 -0.38 -0.9 -0.34 0.28 -0.11 0.18 0.12 -0.33 -0.48 0.64 -0.67 -0.05 -0.24 0.64 -0.43 -0.2 0.4 0.41 0.42
-0.19 -0.57 0.63 0.27 0.3 -0.7 -0.11 -0.03 -0.11 -0.07 0.5 -0.34 -2.24 -1.86 0.45 -0.02 -0.23 0.46 0.5 0.46
-0.22 0.57 0.37 0.06 0.67 -0.16 -0.4 -0.31 -0.12 -0.24 -0.2 -0.67 0.03 0.01 -0.02 -0.15 -0.32 0.44 0.09 -0.17
-0.44 0.41 0.51 -0.49 -0.34 -1.7 0.36 -1.78 -0.41 -0.1 0.88 -1.81 -3.7 -2.78 0.92 0.36 0.76 0.14 0.58 0.7
-0.02 0.57 0.19 0.58 0.52 -0.55 -0.6 -0.89 -0.54 -0.89 1.46 -1.74 -2.54 -1.91 1.76 -0.16 -1.09 0.07 -0.58 -1.33
0.11 1.11 0.97 -0.36 1.12 -1.97 -0.4 -0.4 0.03 -0.05 0.14 -1.45 -1.61 -1.58 0.26 -0.77 -2.91 0.1 1.01 -0.05
-0.91 1.64 0.22 - 1.02 0.11 0.45 -0.55 -0.17 -0.1 -0.53 -1.01 -1.22 -2.08 -0.41 -0.22 -0.86 0.07 1.23 -0.29
-0.6 0.61 -0.31 -1.76 0.86 -0.49 1.23 -0.52 0.1 -0.12 0.04 -0.61 -2.99 -3.11 0.44 0.04 -1.01 0.23 0.98 0.26
-0.16 0.32 -0.02 -0.43 0.25 -0.72 -0.47 -0.39 0.19 0.14 0.58 -1.15 -1.2 -1.26 0.59 0.07 -0.18 0.49 0.24 0.83
-0.46 -0.13 -0.39 -0.56 0.45 -1.02 -0.3 -0.48 -0.02 0.03 0.91 -0.92 -1.12 -0.92 1.17 0.23 -0.44 0.47 -0.18 0.77
-0.54 0.71 0.07 -0.01 0.46 -0.08 0.26 -0.42 -0.28 -0.13 0.33 -0.63 -1.06 -0.85 0.37 -0.21 -0.25 0.25 0.55 0.06
0.8 -1.52 -0.17 0.45 -1.16 -1.21 -0.47 -0.48 -0.59 -0.44 1.59 -1.16 -0.95 -1.16 1.53 0.07 0.53 -0.87 -1.03 0.11
0.19 -0.26 0.23 -0.46 0.16 0.06 0.66 -0.56 -0.02 -0.65 -0.23 -0.39 -1.79 -0.89 -0.64 0.12 0.11 0.67 0.42 0.92
0.19 -0.41 0.32 -0.23 0.09 -0.9 -0.21 -0.22 -0.02 -0.07 1.22 -0.79 -2.0 -1.92 0.94 0.33 -0.23 0.34 0.52 -0.77
-0.06 -0.47 0.26 -0.06 1.01 -1.74 -0.79 -0.17 0.23 -0.05 1.07 -0.78 -1.98 -1.93 0.68 0.81 -0.04 -0.06 0.53 -1.63
-0.9 0.26 0.07 -0.44 -0.16 -0.03 0.72 -0.32 -0.29 -0.25 0.13 0.43 -2.12 -1.82 0.05 0.01 0.35 0.45 0.88 0.02
-0.32 0.43 -0.04 -0.27 -0.22 -0.69 0.78 -0.55 0.26 0.07 0.35 -0.43 -1.51 -1.59 0.29 0.46 -0.52 -0.14 0.9 0.24
0.39 -2.01 -0.92 -0.05 -0.35 -4.42 -0.88 -0.08 0.2 0.52 1.22 -1.14 -1.38 -1.93 1.15 0.69 0.71 0.79 -0.05 -1.13
-1.01 -0.36 -0.24 -0.49 -0.03 0.83 0.95 -0.39 -0.29 -0.01 0.39 -0.13 -2.48 -2.69 0.48 -0.58 -1.07 0.4 0.86 0.74
0.06 0.03 -0.22 0.08 -0.03 -1.81 0.78 -0.35 0.46 0.34 0.48 -1.53 -0.57 -0.83 0.55 -0.36 -0.15 0.01 0.51 0.07
0.33 -2.01 -0.05 -0.25 -1.49 -2.21 0.03 -1.58 -0.93 -1.17 2.33 -1.68 -1.69 -0.85 2.47 -0.97 -1.01 -0.93 - -0.98
0.83 -1.82 -0.13 -0.96 -1.55 -1.23 -0.45 -1.58 -0.85 -1.26 2.48 -1.69 -2.42 -3.1 2.54 -0.3 -1.26 -2.24 - -1.96
-0.46 -1.46 -0.54 0.24 -0.03 -0.8 0.76 -0.32 -0.05 0.12 1.16 -1.03 -3.82 -3.56 1.11 0.16 -0.08 0.47 0.84 -0.57
-0.05 -0.55 0.06 0.36 0.56 -0.5 -0.24 -0.09 -0.12 -0.19 -0.39 -1.28 -0.47 -0.33 0.15 0.06 0.19 0.53 0.75 0.19
0.26 -0.73 -0.49 -0.95 0.38 0.23 -0.02 -0.61 -0.32 -0.4 0.72 -0.23 -4.29 -2.37 0.85 0.13 -0.07 1.03 0.29 0.51
0.27 0.03 -1.3 0.94 -0.52 -1.4 -0.41 0.06 0.44 0.22 1.29 -1.71 -1.49 -1.96 0.51 -1.24 0.86 -0.08 1.04 -5.03
0.28 0.07 0.4 0.13 -0.1 -0.62 0.2 -0.13 -0.09 -0.24 0.67 -0.49 -0.74 -0.67 0.65 -0.37 -0.19 -0.11 -0.23 0.45
-0.09 0.32 -0.39 0.31 0.01 -1.22 -0.02 -0.11 -0.23 -0.13 1.33 -0.33 -1.83 -2.17 1.43 -0.38 0.01 0.23 -0.81 -0.6
0.52 -0.14 0.82 0.72 0.11 -1.71 0.26 -0.51 -0.47 -0.08 1.01 -0.84 -3.27 -3.52 0.87 -0.81 -0.99 -0.09 0.67 0.13
-0.03 -0.09 -0.12 -0.17 0.54 -0.47 0.04 -0.13 -0.05 -0.05 0.16 -0.52 -0.07 -0.13 0.31 -0.18 -0.48 0.41 0.48 -0.05
0.4 0.56 0.21 0.15 1.28 -0.84 0.79 -0.46 -0.96 -0.41 -0.2 -1.27 -1.55 -1.23 -0.29 -1.72 -1.77 -0.02 1.29 0.41
0.26 -1.5 0.2 -0.55 -0.44 -1.27 0.66 -0.64 0.37 0.29 1.85 -0.8 -2.51 -2.51 1.49 -0.48 0.09 -1.41 -1.02 -0.45
-0.01 0.06 0.92 -0.93 0.65 -0.72 -0.97 -0.02 -0.54 -1.26 0.83 -1.36 -1.76 -1.76 0.65 0.35 0.07 0.4 1.16 -0.81
0.85 0.15 1.54 -0.31 - -1.67 0.74 -2.33 -0.63 -0.77 1.84 -3.99 -1.01 -3.48 2.49 - - - -3.43 -
0.35 -0.06 0.42 0.15 0.49 -0.55 -0.62 -0.2 -0.54 -0.64 0.13 -0.7 -0.18 -0.12 0.16 -0.05 -0.3 0.9 -0.14 0.27
0.79 -0.54 0.45 -1.32 -0.04 -0.57 1.13 -1.01 0.05 -0.59 0.56 -1.61 -1.44 -1.9 0.45 0.0 -0.3 -0.12 0.89 0.48
0.3 1.45 1.53 - 1.08 -1.16 - -0.4 -0.46 -1.19 -0.43 -0.71 -1.36 -1.46 -0.58 -0.18 -0.54 0.62 0.96 -0.28
0.21 -0.46 -0.72 -0.51 0.65 -1.03 0.44 -0.11 0.1 -0.04 0.35 -1.01 -1.65 -1.95 0.7 0.34 0.4 0.36 0.39 0.36
0.09 0.13 0.4 0.47 0.37 -0.34 0.25 -0.38 -0.07 -0.01 -0.0 -0.63 -0.93 -1.04 0.31 0.0 -0.29 0.18 0.48 -0.15
0.23 -0.94 -0.08 -0.61 -0.04 -2.88 -0.76 -0.11 0.21 0.3 1.58 -0.9 -2.98 -3.43 1.59 0.53 -0.1 -0.52 0.64 -1.67
0.21 -0.59 -0.12 -0.07 -0.25 -0.91 -0.46 -0.93 -0.91 -0.6 1.43 -1.56 -2.69 -2.57 1.57 -0.27 0.19 0.0 0.39 0.91
0.01 -0.09 -0.28 -0.43 0.92 -0.59 0.32 -0.05 -0.24 -0.21 0.39 -0.53 -0.31 -0.52 0.29 -0.31 0.06 0.2 0.21 0.18
-0.77 -0.89 0.19 0.07 1.19 - -4.25 0.14 0.16 1.07 1.25 -0.1 -1.17 -0.6 0.72 -0.41 -1.03 -0.47 0.77 -1.93
-0.93 -1.77 -0.21 -0.23 -0.17 - -0.65 -0.08 0.51 0.69 1.32 -0.96 -1.37 -1.48 1.3 1.07 0.5 -0.32 0.24 -2.05
0.35 -0.16 -0.48 -0.4 0.71 -0.21 -0.13 -0.36 0.23 0.17 1.18 -0.93 -2.94 -3.01 0.95 0.9 -0.05 -0.0 -0.66 -1.25
-0.09 0.25 0.03 -0.94 0.57 -0.25 -0.3 -0.32 -0.27 -0.37 0.25 -0.41 -0.77 -0.61 0.31 -0.12 -0.47 0.78 0.29 0.84
-0.22 0.09 -0.13 -0.82 0.47 -0.29 -0.12 -0.56 0.12 -0.2 0.41 -0.6 -2.28 -1.88 0.4 0.53 -0.25 0.75 0.04 1.05
0.61 -1.97 -0.04 0.15 0.58 - -1.59 -0.61 -0.04 0.57 1.67 -1.33 -2.44 -3.56 1.79 0.09 0.29 -1.24 -0.94 -0.62
0.61 -1.97 -0.04 0.15 0.58 - -1.59 -0.61 -0.04 0.57 1.67 -1.33 -2.44 -3.56 1.79 0.09 0.29 -1.24 -0.94 -0.62
-0.13 0.18 0.5 0.43 0.03 -0.51 -0.38 -0.12 -0.14 -0.18 0.73 -0.79 -2.03 -1.97 0.62 -0.24 -0.13 0.46 0.58 0.14
0.23 -0.62 0.17 -0.74 0.08 -3.15 -0.15 -0.37 -0.11 -0.14 1.61 -0.93 -3.05 -2.74 1.42 0.24 0.5 0.33 0.18 -1.88
-0.03 0.41 -0.19 -0.08 0.28 -1.0 0.12 -0.13 -0.05 -0.26 0.33 -0.64 -0.29 -0.47 0.29 0.25 -0.23 0.1 0.33 0.4
-0.3 0.02 0.05 -0.5 0.37 -2.82 -1.39 -0.99 -0.46 -0.21 1.49 -1.42 -2.0 -2.25 1.54 -0.48 0.45 0.67 0.23 0.15
-0.16 0.44 0.06 -0.33 0.48 -0.54 -0.5 -0.15 -0.3 -0.28 0.63 -0.76 -0.77 -1.12 0.64 -0.39 -0.4 0.41 0.69 0.46
0.51 -0.4 -0.09 0.45 0.4 -0.74 -0.01 -0.01 -0.65 -0.7 0.54 -0.74 -0.66 -0.87 0.71 -0.24 -0.42 0.55 0.28 0.29
0.45 0.03 0.05 -0.28 0.86 -0.69 -0.16 -0.1 -0.37 -0.5 0.43 -1.04 -0.28 -0.28 0.16 -0.41 -0.47 0.66 -0.16 0.55
0.23 -0.32 -0.07 -0.01 0.52 -0.62 -0.16 -0.15 -0.57 -0.76 0.56 -0.76 -0.0 -0.23 0.44 -0.01 -0.44 0.57 -0.23 0.66
0.15 -0.62 -0.41 -1.33 0.36 -1.17 -0.49 0.06 0.3 0.2 0.64 -0.35 0.27 0.05 0.51 0.71 -0.52 -0.22 0.11 -0.1
0.09 -0.22 0.07 -0.13 -0.28 0.06 0.17 0.03 0.11 0.01 0.85 -0.54 -0.38 -0.58 0.78 -0.01 -0.22 -0.36 -0.16 -0.26
-0.06 -0.12 -0.29 -0.47 0.29 -0.22 0.31 -0.14 0.13 0.16 0.22 -0.7 -0.49 -1.01 0.37 -1.02 -1.13 -0.07 1.11 0.85
0.13 -0.52 -0.07 -0.67 -0.49 -2.78 -0.68 -1.34 -0.9 -0.28 1.47 -2.0 -3.37 -3.41 1.64 0.13 0.71 0.23 0.41 0.86
0.44 -0.87 -0.15 -0.34 -0.12 -1.45 -0.81 -1.14 -1.01 -0.47 1.67 -2.0 -3.04 -3.21 1.88 -1.05 -0.52 0.57 -0.2 0.99
0.07 -1.22 -0.56 0.2 -0.31 -2.07 -0.74 -1.5 -1.08 -0.58 1.93 -1.97 -4.94 -3.74 2.05 -0.97 -0.6 0.33 -0.05 0.89
-0.14 0.05 -0.16 0.14 0.75 -1.59 -0.49 -0.27 0.09 0.05 0.24 -0.91 -0.2 -0.35 0.17 0.39 -0.15 -0.08 0.55 0.39
-0.83 -1.04 -1.31 -0.71 -0.4 -0.44 -0.2 -0.8 -0.49 0.17 1.62 -1.49 -3.24 -2.94 1.74 -0.77 0.51 0.19 0.92 0.16
0.23 -0.26 0.33 0.43 0.43 -1.09 -0.61 -0.09 -0.2 -0.39 0.84 -1.04 -1.03 -1.1 0.64 0.13 -0.04 0.09 0.95 -1.05
-1.33 -1.03 -0.65 -1.55 -0.59 -0.28 0.04 -0.87 -0.85 -0.44 1.54 -1.31 -2.4 -2.13 1.72 -0.46 0.19 0.28 0.48 1.19
0.34 0.06 0.95 -0.09 0.13 -0.46 -0.66 -0.03 0.07 -0.07 -0.02 0.03 -1.25 -1.45 -0.25 0.03 -0.09 0.5 0.56 -0.14
0.73 1.33 0.49 - 1.06 -1.96 - -0.3 0.21 -0.67 -0.28 -1.69 -0.57 -0.62 -0.05 -0.13 -0.59 0.65 1.2 -0.69
0.21 0.01 0.45 0.12 0.6 0.46 -0.63 -0.1 -0.13 -0.39 -0.37 0.18 -1.65 -1.78 0.19 0.01 0.08 0.57 0.02 0.03
0.02 0.08 0.5 0.48 0.32 -0.66 -0.12 -0.35 -0.05 0.0 0.11 -0.65 -0.45 -0.49 0.22 -0.15 -0.39 0.09 0.62 -0.05
0.1 0.01 -0.02 -0.08 0.79 -0.64 0.12 -0.15 -0.16 -0.27 0.12 -0.37 -0.11 -0.47 0.07 -0.28 -0.34 0.24 0.57 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.